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Definition Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome.
Accession NC_010673
Length 922,307

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The map label for this gene is 187918125

Identifier: 187918125

GI number: 187918125

Start: 260944

End: 263229

Strand: Direct

Name: 187918125

Synonym: BH0252

Alternate gene names: NA

Gene position: 260944-263229 (Clockwise)

Preceding gene: 187918124

Following gene: 187918127

Centisome position: 28.29

GC content: 27.82

Gene sequence:

>2286_bases
ATGGATTTGGAAACCTTAAGCATTAAATACAGAGTTTTTATATTAATAATATTCACATTAATAACAATTTTTTTAGGATT
TTTCTTAAAAAACATAGAATTCGATTCAAACATTTTAAAACTTCTCCCAAAGAGCGAAAAAAATGAAGAAACAATAGACA
TAGACAACAACAATTCGCTCTTATCAACAATAGTAATGTTTAAAGATAAAAAAAATATTTTTAATAAAGAAACTTTTGGA
AAAATTAATAAAGTAGCAAATGATATAGCCAAGATACTAAAAGTAAAACCCAACTCTGTTACAAGTATATTCACTTACTT
TCCACAATTCAAAAAAGATGTATACACAGATGAAGATATGATTGAAATAAGAAATAAAGTCAATTCAACATCATTTATAA
AAAAAATATTCATCAATGATGATGAAACCTTAATATACTTTATAGTAATATCAACAGCAGATGACAAAGCAAACTTTAGC
CGAAATTTAAAGAGTGAACTTGAAGCAATGGAAGCTACAATTAAAAGTTATGAAACTGATGATCTTAAACTTTACTTAAC
AGGAGATCTTGTAATAAGGGAAAAAATACTTAATTACATGGCTGATGACTTTAAATTATTAGGTCCGTTTGCTACTCTTG
TAGTAATCCTATCACTCTATCTTATTGTAAAAAATATACTAGGAGCAATAATCCCTGTACTAATTGCAATATTTGCACTA
ACTTGGACTTTTGGAATTAAAAGCCTTGTTATGTCTCCAATTACTGTTCCAGAAACCACAATGATAGTTCTCCTTATTTC
GATTGGATGTGCTAATGGTGTACATATAATAAATGGAATATTAAAGAGAATAAAAAATGAACCTTACACTGAAAAAACAA
TAATAACTACAATTAAAACCCTCAGAACACCAATAATTTTAACTTCTCTTACAACAGCTTTCGGGTTTTTATCATTAATA
ACCTCATCAATTCAAGCATACAGAACAATGGGAATTTTTATGTCAATAGGAGTCATTATTGCAATGCTTATGTCCCTATT
AGTACTGCCTGGAATACTAGTTAAAATACCATTTAAACATAAAAATAACGATAATAAAAACGCAAAAAATGCTTTCCTTG
AAAAACTTTCTCTAATAAACCAAACAGTTACAAAATGGATATTAAATAACAAATATCTCTCATCTACTATGACTCTAATT
ATTTTATTAAGCTCAATTGTAGGTCTTTTCAACATAGAAATTAACTTTGACGAAAAAGATTATTTTAAAGAAAATACAAG
CGTCAAGCAAACACTTAATTTAATGCAAAGAGAAATAGGGGGAACGTCTATTATCAAAATTGAAATTAATGGTACTCCTG
GTGAATTCAAAAATGAAAAAAATATGAAAAATTTGGATTTAATTACAGATGAGCTTGACAAATTTACTGATAAAACACAA
TCCAGTTCAATAAACGGCGTCATAAGACTTATGAATTTTAAATTCAAAAAAGAAAATCCAAAAGAATATAGACTGCCTGA
GAATCAAGCCGTCTTAAACAAACTAATACTCTTAATCAGTAGAAGCAATTCTATTAAGAACATGACCAAGATGTATATTA
ATGATGATTGGTCTCAGATATCAATAATCATAAGAACTGATCAAAATTCAACTGAAGAAATTAAAAATTTTGCCAACTAT
GCAAGTAATTTGATTGAAAAATATATGCCAGGACATAAATATCAATTTTCAGGGGCTCATGACAAAATATTAATAGCTAA
AACCATGGTGACAGAACAAATTACAAATATTATTACAACACTAAGTGCAATAACAATATTGCTAATGTTATTCTTCAAAT
CCATGAAAATAGGAATAATAATTGTGATTCCAGTGGCATGGTCAGTATTTTTAAATTTTGCAGTAATGAAGCTTTTCGGA
ATAACACTAAATCCCGCAACAGCAACAATTGCATCAGTTAGTATGGGTATAGGAGTAGACTACTCCATTCATTTCTTTAA
TGCATTCATATTAAATTATCAAACAACTAAGGATTACAAAAAGGCTTTAATTGAATCAATTCCTGATGTGTTTAATGGAA
TATTTGCAAATTCAATATCAGTAGGGATAGGATTCTTAACATTAATATTTTCTACTTATAAAATAATTGCAACACTTGGC
GCAATCATAGCCTTTACAATGTTAACAACATCTCTTGCATCATTAACACTGCTTCCATTACTAATTTACCTATTTAAACC
CACAATTAAAATACGAAAGATAATAAAGGCAAAAATTACAGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCACAAAATCATGCAAAATATACAAAATAAACAAATAATAAAGATCATTACGGTCAAAGATAAGCTTATAAATATAGT
AACAAGATAACGAGGCAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATATGAAATAATAATATGATCAAAAAATAGTCAAACCTAAGATAAAATCTAAAAACCTTTAGATTTTAAAATAATAATT
TAATAACTTCTCTCATATTA

Product: antibiotic transport protein

Products: NA

Alternate protein names: RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Exporter Of RND Superfamily Protein; Integral Membrane Protein; Inner Membrane Transporter; Histidine Kinase; RND Superfamily Exporter; MMPL Domain-Containing Protein; Mmpl Family; Exporter; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; Exporters Of RND Superfamily; Transporter RND Superfamily

Number of amino acids: Translated: 761; Mature: 761

Protein sequence:

>761_residues
MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG
KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS
RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL
TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI
TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI
ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ
SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY
ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG
ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG
AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE

Sequences:

>Translated_761_residues
MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG
KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS
RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL
TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI
TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI
ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ
SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY
ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG
ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG
AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE
>Mature_761_residues
MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG
KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS
RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL
TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI
TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI
ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ
SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY
ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG
ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG
AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86077; Mature: 86077

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSL
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHH
LSTIVMFKDKKNIFNKETFGKINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDM
HHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFSRNLKSELEAMEATIKSYETD
HHHHHHCCHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKT
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LRTPIILTSLTTAFGFLSLITSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKH
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
KNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLIILLSSIVGLFNIEINFDEKD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHH
YFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ
HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHC
SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQI
CCCHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEE
SIIIRTDQNSTEEIKNFANYASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITT
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFGITLNPATATIASVSMGIGVD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
YSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG
EEHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSL
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHH
LSTIVMFKDKKNIFNKETFGKINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDM
HHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFSRNLKSELEAMEATIKSYETD
HHHHHHCCHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKT
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LRTPIILTSLTTAFGFLSLITSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKH
HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
KNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLIILLSSIVGLFNIEINFDEKD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHH
YFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ
HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHC
SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQI
CCCHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEE
SIIIRTDQNSTEEIKNFANYASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITT
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFGITLNPATATIASVSMGIGVD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
YSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG
EEHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA