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Definition Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome chromosome I, complete sequence.
Accession NC_010602
Length 3,599,677

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The map label for this gene is 183220398

Identifier: 183220398

GI number: 183220398

Start: 1031461

End: 1034130

Strand: Direct

Name: 183220398

Synonym: LEPBI_I0994

Alternate gene names: NA

Gene position: 1031461-1034130 (Clockwise)

Preceding gene: 183220397

Following gene: 183220399

Centisome position: 28.65

GC content: 34.31

Gene sequence:

>2670_bases
ATGAGTTTTCCCTTTGTTAAGAGAATGAAATACCAGTTGTTTATGGTATTTGGATTGATTGTTTTAATTTCAATTCTAAA
AATCAGAGAAATCAAGTTAGGCGATGCTAAGGTTATGGAAGATGTTGAAACTTTAGTCATCACTCAGAATTGGCCCAGCA
AAACAGCCAGACAAATCGAAGAAAATGTAACCAAACCATGGGAAATGATCCTTAAATCTGTTGACGGTTATTTGGAATTA
AAATCGATTTCTGATCATGGAAATTTAGCACTCTACTTAACGTTGAGTCCAGAATTTCCCAAAGAAGAATTACTCCAATC
AGTTCGAAATGTGTACATTCTAAATCAAAACAAGTTTCCTCGAGACATTCATTTTCCCCGATTTGTTTATGATAAAGATA
AAGAATTTCATTTCATTCTTCTGAAAAAGGTAAAGTCTGATCGGACTTCATCCCTTTCTGATTTGGAACAAAGGATCAAA
GACATTGATTATGTGACGAAATTTGTATACCAACCCGAATTTGAGAGGGAAATACAAATCAAAGTGGACCATCTATCCTT
ATTACAATCATCACAACCAACAATGGTTCAAATTTACCAGTCCATACGTCGTCATTTTGAAGGTGTGAGAATGGATACAA
GTCGTGAGGAGTATTTTGTTACGGACTACCCTATCAAACCAATGGAGTGGGGGAAAATCCAAATTCAATTTGGAAATTTC
GGAAAAGTTTCACTCGGACAAATTGCTAGAGTGGAAGTGGAGCAAGTTGATGCAAAAAAAAATACAAGAGTGAATGGGAA
AAGTTTCGAATCCATCCTCATCCATACCGACAGCGGATTTAGACAATTGTTATTAGAATTGAAGTTAGTTGGGATACTAA
AAAGTTTTCCAGATTGGGAAATTGTTTTTTCCTCCCAAGAGGAATTATTCACAAACACTGTTGAATTGGTTTTCTTTTAT
CTATTGATCGAATCTTACTTAATGATATACCTAGGTTTGTACAAACGGAAATGGCTCGAAGCTTTCGTTTTCAGTTTTAG
TTTTCTTCTATTTCTCATTGTCGTATTTTTTTTCCTTCACTTGTTTCAAATTCCCATCGGTGATTCTGGTTTCGTATTTT
TGTTTGTTCTGAAATTATTTTTTCCTTTTGTACGTTTTCAACGTGTTTTATACCATAAGAAACAGATTGGGGGCTTTGTT
TTATTATTTTCTGTTTTGGTATGGCTAGAGTGGATTCCCATCTCTATCTTTGTTTTGATTTTTATTTTTTTCAATAGTCT
TGCAGTGTATCCTTTCTGTCGGAATTTGATTCTGGTATTTTTGAAACGAAAATGTGTTCTCACCTTAAACTTATCTACGT
TCCAAATTTCATTTCTGAATCGAATTTTAAATCCGAAACCAATTTCAAATCCTGGCGCTTTCTTTATGATCTCTGGTCTT
GTCCTTTTGTTTTCATTTTTTTATTCAGTGGAGGGCCTTTGGGTTTCGTTTCCCATCACATCCAATCAAAGTAGTATCCA
ACATGCTCGACTCGAATTTCCTACCTATACTTCGGAATCTGAAATCAATCGAGTCACAAGGCAGGTGGAAGAAGCAATTT
TAAGCCAACATTGGACCAAATTACTTGTTGTGACTCAAAAAAATTTTCGTTCCGAGTTTTATTTAAAACTGGCTGAATTG
ACAAACCCTCAACTATTTTCTACTTTGCCAACGGAAATGGGGTATTTCCATTTTGTAAAAGGTAAAGCAGTCCAAGACAC
TAACACACTTCGTTTTACAAATCAGGATCCGATTGCATTGGAAGTTTCTATTTTGAAGTTATTACCTTGGCTGAAAAGTA
GGAAGGAGATTAAGGAAGTTGTTTTAGGATTTCAAAAAGCGAGTGAAGGATTAAAGTTTCAATCGAATTCAACTCATCGT
GTTAAAATGAAAGCAGATGTCGATCCAACCATCAAAGAGTCAAGTTTTCAATTGAATCCAACCGTCGTTGCGAAAATGCC
TTTGGAAGAGAAAATAGTCGATGTGAAACTTATGCTCAATAAAACAATTTCAAAAGAGGAGTTTCGGAAACAACCCGTAC
CAACAAGAAACGGGAGTTTGGTATTTCTCGATTCTTTTCGAAATTTTTCTTCCATTAAAAATTTTGGGAGGATCTATCAT
AAAAATACTGAGACAAGTATGGAAATTTTGATCAAAGGAGAATCGCTCCCATGGGAAACAATTGAGGATGGGATTCGAAA
TTTTCTAAAAAACGATGAGACAGAGTATGCAGAACGTACTGAAACGAAATCAGGAGAACCACACTTTAGATTGGTGTTTT
TTGTTATCCTCGTATCCGTTTTGTTCTTTCGGAAACAATATTACAAAGAGTATGTATCTTTTGTAATCACGATCACTTTT
ATATGGAAATTCCAATCGATTCTTTTTACAAGAGACTATCTTCAATTGGGTATGGTAATCTTAGTTTATCTATTTTTTAG
TTTCACAATTCGAAAGAAAAATCAATGTTTGGCTCATTCAAATACCTTTATCATTGGATCATTATTTCTTTCCTATGTGT
ATCCTTGGAATGGTGGGGTTTACCTGTTTGAATCAATGTTTTTGATCTTTGCCTTTGGATATTTTTATCAAAAAAGCCTT
CATTATCTAAAAAATATTCAAACCAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCAGTGACAATTTGTATTGGAATTCTAGTTTCCGCCTATTTTGTATTCAAGATTTATCCAATTGTATTCTCAAAGTATT
TGAATGCCCGTGTGTAATGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTTTTTACCTCATAGAACGGAGGTTCTTTATGGTAAACGATCGCACTGGTTTTAGAGCCGTATCTATCATCCTTGT
TTTAATGTTATTTCTCACGG

Product: putative multidrug protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 889; Mature: 888

Protein sequence:

>889_residues
MSFPFVKRMKYQLFMVFGLIVLISILKIREIKLGDAKVMEDVETLVITQNWPSKTARQIEENVTKPWEMILKSVDGYLEL
KSISDHGNLALYLTLSPEFPKEELLQSVRNVYILNQNKFPRDIHFPRFVYDKDKEFHFILLKKVKSDRTSSLSDLEQRIK
DIDYVTKFVYQPEFEREIQIKVDHLSLLQSSQPTMVQIYQSIRRHFEGVRMDTSREEYFVTDYPIKPMEWGKIQIQFGNF
GKVSLGQIARVEVEQVDAKKNTRVNGKSFESILIHTDSGFRQLLLELKLVGILKSFPDWEIVFSSQEELFTNTVELVFFY
LLIESYLMIYLGLYKRKWLEAFVFSFSFLLFLIVVFFFLHLFQIPIGDSGFVFLFVLKLFFPFVRFQRVLYHKKQIGGFV
LLFSVLVWLEWIPISIFVLIFIFFNSLAVYPFCRNLILVFLKRKCVLTLNLSTFQISFLNRILNPKPISNPGAFFMISGL
VLLFSFFYSVEGLWVSFPITSNQSSIQHARLEFPTYTSESEINRVTRQVEEAILSQHWTKLLVVTQKNFRSEFYLKLAEL
TNPQLFSTLPTEMGYFHFVKGKAVQDTNTLRFTNQDPIALEVSILKLLPWLKSRKEIKEVVLGFQKASEGLKFQSNSTHR
VKMKADVDPTIKESSFQLNPTVVAKMPLEEKIVDVKLMLNKTISKEEFRKQPVPTRNGSLVFLDSFRNFSSIKNFGRIYH
KNTETSMEILIKGESLPWETIEDGIRNFLKNDETEYAERTETKSGEPHFRLVFFVILVSVLFFRKQYYKEYVSFVITITF
IWKFQSILFTRDYLQLGMVILVYLFFSFTIRKKNQCLAHSNTFIIGSLFLSYVYPWNGGVYLFESMFLIFAFGYFYQKSL
HYLKNIQTS

Sequences:

>Translated_889_residues
MSFPFVKRMKYQLFMVFGLIVLISILKIREIKLGDAKVMEDVETLVITQNWPSKTARQIEENVTKPWEMILKSVDGYLEL
KSISDHGNLALYLTLSPEFPKEELLQSVRNVYILNQNKFPRDIHFPRFVYDKDKEFHFILLKKVKSDRTSSLSDLEQRIK
DIDYVTKFVYQPEFEREIQIKVDHLSLLQSSQPTMVQIYQSIRRHFEGVRMDTSREEYFVTDYPIKPMEWGKIQIQFGNF
GKVSLGQIARVEVEQVDAKKNTRVNGKSFESILIHTDSGFRQLLLELKLVGILKSFPDWEIVFSSQEELFTNTVELVFFY
LLIESYLMIYLGLYKRKWLEAFVFSFSFLLFLIVVFFFLHLFQIPIGDSGFVFLFVLKLFFPFVRFQRVLYHKKQIGGFV
LLFSVLVWLEWIPISIFVLIFIFFNSLAVYPFCRNLILVFLKRKCVLTLNLSTFQISFLNRILNPKPISNPGAFFMISGL
VLLFSFFYSVEGLWVSFPITSNQSSIQHARLEFPTYTSESEINRVTRQVEEAILSQHWTKLLVVTQKNFRSEFYLKLAEL
TNPQLFSTLPTEMGYFHFVKGKAVQDTNTLRFTNQDPIALEVSILKLLPWLKSRKEIKEVVLGFQKASEGLKFQSNSTHR
VKMKADVDPTIKESSFQLNPTVVAKMPLEEKIVDVKLMLNKTISKEEFRKQPVPTRNGSLVFLDSFRNFSSIKNFGRIYH
KNTETSMEILIKGESLPWETIEDGIRNFLKNDETEYAERTETKSGEPHFRLVFFVILVSVLFFRKQYYKEYVSFVITITF
IWKFQSILFTRDYLQLGMVILVYLFFSFTIRKKNQCLAHSNTFIIGSLFLSYVYPWNGGVYLFESMFLIFAFGYFYQKSL
HYLKNIQTS
>Mature_888_residues
SFPFVKRMKYQLFMVFGLIVLISILKIREIKLGDAKVMEDVETLVITQNWPSKTARQIEENVTKPWEMILKSVDGYLELK
SISDHGNLALYLTLSPEFPKEELLQSVRNVYILNQNKFPRDIHFPRFVYDKDKEFHFILLKKVKSDRTSSLSDLEQRIKD
IDYVTKFVYQPEFEREIQIKVDHLSLLQSSQPTMVQIYQSIRRHFEGVRMDTSREEYFVTDYPIKPMEWGKIQIQFGNFG
KVSLGQIARVEVEQVDAKKNTRVNGKSFESILIHTDSGFRQLLLELKLVGILKSFPDWEIVFSSQEELFTNTVELVFFYL
LIESYLMIYLGLYKRKWLEAFVFSFSFLLFLIVVFFFLHLFQIPIGDSGFVFLFVLKLFFPFVRFQRVLYHKKQIGGFVL
LFSVLVWLEWIPISIFVLIFIFFNSLAVYPFCRNLILVFLKRKCVLTLNLSTFQISFLNRILNPKPISNPGAFFMISGLV
LLFSFFYSVEGLWVSFPITSNQSSIQHARLEFPTYTSESEINRVTRQVEEAILSQHWTKLLVVTQKNFRSEFYLKLAELT
NPQLFSTLPTEMGYFHFVKGKAVQDTNTLRFTNQDPIALEVSILKLLPWLKSRKEIKEVVLGFQKASEGLKFQSNSTHRV
KMKADVDPTIKESSFQLNPTVVAKMPLEEKIVDVKLMLNKTISKEEFRKQPVPTRNGSLVFLDSFRNFSSIKNFGRIYHK
NTETSMEILIKGESLPWETIEDGIRNFLKNDETEYAERTETKSGEPHFRLVFFVILVSVLFFRKQYYKEYVSFVITITFI
WKFQSILFTRDYLQLGMVILVYLFFSFTIRKKNQCLAHSNTFIIGSLFLSYVYPWNGGVYLFESMFLIFAFGYFYQKSLH
YLKNIQTS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104639; Mature: 104508

Theoretical pI: Translated: 9.73; Mature: 9.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFPFVKRMKYQLFMVFGLIVLISILKIREIKLGDAKVMEDVETLVITQNWPSKTARQIE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHH
ENVTKPWEMILKSVDGYLELKSISDHGNLALYLTLSPEFPKEELLQSVRNVYILNQNKFP
HHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCEEEECCCCCC
RDIHFPRFVYDKDKEFHFILLKKVKSDRTSSLSDLEQRIKDIDYVTKFVYQPEFEREIQI
CCCCCCCEEECCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
KVDHLSLLQSSQPTMVQIYQSIRRHFEGVRMDTSREEYFVTDYPIKPMEWGKIQIQFGNF
EEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC
GKVSLGQIARVEVEQVDAKKNTRVNGKSFESILIHTDSGFRQLLLELKLVGILKSFPDWE
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
IVFSSQEELFTNTVELVFFYLLIESYLMIYLGLYKRKWLEAFVFSFSFLLFLIVVFFFLH
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFQIPIGDSGFVFLFVLKLFFPFVRFQRVLYHKKQIGGFVLLFSVLVWLEWIPISIFVLI
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFFNSLAVYPFCRNLILVFLKRKCVLTLNLSTFQISFLNRILNPKPISNPGAFFMISGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VLLFSFFYSVEGLWVSFPITSNQSSIQHARLEFPTYTSESEINRVTRQVEEAILSQHWTK
HHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LLVVTQKNFRSEFYLKLAELTNPQLFSTLPTEMGYFHFVKGKAVQDTNTLRFTNQDPIAL
EEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHCCCEEEECCCEECCCCCEEECCCCCCEE
EVSILKLLPWLKSRKEIKEVVLGFQKASEGLKFQSNSTHRVKMKADVDPTIKESSFQLNP
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEECC
TVVAKMPLEEKIVDVKLMLNKTISKEEFRKQPVPTRNGSLVFLDSFRNFSSIKNFGRIYH
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHC
KNTETSMEILIKGESLPWETIEDGIRNFLKNDETEYAERTETKSGEPHFRLVFFVILVSV
CCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
NTFIIGSLFLSYVYPWNGGVYLFESMFLIFAFGYFYQKSLHYLKNIQTS
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SFPFVKRMKYQLFMVFGLIVLISILKIREIKLGDAKVMEDVETLVITQNWPSKTARQIE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHH
ENVTKPWEMILKSVDGYLELKSISDHGNLALYLTLSPEFPKEELLQSVRNVYILNQNKFP
HHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCEEEECCCCCC
RDIHFPRFVYDKDKEFHFILLKKVKSDRTSSLSDLEQRIKDIDYVTKFVYQPEFEREIQI
CCCCCCCEEECCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
KVDHLSLLQSSQPTMVQIYQSIRRHFEGVRMDTSREEYFVTDYPIKPMEWGKIQIQFGNF
EEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC
GKVSLGQIARVEVEQVDAKKNTRVNGKSFESILIHTDSGFRQLLLELKLVGILKSFPDWE
CCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
IVFSSQEELFTNTVELVFFYLLIESYLMIYLGLYKRKWLEAFVFSFSFLLFLIVVFFFLH
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFQIPIGDSGFVFLFVLKLFFPFVRFQRVLYHKKQIGGFVLLFSVLVWLEWIPISIFVLI
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFFNSLAVYPFCRNLILVFLKRKCVLTLNLSTFQISFLNRILNPKPISNPGAFFMISGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VLLFSFFYSVEGLWVSFPITSNQSSIQHARLEFPTYTSESEINRVTRQVEEAILSQHWTK
HHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LLVVTQKNFRSEFYLKLAELTNPQLFSTLPTEMGYFHFVKGKAVQDTNTLRFTNQDPIAL
EEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHCCCEEEECCCEECCCCCEEECCCCCCEE
EVSILKLLPWLKSRKEIKEVVLGFQKASEGLKFQSNSTHRVKMKADVDPTIKESSFQLNP
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEECC
TVVAKMPLEEKIVDVKLMLNKTISKEEFRKQPVPTRNGSLVFLDSFRNFSSIKNFGRIYH
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHC
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CCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LFFRKQYYKEYVSFVITITFIWKFQSILFTRDYLQLGMVILVYLFFSFTIRKKNQCLAHS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
NTFIIGSLFLSYVYPWNGGVYLFESMFLIFAFGYFYQKSLHYLKNIQTS
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA