Definition Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome.
Accession NC_010981
Length 1,482,455

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The map label for this gene is cycK [H]

Identifier: 190570822

GI number: 190570822

Start: 418134

End: 420224

Strand: Reverse

Name: cycK [H]

Synonym: WPa_0391

Alternate gene names: 190570822

Gene position: 420224-418134 (Counterclockwise)

Preceding gene: 190570824

Following gene: 190570820

Centisome position: 28.35

GC content: 36.54

Gene sequence:

>2091_bases
ATGAATCTTATGCCTGAATTTGGGAATATATTGTTATTGGTAGCCTGTTTGTTATCTTTAACGTATTTGTTTCTACCGTT
TAGTTCTTACCGATTCGTCTCCTCTGCCATATTTTTTTGTGTGTCAGCATCAATGGCTATTTTGATCTACTGCCACATTA
AAAATGATTTCTCACTTGAAAACGTATATTACCACTCACACACAACAAAACCTTTAATCTATAAGATTTGTGGTGTTTGG
GGAAATAAAGAAGGGTCTATGTTGCTTTGGACCTTAGTGCTTGTCATGTATTTATTACTAATGGATATTTATATACCTTC
TGTCATCCCAGTGCTTGACTACTTGGATCCAGACAATTTAATTGCAAATGAGTACATCAAATGGCAGTGTAATAAAAACT
GGATTCCAGTGTCAGCTACTTGCATGACACCAGAACGAACTAATGGTAGTAAATTAAAAAAAATATCTCTTATCACCCAA
GGCTTGATTTGCTTTTGTTTTTTACTGTTCACTTTACTTGAATCCAGCCCCTTCACTAAAATGCCAGGCATTGAAACAGA
TGGACTGGGTTTTAATCCGATATTGCAGGATATAGGCCTTGCTATTCATCCACCGGTATTATATTTGGGGTACCTTGGAT
TTAGCATTCCTTTTTCGCTCTCTATAGCTGGATTAATTTTAAATACTGAAGGAAATGTTTGGGCTAAAATTGTCAGGCCT
TGGGTACTTATTTCTTGGTCGCTGCTCACTTTGGGCATCAGCTTGGGTAGCTGGTGGGCATATCGTGAACTCGGTTGGGG
TGGATTTTGGTTCTGGGATCCAGTGGAAAACGTTTCTTTGATGCCTTGGCTAATTGCAGTGGCGCTGACACATTTGTTGC
TCGTTGTACGAAATTTCAATACTTTAAGGAATTTCGCTATTTTACTTACGCTTACAACTTTTATATTGAGTGTGACTGGA
ACATTTCTAGTCCGCTCAGGAATACTTACCTCAGTGCACACGTTTGCAGATGACCCAAGATATGGACTGTATATATTAGC
TCTACTTGGTGTAATTACAGTCAGTAGCTTAGTAATATTTGTAGTGTTTACGAGAAAGAATCACACATCTTTCCAGTATT
CGATATTGGAATCTGAAAAGAAATCTGCTACTCAAGTGACAGAAGGTAGAAGATTCTTTTCACGCCTTACGATGATGCTG
ATGAACAATTTATTATTCATCACTGCCTTTTTCATCGTGTTCGTTGGCACTTTATACCCTACAGTGCTTGAGTATTTAAC
CGGTGAATTAATTTCAGTTGGAGCACCATATTACAATTCTTTATTTAACTCTATTGCACTAGCTATTCTAGTACTCACCA
TGATAGGGCAATACTGCAGTTGGCAGGGAAATAGTCTATTGCCAATATTCCGTGAATATAGATTTTCATTTTGTAGTGCT
GCAGCTATTTTGCCGTTTATCTTTCACATGGAGCTAATGATTGTGCTATCAATTACCATCTCCATAGCATTATTAATCTT
TGTTTTAGAAGCATATAGTAAAAGAATTTGTTTATTTAAGGTAGCATTTGGTGAATCAATTTTATTAGCAAGAAGAGTTT
CTAAGTCCTACTATGGAATGATGCTTGCTCATGCTGGAGTGGCAATTCTAGTGCTTGGTATATCTTATTCCGTTGGTTGG
CAGGAGAAAAAAGAAAACTACTTGGGAATAGGAGACAGCATAACAGTCAATAAATTTAAAGTTACTTTACGAAATATTGA
GCTAATAAAAGAAAAAAATTTCCATGCAGTGAGGGGTACAATGGATATCAGGAATTTGCTGAATAATAAGATATTAGGTG
AAGTAACTCCTGAATATAGATTTTACCTTGCGGAAGGTCAGAAAAATGTTGAAAGCAGTATCTACCACAATTTATTTTCT
GATATTTATGTTGTAATTGGAGAGATTGATAAGAGTAAGAGCAAAATCGCAGCTAAAGTGCACTATAAACCTGGAATGTC
TATAATCTGGCTAGGATCCTTTCTTATCGCTTTTGGCTCGCTCCTTGCTGCTTTGCCTTCTACCAAAAAAGTAGTTCCTT
CAGTATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTAATGCTTAATTTTTACTTACTATTAATATAATTGAAGATTAACTTTGTTCCTATATTAAAACTTTAACTCCCAATTT
ATTATTAGTAATATCATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTTGCATTTTTTGGCAATTTAAACTTAAGCTAAGCAACACTAACCTCGCTAGCGAATTTTCTCTGTGTTCTGTTGTAC
AATAGGAAATAAAGATATAT

Product: cytochrome c-type biogenesis protein CcmF, putative

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696

Protein sequence:

>696_residues
MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW
GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ
GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP
WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG
TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML
MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA
AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW
QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS
DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS

Sequences:

>Translated_696_residues
MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW
GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ
GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP
WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG
TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML
MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA
AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW
QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS
DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS
>Mature_696_residues
MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLENVYYHSHTTKPLIYKICGVW
GNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNLIANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQ
GLICFCFLLFTLLESSPFTKMPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP
WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFNTLRNFAILLTLTTFILSVTG
TFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIFVVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMML
MNNLLFITAFFIVFVGTLYPTVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA
AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGMMLAHAGVAILVLGISYSVGW
QEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGTMDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFS
DIYVVIGEIDKSKSKIAAKVHYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS

Specific function: Required for the biogenesis of c-type cytochromes. Possible subunit of a heme lyase [H]

COG id: COG1138

COG function: function code O; Cytochrome c biogenesis factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788524, Length=709, Percent_Identity=30.7475317348378, Blast_Score=329, Evalue=4e-91,
Organism=Escherichia coli, GI1790511, Length=516, Percent_Identity=32.5581395348837, Blast_Score=238, Evalue=1e-63,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR003567
- InterPro:   IPR003568 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78458; Mature: 78458

Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCCCCCC
NVYYHSHTTKPLIYKICGVWGNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNL
EEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQGLICFCFLLFTLLESSPFTK
HHCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
MPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP
CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFN
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLRNFAILLTLTTFILSVTGTFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
VVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMMLMNNLLFITAFFIVFVGTLYP
EEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA
HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
MLAHAGVAILVLGISYSVGWQEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGT
HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEHEEEEEHHHHHHHCCCCCEECCH
MDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFSDIYVVIGEIDKSKSKIAAKV
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEE
HYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNLMPEFGNILLLVACLLSLTYLFLPFSSYRFVSSAIFFCVSASMAILIYCHIKNDFSLE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCCCCCC
NVYYHSHTTKPLIYKICGVWGNKEGSMLLWTLVLVMYLLLMDIYIPSVIPVLDYLDPDNL
EEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IANEYIKWQCNKNWIPVSATCMTPERTNGSKLKKISLITQGLICFCFLLFTLLESSPFTK
HHCCEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
MPGIETDGLGFNPILQDIGLAIHPPVLYLGYLGFSIPFSLSIAGLILNTEGNVWAKIVRP
CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
WVLISWSLLTLGISLGSWWAYRELGWGGFWFWDPVENVSLMPWLIAVALTHLLLVVRNFN
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLRNFAILLTLTTFILSVTGTFLVRSGILTSVHTFADDPRYGLYILALLGVITVSSLVIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
VVFTRKNHTSFQYSILESEKKSATQVTEGRRFFSRLTMMLMNNLLFITAFFIVFVGTLYP
EEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVLEYLTGELISVGAPYYNSLFNSIALAILVLTMIGQYCSWQGNSLLPIFREYRFSFCSA
HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AAILPFIFHMELMIVLSITISIALLIFVLEAYSKRICLFKVAFGESILLARRVSKSYYGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
MLAHAGVAILVLGISYSVGWQEKKENYLGIGDSITVNKFKVTLRNIELIKEKNFHAVRGT
HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEHEEEEEHHHHHHHCCCCCEECCH
MDIRNLLNNKILGEVTPEYRFYLAEGQKNVESSIYHNLFSDIYVVIGEIDKSKSKIAAKV
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEEE
HYKPGMSIIWLGSFLIAFGSLLAALPSTKKVVPSVS
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7715601; 12597275 [H]