| Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010981 |
| Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is 190571007
Identifier: 190571007
GI number: 190571007
Start: 643950
End: 647204
Strand: Reverse
Name: 190571007
Synonym: WPa_0599
Alternate gene names: NA
Gene position: 647204-643950 (Counterclockwise)
Preceding gene: 190571008
Following gene: 190571006
Centisome position: 43.66
GC content: 35.05
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ACAAGTCAAGGAAGATTGATGAGATATATGGAGTAACTAATTAAAAAGATATTTGAAGTAAGGTTTTAGAAATTTATTCT GTATTGGAAAAAGTTTAGGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTCAAAGGGCTAAGTTATTATGGTCTTCAGCAAGACGAAGATGGTAATATCAAGTTAAACGATTACAATGATGTTTTAA ATGCGCGCAGAGCGAGGGTA
Product: TrlB/VirB6 plasmid conjugal transfer domain protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1084; Mature: 1084
Protein sequence:
>1084_residues MQSRLGKCWFRLLILVICVLVTGCSKNDMPFPRCISADYFGPEPIAIGAHFPIGHDAFFPEGESGEPIDPETGEINYGFH PNQVVKWKDTGLETNGDSLVVRVNGAWTSWSNSNKKKSQSSYSLESLEQLKYATKFERGKGDNSLPDFHLVCNDYKPSIQ KFSSKPKESCTVKCKCINEDDSANTVSRGAPCWFTNGHGAYLLFKRPSDSSPNENLKSMRNPESPTVHLGYNSVAEDGSG LFTLDRDNTTLQDRSCNTVRLEKGWKIYVKILDRYYLDNAGGYSFEFLSGVQKPSNFGFFDYIYNYLKCVLLINENCKKH FDSNDPAAAQAIFQNIAEKSTSFHNFVLSLLVLFIVISSLLYLFGMIRETKHDMLIRMMKITLVIVLISPGSFRFFYDHF LVLFVKGLEQLISIITNFAPNMNTGGNSNVAQGNEAKLFSFMEDMFNKFFAYSVWKKFAAFLHYQMWASLLMIPAIFIGI VLYFLLCMYAYIIFLSGFMGIAFLVAIMPLFLISILFSPLKSLFEGWIKFCISFCLQSIMIFTLLSLLAAMIMNTFYKQL GFTVCYNKWLEIKLCAPKWVFGGFCIIDKEYFSWTPGQIFVPYAIGEASTLNVDKNIEGIEKLSRIGGTVKFTGGAGYIP LPPDYINKGFRYIDYPFFNPIPGTKDNPADHYIAESDMIVSNGCSAKDLVRLTNSLSHASERADIILLINNIEKRIGDVS EIIKRYCQDINKCNSYREIINEIRSLVRSAIKKQGCRILKLHDLYKDSNSEYCQKCKDCEDCKNYKEDSDYQRVQDIQRG YLINAGEIFVLFLLSFLMFSLKEFVQQMGSSIAGGGFGVYNISSMYQASPVTGLMQGLKQQMQDKIGGGLESLGNWATHV PDRLAGGTANLLGRIPGVGGVLKYAINVPRKLVGATIEATKFATSPKNDVDKLEEKIYRAFGIDKEDIAHRRIDKYLEYY KGYVGSHLGYTIEDAMKFTWEHGLDSIGTNPATGEKDGYQHNLLYRAKTYRREFLEKLHDYTIGRKREPEEDESSKENKP NQSNRKLGTEPETLKNTTEAIRAGEDRERQDNERNENIENDEES
Sequences:
>Translated_1084_residues MQSRLGKCWFRLLILVICVLVTGCSKNDMPFPRCISADYFGPEPIAIGAHFPIGHDAFFPEGESGEPIDPETGEINYGFH PNQVVKWKDTGLETNGDSLVVRVNGAWTSWSNSNKKKSQSSYSLESLEQLKYATKFERGKGDNSLPDFHLVCNDYKPSIQ KFSSKPKESCTVKCKCINEDDSANTVSRGAPCWFTNGHGAYLLFKRPSDSSPNENLKSMRNPESPTVHLGYNSVAEDGSG LFTLDRDNTTLQDRSCNTVRLEKGWKIYVKILDRYYLDNAGGYSFEFLSGVQKPSNFGFFDYIYNYLKCVLLINENCKKH FDSNDPAAAQAIFQNIAEKSTSFHNFVLSLLVLFIVISSLLYLFGMIRETKHDMLIRMMKITLVIVLISPGSFRFFYDHF LVLFVKGLEQLISIITNFAPNMNTGGNSNVAQGNEAKLFSFMEDMFNKFFAYSVWKKFAAFLHYQMWASLLMIPAIFIGI VLYFLLCMYAYIIFLSGFMGIAFLVAIMPLFLISILFSPLKSLFEGWIKFCISFCLQSIMIFTLLSLLAAMIMNTFYKQL GFTVCYNKWLEIKLCAPKWVFGGFCIIDKEYFSWTPGQIFVPYAIGEASTLNVDKNIEGIEKLSRIGGTVKFTGGAGYIP LPPDYINKGFRYIDYPFFNPIPGTKDNPADHYIAESDMIVSNGCSAKDLVRLTNSLSHASERADIILLINNIEKRIGDVS EIIKRYCQDINKCNSYREIINEIRSLVRSAIKKQGCRILKLHDLYKDSNSEYCQKCKDCEDCKNYKEDSDYQRVQDIQRG YLINAGEIFVLFLLSFLMFSLKEFVQQMGSSIAGGGFGVYNISSMYQASPVTGLMQGLKQQMQDKIGGGLESLGNWATHV PDRLAGGTANLLGRIPGVGGVLKYAINVPRKLVGATIEATKFATSPKNDVDKLEEKIYRAFGIDKEDIAHRRIDKYLEYY KGYVGSHLGYTIEDAMKFTWEHGLDSIGTNPATGEKDGYQHNLLYRAKTYRREFLEKLHDYTIGRKREPEEDESSKENKP NQSNRKLGTEPETLKNTTEAIRAGEDRERQDNERNENIENDEES >Mature_1084_residues MQSRLGKCWFRLLILVICVLVTGCSKNDMPFPRCISADYFGPEPIAIGAHFPIGHDAFFPEGESGEPIDPETGEINYGFH PNQVVKWKDTGLETNGDSLVVRVNGAWTSWSNSNKKKSQSSYSLESLEQLKYATKFERGKGDNSLPDFHLVCNDYKPSIQ KFSSKPKESCTVKCKCINEDDSANTVSRGAPCWFTNGHGAYLLFKRPSDSSPNENLKSMRNPESPTVHLGYNSVAEDGSG LFTLDRDNTTLQDRSCNTVRLEKGWKIYVKILDRYYLDNAGGYSFEFLSGVQKPSNFGFFDYIYNYLKCVLLINENCKKH FDSNDPAAAQAIFQNIAEKSTSFHNFVLSLLVLFIVISSLLYLFGMIRETKHDMLIRMMKITLVIVLISPGSFRFFYDHF LVLFVKGLEQLISIITNFAPNMNTGGNSNVAQGNEAKLFSFMEDMFNKFFAYSVWKKFAAFLHYQMWASLLMIPAIFIGI VLYFLLCMYAYIIFLSGFMGIAFLVAIMPLFLISILFSPLKSLFEGWIKFCISFCLQSIMIFTLLSLLAAMIMNTFYKQL GFTVCYNKWLEIKLCAPKWVFGGFCIIDKEYFSWTPGQIFVPYAIGEASTLNVDKNIEGIEKLSRIGGTVKFTGGAGYIP LPPDYINKGFRYIDYPFFNPIPGTKDNPADHYIAESDMIVSNGCSAKDLVRLTNSLSHASERADIILLINNIEKRIGDVS EIIKRYCQDINKCNSYREIINEIRSLVRSAIKKQGCRILKLHDLYKDSNSEYCQKCKDCEDCKNYKEDSDYQRVQDIQRG YLINAGEIFVLFLLSFLMFSLKEFVQQMGSSIAGGGFGVYNISSMYQASPVTGLMQGLKQQMQDKIGGGLESLGNWATHV PDRLAGGTANLLGRIPGVGGVLKYAINVPRKLVGATIEATKFATSPKNDVDKLEEKIYRAFGIDKEDIAHRRIDKYLEYY KGYVGSHLGYTIEDAMKFTWEHGLDSIGTNPATGEKDGYQHNLLYRAKTYRREFLEKLHDYTIGRKREPEEDESSKENKP NQSNRKLGTEPETLKNTTEAIRAGEDRERQDNERNENIENDEES
Specific function: Unknown
COG id: COG3704
COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR007688 [H]
Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 122897; Mature: 122897
Theoretical pI: Translated: 7.20; Mature: 7.20
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS00079 MULTICOPPER_OXIDASE1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 4.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQSRLGKCWFRLLILVICVLVTGCSKNDMPFPRCISADYFGPEPIAIGAHFPIGHDAFFP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC EGESGEPIDPETGEINYGFHPNQVVKWKDTGLETNGDSLVVRVNGAWTSWSNSNKKKSQS CCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCCHHHHH SYSLESLEQLKYATKFERGKGDNSLPDFHLVCNDYKPSIQKFSSKPKESCTVKCKCINED HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCC DSANTVSRGAPCWFTNGHGAYLLFKRPSDSSPNENLKSMRNPESPTVHLGYNSVAEDGSG CCCCHHHCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHCCCCCC LFTLDRDNTTLQDRSCNTVRLEKGWKIYVKILDRYYLDNAGGYSFEFLSGVQKPSNFGFF EEEECCCCCEECCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH DYIYNYLKCVLLINENCKKHFDSNDPAAAQAIFQNIAEKSTSFHNFVLSLLVLFIVISSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLFGMIRETKHDMLIRMMKITLVIVLISPGSFRFFYDHFLVLFVKGLEQLISIITNFAP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NMNTGGNSNVAQGNEAKLFSFMEDMFNKFFAYSVWKKFAAFLHYQMWASLLMIPAIFIGI CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLYFLLCMYAYIIFLSGFMGIAFLVAIMPLFLISILFSPLKSLFEGWIKFCISFCLQSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFTLLSLLAAMIMNTFYKQLGFTVCYNKWLEIKLCAPKWVFGGFCIIDKEYFSWTPGQIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCEEEEEECCCHHHCCEEEEEHHHHCCCCCCEE VPYAIGEASTLNVDKNIEGIEKLSRIGGTVKFTGGAGYIPLPPDYINKGFRYIDYPFFNP EEEECCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCCEEECCCCCCC IPGTKDNPADHYIAESDMIVSNGCSAKDLVRLTNSLSHASERADIILLINNIEKRIGDVS CCCCCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHCHHH EIIKRYCQDINKCNSYREIINEIRSLVRSAIKKQGCRILKLHDLYKDSNSEYCQKCKDCE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHCCCCHHHHHHCCCHH DCKNYKEDSDYQRVQDIQRGYLINAGEIFVLFLLSFLMFSLKEFVQQMGSSIAGGGFGVY HHHCCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH NISSMYQASPVTGLMQGLKQQMQDKIGGGLESLGNWATHVPDRLAGGTANLLGRIPGVGG HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHCCHHHCCCHHHHHHCCCCCHH VLKYAINVPRKLVGATIEATKFATSPKNDVDKLEEKIYRAFGIDKEDIAHRRIDKYLEYY HHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH KGYVGSHLGYTIEDAMKFTWEHGLDSIGTNPATGEKDGYQHNLLYRAKTYRREFLEKLHD HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTIGRKREPEEDESSKENKPNQSNRKLGTEPETLKNTTEAIRAGEDRERQDNERNENIEN HCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHCCCCCC DEES CCCC >Mature Secondary Structure MQSRLGKCWFRLLILVICVLVTGCSKNDMPFPRCISADYFGPEPIAIGAHFPIGHDAFFP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC EGESGEPIDPETGEINYGFHPNQVVKWKDTGLETNGDSLVVRVNGAWTSWSNSNKKKSQS CCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCCHHHHH SYSLESLEQLKYATKFERGKGDNSLPDFHLVCNDYKPSIQKFSSKPKESCTVKCKCINED HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCC DSANTVSRGAPCWFTNGHGAYLLFKRPSDSSPNENLKSMRNPESPTVHLGYNSVAEDGSG CCCCHHHCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHCCCCCC LFTLDRDNTTLQDRSCNTVRLEKGWKIYVKILDRYYLDNAGGYSFEFLSGVQKPSNFGFF EEEECCCCCEECCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHH DYIYNYLKCVLLINENCKKHFDSNDPAAAQAIFQNIAEKSTSFHNFVLSLLVLFIVISSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLFGMIRETKHDMLIRMMKITLVIVLISPGSFRFFYDHFLVLFVKGLEQLISIITNFAP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NMNTGGNSNVAQGNEAKLFSFMEDMFNKFFAYSVWKKFAAFLHYQMWASLLMIPAIFIGI CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLYFLLCMYAYIIFLSGFMGIAFLVAIMPLFLISILFSPLKSLFEGWIKFCISFCLQSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFTLLSLLAAMIMNTFYKQLGFTVCYNKWLEIKLCAPKWVFGGFCIIDKEYFSWTPGQIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCEEEEEECCCHHHCCEEEEEHHHHCCCCCCEE VPYAIGEASTLNVDKNIEGIEKLSRIGGTVKFTGGAGYIPLPPDYINKGFRYIDYPFFNP EEEECCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCCEEECCCCCCC IPGTKDNPADHYIAESDMIVSNGCSAKDLVRLTNSLSHASERADIILLINNIEKRIGDVS CCCCCCCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHCHHH EIIKRYCQDINKCNSYREIINEIRSLVRSAIKKQGCRILKLHDLYKDSNSEYCQKCKDCE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHCCCCHHHHHHCCCHH DCKNYKEDSDYQRVQDIQRGYLINAGEIFVLFLLSFLMFSLKEFVQQMGSSIAGGGFGVY HHHCCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH NISSMYQASPVTGLMQGLKQQMQDKIGGGLESLGNWATHVPDRLAGGTANLLGRIPGVGG HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHCCHHHCCCHHHHHHCCCCCHH VLKYAINVPRKLVGATIEATKFATSPKNDVDKLEEKIYRAFGIDKEDIAHRRIDKYLEYY HHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH KGYVGSHLGYTIEDAMKFTWEHGLDSIGTNPATGEKDGYQHNLLYRAKTYRREFLEKLHD HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTIGRKREPEEDESSKENKPNQSNRKLGTEPETLKNTTEAIRAGEDRERQDNERNENIEN HCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHCCCCCC DEES CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA