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The map label for this gene is comEC [H]

Identifier: 188585799

GI number: 188585799

Start: 1242334

End: 1244586

Strand: Direct

Name: comEC [H]

Synonym: Nther_1173

Alternate gene names: 188585799

Gene position: 1242334-1244586 (Clockwise)

Preceding gene: 188585798

Following gene: 188585800

Centisome position: 39.25

GC content: 35.77

Gene sequence:

>2253_bases
GTGGGTCTGTTTTTAATATTTTGTATTAATTTAATTAGCATCTGGTATTGGAACCGCCAATTACTTCCCCTTTATATAGG
TACAGATAGTCAAAATTCCTATGACGTAGAATTCATTGGGAAAATTTCTGGTTCTCCTAGTACAGGTGCTAATTCCATCC
ACTATCCTGTAACAATAACGGAATTAAGCTTTGTTGAACAAATAGACCAACTACAACAAATAGAACAAGTAGACCAAACC
TTTAATTCACCTTTGAAAGTGCGTATGAGTTTACCGAAAAAGGATGTGGATGAACAAAGGGAATTACTACCAGGTAATCG
GGTTCGAGGAAGGGCAAACATGGTTAAACCAGAAGGAGCTAGGAATCCTGGAGGTTTTGACTATGCCAGCTATCTAAAGA
GCAGGGGTAAATTTCACATTCTATACCCTCAGAATCCACATAATCTTGAAATTATTGGTGAAAGTATTTCACTACATAGA
CCGGGAACTTTGTTATCGAACAATTTAACAGAAATTTATCTTAAAAACTTAGACCTTGAGGTTTCCCCCTGGGTAATTGC
TCTTACCTTGGGGGATCTTTCATATTTGAATAAACAATCTATCACAATTCTAGATGAGGCTGGAGCGCGTTATTTAACTG
CTGTATCCGGCCTTCATATGAAAATTGTGGCCCTTAGCCTATACAATGCATTACTTGCTATTGGGATTAGAAAAAAGTGC
TCTGTAATAGTAACTTTAATTGTGAGTTTAATTTATGCCTCTGCAGCTGGTTTTTCACCTTCAGTAATGAGAGCTATGCT
AATGCTTGGGCTAGTTTTATGTTCTTCTTTAACCACTCAAAAATTATCACCCCTCTTAGCACTTAGCTTAAGTTTATTGG
TAATATTGGCTTTTTCGCCTTTTTTAATTTTTAATGTTGGTTTACAATTGTCCTTTATTGCTACTTTGTTTATCATTCTA
ATTTACCCAGAACTCAAATCAACACGCAACTCAATAACATCTTTTCTAATAGAACCTTTTAAAATTGCACTTTGTGCCCA
ATTAGGTGTATTCCCCTTAATTTTACACCACTTTGGCTGGGTGTCTTTTGGTAGTCTATTATTGGCTCCTTTTCTAGCAA
TGGTGTTAGCACCATTAATTTTGGCAGCTATGATTTTCGGGTTACTAGTTAATTTAGATCTAGCTTTTATACCAATCCAG
TTTTTAAAAGTCTTTATTGAACTGACAGTGCGATACTTACAAACTGTAATCTACCTGGTCGCTCAGTATAGCTTTAGTTT
ATGGGGTCATTGGTCGGGGGTTCAATTAGTTTGTTATTATATATCCATACTTGTTATTCTCATTTTTAAAAATTCACCAT
TGATTATTCGGCCTGTTAAGTATTTACCCCTATTAGCTATTTTTTCAATGATATGTTTATTCATAAGCTTTCTAAGCCCC
TTTAATAAAACCTTAGATACCTATTATCTGGATGTAGGCCAAGGTAACTCGGCCGTTATTTTCACACCGAAAGGACAGAC
AATTTTAATTGACAGTGGTGGAGTACCATTGGATAGTAGATTTTCTGATCCTGGTGAAACTGTACTATTACCATTTTTAA
GATATTACGGTGAAAAGACAATTGATCTGGTTATTATAACTCATGCTCATACCGATCATTTTGCAGGTTTAATAGCTATA
TTAGACCATGTAAATATTTCCCAAGTGTTAATACCCGAGCTTGGGAATGATACTGAAGAATTCGAGAAATTGATGGAACA
ATTGAATAATAGAAATATTCCTGTTAACTATGTACAAGATCCCGGCGTTATAGATTTAGGATCTGATGCAACTATGGAAA
TATTACACCCGAATTCTCCCTATTTAACAGGGACAAATTGTGACTTAAACAATAACTCTATCGTAACCAGATTAGTATGG
CAAGAAACAGCTTTATTTTTCCCAGGGGATTTGGAGGAGGAAGGAGAAAGAAGATTGTTGAATACAATTAGCGAAGATAA
TCTTAACAGCCAGGTACTAAAAGTCCCTCATCATGGCAGCTCAACTTCCTCATCTTTGCAATTTTTGGAGGCCATAGACC
CGTCTGTTGCCATTATTTCAGTAGGTAATAACAGCTATGGCCATCCTTCACTACAATTGATAGAAGAACTTGAAAGTTCC
GGGATTCGAGTGTTTCGAACTGATAAAAATGGGGCTGTGATATTAAACAGCAATGGGAGAGAATTACAGATCAAATCCTA
TATTGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAACGGAAGCAATTCCTGACAAGAGTTAAATCTATATATTTATTTACACGGGTGGTGTAAAAATTAAACAAAATTGAGA
GTACTTTAAAACTGGTATGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAATCCGTCCAATTGAAAATTTTATAGTGTCAACAAATAAATTCATAGAGCCATTTAAAAAATTGGTTTAGGGATTAA
AGGAGGATGAATTAAAATGA

Product: DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 750; Mature: 749

Protein sequence:

>750_residues
MGLFLIFCINLISIWYWNRQLLPLYIGTDSQNSYDVEFIGKISGSPSTGANSIHYPVTITELSFVEQIDQLQQIEQVDQT
FNSPLKVRMSLPKKDVDEQRELLPGNRVRGRANMVKPEGARNPGGFDYASYLKSRGKFHILYPQNPHNLEIIGESISLHR
PGTLLSNNLTEIYLKNLDLEVSPWVIALTLGDLSYLNKQSITILDEAGARYLTAVSGLHMKIVALSLYNALLAIGIRKKC
SVIVTLIVSLIYASAAGFSPSVMRAMLMLGLVLCSSLTTQKLSPLLALSLSLLVILAFSPFLIFNVGLQLSFIATLFIIL
IYPELKSTRNSITSFLIEPFKIALCAQLGVFPLILHHFGWVSFGSLLLAPFLAMVLAPLILAAMIFGLLVNLDLAFIPIQ
FLKVFIELTVRYLQTVIYLVAQYSFSLWGHWSGVQLVCYYISILVILIFKNSPLIIRPVKYLPLLAIFSMICLFISFLSP
FNKTLDTYYLDVGQGNSAVIFTPKGQTILIDSGGVPLDSRFSDPGETVLLPFLRYYGEKTIDLVIITHAHTDHFAGLIAI
LDHVNISQVLIPELGNDTEEFEKLMEQLNNRNIPVNYVQDPGVIDLGSDATMEILHPNSPYLTGTNCDLNNNSIVTRLVW
QETALFFPGDLEEEGERRLLNTISEDNLNSQVLKVPHHGSSTSSSLQFLEAIDPSVAIISVGNNSYGHPSLQLIEELESS
GIRVFRTDKNGAVILNSNGRELQIKSYIEN

Sequences:

>Translated_750_residues
MGLFLIFCINLISIWYWNRQLLPLYIGTDSQNSYDVEFIGKISGSPSTGANSIHYPVTITELSFVEQIDQLQQIEQVDQT
FNSPLKVRMSLPKKDVDEQRELLPGNRVRGRANMVKPEGARNPGGFDYASYLKSRGKFHILYPQNPHNLEIIGESISLHR
PGTLLSNNLTEIYLKNLDLEVSPWVIALTLGDLSYLNKQSITILDEAGARYLTAVSGLHMKIVALSLYNALLAIGIRKKC
SVIVTLIVSLIYASAAGFSPSVMRAMLMLGLVLCSSLTTQKLSPLLALSLSLLVILAFSPFLIFNVGLQLSFIATLFIIL
IYPELKSTRNSITSFLIEPFKIALCAQLGVFPLILHHFGWVSFGSLLLAPFLAMVLAPLILAAMIFGLLVNLDLAFIPIQ
FLKVFIELTVRYLQTVIYLVAQYSFSLWGHWSGVQLVCYYISILVILIFKNSPLIIRPVKYLPLLAIFSMICLFISFLSP
FNKTLDTYYLDVGQGNSAVIFTPKGQTILIDSGGVPLDSRFSDPGETVLLPFLRYYGEKTIDLVIITHAHTDHFAGLIAI
LDHVNISQVLIPELGNDTEEFEKLMEQLNNRNIPVNYVQDPGVIDLGSDATMEILHPNSPYLTGTNCDLNNNSIVTRLVW
QETALFFPGDLEEEGERRLLNTISEDNLNSQVLKVPHHGSSTSSSLQFLEAIDPSVAIISVGNNSYGHPSLQLIEELESS
GIRVFRTDKNGAVILNSNGRELQIKSYIEN
>Mature_749_residues
GLFLIFCINLISIWYWNRQLLPLYIGTDSQNSYDVEFIGKISGSPSTGANSIHYPVTITELSFVEQIDQLQQIEQVDQTF
NSPLKVRMSLPKKDVDEQRELLPGNRVRGRANMVKPEGARNPGGFDYASYLKSRGKFHILYPQNPHNLEIIGESISLHRP
GTLLSNNLTEIYLKNLDLEVSPWVIALTLGDLSYLNKQSITILDEAGARYLTAVSGLHMKIVALSLYNALLAIGIRKKCS
VIVTLIVSLIYASAAGFSPSVMRAMLMLGLVLCSSLTTQKLSPLLALSLSLLVILAFSPFLIFNVGLQLSFIATLFIILI
YPELKSTRNSITSFLIEPFKIALCAQLGVFPLILHHFGWVSFGSLLLAPFLAMVLAPLILAAMIFGLLVNLDLAFIPIQF
LKVFIELTVRYLQTVIYLVAQYSFSLWGHWSGVQLVCYYISILVILIFKNSPLIIRPVKYLPLLAIFSMICLFISFLSPF
NKTLDTYYLDVGQGNSAVIFTPKGQTILIDSGGVPLDSRFSDPGETVLLPFLRYYGEKTIDLVIITHAHTDHFAGLIAIL
DHVNISQVLIPELGNDTEEFEKLMEQLNNRNIPVNYVQDPGVIDLGSDATMEILHPNSPYLTGTNCDLNNNSIVTRLVWQ
ETALFFPGDLEEEGERRLLNTISEDNLNSQVLKVPHHGSSTSSSLQFLEAIDPSVAIISVGNNSYGHPSLQLIEELESSG
IRVFRTDKNGAVILNSNGRELQIKSYIEN

Specific function: The comE operon is required for the binding and uptake of transforming DNA. ComEC is required for internalization but is dispensable for DNA binding [H]

COG id: COG2333

COG function: function code R; Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To H.influenzae REC2, N.gonorrhoeae ComA and E.coli YcaI [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=714, Percent_Identity=23.8095238095238, Blast_Score=117, Evalue=2e-27,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83421; Mature: 83290

Theoretical pI: Translated: 5.85; Mature: 5.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLFLIFCINLISIWYWNRQLLPLYIGTDSQNSYDVEFIGKISGSPSTGANSIHYPVTIT
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEH
ELSFVEQIDQLQQIEQVDQTFNSPLKVRMSLPKKDVDEQRELLPGNRVRGRANMVKPEGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
RNPGGFDYASYLKSRGKFHILYPQNPHNLEIIGESISLHRPGTLLSNNLTEIYLKNLDLE
CCCCCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCEECCCCCCHHHCCCCEEHHCCCCCE
VSPWVIALTLGDLSYLNKQSITILDEAGARYLTAVSGLHMKIVALSLYNALLAIGIRKKC
ECCEEEEEEECCHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
SVIVTLIVSLIYASAAGFSPSVMRAMLMLGLVLCSSLTTQKLSPLLALSLSLLVILAFSP
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
FLIFNVGLQLSFIATLFIILIYPELKSTRNSITSFLIEPFKIALCAQLGVFPLILHHFGW
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSFGSLLLAPFLAMVLAPLILAAMIFGLLVNLDLAFIPIQFLKVFIELTVRYLQTVIYLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQYSFSLWGHWSGVQLVCYYISILVILIFKNSPLIIRPVKYLPLLAIFSMICLFISFLSP
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNKTLDTYYLDVGQGNSAVIFTPKGQTILIDSGGVPLDSRFSDPGETVLLPFLRYYGEKT
HHHCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCE
IDLVIITHAHTDHFAGLIAILDHVNISQVLIPELGNDTEEFEKLMEQLNNRNIPVNYVQD
EEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC
PGVIDLGSDATMEILHPNSPYLTGTNCDLNNNSIVTRLVWQETALFFPGDLEEEGERRLL
CCEEECCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEHHHEEECCCCCCHHHHHHHH
NTISEDNLNSQVLKVPHHGSSTSSSLQFLEAIDPSVAIISVGNNSYGHPSLQLIEELESS
HHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHC
GIRVFRTDKNGAVILNSNGRELQIKSYIEN
CEEEEEECCCCEEEECCCCCEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GLFLIFCINLISIWYWNRQLLPLYIGTDSQNSYDVEFIGKISGSPSTGANSIHYPVTIT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEH
ELSFVEQIDQLQQIEQVDQTFNSPLKVRMSLPKKDVDEQRELLPGNRVRGRANMVKPEGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
RNPGGFDYASYLKSRGKFHILYPQNPHNLEIIGESISLHRPGTLLSNNLTEIYLKNLDLE
CCCCCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCEECCCCCCHHHCCCCEEHHCCCCCE
VSPWVIALTLGDLSYLNKQSITILDEAGARYLTAVSGLHMKIVALSLYNALLAIGIRKKC
ECCEEEEEEECCHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
SVIVTLIVSLIYASAAGFSPSVMRAMLMLGLVLCSSLTTQKLSPLLALSLSLLVILAFSP
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
FLIFNVGLQLSFIATLFIILIYPELKSTRNSITSFLIEPFKIALCAQLGVFPLILHHFGW
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSFGSLLLAPFLAMVLAPLILAAMIFGLLVNLDLAFIPIQFLKVFIELTVRYLQTVIYLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQYSFSLWGHWSGVQLVCYYISILVILIFKNSPLIIRPVKYLPLLAIFSMICLFISFLSP
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNKTLDTYYLDVGQGNSAVIFTPKGQTILIDSGGVPLDSRFSDPGETVLLPFLRYYGEKT
HHHCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCE
IDLVIITHAHTDHFAGLIAILDHVNISQVLIPELGNDTEEFEKLMEQLNNRNIPVNYVQD
EEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECC
PGVIDLGSDATMEILHPNSPYLTGTNCDLNNNSIVTRLVWQETALFFPGDLEEEGERRLL
CCEEECCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEHHHEEECCCCCCHHHHHHHH
NTISEDNLNSQVLKVPHHGSSTSSSLQFLEAIDPSVAIISVGNNSYGHPSLQLIEELESS
HHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHC
GIRVFRTDKNGAVILNSNGRELQIKSYIEN
CEEEEEECCCCEEEECCCCCEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7968523; 8969508; 9384377 [H]