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The map label for this gene is ypnP [H]

Identifier: 170755229

GI number: 170755229

Start: 385884

End: 387212

Strand: Direct

Name: ypnP [H]

Synonym: CLD_0446

Alternate gene names: 170755229

Gene position: 385884-387212 (Clockwise)

Preceding gene: 170755860

Following gene: 170757440

Centisome position: 9.75

GC content: 30.85

Gene sequence:

>1329_bases
ATGGAAACCGATATGACAAAAGGAAAACCAATGGGAATCATTGTAAGGTTCTTTATTCCTATGTTTATTGGAAATTTATT
TCAACAAATATACAATGTAGTAGATTCCATTGTTGTAGGGCGATTTGTAGGAAATGAAGCCTTTGCAGCTGTGGGTTCCT
GCTTCCTCATTATGAGTTTTATGACATCTATTTTAATTGGACTAGCTATGGGAGCATCTGCATTCTTCTCACAACTTTAT
GGTGCAAAACAATATGATGAAATGAAAAAAGCTATATCTACTTCATTTTTTTTCATATTATTTATAAGCATTCTGTTAAG
TATTATAACAAACGTATTTCTTTATGAAATAATTGAATTATTTCAGATGCCCAAAGATACTGTAACATATTCTGCTGAAT
ATTTAAGGTATATCTTAACAGGGCTTATATTCACCGGACTTTATAATATATGTGCTTATTTGTTACGTTCCGTTGGAGAT
TCAAAATCTCCACTATATTTTTTGATTGTTTCTTGTATTGTAAATACTATTTTAGATTTAATTTTTGTCTTAGTGTTTAA
CATGGGAGTTTCAGGTGTGGGATTAGCTACATTTATAGCACAAGGATTGTCCGCATTATGGTGTGCATTTTATACTGTAA
AACATATGAAATTCCTTGATTTTAAAAGAAAAGATATTGTATTTAGTAGAAAACTTTTTAAAACGATTTTAAGCTATTCT
GTTTTGACAGCAGTGCAGCAATCTCTATCAAGTTTTGGAATGTTAATGATTCAAGGATTAATTAATACATTCGGAACTAC
TGTGATGGCTGCCTTTGCAGCTTGTTCAAAGATTGATGAGTTTGCTAATCGTCCTTTACAGGATTTAAGTAATGCATTTT
CAACTTATGTTGCACAAAATAAGGGAGCAGGAAATATAGAAAGGATTCGTCAAGGGTTTTATGCCATTTTAAAGGTTATT
GCTTTAATCTCTTTTATAATATCAATAGTTGTTTTTATTTTCGCACCTAATTTAATTTCAATTTTTGTGAAAAAGGAATC
CATAGATATTATTCAGGTTGGGGTAGGTTATCTTCGGATTGTATGTATTTTTTACATATTACTTGGTTGTATCGTTATGT
TTTATGGATTTTTCCGTGGTATGGGAGAAGTTAATATATCAATTATTTTAACTGTTGTATCTCAAGGAATAAGAGTAGCC
TTGGCCTATGGACTAGCCAGAACATCTATGGGATTTACAGGAATATGCTGGTCCATTGTAATTGGATGGTTCTTATCCAA
TGCTTTAGGTGGATTTATGTATAAAAAAGTAATGGCAAATTCAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGTGAGATATATACCAATCCTATAACGGGAAAAATGGCTATTGCTTATAAAATGCCTAAATATTAAAGCGTGCATATCT
GAAAAAAAGGAGGTTTTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATATAGATAGGAGTGTTATATGAACACTCCTACTTTTAGTGCACTCAGTACTGGCAATAACTTAGCTTATTGATGAAA
GTCTGAGATTATCTTAATAG

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 442; Mature: 442

Protein sequence:

>442_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILFISILLSIITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSVGD
SKSPLYFLIVSCIVNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMANSI

Sequences:

>Translated_442_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILFISILLSIITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSVGD
SKSPLYFLIVSCIVNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMANSI
>Mature_442_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILFISILLSIITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSVGD
SKSPLYFLIVSCIVNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMANSI

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49157; Mature: 49157

Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
6.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
6.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]