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Definition Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome.
Accession NC_010674
Length 3,800,327

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The map label for this gene is 187933682

Identifier: 187933682

GI number: 187933682

Start: 3396964

End: 3398319

Strand: Reverse

Name: 187933682

Synonym: CLL_A3245

Alternate gene names: NA

Gene position: 3398319-3396964 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187935357

Following gene: 187934897

Centisome position: 89.42

GC content: 23.3

Gene sequence:

>1356_bases
ATGAAGGAAAAAATAAAGAATATAATAAGTAAAAAAATAGTTAATAAGGACAAACTACCATTTATAGTATTGATAGGCAT
ATTCATTCTTATACATATAAAAATGAATATAAATTTTGGAGATGATCTTGTTTATAGAACTCAATTTAGCACTCCTTGGG
AAGGAATGGTTTCATTTTATAAAACGTGGGCATCGCCGTCATTACTTTCTTTAATTCAATTTTATCTAGTTAGATTGCCT
GATATTGTTTTTAAAATATGTAATATATTGATGATTTTATTATCAGCATATTCTATATCAAAAATTACAAAGGATAAGGA
AGCAAAATATACAAATTGGATAATAGTATTTTTTATAATATTATATCCATTTATGCAGATGGCTACAGCTGGATGGATAG
TTACATCAGTTTCGTATATTTTCCCAACTGCTTTTGGTTTATATTCATTTGTATATTTAAGATATATATTAGATGGTAAA
AAAATAAGCAAGTTAAATTATTGTTTATTTTTCATTTCATTAATATTAGGTTTAGGACAATTACAAATGGCTTGCATTAT
TTTTGGTATATATTTTGTATTAAATATATTTTTTGCAATTAATAAAAGAGTTTACAAGTTTGCTATATTTCAAAACATAA
TAGCGTTTCTTTTTTGTATATATCATGCAACTGCACCAGGAAATATGAATAGAAGTATTCACGAAACAGCTACATGGTTT
TCAGATTTTGGTATGATATCAACAGTAAACAAAATAAAATTAGGGTTTACATCTACATTAGGAAATTTAACATTATCATC
AAATATATTTTTTCTATGTTTTGTTTTTTTACTTGTTGTTGGAGTTTATTATAAGTATAATGATGTGCTATATAGGTTAA
TTTCACTTATTCCACTATTAGCTTTAATGATATTTGGGATGTTTAAAAGTATTTTTAAAGATATTTTTCCTGATTTAGTA
AATTTGATGAATAATGGTTCGAATGATTTTTTACAAATTAACGCATATAATTTTTATTCTAAAATTAATTATTTGACTAT
AATATTAGGTGTTATTATAGTAGGCTGTATATTAATTTCGATGTATTTAATATTTGAAAATACTTTAAAGATGCTTATTG
TTGAAATAATTTTTTTAGCAGGTTTTAGTTCTAGAATGATTATGAGTTTTTCACCTACAATTTATGCATCTAGTACACGT
ACGTTTATATTTTTATATTTTTCTATTATATTATGTGCTGTATTTATATTTAATCAAATTAGCAAAAATACAACAGAGAA
GAAACAAAAAGATTTGTTAATGTATATAGGTATTGTTTCGGCAATTAGCTATTTACAATTATTAGTTATGCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGAACGATGGAAGAAGGAACTTAAAGATGGAGATCATTATTATAATGTTAATTTAACATTGGATAGGGAAGATTTTTCT
TTAAGGTAAGGTGAAAGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGAAGATTATGACAAAAGAGATAAATCAAAAAAATGTTATAATATTATTTGTATTATTTGCATTATTAGGTAGTATAT
TTTCACTAAGTATTTACTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP
DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK
KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF
SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV
NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR
TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML

Sequences:

>Translated_451_residues
MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP
DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK
KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF
SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV
NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR
TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML
>Mature_451_residues
MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP
DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK
KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF
SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV
NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR
TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52070; Mature: 52070

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFY
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH
KTWASPSLLSLIQFYLVRLPDIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFII
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGKKISKLNYCLFFISLILGLGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALMIFGMFKSIFKDIFPDLVNLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTRTFIFLYFSIILCAVFIFNQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFY
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH
KTWASPSLLSLIQFYLVRLPDIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFII
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGKKISKLNYCLFFISLILGLGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLL
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALMIFGMFKSIFKDIFPDLVNLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTRTFIFLYFSIILCAVFIFNQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA