Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010503 |
Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170762239
Identifier: 170762239
GI number: 170762239
Start: 61190
End: 63355
Strand: Direct
Name: 170762239
Synonym: UPA3_0051
Alternate gene names: NA
Gene position: 61190-63355 (Clockwise)
Preceding gene: 170762158
Following gene: 170762321
Centisome position: 8.14
GC content: 23.87
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGGAAATAGAAAAATGCAAAACACTAAGGCAAACCCTCGTATTAAATCGATTTTTAACTATATTGTAACTGTTAGTGG AATCTATGATTATCAACATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 721; Mature: 721
Protein sequence:
>721_residues MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK GQFNTTLPKGYNDWNAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYYWYQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQWYQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI I
Sequences:
>Translated_721_residues MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK GQFNTTLPKGYND*NAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYY*YQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQ*YQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI I >Mature_721_residues MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDPNFNTFKTDADKTVKDSLEKG INAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYLEKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGE TYKQIKVGKTDPLNYQKAVAPKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK GQFNTTLPKGYND*NAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPPLVEGDHNEIDLPPTQANAI ISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYFNNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQR TYIINKYDPILDINFNSLKLNEVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKI IGQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYY*YQLVGAYKQVSLQFSEVLRLNK DKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNSQQ*YQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAK DFKNAYDSALKSLERQKQVNKQIRRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILI I
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 83059; Mature: 83059
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDP CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC NFNTFKTDADKTVKDSLEKGINAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYL CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGETYKQIKVGKTDPLNYQKAVA HHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCC PKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCC GQFNTTLPKGYNDNAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPP CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC LVEGDHNEIDLPPTQANAIISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYF CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQRTYIINKYDPILDINFNSLKLN CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHEEEEECCCCEEEECCCCEECH EVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKII HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH GQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYYYQLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH GAYKQVSLQFSEVLRLNKDKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNS HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH QQYQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAKDFKNAYDSALKSLERQKQVNKQI HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MRNKLKIKLKFLASLATIPIVASPLIFSVAANEDGKQENNNGNNHDPNQQKKPKIPKNDP CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC NFNTFKTDADKTVKDSLEKGINAAIVYVKSRQEEILENKEIEFKKKIQQLIYLKNLQSYL CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKNKENILKNPNDYGFYLNTPQILGTLKNYDIKDIEFNGETYKQIKVGKTDPLNYQKAVA HHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCC PKGKISDVQSDQINDVEETKYKDTLKKYESEFLKEINKLIYDENDVPQINKDVELTRDEK CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCC GQFNTTLPKGYNDNAYFISKIKDRVTAFDLKQNQQTNEDKQEEQPNEQKDPDTPPPLPPP CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC LVEGDHNEIDLPPTQANAIISSLPLLLPYISPIYSNESLSGLKSKFDSLKPELKQTLFYF CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNPINTRYLYSVLDFGVNGSSMINIKVKIIDQVNPKLQRTYIINKYDPILDINFNSLKLN CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHEEEEECCCCEEEECCCCEECH EVNAIKQIFVNLYKHLGLDEKIDYKKLRNFYIRNALFTMIEAAQKLILRFNQIDKDNKII HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH GQKTFATLQNEYLEKYKQKLVNNTDDKERLLNEFNNLTKENFFRYLNNTLINNDYYYQLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH GAYKQVSLQFSEVLRLNKDKIKANIASIKGDENTIANLYKLNNQLIYQLSAIVAQRSFNS HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH QQYQSYLNVLQPIKENFDLMSILTNQTDIKTNKDKAKDFKNAYDSALKSLERQKQVNKQI HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRKIGIAFIVISLLVLIINLIIYGLIKKLKNKKVILIINSVIMVLTIIVLIMGIILII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA