| Definition | Listeria monocytogenes Clip81459, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012488 |
| Length | 2,912,690 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 226223274
GI number: 226223274
Start: 689463
End: 692153
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: Lm4b_00671
Alternate gene names: 226223274
Gene position: 689463-692153 (Clockwise)
Preceding gene: 226223273
Following gene: 226223275
Centisome position: 23.67
GC content: 38.76
Gene sequence:
>2691_bases ATGCGGAAAGTATACGAAATATTTATTTTAGACTGGCGCCGTCTCTTTAAAGCGCCTTTAGCTTTATTATTAGTAATTGC ATTAATTATTTTGCCATCATTATATGCTTGGTTTAATATTGAAGCACTTTGGGATCCGTATTCCAACACTTCGGGGATCA AAGTGGCAGTTTCGATTGATGATGAAGGCGCGGAAATAGACGTACCTGGGAAAAAGCCGCAACAAGTGAACGTCGGGGAC CAGCTCAAGAAAACGTTAGAAAAAAATAAAAAACTCGGTTGGACTTTTGTAAGTGAGGATGAAGCGAAAAAAGGCGTGAA AAGTGGGAAATACTACGCGTCTATTCATATTCCAAAAGATTTTTCAGAAGATATGGTTTCGGTCGTAAATGATAATGTTA CCAAACCGACAATCGATTATTCCGTCAATGAAAAAATCAATGCTATCGCGCCAAAAATGACCGAGAGTGGCGCAACGACG ATTGTAAATCAAATTAGTTCTGAGTTTGTCGGCACAGTTAGTAAAGCCGTTTTGGAAGAGTTTAATAAAGCGGGGATTGA TCTTGAAAATGAATTGCCAACAATTCGTCGCCTAAAAACCAAGGTATTCCAAGTGCAGGATGCTTTACCAGAACTGAAAA AAATGGGAGCAGAAGCGGTCAAAATAGAAGCCAAACTACCCGAACTAAAAGCCAAAGCAAACCAAGTTGTCGAGCTAAAT GAAAAAATTCCTGAACTAAATAAAGCAACAGAAAACGTCTTATTAGTGGAACAACAACTACCAAAAATTGACCAACTCGG GCAAGATATTTTAGTGCTCCAAAAGAAAATCCCGGAAATCAAACAAATCGCCGAATCGGTAAAAGAAGTAGATGAAAACT TCGGAACGATTAAGAAAACGGTCAATGACGCAGTGAATGAATCGGGCAAAGCGCTTGATGTGATTGATACAGCAATGGCG GCAATTCCAACGGTAGAAAAAATTGCTCAAAATGGCAGCGGCTATGTGGATAAAGTATCTGATTTTGCGGATGAAATCAA TAAGTCCTTTGATACGTTAGCGCCTGCTATTAAACAAAACTTAACGCTAATGAAGCAAATGGCGGACAACATCTATCAAG TGACAGAAGCAATCAAAAATGGCTCAATCACGCCAGAACAAGCTATTACGGAATTGAAAAAAATGGAGCAAGATATTGAT TCCTTACAACAAATGATTACCAAACAAACCGCGACATTAGAAAGTTTAAATGAAACATTGCCGAATAAGCCATTTACTGA TTTAATTGCGAATTTAAAAACGATTAATAGCCAGTTAGGCGCGCAAAAAGAAACGATTACAAAAGTACGCACAGAACTTG AAAATGGCGCGCAACCTTCCGAGGAACTTTTAAATCAACTGAATGAACAAGCGAAAAAAGTTAGCGCGAAGTTAGACCAA ATTTTAGCGAACTATGATTCTGAAATCGTTCCAGCAATTAAAGTCGGCTTAAACCAAATTCAAGGAGATTTGAAAGACAG CCAGAAACTATTAGAAACCCTACAAGCGAAAATCCCAGAAATTACGCAGGTTTTAAAAGATTCGAGGGAAACACTACAAA CCGGTCAAACATACTTAAAAGAATTCCAAGAACGCTTACCAGAAATTCAAAAAACGTTAGATGAAGCGACAAAAGTAATC AACACCAAGCTCGACACGATTATCGCAGGCATTAACGAAGCAGCCAACTTTTACCAAAACGATTATCCGAATGTAAAAGC GAACATAAAAAAAGCGGCCAACTTCATTCGTGATGATTTACCAGGGCTTGAAAAAGAAATAAATCAAGCCTCCAATCTCA TCCAAGAAAAAATGCCGGAATTCGAAAAAGCGATTAAAATTGCGGCCGATCTTTCGAGGGAAGAATTGCCGGAATTCGAA AAAGCCATTAATAATGCAGCGAATAAAATTACCGATTTCGATAAAAATTACGATTTGCAAAGCATTATTAAGATGCTCAG AAATGACGCAGATAAAGATAGTTCATTTATTGCCAATCCAGTTAAGTTAAAAGAAACAAGCTACTATCCAATTCCAAATT ATGGTTCGGCAAGTTCGCCATTTTATACAGCTCTTTGTTTATGGGTCGGTGCGCTCTTGTTGATTTCGTTATTACGTGTG GATGTAGAAGTGCCGGCAGGAATTTTCAGCCATTATCACCGATATTTTGGCCGATTGCTGACCTTCCTATCTATCGGATT AATGCAGGCGCTTATCGTGACGCTCGGGAATATTTTCTTGCTCGGGGTATCCATCGCAGAACCATTACTACATGTACTAT TCAGCATGTTTATCAGCGTGGTGTTCATGACAATTGTCTACACGCTCGTATCGCTATTTAATAATGTTGGAAAAGGGATT GCGATTATCTTGTTAGTTTTACAAATTTCAGGAGCAGGCGGGAACTTTCCAATTCAAGTTTCGCCACCATTTTTCCAAGC TATTTATCCTTTCTTGCCATTCACTTATGCCGTTAGTTTAATTCGGGAAAGTGTTGGGGGGCTTTATATGCCAACGGTTT GGATCGATATGAGTGTTCTTGCCGGATTTGCCATTCTCTTTATCACGCTAGGCATTTTACTCAAAAAACCACTAGACAAA GTAGTACCCAAGCTATCAGAAAAAGCAAAACGAAGCAAGCTCATCCATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCAAAAGAGGTAATACAAAAATTAGTGAATTTGTATATTATCCGTACATTTAGATAGTATTTCTAAAGGTAAATTGCTT AAAAACAGGAGGTGCTTTTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTTTTTCTGTGATATAATTACGAGCGAAGAGGGGGCAGACTTTGTGGCAAACAAATTTAAAACATTAGATAAGATGGT GTATAATCTACTTCTTGAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896
Protein sequence:
>896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEIDVPGKKPQQVNVGD QLKKTLEKNKKLGWTFVSEDEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVTKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKAVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGAEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIAESVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMA AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFADEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSITPEQAITELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIANLKTINSQLGAQKETITKVRTELENGAQPSEELLNQLNEQAKKVSAKLDQ ILANYDSEIVPAIKVGLNQIQGDLKDSQKLLETLQAKIPEITQVLKDSRETLQTGQTYLKEFQERLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAANFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAADLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVKLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWIDMSVLAGFAILFITLGILLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH
Sequences:
>Translated_896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEIDVPGKKPQQVNVGD QLKKTLEKNKKLGWTFVSEDEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVTKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKAVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGAEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIAESVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMA AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFADEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSITPEQAITELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIANLKTINSQLGAQKETITKVRTELENGAQPSEELLNQLNEQAKKVSAKLDQ ILANYDSEIVPAIKVGLNQIQGDLKDSQKLLETLQAKIPEITQVLKDSRETLQTGQTYLKEFQERLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAANFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAADLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVKLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWIDMSVLAGFAILFITLGILLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH >Mature_896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEIDVPGKKPQQVNVGD QLKKTLEKNKKLGWTFVSEDEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVTKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKAVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGAEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIAESVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMA AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFADEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSITPEQAITELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIANLKTINSQLGAQKETITKVRTELENGAQPSEELLNQLNEQAKKVSAKLDQ ILANYDSEIVPAIKVGLNQIQGDLKDSQKLLETLQAKIPEITQVLKDSRETLQTGQTYLKEFQERLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAANFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAADLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVKLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWIDMSVLAGFAILFITLGILLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99683; Mature: 99683
Theoretical pI: Translated: 5.19; Mature: 5.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSID CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEC DEGAEIDVPGKKPQQVNVGDQLKKTLEKNKKLGWTFVSEDEAKKGVKSGKYYASIHIPKD CCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC FSEDMVSVVNDNVTKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATTIVNQISSEFVGTVSKAVLEE HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGAEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHH EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIAESVKEVDENFGTIKKT HHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNDAVNESGKALDVIDTAMAAIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFADEINKSFDTLAPAIKQN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSITPEQAITELKKMEQDIDSLQQMITKQTATLESLNETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNKPFTDLIANLKTINSQLGAQKETITKVRTELENGAQPSEELLNQLNEQAKKVSAKLDQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILANYDSEIVPAIKVGLNQIQGDLKDSQKLLETLQAKIPEITQVLKDSRETLQTGQTYLK HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EFQERLPEIQKTLDEATKVINTKLDTIIAGINEAANFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAADLSREELPEFEKAINNAANKITDFDKNYDLQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH SIIKMLRNDADKDSSFIANPVKLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV HHHHHHHCCCCCCHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISV HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMTIVYTLVSLFNNVGKGIAIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSL HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRESVGGLYMPTVWIDMSVLAGFAILFITLGILLKKPLDKVVPKLSEKAKRSKLIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSID CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEC DEGAEIDVPGKKPQQVNVGDQLKKTLEKNKKLGWTFVSEDEAKKGVKSGKYYASIHIPKD CCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC FSEDMVSVVNDNVTKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATTIVNQISSEFVGTVSKAVLEE HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGAEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHH EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIAESVKEVDENFGTIKKT HHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNDAVNESGKALDVIDTAMAAIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFADEINKSFDTLAPAIKQN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSITPEQAITELKKMEQDIDSLQQMITKQTATLESLNETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNKPFTDLIANLKTINSQLGAQKETITKVRTELENGAQPSEELLNQLNEQAKKVSAKLDQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILANYDSEIVPAIKVGLNQIQGDLKDSQKLLETLQAKIPEITQVLKDSRETLQTGQTYLK HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EFQERLPEIQKTLDEATKVINTKLDTIIAGINEAANFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAADLSREELPEFEKAINNAANKITDFDKNYDLQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH SIIKMLRNDADKDSSFIANPVKLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV HHHHHHHCCCCCCHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISV HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMTIVYTLVSLFNNVGKGIAIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSL HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRESVGGLYMPTVWIDMSVLAGFAILFITLGILLKKPLDKVVPKLSEKAKRSKLIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]