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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 170754401

GI number: 170754401

Start: 401875

End: 403737

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CLD_0431

Alternate gene names: 170754401

Gene position: 401875-403737 (Clockwise)

Preceding gene: 170757684

Following gene: 170755040

Centisome position: 10.15

GC content: 24.91

Gene sequence:

>1863_bases
ATGAATTTTAGAGAATTTTCCACCAAAAATGTAGTAAGAAATATTAGAGCATATTTTGCATATTTATTAAGTAGTACTAT
ATCAGCAGCTTTATTATTTTCATTTACTATGCTTATATTACATCCTAATTTAGATGTAACTACATTTCCAATATATTTAC
AGAAGGCATTTAATATAACAACAATAATTGCATATCTATTTTTATGTTTATTTATATTTTATTCTGTAAGTGTATTTATA
AAGAGTAGGTTTAAAGAGTTCGGTATATTATATATTTTAGGATCTTCGGATAAACAAATTAAAAAGATGATTGCAATTGA
AAATGTATTAATTAGCTCACTATCTGGAATATTTGGGGTTATATTAGGATTAGTTTTTTCTAAAATATTTTTAATACTTA
GTGGAAGACTTTTAGGGTATAATGCTTTACGATTCTATTTGCCAGTTAAAGCAATTATAATAACTTTTTTAACCTTTGTT
TTAATGGGAATTTTAATTTCTATCTTTACTACATATATGATAAAGGAAGATGAAGTTTTAAATTTACTCAAGGGCACACA
AAAACCAAAGAGTGAGCCAAAGACTTCAAATATTATTGCAATATTGTGTGTAGTATTATTGCTTGGAGGATATTATTTTT
CTATTACATCAACTATGAATAGTATAGCCTATAGAATTATACCTGTAACAGTAGTAGTTATAATTGGAACATATTTGTTG
TTTTCACAATTAAGTGTTTTTGTAATAAAGATTTTAAAAAAGAATAGAGAATTCTATATGAATAAAACAAAGGTATTATG
GATTTCAACCCTTTTATATAGGATAAAGGATAATACTAGAATGTTCTTTTTAATCACCATAACTTCTGCCATGGCATTTA
CATCTATTGGAGCTGTATCAGCTTTTTGGATCAATAAGGAGGCTGAAGTTGATAAAAATTTTCCTCAAGCATTTTTTTAC
GCATCTTACAAAAAAGATTATAACGAATTAGATTTTATAGAAGGTTCTTTAAAAAAAGAAGGTTATAATTATACAAAAGT
TCAAGGGCATATCAAGTCTTTAGTATCTAAGAAAAATACTATACCTATAAATATAATTAATGAAAGTACCTATAATAGTA
TAGCTGAATCACTTGGACAAGAAAAAATACATATTAAAAGTAATGAAGCAATAGCAGGGACACCATTAATGGGTAATAAG
AGAGATAATATTTTAGTAGATAATATGGATATAAAAGTTATCACAACGTTAGAAGAAAGAATAATTCCTGCATTATATGA
TTATGTATATATTGTAAAAGATGATGTATATGATAAAATTAGTGGTTCAACATCTTCATTTTGCGCATTTAATGTAGAAA
GTTATAAAGATACTTTGAATATTTGTAAAAACTATGAGGGAAAATTTGGAGAAAGCAATAATAAGAAAGATCATATTATT
TTAATGAAAGCGAATATACTAGAATCACATAAAATAGGATATGGAGTGATTATGTTCTTAACTATATTCATAGGAATAAT
TTTCTTTGTAACTACGGGGAGCTTTTTATATAACAAATATTATATGGATGTTCAACAAGATAGAATGAAGTATGAACAGC
TAAATAAAATTGGGATAACCTTTAAAGAAATAAAAAAAGTATCAACTATTGAAATTGGAGTACTATTTTTGTTTCCTTAT
ATTGTTTCAGTAATACATTCACTATTTGCATTGTCAGCATTAAAAAATGCCTTTGAAATGGATGTTAACTTAGTAGCATT
TTTTGTAATGGGTAGTTTCTTCATTATTCAAATAATATATTTTTTAATAATAAGAGGAAACTACTTATTAGATATAAAAA
AAGGATTAGTAAATAGAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGACGGAGTTATATACAATGAAATTTATAAGGGGGAGAGTAGGCAGCAATTCTATCAAGAAATAATAGATTTACTTGCA
TTATTAGGAGGTGGTAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAGAAAAAGTTATACGTATAAAAAAATATATATAGCTTTTATATGATATCTAATATGTTTAAATAAACTAACTGTTAT
TATATAATAATATATAATAA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620

Protein sequence:

>620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLILHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLTFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNSIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFLIIRGNYLLDIKKGLVNRI

Sequences:

>Translated_620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLILHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLTFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNSIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFLIIRGNYLLDIKKGLVNRI
>Mature_620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLILHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLTFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNSIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVDNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFLIIRGNYLLDIKKGLVNRI

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70910; Mature: 70910

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLILHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLTFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNSIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVDNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKDHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLIIRGNYLLDIKKGLVNRI
HHHHCCCEEEEEHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLILHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLTFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNSIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVDNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEGKFGESNNKKDHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLIIRGNYLLDIKKGLVNRI
HHHHCCCEEEEEHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]