Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfmI [H]

Identifier: 225861996

GI number: 225861996

Start: 2045187

End: 2046365

Strand: Reverse

Name: yfmI [H]

Synonym: SPT_2193

Alternate gene names: 225861996

Gene position: 2046365-2045187 (Counterclockwise)

Preceding gene: 225861998

Following gene: 225861995

Centisome position: 96.89

GC content: 33.76

Gene sequence:

>1179_bases
ATGTCTAATTCATTTGTCAAGTTGTTAGTCTCTCAATTATTTGCAAATTTAGCAGATATTTTCTTTAGAGTAACAATCAT
TGCTAACATATACATTATTTCAAAATCAGTAATTGCCACATCACTAGTTCCTATCTTAATAGGAATATCCTCTTTTGTTG
CGAGTCTTTTAGTTCCGTTGGTTACTAAAAGGTTAGCGCTAAATAGGGTTTTATCTTTATCTCAATTTGGAAAGACTATA
TTATTGGCGATACTGGTAGGAATGTTTACCGTAATGCAATCCGTAGCGCCTTTGGTGACCTATCTATTTGTTGTTGCAAT
TTCCATACTAGATGGTTTTGCAGCACCCGTTTCCTATGCTATTGTGCCACGCTATGCGACCGATTTGGGTAAGGCTAATT
CAGCCTTATCAATGACTGGTGAAGCTGTTCAATTGATAGGTTGGGGATTAGGTGGACTCTTGTTTGCAACAATTGGTCTG
TTACCTACCACGTGTATCAATTTAGTCTTGTATATCATTTCTAGCTTTCTGATGTTATTTCTTCCTAACGCTGAAGTGGA
GGTGTTAGAGTCAGAAACTAATCTTGAAATTTTGCTCAAAGGTTGGAAGTTAGTTGCTAGAAATCCTAGATTAAGACTTT
TTGTATCAGCAAATTTATTGGAAATTTTTTCAAATACGATTTGGGTTTCTTCCATTATACTTGTTTTTGTAACGGAGTTA
TTAAATAAAACGGAAAGTTACTGGGGATATTCTAATACAGCATACTCTATTGGTATTATAATTAGTGGCTTAATTGCTTT
TAGGCTATCTGAAAAGTTCCTTGCTGCTAAATGGGAAAGTATTCTTTTTCCTCTTGTAGCTATGGCAATAGTGACACTGA
CTATTCTATATTTTCCAAACGCACAGATGTTTTTATTATTTTCAGCTTTAGTTGGTATGTTATCGCAACTAAAAGAAGTT
CCTGAAAGTGTATTTCTTCAGGAAACAGTAGAGGAAAATCATTTAGTTAATGTCTATTCCGTTCTTGAAGTGATTTCTAC
ATTAGCATTTTCAGTATTTGTTTTGCTAATGAGCTATATTACTGAGAGTTTTGGTATTAGCATCAGTTTTTGGCTATCAG
CCATTTGTCTGATGATAGAAGCTATTTTAATTTATATCAGACGAGATTATTTTAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCATGTAAAAAACCTCACTTTTGTTTTCTGCTATTTTATGCTAAAATATTAAAAATCAAATTTAATTCCAAAGTTTGT
AACTAAAGGGGGAGCGCTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGAGTGGTTAAAAAGTCTTTAAAAATCAGAAAAGCGCATAGTATCAGGTGTTGAAAAAACTTGATATTGTGTGTTTTAT
TATGGGAAGATTTACTTCAT

Product: permease of the major facilitator superfamily

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 392; Mature: 391

Protein sequence:

>392_residues
MSNSFVKLLVSQLFANLADIFFRVTIIANIYIISKSVIATSLVPILIGISSFVASLLVPLVTKRLALNRVLSLSQFGKTI
LLAILVGMFTVMQSVAPLVTYLFVVAISILDGFAAPVSYAIVPRYATDLGKANSALSMTGEAVQLIGWGLGGLLFATIGL
LPTTCINLVLYIISSFLMLFLPNAEVEVLESETNLEILLKGWKLVARNPRLRLFVSANLLEIFSNTIWVSSIILVFVTEL
LNKTESYWGYSNTAYSIGIIISGLIAFRLSEKFLAAKWESILFPLVAMAIVTLTILYFPNAQMFLLFSALVGMLSQLKEV
PESVFLQETVEENHLVNVYSVLEVISTLAFSVFVLLMSYITESFGISISFWLSAICLMIEAILIYIRRDYFK

Sequences:

>Translated_392_residues
MSNSFVKLLVSQLFANLADIFFRVTIIANIYIISKSVIATSLVPILIGISSFVASLLVPLVTKRLALNRVLSLSQFGKTI
LLAILVGMFTVMQSVAPLVTYLFVVAISILDGFAAPVSYAIVPRYATDLGKANSALSMTGEAVQLIGWGLGGLLFATIGL
LPTTCINLVLYIISSFLMLFLPNAEVEVLESETNLEILLKGWKLVARNPRLRLFVSANLLEIFSNTIWVSSIILVFVTEL
LNKTESYWGYSNTAYSIGIIISGLIAFRLSEKFLAAKWESILFPLVAMAIVTLTILYFPNAQMFLLFSALVGMLSQLKEV
PESVFLQETVEENHLVNVYSVLEVISTLAFSVFVLLMSYITESFGISISFWLSAICLMIEAILIYIRRDYFK
>Mature_391_residues
SNSFVKLLVSQLFANLADIFFRVTIIANIYIISKSVIATSLVPILIGISSFVASLLVPLVTKRLALNRVLSLSQFGKTIL
LAILVGMFTVMQSVAPLVTYLFVVAISILDGFAAPVSYAIVPRYATDLGKANSALSMTGEAVQLIGWGLGGLLFATIGLL
PTTCINLVLYIISSFLMLFLPNAEVEVLESETNLEILLKGWKLVARNPRLRLFVSANLLEIFSNTIWVSSIILVFVTELL
NKTESYWGYSNTAYSIGIIISGLIAFRLSEKFLAAKWESILFPLVAMAIVTLTILYFPNAQMFLLFSALVGMLSQLKEVP
ESVFLQETVEENHLVNVYSVLEVISTLAFSVFVLLMSYITESFGISISFWLSAICLMIEAILIYIRRDYFK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43345; Mature: 43214

Theoretical pI: Translated: 6.02; Mature: 6.02

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNSFVKLLVSQLFANLADIFFRVTIIANIYIISKSVIATSLVPILIGISSFVASLLVPL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTKRLALNRVLSLSQFGKTILLAILVGMFTVMQSVAPLVTYLFVVAISILDGFAAPVSYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVPRYATDLGKANSALSMTGEAVQLIGWGLGGLLFATIGLLPTTCINLVLYIISSFLMLF
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPNAEVEVLESETNLEILLKGWKLVARNPRLRLFVSANLLEIFSNTIWVSSIILVFVTEL
CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKTESYWGYSNTAYSIGIIISGLIAFRLSEKFLAAKWESILFPLVAMAIVTLTILYFPN
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AQMFLLFSALVGMLSQLKEVPESVFLQETVEENHLVNVYSVLEVISTLAFSVFVLLMSYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TESFGISISFWLSAICLMIEAILIYIRRDYFK
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SNSFVKLLVSQLFANLADIFFRVTIIANIYIISKSVIATSLVPILIGISSFVASLLVPL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTKRLALNRVLSLSQFGKTILLAILVGMFTVMQSVAPLVTYLFVVAISILDGFAAPVSYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVPRYATDLGKANSALSMTGEAVQLIGWGLGGLLFATIGLLPTTCINLVLYIISSFLMLF
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPNAEVEVLESETNLEILLKGWKLVARNPRLRLFVSANLLEIFSNTIWVSSIILVFVTEL
CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKTESYWGYSNTAYSIGIIISGLIAFRLSEKFLAAKWESILFPLVAMAIVTLTILYFPN
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
AQMFLLFSALVGMLSQLKEVPESVFLQETVEENHLVNVYSVLEVISTLAFSVFVLLMSYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TESFGISISFWLSAICLMIEAILIYIRRDYFK
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9272861; 9384377 [H]