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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 190570888

GI number: 190570888

Start: 501322

End: 502566

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: WPa_0465

Alternate gene names: 190570888

Gene position: 501322-502566 (Clockwise)

Preceding gene: 190570887

Following gene: 190570890

Centisome position: 33.82

GC content: 28.27

Gene sequence:

>1245_bases
ATGGTAAAAACAAATCGCTTGATTAGTAATACTAACTATATTAACTTAGTTATTGCTGACTTTATTTCCAGTTTAGGTGA
CTGGATGGTAATACCTATTATTGGCTCATTATTCTTTTATGATATTGGTTTATCATCACAAATGCTTGCTATTGTTGAAA
TTATTATTGCAGCTCCAAGCGTTTTTTTTGGATCAATTATAGGAGTATCTGTAGATAATAAAAATCCAATACCTATTTTG
ATTTATTCTGATATTTCTCGAGCAGTTTTATCAATTATTTTATATTTTTTAGCTTATCATTACGAAATAGTTTTGTTATT
ACTCTTTTTGGAGGGAATATGCCGTTGTTTTTTCTTACCTTCTAGGCAAATAGCCTTAAAAGTACTAGTTCTTAATGATC
TATTACCAAAAGCATCAGGTTTTTTGCATACTTCAAGTCAACTTGCAAAAATTATTGGTCCAGCATTTGGTGGTTTGTTG
ATCTTGTATTGCAATATAAAATTTTTGTTTATTATCAATGCCTTAACTTTTCTAGCATCTGCATGCTTTATCAAAGCTAT
TAGTCTACCTATGAAAATTACAGAAACAAAATTGTCTAACAATAAGATTAGTAAATTGACTTTTATATATAAGAAACTAA
TAAATGTTGCCAGTACAATTAAAAACAATAAGCTTTTAAGAATTGTTATTATTAATAGTGCATTAAGGTTTGCCATAATA
TTTATATTCGATCTTTATATAATAGTTTTCAACAAATTTATGAATTTTAGTGCATCAATATATGCAATAGCAATAAGTGC
TATAGGAATGGGCAGTGTTGTTGGTGCAGTAGTAGTTACTACTTACATTACGCGCTTTAGATACATACTGTTGATTTCTG
CAGGGCAAACTCTTGGTGGATTATTATTATTCCTTTTAGGTTCATTAGCTTTTTATCATATAAATTTGTCTGTGTATTTT
TATGTATTAATATGGTTTTTATTTGGAATAACGGGGGCGCTGATTAATGTACCATATGCTAGTCTATTACAGACAGAAGT
TGACCAAAGTATAATAGGCTCAGTTTCTGCCTTTAGCGAATCTATTCAAAACTTTTTCATGATTATTTCTCCTTTGGTTG
GTGCATTGCTAATCAGTTTTATTACAATTGATATAATGTTTTTATTAGTTGGCTTATTATTAGTGTTACTTGGACTATCA
TTAATAATGAATAATCAAAGATTGTTGCTAAGTAATTTTTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTAAGTATGAGTAATCATTTGGGTTCGAAATTTTATTTAAATAATGGCTTTCAAGCTAAAGCATATCACCTGTCATGTA
AAGTTTAATAGTATTAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAGTGCAGAACAGATCTTTTATGCTACCCTATAACCGATACAGGGAAAGTTTAGGGTTCTGTCGCATCTATAAATTG
TATTAAATAAGAGTCTGATA

Product: Major facilitator superfamily protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414

Protein sequence:

>414_residues
MVKTNRLISNTNYINLVIADFISSLGDWMVIPIIGSLFFYDIGLSSQMLAIVEIIIAAPSVFFGSIIGVSVDNKNPIPIL
IYSDISRAVLSIILYFLAYHYEIVLLLLFLEGICRCFFLPSRQIALKVLVLNDLLPKASGFLHTSSQLAKIIGPAFGGLL
ILYCNIKFLFIINALTFLASACFIKAISLPMKITETKLSNNKISKLTFIYKKLINVASTIKNNKLLRIVIINSALRFAII
FIFDLYIIVFNKFMNFSASIYAIAISAIGMGSVVGAVVVTTYITRFRYILLISAGQTLGGLLLFLLGSLAFYHINLSVYF
YVLIWFLFGITGALINVPYASLLQTEVDQSIIGSVSAFSESIQNFFMIISPLVGALLISFITIDIMFLLVGLLLVLLGLS
LIMNNQRLLLSNFF

Sequences:

>Translated_414_residues
MVKTNRLISNTNYINLVIADFISSLGDWMVIPIIGSLFFYDIGLSSQMLAIVEIIIAAPSVFFGSIIGVSVDNKNPIPIL
IYSDISRAVLSIILYFLAYHYEIVLLLLFLEGICRCFFLPSRQIALKVLVLNDLLPKASGFLHTSSQLAKIIGPAFGGLL
ILYCNIKFLFIINALTFLASACFIKAISLPMKITETKLSNNKISKLTFIYKKLINVASTIKNNKLLRIVIINSALRFAII
FIFDLYIIVFNKFMNFSASIYAIAISAIGMGSVVGAVVVTTYITRFRYILLISAGQTLGGLLLFLLGSLAFYHINLSVYF
YVLIWFLFGITGALINVPYASLLQTEVDQSIIGSVSAFSESIQNFFMIISPLVGALLISFITIDIMFLLVGLLLVLLGLS
LIMNNQRLLLSNFF
>Mature_414_residues
MVKTNRLISNTNYINLVIADFISSLGDWMVIPIIGSLFFYDIGLSSQMLAIVEIIIAAPSVFFGSIIGVSVDNKNPIPIL
IYSDISRAVLSIILYFLAYHYEIVLLLLFLEGICRCFFLPSRQIALKVLVLNDLLPKASGFLHTSSQLAKIIGPAFGGLL
ILYCNIKFLFIINALTFLASACFIKAISLPMKITETKLSNNKISKLTFIYKKLINVASTIKNNKLLRIVIINSALRFAII
FIFDLYIIVFNKFMNFSASIYAIAISAIGMGSVVGAVVVTTYITRFRYILLISAGQTLGGLLLFLLGSLAFYHINLSVYF
YVLIWFLFGITGALINVPYASLLQTEVDQSIIGSVSAFSESIQNFFMIISPLVGALLISFITIDIMFLLVGLLLVLLGLS
LIMNNQRLLLSNFF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45874; Mature: 45874

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVKTNRLISNTNYINLVIADFISSLGDWMVIPIIGSLFFYDIGLSSQMLAIVEIIIAAPS
CCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCH
VFFGSIIGVSVDNKNPIPILIYSDISRAVLSIILYFLAYHYEIVLLLLFLEGICRCFFLP
HHHHHHHEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SRQIALKVLVLNDLLPKASGFLHTSSQLAKIIGPAFGGLLILYCNIKFLFIINALTFLAS
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ACFIKAISLPMKITETKLSNNKISKLTFIYKKLINVASTIKNNKLLRIVIINSALRFAII
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
FIFDLYIIVFNKFMNFSASIYAIAISAIGMGSVVGAVVVTTYITRFRYILLISAGQTLGG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHH
LLLFLLGSLAFYHINLSVYFYVLIWFLFGITGALINVPYASLLQTEVDQSIIGSVSAFSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIQNFFMIISPLVGALLISFITIDIMFLLVGLLLVLLGLSLIMNNQRLLLSNFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MVKTNRLISNTNYINLVIADFISSLGDWMVIPIIGSLFFYDIGLSSQMLAIVEIIIAAPS
CCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCH
VFFGSIIGVSVDNKNPIPILIYSDISRAVLSIILYFLAYHYEIVLLLLFLEGICRCFFLP
HHHHHHHEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SRQIALKVLVLNDLLPKASGFLHTSSQLAKIIGPAFGGLLILYCNIKFLFIINALTFLAS
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ACFIKAISLPMKITETKLSNNKISKLTFIYKKLINVASTIKNNKLLRIVIINSALRFAII
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
FIFDLYIIVFNKFMNFSASIYAIAISAIGMGSVVGAVVVTTYITRFRYILLISAGQTLGG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHH
LLLFLLGSLAFYHINLSVYFYVLIWFLFGITGALINVPYASLLQTEVDQSIIGSVSAFSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIQNFFMIISPLVGALLISFITIDIMFLLVGLLLVLLGLSLIMNNQRLLLSNFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]