Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome.
Accession NC_010503
Length 751,679

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The map label for this gene is 170762239

Identifier: 170762239

GI number: 170762239

Start: 61190

End: 63355

Strand: Direct

Name: 170762239

Synonym: UPA3_0051

Alternate gene names: NA

Gene position: 61190-63355 (Clockwise)

Preceding gene: 170762158

Following gene: 170762321

Centisome position: 8.14

GC content: 23.87

Gene sequence:

>2166_bases
ATGAGAAATAAATTGAAAATAAAATTAAAATTTTTAGCTTCACTAGCAACAATACCAATTGTAGCTTCACCATTAATTTT
TTCTGTTGCAGCTAATGAGGATGGTAAACAAGAAAACAATAATGGTAATAATCATGATCCTAATCAACAAAAAAAACCAA
AAATTCCTAAAAACGATCCTAATTTTAATACTTTTAAAACTGATGCTGATAAAACTGTTAAAGATAGTTTAGAAAAAGGA
ATTAATGCTGCTATTGTTTATGTAAAATCACGTCAAGAAGAAATTTTAGAAAATAAAGAAATTGAGTTTAAGAAAAAAAT
TCAACAACTAATTTATTTAAAAAATCTGCAGTCATATCTTGAGAAAAATAAAGAAAACATCTTAAAAAATCCTAATGATT
ATGGTTTTTATTTAAATACTCCTCAAATTTTAGGAACTCTTAAAAATTATGATATTAAAGATATTGAGTTTAATGGAGAA
ACATATAAGCAAATCAAAGTTGGCAAAACTGATCCTTTAAATTATCAAAAAGCCGTTGCTCCAAAAGGAAAAATTAGTGA
TGTACAAAGTGATCAAATTAATGATGTTGAAGAAACAAAATACAAAGATACGTTAAAAAAATATGAATCTGAATTTTTAA
AAGAAATTAATAAATTAATTTATGATGAAAATGATGTTCCACAAATTAACAAAGATGTTGAGTTAACACGTGATGAAAAA
GGACAATTTAATACAACTTTACCTAAAGGTTATAATGATTGAAACGCTTATTTTATTTCTAAAATAAAAGATCGTGTTAC
AGCATTTGATTTAAAACAAAATCAACAAACAAACGAAGATAAACAAGAAGAACAGCCAAATGAGCAAAAAGATCCCGATA
CACCACCACCATTACCACCACCATTAGTAGAAGGCGATCATAATGAAATAGATCTTCCCCCAACACAAGCTAATGCTATT
ATTTCTTCTTTACCACTATTATTACCTTATATTAGTCCTATATATTCAAATGAATCATTAAGTGGATTAAAATCAAAATT
TGATAGTTTAAAACCAGAGCTTAAACAAACATTATTTTATTTTAATAACCCAATTAACACACGTTATCTTTATAGTGTAT
TAGATTTTGGCGTTAATGGTAGTAGTATGATTAATATTAAAGTTAAAATTATTGATCAAGTTAATCCTAAACTACAACGT
ACATATATTATTAATAAATATGATCCAATTTTAGATATTAATTTTAATAGTCTAAAATTAAATGAAGTTAATGCTATTAA
ACAAATTTTTGTTAACTTGTATAAACATTTAGGACTAGATGAGAAAATTGATTATAAGAAATTACGTAACTTTTATATTA
GAAATGCTTTATTTACAATGATTGAAGCTGCTCAAAAACTTATTTTGCGATTCAATCAAATTGATAAAGATAATAAAATT
ATTGGTCAAAAAACTTTTGCAACATTACAAAATGAATATTTAGAAAAATACAAACAAAAACTTGTAAACAACACCGATGA
TAAGGAAAGATTATTAAATGAGTTTAATAATTTAACAAAAGAAAATTTCTTTCGTTATTTAAATAACACTTTAATCAATA
ATGATTATTATTGATATCAACTAGTTGGTGCTTATAAACAAGTTAGCTTACAGTTTAGTGAAGTTCTTCGATTAAATAAA
GATAAAATTAAAGCTAATATTGCAAGTATTAAAGGTGATGAAAACACCATTGCAAATTTATATAAATTAAATAACCAATT
AATTTATCAATTATCGGCGATTGTTGCACAACGTAGTTTTAATTCTCAACAATGATATCAGTCATATTTAAATGTTTTAC
AACCGATTAAAGAAAATTTTGATTTAATGTCTATATTAACAAATCAAACCGATATTAAAACAAATAAGGACAAAGCTAAG
GATTTTAAAAATGCATATGATAGTGCTTTAAAATCTCTTGAAAGACAAAAACAAGTAAATAAACAAATTCGTCGTAAGAT
TGGAATTGCGTTTATAGTAATTAGCTTACTGGTTTTAATAATTAATTTAATTATTTATGGATTGATTAAAAAACTAAAAA
ATAAAAAAGTTATTCTAATTATTAATAGTGTGATAATGGTGTTGACAATCATTGTTTTAATAATGGGAATTATTCTAATA
ATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGATTAACTCTAAGTGAATTTTTAGATCTTGATAATCTAAAACAAGAACAATATATAACTAATATGCAAATTAGATTAAA
TTTAGTGGAGTATAAAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGGAAATAGAAAAATGCAAAACACTAAGGCAAACCCTCGTATTAAATCGATTTTTAACTATATTGTAACTGTTAGTGG
AATCTATGATTATCAACATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 721; Mature: 721

Protein sequence:

>721_residues
MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG
INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE
TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK
GQFNTTLPKGYNDWNAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI
ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR
TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI
IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYYWYQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK
DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQWYQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK
DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI
I

Sequences:

>Translated_721_residues
MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG
INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE
TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK
GQFNTTLPKGYND*NAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI
ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR
TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI
IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYY*YQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK
DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQ*YQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK
DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI
I
>Mature_721_residues
MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG
INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE
TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK
GQFNTTLPKGYND*NAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI
ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR
TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI
IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYY*YQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK
DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQ*YQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK
DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI
I

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83059; Mature: 83059

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDP
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NFNTFKTDADKTVKDSLEKGINAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGETYKQIKVGKTDPLNYQKAVA
HHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCC
PKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCC
GQFNTTLPKGYNDNAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPP
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
LVEGDHNEIDLPPTQANAIISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYF
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQRTYIINKYDPILDINFNSLKLN
CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHEEEEECCCCEEEECCCCEECH
EVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKII
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
GQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYYYQLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
GAYKQVSLQFSEVLRLNKDKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNS
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QQYQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAKDFKNAYDSALKSLERQKQVNKQI
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
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CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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EKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGETYKQIKVGKTDPLNYQKAVA
HHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCC
PKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK
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CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQRTYIINKYDPILDINFNSLKLN
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RRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA