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The map label for this gene is yycA [H]

Identifier: 170754469

GI number: 170754469

Start: 379016

End: 381268

Strand: Direct

Name: yycA [H]

Synonym: CLD_0451

Alternate gene names: 170754469

Gene position: 379016-381268 (Clockwise)

Preceding gene: 170754483

Following gene: 170755498

Centisome position: 9.58

GC content: 32.71

Gene sequence:

>2253_bases
ATGAAAAAGATAAAGTTTACAAAAGAGAATATAGCGTTATCGTTAATTTTGATATTATCTTTAATATTAAATTTAGCGAA
TTTGAACATAGAAGGATACGCAAATCAATATTATGCTGCAGGTGTAAAGAGTATGACTTTAAGTTTAAAGAACTTTTTCT
TTATATCCTTTGATCCAGCCAGTTTTGTAAGTATTGATAAGCCACCTTTAGGTTTTTGGATCCAAGCTATATTTGCTAAA
ATATTTGGCTTTAGTGGATGGAGTATAATATTACCTCAGGCTATTGCAGGGGTAGTATCAGTAGGATTAATATATGTTAT
TGTTAAAAGGAGCTTTGGAGCTGTTGCGGGTCTTATTTCTGCAATATGTCTTGCAGTTACGCCTGTTTTTGTAGCTGTAA
GTAGAAATAACACTTGTGATAATTTACTTGTTTTAACATTACTATTAGCTTGCTTAGTTCTTTCTAAGGCAGCAGAAAAA
GGGAAACTAAAATATCTTTTAATAAGTTTAGCAATTATAGGGATCGGATTTAATATAAAAATGCTTCAAGCATATATGAT
AATACCAGCTATATATATAACTTATCTTCTTTCTAATGCAGTATCCTTTAAAAAAAGAATAGTTCATCTTATGGCTGGTA
CAATTATTTTAATTTTAGTTTCATTGTCCTGGGCCTTTATTGTAGACTTAATACCTGAAGGAAATAGACCTTATGTAGGA
AGTAGTACTAATAATTCGGTTATGGAGCTTATAATAGGACATAATGGTCTTGAGAGACTTGGTATTGGTAGTAAATCAAC
TCAGGGTGGTGGGGCACCAGGAGGAATGGATGGGAAAAATCAGCAAAAAACTGATGGGACTTCCAGTGCAACTAAAAATA
AAGATTCAGAGCAAACATCAAAGGAGAATGGGCAAACCGGAGGAGAGACACCATCAATAGACAATGATCAAATGCAAGGA
CAACCTCCATCAATGGATAATGGAGAAATGCAAGGGGACCCTCCTAATACTCAAGATGGAGGAAAAGGGAATGCTAATCC
TCCTAATGGTGATGGAAAAGGTCCCGGTGGAATGCAGAAGCCTAATGGAGGAGGAATGGGAGGAACCTTTGGGGGCCAAG
AAGTTGCAAGTATTGCTAGATTATTCTCTAATAATAGCTTATCAGACCAAATTATTTGGTTATTTCCTCTTGCTGTGTTT
GGATTTATAGCAGCGGCAATAAAAGAAAAGCTAAATAAGACTTCTGATAATAAAAGAAAGTTGTCATTAGTACTGTGGAG
TATGTGGTTATTACCTGAATTTATATACTTCAGTTTTACAAAAGGGCTATTCCACCCTTATTATTTAACTATGCTAGCTC
CACCAATTTCAGCTTTAGTAGGAATTGGAATTGTGTCAATGTGGAAGTTATATAATGAGAATGGCTTGAAGTCTTGGATT
TTACCAGTAGCACTTATCGCAGACGGATTAACTCAGATATTAATATTATCTTATTATTATAATATATCAAACACAGCCAA
AATTTTAAGCACAATAGTAGCAGTTTCATGTATTGTATCTACGATCATACTAGCTATAGTTAACTTAACAAAAAATAAAA
AAGATACGTTAAAATTTAAAAGTATAAAATTTAAGAAATCACTGGTTACTATTGCTTTAATGGGGCTTTTAATAACTCCT
TTAGTTTGCTCTGCTACTACAATTCTTTATCCAATGTCTGGGACTTTCCCATCTGCTGGATTATCATTAATGACTAATAA
GCAAAAAGATGGTTTTAATATGGGTGATCCTAATAGTGGTAATACAAAGCTAATAGAATTTCTAAAGAGTCATAAAACAA
ATGAAAAATATCTTCTTGTTACTTCATCCACTAATGGGTATGCTTCAGATATAATTATAAATACTGGAGAATCTGTAATG
GCACTCGGAGGTTTCTTTGGAACAGATAAGGTAATTACCTTAGATGAATTTAAAGAACTAGTTAATAATGGAGAAGTTAG
ATATGTAATGGTAGGTGGTATGGGAGGAAACTCAAGTAGCGATATTATGAATTGGGTTAAAGAAAATGGTAAAGTTGTTT
CAGAAAGTGAATGGAAAAATTCAAATGAGGTAAATAGTGAAAGAGTTAATAAGGACGACAATAATAAAGAAAACTCAAAT
TCAAATACTAAACAATTCACCCCAGAAGGAAAAGGGAATTCTGAACAGTTATACGATTTAAAAAATTATACTGATACCAC
AACAAAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATAGCATGTAAATAAACATATAAAAAATAAGAAATACTTAATTTTAGAAATGGATAAAGTGAAAACTAACATATATT
TTGAGTGGGGGATATAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTATATATAGGTAAGCTTGGTAAATAATGTTTCAAACCCACCACAGAAATGTGGTGGGTTTTATGTATTTAATACT
CTATTTTTTAAGTATATAAA

Product: dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 750; Mature: 750

Protein sequence:

>750_residues
MKKIKFTKENIALSLILILSLILNLANLNIEGYANQYYAAGVKSMTLSLKNFFFISFDPASFVSIDKPPLGFWIQAIFAK
IFGFSGWSIILPQAIAGVVSVGLIYVIVKRSFGAVAGLISAICLAVTPVFVAVSRNNTCDNLLVLTLLLACLVLSKAAEK
GKLKYLLISLAIIGIGFNIKMLQAYMIIPAIYITYLLSNAVSFKKRIVHLMAGTIILILVSLSWAFIVDLIPEGNRPYVG
SSTNNSVMELIIGHNGLERLGIGSKSTQGGGAPGGMDGKNQQKTDGTSSATKNKDSEQTSKENGQTGGETPSIDNDQMQG
QPPSMDNGEMQGDPPNTQDGGKGNANPPNGDGKGPGGMQKPNGGGMGGTFGGQEVASIARLFSNNSLSDQIIWLFPLAVF
GFIAAAIKEKLNKTSDNKRKLSLVLWSMWLLPEFIYFSFTKGLFHPYYLTMLAPPISALVGIGIVSMWKLYNENGLKSWI
LPVALIADGLTQILILSYYYNISNTAKILSTIVAVSCIVSTIILAIVNLTKNKKDTLKFKSIKFKKSLVTIALMGLLITP
LVCSATTILYPMSGTFPSAGLSLMTNKQKDGFNMGDPNSGNTKLIEFLKSHKTNEKYLLVTSSTNGYASDIIINTGESVM
ALGGFFGTDKVITLDEFKELVNNGEVRYVMVGGMGGNSSSDIMNWVKENGKVVSESEWKNSNEVNSERVNKDDNNKENSN
SNTKQFTPEGKGNSEQLYDLKNYTDTTTKK

Sequences:

>Translated_750_residues
MKKIKFTKENIALSLILILSLILNLANLNIEGYANQYYAAGVKSMTLSLKNFFFISFDPASFVSIDKPPLGFWIQAIFAK
IFGFSGWSIILPQAIAGVVSVGLIYVIVKRSFGAVAGLISAICLAVTPVFVAVSRNNTCDNLLVLTLLLACLVLSKAAEK
GKLKYLLISLAIIGIGFNIKMLQAYMIIPAIYITYLLSNAVSFKKRIVHLMAGTIILILVSLSWAFIVDLIPEGNRPYVG
SSTNNSVMELIIGHNGLERLGIGSKSTQGGGAPGGMDGKNQQKTDGTSSATKNKDSEQTSKENGQTGGETPSIDNDQMQG
QPPSMDNGEMQGDPPNTQDGGKGNANPPNGDGKGPGGMQKPNGGGMGGTFGGQEVASIARLFSNNSLSDQIIWLFPLAVF
GFIAAAIKEKLNKTSDNKRKLSLVLWSMWLLPEFIYFSFTKGLFHPYYLTMLAPPISALVGIGIVSMWKLYNENGLKSWI
LPVALIADGLTQILILSYYYNISNTAKILSTIVAVSCIVSTIILAIVNLTKNKKDTLKFKSIKFKKSLVTIALMGLLITP
LVCSATTILYPMSGTFPSAGLSLMTNKQKDGFNMGDPNSGNTKLIEFLKSHKTNEKYLLVTSSTNGYASDIIINTGESVM
ALGGFFGTDKVITLDEFKELVNNGEVRYVMVGGMGGNSSSDIMNWVKENGKVVSESEWKNSNEVNSERVNKDDNNKENSN
SNTKQFTPEGKGNSEQLYDLKNYTDTTTKK
>Mature_750_residues
MKKIKFTKENIALSLILILSLILNLANLNIEGYANQYYAAGVKSMTLSLKNFFFISFDPASFVSIDKPPLGFWIQAIFAK
IFGFSGWSIILPQAIAGVVSVGLIYVIVKRSFGAVAGLISAICLAVTPVFVAVSRNNTCDNLLVLTLLLACLVLSKAAEK
GKLKYLLISLAIIGIGFNIKMLQAYMIIPAIYITYLLSNAVSFKKRIVHLMAGTIILILVSLSWAFIVDLIPEGNRPYVG
SSTNNSVMELIIGHNGLERLGIGSKSTQGGGAPGGMDGKNQQKTDGTSSATKNKDSEQTSKENGQTGGETPSIDNDQMQG
QPPSMDNGEMQGDPPNTQDGGKGNANPPNGDGKGPGGMQKPNGGGMGGTFGGQEVASIARLFSNNSLSDQIIWLFPLAVF
GFIAAAIKEKLNKTSDNKRKLSLVLWSMWLLPEFIYFSFTKGLFHPYYLTMLAPPISALVGIGIVSMWKLYNENGLKSWI
LPVALIADGLTQILILSYYYNISNTAKILSTIVAVSCIVSTIILAIVNLTKNKKDTLKFKSIKFKKSLVTIALMGLLITP
LVCSATTILYPMSGTFPSAGLSLMTNKQKDGFNMGDPNSGNTKLIEFLKSHKTNEKYLLVTSSTNGYASDIIINTGESVM
ALGGFFGTDKVITLDEFKELVNNGEVRYVMVGGMGGNSSSDIMNWVKENGKVVSESEWKNSNEVNSERVNKDDNNKENSN
SNTKQFTPEGKGNSEQLYDLKNYTDTTTKK

Specific function: Unknown

COG id: COG1807

COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 39 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003342 [H]

Pfam domain/function: PF02366 PMT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81127; Mature: 81127

Theoretical pI: Translated: 9.58; Mature: 9.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKIKFTKENIALSLILILSLILNLANLNIEGYANQYYAAGVKSMTLSLKNFFFISFDPA
CCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECEEEEEEECCC
SFVSIDKPPLGFWIQAIFAKIFGFSGWSIILPQAIAGVVSVGLIYVIVKRSFGAVAGLIS
CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AICLAVTPVFVAVSRNNTCDNLLVLTLLLACLVLSKAAEKGKLKYLLISLAIIGIGFNIK
HHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHH
MLQAYMIIPAIYITYLLSNAVSFKKRIVHLMAGTIILILVSLSWAFIVDLIPEGNRPYVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SSTNNSVMELIIGHNGLERLGIGSKSTQGGGAPGGMDGKNQQKTDGTSSATKNKDSEQTS
CCCCCHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
KENGQTGGETPSIDNDQMQGQPPSMDNGEMQGDPPNTQDGGKGNANPPNGDGKGPGGMQK
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PNGGGMGGTFGGQEVASIARLFSNNSLSDQIIWLFPLAVFGFIAAAIKEKLNKTSDNKRK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSLVLWSMWLLPEFIYFSFTKGLFHPYYLTMLAPPISALVGIGIVSMWKLYNENGLKSWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LPVALIADGLTQILILSYYYNISNTAKILSTIVAVSCIVSTIILAIVNLTKNKKDTLKFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
SIKFKKSLVTIALMGLLITPLVCSATTILYPMSGTFPSAGLSLMTNKQKDGFNMGDPNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCCCCC
NTKLIEFLKSHKTNEKYLLVTSSTNGYASDIIINTGESVMALGGFFGTDKVITLDEFKEL
CHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHH
VNNGEVRYVMVGGMGGNSSSDIMNWVKENGKVVSESEWKNSNEVNSERVNKDDNNKENSN
HCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCC
SNTKQFTPEGKGNSEQLYDLKNYTDTTTKK
CCCCEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKIKFTKENIALSLILILSLILNLANLNIEGYANQYYAAGVKSMTLSLKNFFFISFDPA
CCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECEEEEEEECCC
SFVSIDKPPLGFWIQAIFAKIFGFSGWSIILPQAIAGVVSVGLIYVIVKRSFGAVAGLIS
CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AICLAVTPVFVAVSRNNTCDNLLVLTLLLACLVLSKAAEKGKLKYLLISLAIIGIGFNIK
HHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHH
MLQAYMIIPAIYITYLLSNAVSFKKRIVHLMAGTIILILVSLSWAFIVDLIPEGNRPYVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SSTNNSVMELIIGHNGLERLGIGSKSTQGGGAPGGMDGKNQQKTDGTSSATKNKDSEQTS
CCCCCHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
KENGQTGGETPSIDNDQMQGQPPSMDNGEMQGDPPNTQDGGKGNANPPNGDGKGPGGMQK
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PNGGGMGGTFGGQEVASIARLFSNNSLSDQIIWLFPLAVFGFIAAAIKEKLNKTSDNKRK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSLVLWSMWLLPEFIYFSFTKGLFHPYYLTMLAPPISALVGIGIVSMWKLYNENGLKSWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LPVALIADGLTQILILSYYYNISNTAKILSTIVAVSCIVSTIILAIVNLTKNKKDTLKFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
SIKFKKSLVTIALMGLLITPLVCSATTILYPMSGTFPSAGLSLMTNKQKDGFNMGDPNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCCCCC
NTKLIEFLKSHKTNEKYLLVTSSTNGYASDIIINTGESVMALGGFFGTDKVITLDEFKEL
CHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHH
VNNGEVRYVMVGGMGGNSSSDIMNWVKENGKVVSESEWKNSNEVNSERVNKDDNNKENSN
HCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCC
SNTKQFTPEGKGNSEQLYDLKNYTDTTTKK
CCCCEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]