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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 220931960

GI number: 220931960

Start: 1214101

End: 1215402

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: Hore_11210

Alternate gene names: 220931960

Gene position: 1214101-1215402 (Clockwise)

Preceding gene: 220931959

Following gene: 220931961

Centisome position: 47.09

GC content: 34.79

Gene sequence:

>1302_bases
ATGTCCTCTAAAGAGAAGAGTATTTTTAGAAACACCAATTTCTTGTTATTATTTACTGGCGGGCTTGTTTCTCGAATCGG
TAATGCGGTTCACTATGTGGGGTTAACCTGGTTTGTTCTGGAACTGACCGGAAGTGGAGCTGCAACAGGAATTATTTTAT
TTCTGTCTACCATACCCGGGGTAATTGTCAGTCCTTTTGGTGGAGTAGTAGCTGACAGAGTCAGCAGGAAACTCCTTATT
GTCGGGATGGATTTAATCAGGGGTATAGCTGTAATATTTTTAAGCTGGGCTATATATACAGATGTTGTAACTTTTATTCA
CCTTGCTGTTATTACTGTTATTCTGGCTGTTTGTGGTTCTTTTTTCAACCCGGCAGTTTCGGCAACTATTCCCAATATTG
TCCTTGATAGAAATTTACAGAAAGCCAACTCCATTGAACATTTTAGTCAAAACTTTTCACAGGTAATCGGCTTTGCTCTT
GGGGGAATATTGATTGCCATCTTCGGGGTCGCTGGTGTCTTTCTCCTTAATGGAATATCTTTTATTATCTCAGCAATATC
TGAGCTTTTTATAAATATCCCACCTGTAGAAAAAACATTAATAAAACATAAGACATCTTTTTTCTCTGACTTTAAGTTTG
GAGTAAAATATTTATTCAAACATAAAACAATTTTGTCACTATTTAACACTGCATTATTTTTAAATTTTATTACATCTGGA
ATTATGGCAGTTGGAATACCGTATGTTTTTAAGGAAGTTATTGCTGTAGGAAGCAAATTATTTGGTTTTGCTCAGGCTGT
AACTCCAGCCGGGGCTTTTATTGGTGCAATAGTAATGAATTTTTTACCCGAAATTAAAAAGTACTATAAAGTTTTTATTA
TAAATATAACAATACTGGCTCTTTTATTACTGGGATTTAGCTTTACTATAATGCCTTCAGTATTCAAAGCTTATGGGGTT
AATAATGTTTATCTGACATTATTGGTTATCCTGGCAACGCTGGGTATTATTAATGCCATTATAAATATACCGATAATGGT
CTTACTACAACGAATAATTCCTGATGAGATCCGGGGAAGAATATTTGGTTTGATTATGTCATTGAGCCAGGGTCTGGTGC
CTATCTCCATGGCAATTACAGGTTATCTCTTTGACTTAATAGCTGCCTATTTACTATTTGCATATACAGGTGGTTTTACT
TTAGTTGTTGCCTTTGTTATGACCAGAGTAAAAGCCCTTAGAAATTTAAATAAAAAAGCAGAAGATAATATAATGACAGA
TGATGTTGACTATTCTATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATAATCATAAAACATTATATATTTTTTATCATAATATTAGATGGTTGTATAAAATAAGGTTTTAGAATTCTAAAAAATA
AAAAGGAAGGGGTTTATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTATCTATTAATGAGGAGGAGTAAACATTGAAGATAAATACATCCAACATTATACTTCATACTAATTCAAGTTACGAA
TTACTGATAAGCTTAATCAG

Product: major facilitator superfamily protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 432

Protein sequence:

>433_residues
MSSKEKSIFRNTNFLLLFTGGLVSRIGNAVHYVGLTWFVLELTGSGAATGIILFLSTIPGVIVSPFGGVVADRVSRKLLI
VGMDLIRGIAVIFLSWAIYTDVVTFIHLAVITVILAVCGSFFNPAVSATIPNIVLDRNLQKANSIEHFSQNFSQVIGFAL
GGILIAIFGVAGVFLLNGISFIISAISELFINIPPVEKTLIKHKTSFFSDFKFGVKYLFKHKTILSLFNTALFLNFITSG
IMAVGIPYVFKEVIAVGSKLFGFAQAVTPAGAFIGAIVMNFLPEIKKYYKVFIINITILALLLLGFSFTIMPSVFKAYGV
NNVYLTLLVILATLGIINAIINIPIMVLLQRIIPDEIRGRIFGLIMSLSQGLVPISMAITGYLFDLIAAYLLFAYTGGFT
LVVAFVMTRVKALRNLNKKAEDNIMTDDVDYSM

Sequences:

>Translated_433_residues
MSSKEKSIFRNTNFLLLFTGGLVSRIGNAVHYVGLTWFVLELTGSGAATGIILFLSTIPGVIVSPFGGVVADRVSRKLLI
VGMDLIRGIAVIFLSWAIYTDVVTFIHLAVITVILAVCGSFFNPAVSATIPNIVLDRNLQKANSIEHFSQNFSQVIGFAL
GGILIAIFGVAGVFLLNGISFIISAISELFINIPPVEKTLIKHKTSFFSDFKFGVKYLFKHKTILSLFNTALFLNFITSG
IMAVGIPYVFKEVIAVGSKLFGFAQAVTPAGAFIGAIVMNFLPEIKKYYKVFIINITILALLLLGFSFTIMPSVFKAYGV
NNVYLTLLVILATLGIINAIINIPIMVLLQRIIPDEIRGRIFGLIMSLSQGLVPISMAITGYLFDLIAAYLLFAYTGGFT
LVVAFVMTRVKALRNLNKKAEDNIMTDDVDYSM
>Mature_432_residues
SSKEKSIFRNTNFLLLFTGGLVSRIGNAVHYVGLTWFVLELTGSGAATGIILFLSTIPGVIVSPFGGVVADRVSRKLLIV
GMDLIRGIAVIFLSWAIYTDVVTFIHLAVITVILAVCGSFFNPAVSATIPNIVLDRNLQKANSIEHFSQNFSQVIGFALG
GILIAIFGVAGVFLLNGISFIISAISELFINIPPVEKTLIKHKTSFFSDFKFGVKYLFKHKTILSLFNTALFLNFITSGI
MAVGIPYVFKEVIAVGSKLFGFAQAVTPAGAFIGAIVMNFLPEIKKYYKVFIINITILALLLLGFSFTIMPSVFKAYGVN
NVYLTLLVILATLGIINAIINIPIMVLLQRIIPDEIRGRIFGLIMSLSQGLVPISMAITGYLFDLIAAYLLFAYTGGFTL
VVAFVMTRVKALRNLNKKAEDNIMTDDVDYSM

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47236; Mature: 47105

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSKEKSIFRNTNFLLLFTGGLVSRIGNAVHYVGLTWFVLELTGSGAATGIILFLSTIPG
CCCCHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCH
VIVSPFGGVVADRVSRKLLIVGMDLIRGIAVIFLSWAIYTDVVTFIHLAVITVILAVCGS
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFNPAVSATIPNIVLDRNLQKANSIEHFSQNFSQVIGFALGGILIAIFGVAGVFLLNGIS
HCCCHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIISAISELFINIPPVEKTLIKHKTSFFSDFKFGVKYLFKHKTILSLFNTALFLNFITSG
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMAVGIPYVFKEVIAVGSKLFGFAQAVTPAGAFIGAIVMNFLPEIKKYYKVFIINITILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLGFSFTIMPSVFKAYGVNNVYLTLLVILATLGIINAIINIPIMVLLQRIIPDEIRGR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
IFGLIMSLSQGLVPISMAITGYLFDLIAAYLLFAYTGGFTLVVAFVMTRVKALRNLNKKA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
EDNIMTDDVDYSM
HCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SSKEKSIFRNTNFLLLFTGGLVSRIGNAVHYVGLTWFVLELTGSGAATGIILFLSTIPG
CCCHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCH
VIVSPFGGVVADRVSRKLLIVGMDLIRGIAVIFLSWAIYTDVVTFIHLAVITVILAVCGS
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFNPAVSATIPNIVLDRNLQKANSIEHFSQNFSQVIGFALGGILIAIFGVAGVFLLNGIS
HCCCHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIISAISELFINIPPVEKTLIKHKTSFFSDFKFGVKYLFKHKTILSLFNTALFLNFITSG
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMAVGIPYVFKEVIAVGSKLFGFAQAVTPAGAFIGAIVMNFLPEIKKYYKVFIINITILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLGFSFTIMPSVFKAYGVNNVYLTLLVILATLGIINAIINIPIMVLLQRIIPDEIRGR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
IFGLIMSLSQGLVPISMAITGYLFDLIAAYLLFAYTGGFTLVVAFVMTRVKALRNLNKKA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
EDNIMTDDVDYSM
HCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]