Definition | Borrelia hermsii DAH chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010673 |
Length | 922,307 |
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The map label for this gene is 187918125
Identifier: 187918125
GI number: 187918125
Start: 260944
End: 263229
Strand: Direct
Name: 187918125
Synonym: BH0252
Alternate gene names: NA
Gene position: 260944-263229 (Clockwise)
Preceding gene: 187918124
Following gene: 187918127
Centisome position: 28.29
GC content: 27.82
Gene sequence:
>2286_bases ATGGATTTGGAAACCTTAAGCATTAAATACAGAGTTTTTATATTAATAATATTCACATTAATAACAATTTTTTTAGGATT TTTCTTAAAAAACATAGAATTCGATTCAAACATTTTAAAACTTCTCCCAAAGAGCGAAAAAAATGAAGAAACAATAGACA TAGACAACAACAATTCGCTCTTATCAACAATAGTAATGTTTAAAGATAAAAAAAATATTTTTAATAAAGAAACTTTTGGA AAAATTAATAAAGTAGCAAATGATATAGCCAAGATACTAAAAGTAAAACCCAACTCTGTTACAAGTATATTCACTTACTT TCCACAATTCAAAAAAGATGTATACACAGATGAAGATATGATTGAAATAAGAAATAAAGTCAATTCAACATCATTTATAA AAAAAATATTCATCAATGATGATGAAACCTTAATATACTTTATAGTAATATCAACAGCAGATGACAAAGCAAACTTTAGC CGAAATTTAAAGAGTGAACTTGAAGCAATGGAAGCTACAATTAAAAGTTATGAAACTGATGATCTTAAACTTTACTTAAC AGGAGATCTTGTAATAAGGGAAAAAATACTTAATTACATGGCTGATGACTTTAAATTATTAGGTCCGTTTGCTACTCTTG TAGTAATCCTATCACTCTATCTTATTGTAAAAAATATACTAGGAGCAATAATCCCTGTACTAATTGCAATATTTGCACTA ACTTGGACTTTTGGAATTAAAAGCCTTGTTATGTCTCCAATTACTGTTCCAGAAACCACAATGATAGTTCTCCTTATTTC GATTGGATGTGCTAATGGTGTACATATAATAAATGGAATATTAAAGAGAATAAAAAATGAACCTTACACTGAAAAAACAA TAATAACTACAATTAAAACCCTCAGAACACCAATAATTTTAACTTCTCTTACAACAGCTTTCGGGTTTTTATCATTAATA ACCTCATCAATTCAAGCATACAGAACAATGGGAATTTTTATGTCAATAGGAGTCATTATTGCAATGCTTATGTCCCTATT AGTACTGCCTGGAATACTAGTTAAAATACCATTTAAACATAAAAATAACGATAATAAAAACGCAAAAAATGCTTTCCTTG AAAAACTTTCTCTAATAAACCAAACAGTTACAAAATGGATATTAAATAACAAATATCTCTCATCTACTATGACTCTAATT ATTTTATTAAGCTCAATTGTAGGTCTTTTCAACATAGAAATTAACTTTGACGAAAAAGATTATTTTAAAGAAAATACAAG CGTCAAGCAAACACTTAATTTAATGCAAAGAGAAATAGGGGGAACGTCTATTATCAAAATTGAAATTAATGGTACTCCTG GTGAATTCAAAAATGAAAAAAATATGAAAAATTTGGATTTAATTACAGATGAGCTTGACAAATTTACTGATAAAACACAA TCCAGTTCAATAAACGGCGTCATAAGACTTATGAATTTTAAATTCAAAAAAGAAAATCCAAAAGAATATAGACTGCCTGA GAATCAAGCCGTCTTAAACAAACTAATACTCTTAATCAGTAGAAGCAATTCTATTAAGAACATGACCAAGATGTATATTA ATGATGATTGGTCTCAGATATCAATAATCATAAGAACTGATCAAAATTCAACTGAAGAAATTAAAAATTTTGCCAACTAT GCAAGTAATTTGATTGAAAAATATATGCCAGGACATAAATATCAATTTTCAGGGGCTCATGACAAAATATTAATAGCTAA AACCATGGTGACAGAACAAATTACAAATATTATTACAACACTAAGTGCAATAACAATATTGCTAATGTTATTCTTCAAAT CCATGAAAATAGGAATAATAATTGTGATTCCAGTGGCATGGTCAGTATTTTTAAATTTTGCAGTAATGAAGCTTTTCGGA ATAACACTAAATCCCGCAACAGCAACAATTGCATCAGTTAGTATGGGTATAGGAGTAGACTACTCCATTCATTTCTTTAA TGCATTCATATTAAATTATCAAACAACTAAGGATTACAAAAAGGCTTTAATTGAATCAATTCCTGATGTGTTTAATGGAA TATTTGCAAATTCAATATCAGTAGGGATAGGATTCTTAACATTAATATTTTCTACTTATAAAATAATTGCAACACTTGGC GCAATCATAGCCTTTACAATGTTAACAACATCTCTTGCATCATTAACACTGCTTCCATTACTAATTTACCTATTTAAACC CACAATTAAAATACGAAAGATAATAAAGGCAAAAATTACAGAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATCACAAAATCATGCAAAATATACAAAATAAACAAATAATAAAGATCATTACGGTCAAAGATAAGCTTATAAATATAGT AACAAGATAACGAGGCAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATATGAAATAATAATATGATCAAAAAATAGTCAAACCTAAGATAAAATCTAAAAACCTTTAGATTTTAAAATAATAATT TAATAACTTCTCTCATATTA
Product: antibiotic transport protein
Products: NA
Alternate protein names: RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Exporter Of RND Superfamily Protein; Integral Membrane Protein; Inner Membrane Transporter; Histidine Kinase; RND Superfamily Exporter; MMPL Domain-Containing Protein; Mmpl Family; Exporter; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; Exporters Of RND Superfamily; Transporter RND Superfamily
Number of amino acids: Translated: 761; Mature: 761
Protein sequence:
>761_residues MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE
Sequences:
>Translated_761_residues MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE >Mature_761_residues MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSLLSTIVMFKDKKNIFNKETFG KINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDMIEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFS RNLKSELEAMEATIKSYETDDLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKTLRTPIILTSLTTAFGFLSLI TSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKHKNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLI ILLSSIVGLFNIEINFDEKDYFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQISIIIRTDQNSTEEIKNFANY ASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITTLSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFG ITLNPATATIASVSMGIGVDYSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE
Specific function: Unknown
COG id: COG1033
COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 86077; Mature: 86077
Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88
Prosite motif: PS50156 SSD
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSL CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHH LSTIVMFKDKKNIFNKETFGKINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDM HHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFSRNLKSELEAMEATIKSYETD HHHHHHCCHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKT HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LRTPIILTSLTTAFGFLSLITSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKH HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC KNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLIILLSSIVGLFNIEINFDEKD CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHH YFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHC SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQI CCCHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEE SIIIRTDQNSTEEIKNFANYASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITT EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH LSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFGITLNPATATIASVSMGIGVD HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC YSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG EEHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDLETLSIKYRVFILIIFTLITIFLGFFLKNIEFDSNILKLLPKSEKNEETIDIDNNNSL CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCHH LSTIVMFKDKKNIFNKETFGKINKVANDIAKILKVKPNSVTSIFTYFPQFKKDVYTDEDM HHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IEIRNKVNSTSFIKKIFINDDETLIYFIVISTADDKANFSRNLKSELEAMEATIKSYETD HHHHHHCCHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DLKLYLTGDLVIREKILNYMADDFKLLGPFATLVVILSLYLIVKNILGAIIPVLIAIFAL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TWTFGIKSLVMSPITVPETTMIVLLISIGCANGVHIINGILKRIKNEPYTEKTIITTIKT HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LRTPIILTSLTTAFGFLSLITSSIQAYRTMGIFMSIGVIIAMLMSLLVLPGILVKIPFKH HHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC KNNDNKNAKNAFLEKLSLINQTVTKWILNNKYLSSTMTLIILLSSIVGLFNIEINFDEKD CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHH YFKENTSVKQTLNLMQREIGGTSIIKIEINGTPGEFKNEKNMKNLDLITDELDKFTDKTQ HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHC SSSINGVIRLMNFKFKKENPKEYRLPENQAVLNKLILLISRSNSIKNMTKMYINDDWSQI CCCHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEE SIIIRTDQNSTEEIKNFANYASNLIEKYMPGHKYQFSGAHDKILIAKTMVTEQITNIITT EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH LSAITILLMLFFKSMKIGIIIVIPVAWSVFLNFAVMKLFGITLNPATATIASVSMGIGVD HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC YSIHFFNAFILNYQTTKDYKKALIESIPDVFNGIFANSISVGIGFLTLIFSTYKIIATLG EEHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPTIKIRKIIKAKITE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA