Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
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Accession | NC_010981 |
Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is 190571496
Identifier: 190571496
GI number: 190571496
Start: 1191159
End: 1192970
Strand: Reverse
Name: 190571496
Synonym: WPa_1113
Alternate gene names: NA
Gene position: 1192970-1191159 (Counterclockwise)
Preceding gene: 190571497
Following gene: 190571495
Centisome position: 80.47
GC content: 31.24
Gene sequence:
>1812_bases ATGATAGGTGTTTCCCAAATACAATTTCCTGGAAAGGATTCTTACAGATTAAAGACAGCAAGTTACTTCGCAGCTTTTGT TTCTTTAAGCATTTTAGTTAATCCTGCCAATGTCTTTTTATCTTTTGCCACATTGTTTTTTAGATCTGAAATAAAAACTT TTTACGTTTATAAAGACATAAAAGCTGCAAAGCAGGAAAAAATAAGTAAAAAGGAATATTGGGAAATATTTTTTGAGAAA AATAAAATTAAGATAGCATCTTTCCTTTTATTTTTTGCCTCTATAACATATATAACTTTTACAACTACTTTCCTGCTTGT TTCGTTACTTGCAACAATACCACTTGCAATGATTTTAATTCTATTACAAAGTGAATTAAGGCCAAAGGATTTTAATCCAT TTACGTTACTCAAAGCTGCTATTAGTTTCTTTTTAGAAGGCATAAAAGAAAACTCACGTGGGCTAGTCAATAGCTTTGAT ATTAAGCTTGAACATTTACTACCCCATCAATTAAATAATGATATCATTAAAAATATTGACAAATTAAAAGATAAATATAC TGAACAAGTATCTGAAGACACTATTAATAATGAGGGATTTAAAGAATTTATTGAATATATAAATCACTTACATATGCTTG ATGGCCAACCATTTAGTAATGAGAATAAGGGAAAATTAGTAATGTTTTTGCAAGATTTTTGCAAAGGTAATGAGAAACAT AGCTCTGGCTTCACTGGTGGACAAATTCTTCTGTTAGTTCTTAGAGCCTGCAATGATGGAGATAGAGAAGCTGTAAAAAA TAAAAAAGACGCGTTGATTGCAAATTTACTAGATAGCCAAACTTTCTCTAGAAAAGAACGAATTCCTAACACATGTTTTA CTGGTGTTATCTACAGAATGTTAAGTACATTAGAGGGTATTCATTCCGATCCAGAGATTAAATTTACACCACCTAGACAA ATGCTCCTTACAGAAGCAGAAAATGAAGCACGTAAGTTTATGTTAGACAGGCTAAAAAATAAGAAGAACAGTAAAGAAAT TCTTAGGGCTTGGCATAACGCCCAAAATAATTATGAAGATGATAAAAGTCAAAAAATAGTTGATGATTTTATTGCAGAAG TAAGCGTTCCTTTAATGAGAAGGTTGCTAAGTTTTACTTCTCAGTATAGTGAACAAATTGTGCTGACATTAATGAAAAAT ATCAGCTCTGTAAAGTTAAATAAATTAGAGCACTTTGTGTTGGGTCAGCACATGAGAGATAGACTGCAGGAGCATGCTTT AGATGACCAACTCGAAAATATCAAAGAAAAAGTCTTTTTGAAGCTTTTAAACCAAAATTTACTTAGGATAGATTTTTCTC TTAAGGATTCATTTTTGAATGAAGCTAAGGGAATAGCTGACGAAATAATAAAAGAAGAAGTAGAGAAATTTAGGTCAGAA ACTGCTGAAAAGGCTAGGAAAGTTAACCCTATAGAAGCTCAAATAGATGCTACATTGCAAAATCTGTCAGCCTTGCCACG AGAAAGGAAGTGTTGCATTGCATATAACAGACTAAATGGACAATATAAAGGTGATAAAAGAGAAATAATGGAGAACATCT TACTAAAAAAATTAGAGATAACGAAAGAAGAAATGAATAAGATGCTAGAAGAGTATGATATACGTAAGCTAAAATTAGCA CTTGATGATGCATGTAAAAAAAGTGGAAAAAACATGGAAGAAATAATAAAAGAAGTAGAAGAAGTAGTCTCAAGTCATCT CTCACATGGAGTATCCGCTAGTAACCTCAGTTATGGATTAGAAAATAGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTGAATACGATGAGTGCGTAGACAGTAAAATACTTAAGCATTGACATCTATAGGCTATTTGTTATTACTACAATATCAT AATATTATAGAGAGTAGACT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGTATAACTAAGAAGAGGGAAACAGGGTAAACTCGAGTATTTTAGTAATAATAAGAGGTTACCCATGAAGAAAGATATT ACAGAACTGTACTGTTGCGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 603; Mature: 603
Protein sequence:
>603_residues MIGVSQIQFPGKDSYRLKTASYFAAFVSLSILVNPANVFLSFATLFFRSEIKTFYVYKDIKAAKQEKISKKEYWEIFFEK NKIKIASFLLFFASITYITFTTTFLLVSLLATIPLAMILILLQSELRPKDFNPFTLLKAAISFFLEGIKENSRGLVNSFD IKLEHLLPHQLNNDIIKNIDKLKDKYTEQVSEDTINNEGFKEFIEYINHLHMLDGQPFSNENKGKLVMFLQDFCKGNEKH SSGFTGGQILLLVLRACNDGDREAVKNKKDALIANLLDSQTFSRKERIPNTCFTGVIYRMLSTLEGIHSDPEIKFTPPRQ MLLTEAENEARKFMLDRLKNKKNSKEILRAWHNAQNNYEDDKSQKIVDDFIAEVSVPLMRRLLSFTSQYSEQIVLTLMKN ISSVKLNKLEHFVLGQHMRDRLQEHALDDQLENIKEKVFLKLLNQNLLRIDFSLKDSFLNEAKGIADEIIKEEVEKFRSE TAEKARKVNPIEAQIDATLQNLSALPRERKCCIAYNRLNGQYKGDKREIMENILLKKLEITKEEMNKMLEEYDIRKLKLA LDDACKKSGKNMEEIIKEVEEVVSSHLSHGVSASNLSYGLENR
Sequences:
>Translated_603_residues MIGVSQIQFPGKDSYRLKTASYFAAFVSLSILVNPANVFLSFATLFFRSEIKTFYVYKDIKAAKQEKISKKEYWEIFFEK NKIKIASFLLFFASITYITFTTTFLLVSLLATIPLAMILILLQSELRPKDFNPFTLLKAAISFFLEGIKENSRGLVNSFD IKLEHLLPHQLNNDIIKNIDKLKDKYTEQVSEDTINNEGFKEFIEYINHLHMLDGQPFSNENKGKLVMFLQDFCKGNEKH SSGFTGGQILLLVLRACNDGDREAVKNKKDALIANLLDSQTFSRKERIPNTCFTGVIYRMLSTLEGIHSDPEIKFTPPRQ MLLTEAENEARKFMLDRLKNKKNSKEILRAWHNAQNNYEDDKSQKIVDDFIAEVSVPLMRRLLSFTSQYSEQIVLTLMKN ISSVKLNKLEHFVLGQHMRDRLQEHALDDQLENIKEKVFLKLLNQNLLRIDFSLKDSFLNEAKGIADEIIKEEVEKFRSE TAEKARKVNPIEAQIDATLQNLSALPRERKCCIAYNRLNGQYKGDKREIMENILLKKLEITKEEMNKMLEEYDIRKLKLA LDDACKKSGKNMEEIIKEVEEVVSSHLSHGVSASNLSYGLENR >Mature_603_residues MIGVSQIQFPGKDSYRLKTASYFAAFVSLSILVNPANVFLSFATLFFRSEIKTFYVYKDIKAAKQEKISKKEYWEIFFEK NKIKIASFLLFFASITYITFTTTFLLVSLLATIPLAMILILLQSELRPKDFNPFTLLKAAISFFLEGIKENSRGLVNSFD IKLEHLLPHQLNNDIIKNIDKLKDKYTEQVSEDTINNEGFKEFIEYINHLHMLDGQPFSNENKGKLVMFLQDFCKGNEKH SSGFTGGQILLLVLRACNDGDREAVKNKKDALIANLLDSQTFSRKERIPNTCFTGVIYRMLSTLEGIHSDPEIKFTPPRQ MLLTEAENEARKFMLDRLKNKKNSKEILRAWHNAQNNYEDDKSQKIVDDFIAEVSVPLMRRLLSFTSQYSEQIVLTLMKN ISSVKLNKLEHFVLGQHMRDRLQEHALDDQLENIKEKVFLKLLNQNLLRIDFSLKDSFLNEAKGIADEIIKEEVEKFRSE TAEKARKVNPIEAQIDATLQNLSALPRERKCCIAYNRLNGQYKGDKREIMENILLKKLEITKEEMNKMLEEYDIRKLKLA LDDACKKSGKNMEEIIKEVEEVVSSHLSHGVSASNLSYGLENR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69642; Mature: 69642
Theoretical pI: Translated: 8.50; Mature: 8.50
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIGVSQIQFPGKDSYRLKTASYFAAFVSLSILVNPANVFLSFATLFFRSEIKTFYVYKDI CCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KAAKQEKISKKEYWEIFFEKNKIKIASFLLFFASITYITFTTTFLLVSLLATIPLAMILI HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLQSELRPKDFNPFTLLKAAISFFLEGIKENSRGLVNSFDIKLEHLLPHQLNNDIIKNID HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHH KLKDKYTEQVSEDTINNEGFKEFIEYINHLHMLDGQPFSNENKGKLVMFLQDFCKGNEKH HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCC SSGFTGGQILLLVLRACNDGDREAVKNKKDALIANLLDSQTFSRKERIPNTCFTGVIYRM CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LSTLEGIHSDPEIKFTPPRQMLLTEAENEARKFMLDRLKNKKNSKEILRAWHNAQNNYED HHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC DKSQKIVDDFIAEVSVPLMRRLLSFTSQYSEQIVLTLMKNISSVKLNKLEHFVLGQHMRD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLQEHALDDQLENIKEKVFLKLLNQNLLRIDFSLKDSFLNEAKGIADEIIKEEVEKFRSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAEKARKVNPIEAQIDATLQNLSALPRERKCCIAYNRLNGQYKGDKREIMENILLKKLEI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKEEMNKMLEEYDIRKLKLALDDACKKSGKNMEEIIKEVEEVVSSHLSHGVSASNLSYGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCC ENR CCC >Mature Secondary Structure MIGVSQIQFPGKDSYRLKTASYFAAFVSLSILVNPANVFLSFATLFFRSEIKTFYVYKDI CCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KAAKQEKISKKEYWEIFFEKNKIKIASFLLFFASITYITFTTTFLLVSLLATIPLAMILI HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLQSELRPKDFNPFTLLKAAISFFLEGIKENSRGLVNSFDIKLEHLLPHQLNNDIIKNID HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHH KLKDKYTEQVSEDTINNEGFKEFIEYINHLHMLDGQPFSNENKGKLVMFLQDFCKGNEKH HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCC SSGFTGGQILLLVLRACNDGDREAVKNKKDALIANLLDSQTFSRKERIPNTCFTGVIYRM CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LSTLEGIHSDPEIKFTPPRQMLLTEAENEARKFMLDRLKNKKNSKEILRAWHNAQNNYED HHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC DKSQKIVDDFIAEVSVPLMRRLLSFTSQYSEQIVLTLMKNISSVKLNKLEHFVLGQHMRD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLQEHALDDQLENIKEKVFLKLLNQNLLRIDFSLKDSFLNEAKGIADEIIKEEVEKFRSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAEKARKVNPIEAQIDATLQNLSALPRERKCCIAYNRLNGQYKGDKREIMENILLKKLEI HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKEEMNKMLEEYDIRKLKLALDDACKKSGKNMEEIIKEVEEVVSSHLSHGVSASNLSYGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCC ENR CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA