| Definition | Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011753 |
| Length | 3,299,303 |
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The map label for this gene is 218709363
Identifier: 218709363
GI number: 218709363
Start: 1479567
End: 1481633
Strand: Direct
Name: 218709363
Synonym: VS_1372
Alternate gene names: NA
Gene position: 1479567-1481633 (Clockwise)
Preceding gene: 218709362
Following gene: 218709364
Centisome position: 44.84
GC content: 44.03
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGGAGCTTATCCCACTCCCCAAGAACCGCTGATGCGGAAGAGTCTGGTGTATGGCTCTCCGTCGGAGATTTGATGTCA GTCCTACTGATGATCTTCGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 688
Protein sequence:
>688_residues MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV
Sequences:
>Translated_688_residues MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV >Mature_688_residues MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75593; Mature: 75593
Theoretical pI: Translated: 4.50; Mature: 4.50
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEP CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC ESLSEPQLKWLAEHLIYTPTENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTS CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH IGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTAFYTSLAGLSSSAVFMALMKV HCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH SSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVE HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVDKMKSELIDPVSEELKKTSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDT HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGASKGLEEQRDAFELSAGRASA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH AFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRN HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC GLNEVVENFRKVFESEYQARHNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH DAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFSRANESFETFFNDFDQSASTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH HNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV HHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEP CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC ESLSEPQLKWLAEHLIYTPTENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTS CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH IGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTAFYTSLAGLSSSAVFMALMKV HCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH SSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVE HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVDKMKSELIDPVSEELKKTSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDT HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGASKGLEEQRDAFELSAGRASA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH AFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRN HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC GLNEVVENFRKVFESEYQARHNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH DAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFSRANESFETFFNDFDQSASTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH HNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV HHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA