Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
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Accession | NC_010981 |
Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is cycK [H]
Identifier: 190570822
GI number: 190570822
Start: 418134
End: 420224
Strand: Reverse
Name: cycK [H]
Synonym: WPa_0391
Alternate gene names: 190570822
Gene position: 420224-418134 (Counterclockwise)
Preceding gene: 190570824
Following gene: 190570820
Centisome position: 28.35
GC content: 36.54
Gene sequence:
>2091_bases ATGAATCTTATGCCTGAATTTGGGAATATATTGTTATTGGTAGCCTGTTTGTTATCTTTAACGTATTTGTTTCTACCGTT TAGTTCTTACCGATTCGTCTCCTCTGCCATATTTTTTTGTGTGTCAGCATCAATGGCTATTTTGATCTACTGCCACATTA AAAATGATTTCTCACTTGAAAACGTATATTACCACTCACACACAACAAAACCTTTAATCTATAAGATTTGTGGTGTTTGG GGAAATAAAGAAGGGTCTATGTTGCTTTGGACCTTAGTGCTTGTCATGTATTTATTACTAATGGATATTTATATACCTTC TGTCATCCCAGTGCTTGACTACTTGGATCCAGACAATTTAATTGCAAATGAGTACATCAAATGGCAGTGTAATAAAAACT GGATTCCAGTGTCAGCTACTTGCATGACACCAGAACGAACTAATGGTAGTAAATTAAAAAAAATATCTCTTATCACCCAA GGCTTGATTTGCTTTTGTTTTTTACTGTTCACTTTACTTGAATCCAGCCCCTTCACTAAAATGCCAGGCATTGAAACAGA TGGACTGGGTTTTAATCCGATATTGCAGGATATAGGCCTTGCTATTCATCCACCGGTATTATATTTGGGGTACCTTGGAT TTAGCATTCCTTTTTCGCTCTCTATAGCTGGATTAATTTTAAATACTGAAGGAAATGTTTGGGCTAAAATTGTCAGGCCT TGGGTACTTATTTCTTGGTCGCTGCTCACTTTGGGCATCAGCTTGGGTAGCTGGTGGGCATATCGTGAACTCGGTTGGGG TGGATTTTGGTTCTGGGATCCAGTGGAAAACGTTTCTTTGATGCCTTGGCTAATTGCAGTGGCGCTGACACATTTGTTGC TCGTTGTACGAAATTTCAATACTTTAAGGAATTTCGCTATTTTACTTACGCTTACAACTTTTATATTGAGTGTGACTGGA ACATTTCTAGTCCGCTCAGGAATACTTACCTCAGTGCACACGTTTGCAGATGACCCAAGATATGGACTGTATATATTAGC TCTACTTGGTGTAATTACAGTCAGTAGCTTAGTAATATTTGTAGTGTTTACGAGAAAGAATCACACATCTTTCCAGTATT CGATATTGGAATCTGAAAAGAAATCTGCTACTCAAGTGACAGAAGGTAGAAGATTCTTTTCACGCCTTACGATGATGCTG ATGAACAATTTATTATTCATCACTGCCTTTTTCATCGTGTTCGTTGGCACTTTATACCCTACAGTGCTTGAGTATTTAAC CGGTGAATTAATTTCAGTTGGAGCACCATATTACAATTCTTTATTTAACTCTATTGCACTAGCTATTCTAGTACTCACCA TGATAGGGCAATACTGCAGTTGGCAGGGAAATAGTCTATTGCCAATATTCCGTGAATATAGATTTTCATTTTGTAGTGCT GCAGCTATTTTGCCGTTTATCTTTCACATGGAGCTAATGATTGTGCTATCAATTACCATCTCCATAGCATTATTAATCTT TGTTTTAGAAGCATATAGTAAAAGAATTTGTTTATTTAAGGTAGCATTTGGTGAATCAATTTTATTAGCAAGAAGAGTTT CTAAGTCCTACTATGGAATGATGCTTGCTCATGCTGGAGTGGCAATTCTAGTGCTTGGTATATCTTATTCCGTTGGTTGG CAGGAGAAAAAAGAAAACTACTTGGGAATAGGAGACAGCATAACAGTCAATAAATTTAAAGTTACTTTACGAAATATTGA GCTAATAAAAGAAAAAAATTTCCATGCAGTGAGGGGTACAATGGATATCAGGAATTTGCTGAATAATAAGATATTAGGTG AAGTAACTCCTGAATATAGATTTTACCTTGCGGAAGGTCAGAAAAATGTTGAAAGCAGTATCTACCACAATTTATTTTCT GATATTTATGTTGTAATTGGAGAGATTGATAAGAGTAAGAGCAAAATCGCAGCTAAAGTGCACTATAAACCTGGAATGTC TATAATCTGGCTAGGATCCTTTCTTATCGCTTTTGGCTCGCTCCTTGCTGCTTTGCCTTCTACCAAAAAAGTAGTTCCTT CAGTATCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTAATGCTTAATTTTTACTTACTATTAATATAATTGAAGATTAACTTTGTTCCTATATTAAAACTTTAACTCCCAATTT ATTATTAGTAATATCATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTTGCATTTTTTGGCAATTTAAACTTAAGCTAAGCAACACTAACCTCGCTAGCGAATTTTCTCTGTGTTCTGTTGTAC AATAGGAAATAAAGATATAT
Product: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF, putative
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696
Protein sequence:
>696_residues MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS
Sequences:
>Translated_696_residues MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS >Mature_696_residues MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS
Specific function: Required for the biogenesis of c-type cytochromes. Possible subunit of a heme lyase [H]
COG id: COG1138
COG function: function code O; Cytochrome c biogenesis factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788524, Length=709, Percent_Identity=30.7475317348378, Blast_Score=329, Evalue=4e-91, Organism=Escherichia coli, GI1790511, Length=516, Percent_Identity=32.5581395348837, Blast_Score=238, Evalue=1e-63,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002541 - InterPro: IPR003567 - InterPro: IPR003568 [H]
Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78458; Mature: 78458
Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLE CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCCCCCC NVYYHSHTTKPLIYKICGVWGNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNL EEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH IANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQGLICFCFLLFTLLESSPFTK HHCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC MPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFN HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLRNFAILLTLTTFILSVTGTFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE VVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMMLMNNLLFITAFFIVFVGTLYP EEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH MLAHAGVAILVLGISYSVGWQEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGT HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEHEEEEEHHHHHHHCCCCCEECCH MDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFSDIYVVIGEIDKSKSKIAAKV HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEE HYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLE CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCCCCCC NVYYHSHTTKPLIYKICGVWGNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNL EEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH IANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQGLICFCFLLFTLLESSPFTK HHCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC MPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFN HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLRNFAILLTLTTFILSVTGTFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE VVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMMLMNNLLFITAFFIVFVGTLYP EEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH MLAHAGVAILVLGISYSVGWQEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGT HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEHEEEEEHHHHHHHCCCCCEECCH MDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFSDIYVVIGEIDKSKSKIAAKV HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEE HYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7715601; 12597275 [H]