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Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is 188586573

Identifier: 188586573

GI number: 188586573

Start: 2068381

End: 2069910

Strand: Reverse

Name: 188586573

Synonym: Nther_1960

Alternate gene names: NA

Gene position: 2069910-2068381 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188586574

Following gene: 188586572

Centisome position: 65.39

GC content: 40.59

Gene sequence:

>1530_bases
TTGGCAGATATTTTAGCCACTGTACCTGCAATTTTGGATGCTTCATATTTGTTAATTGTGGCAGCTGGTGTGTTTGGAGG
TATTTTGGTAGGTGCTCTTCCAGGACTTACTCCTACTATGGGGGTAGCTTTGCTAGTTCCTTTTACATTCTATCTGCCCG
CAGAACAGGGCTTATTAATGTTGGGTTCAGTATATGTAGGCAGTGTATACGGTGGGGCAATAACAGCAATTTTAATAAAT
ATTCCAGGAGCGCCAGCTTCAATAGCTACAATAATGGATGGTCATCCCATGGCAAACAAAGGTGAAGGTGAAAAGGCCAT
TCATCTGGCCACTCTTTCTTCTTTTATAGGTGGCGTATTTGGTGTGATATTACTATTATTTTTTGCTCCTGCTTTGGCAA
GGGTCTCACTAAACTTTGGGCCTGCTGAGCATTTTTGGATAGCTGTTTTTGGAATCACAGTGATAGCTGGCTTATCTAAA
GGAAGTATTTGGAAGGGAATTATGGGAGGCGCTGCGGGTTTATGGTTGAGCACAATTGGCATTGGTGAAATAACGGGTAC
AGCTCGGTTCACCTTTGAGTCGGCTCATTTGACAGGTGGCATTGGCTTAGTCTCTATGTTAATTGGCTTATTTGCATTTC
CCCAGGCTTTGGTCTTTGTAGAGCGCTTGTTTCAAAGTAAAGAAACACGAAAGTTTAATGAAAATGTGTTTCATAAAAGC
AGATCCTTCCTGAAAGGGATAAAAGACATAATTAAGTACAAGAAGAATGTGATTATGGGTTCGATAATAGGTGGCTTGGT
AGGATTAGTGCCTGGAGCTGGTGGTCAAATTGCTGGTTTAGTTGCTTACAACGAAGTGAAGCGTTATTCCCCGGAAAAGG
ATAAGTTCGGCACAGGACATGAAGGAGGAATAATTACTACCGAAAGTGCTAATAACGCCATGGTTGGTTGTTCTCTTGTT
CCCCTTTTGACCCTGGGGATTCCAGGGAGCCCCACGGCGGCAGTTCTATTAGGCGGATTACTCATGAATGGTCTCTGGCC
AGGACCTGAAATGTTTCAGGAAAACGCTTCAATTACCTATACTTTTATTTTAGGAATGGTAGCAGCCCAATTTTTTATGT
TATTTATTGGGGGCTTTGGAGGACGTTTTTTCAAAAGAGTGATGTATGTATCACCTGGGATTATGGCTCCTTTAATTTTA
GTGTTTTGCGTTTTAGGTTCATTTGCAGAAAGAAACAATTTTAGTGATGTGTGGTTTATGTTAATAGTTGGTGTTTTGAT
GTATTTTGGTATGAAATTTGGTTTTAGCCCGGCACCGGTTGGTTTAGGATTTATCCTGGGTGAATATGCCGAAAGAGGAT
TTTTATTAGCAAATCGGGCTAGTGTCAGTGAAGGATCATTAATGCTGCATTTTCTAGACAGCCCCATAGTTATTGTTTTA
ATGCTATTGACAGCAATCTCAATTATAACTACTGCAGTATTAGAAATCAGTAAAAAACAAAAGAAGTTGAAGGAGGTTGA
GCAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGGACTGTCACAAGTAATAAAAGATTCAAATATTATATTGGTGACCTCAAATTTGGTTGAGATATCAAACTTGTGAC
TGCAGAAAGGAGGGAGAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATCCAGAGGAATTCAATATTATAAATTGGAATTACTGCTCTGTGGTCTGGCACTAGTGATTGCCGGTTTATTGATCATG
GAAGCCTTAAAGTATCCAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFZ2 [H]

Number of amino acids: Translated: 509; Mature: 508

Protein sequence:

>509_residues
MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILIN
IPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSK
GSIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS
RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLV
PLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLIL
VFCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL
MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK

Sequences:

>Translated_509_residues
MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILIN
IPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSK
GSIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS
RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLV
PLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLIL
VFCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL
MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK
>Mature_508_residues
ADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILINI
PGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKG
SIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKSR
SFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLVP
LLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILV
FCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVLM
LLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK

Specific function: Unknown

COG id: COG3333

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002823 [H]

Pfam domain/function: PF01970 DUF112 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53829; Mature: 53698

Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLM
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
LGSVYVGSVYGGAITAILINIPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVF
HHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKGSIWKGIMGGAAGLWLSTIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCC
IGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS
CCCCCCCEEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
EGGIITTESANNAMVGCSLVPLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITY
CCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHH
TFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILVFCVLGSFAERNNFSDVWFM
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHH
MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
ADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
LGSVYVGSVYGGAITAILINIPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVF
HHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKGSIWKGIMGGAAGLWLSTIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCC
IGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS
CCCCCCCEEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
EGGIITTESANNAMVGCSLVPLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITY
CCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHH
TFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILVFCVLGSFAERNNFSDVWFM
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHH
MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8672817 [H]