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The map label for this gene is yddG [H]

Identifier: 170016345

GI number: 170016345

Start: 28546

End: 30648

Strand: Direct

Name: yddG [H]

Synonym: LCK_p100038

Alternate gene names: 170016345

Gene position: 28546-30648 (Clockwise)

Preceding gene: 170016344

Following gene: 170016346

Centisome position: 73.74

GC content: 37.71

Gene sequence:

>2103_bases
ATGATGATTGAAATGATGAAAGGAAAACACATGCAAATCAAATTTTGTCGGAAGCTGATTATTTTGGCTTCTTTTTTGTT
TGTTTTAGGCTTTGCGCAAACGCAAGTGTCCGCAGATGATAGCAGTAGTTCAAGTAGTACGTTAGTTAATCAAGATATGC
TTAATGCGATTGATGACGCTTCAAAACAAGCTGATAAAGCGGTAGATGAGGTCACCAGTGACGCAGAAAAGAAGTCAGGC
GATACGAATACAACTGATACCTCATTTAAAGCCAGTGACGCACAAAACATCAACAAGCTTAATGACTCACTGTTTTCATG
GCAACCCTATTCGGAAAAAATTGGCGTGACGGACTTAGCCAATAATACGGGTATGGGCTTAGCCAAGTTCTTTTGGTATT
TGAATACTTTGATTTATCAAATCAATGATGAGTTATTAAGTGCCTTATCAAATGACGGTAATTTATCAAAAGCCTTTACA
CAAGCCCAGAACGCTGTTTCAGGTAAAGTAAAATCTATTTTTGATCAAGGCAAGTTGTTGTTTGGTGGATTAGCTATTAT
TGTCTTAGCAATTACGGGTTTCATGCACTTTGCTAGTGGGCGTACGTCATCAGCGGTTCGCATGGTGGTTAATTTTGTTA
GTATTTTATTAGTCGCAACGCTTTGGTATGGCAATGGTAATGAGTTATTTAATCAAATCAATGAAGCCAGTGACGCAGGA
CAAGCGCAAATGTTAAAAGTCATTGGCAATAGTAATGATAATGTTAAACCAGGGGACACGTTAAGAGTGGGGTATTTTGA
GCGATCCATTGAACGCCCTTATTTCTTGATGAATTATGGGCAAGCCACGGCTGACGCAGTTTCAAAGAAAGGATATTCTC
CATACCAACTCATATCAACGAATGCACAAAGAGATGATGAAAAAGTTCAGACACAAGTAACACAACTAAAAAAGAAATTT
CCCACAATGGGAAAAAATAACTCATTTAACAAGGCAGGTATGAGTTTAGTTGCCATTATGGTGTCAGTTGTTAATGCCAT
TCCTTATGACGCAGTGGCTTTGTTTAATATCTTTGTTATGGTCATTGAATTGGCTTTGTATCTCTTGTCTCCGTTTGTTT
TGGTTATGGCGTTATTCCCACAATTTTCTCGTAATGGGTATAAAATCGTTGGCACAACGATTATGTGGGGCATTGCTAAA
ATTGGGGCTGGGTTCTTAATTGTCTTGGTTGGCGCTTTACAGACATTCACTGATAGTTTTATCCCAGCAACTAATTTTGG
ATCCTATGCTGTCAATGCGTTATTGTTTTTCTTCTTAGTCTTTATCGTCTATAAGTATCGTGGTAAGCTATTTGAATTTG
TTGGGGTTAGTTACTCACGAATTGAGGGACAAATGCCACAAGCCATGCGCTTATCTAATCTACGTGAAAAGGGGCGGAGT
ATTAAGCAGTCTAGCGTTGGTCAAAAAATAAGTCAAATGGGACCAATGCAACGTATGTCACAAAGGCGTGATGTACGTGA
TGAGATGAAAAACAAACAGGCAGATGAAAAACGACAACAAAATCTTTCTCGTGTGCGTGATCAGTTGTTAGGCAAAGAGC
AGGCAAAAACACAAAAATTGTCAGATAAAAATAAGAAACCATTGACGGTTGATGAATTTAAAAAGCCAATGGATTCTAAA
AAGTCTGATGATACAAAACAGTCAGCGGTTGAAAAAGACGGTGTTCATTTACCAAAATCAAACTTTGAAGCTAAACAAAC
TAATAGTCGGGTCAATAATCCAAAGAGTAAGGATAATGGTTCAGATAGTCAAAAGGAAGTGGCTAAAAAGCGTGAAGCAA
TTAAGCGCCAATTATATGGTGCTCCAGCGACACAATCACAACCTAAGACACTTAATAAAGTGCCTGATAATCATAATAAC
TTTGAGCAACCAAAGACACCAAAACGTCAAGAAATCGCTAATGATCAGAAAAAAACAGTTGATTGTGACAAAATAGCGCG
TGAATTATTAGCCGAACGTGATAAGCAAAAGGAACAAAAACAAAAGTTACGTGACGAAAAGGTTAGTCAGTTAAAAAATA
AATTTGGAAAGGATAACTCGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTTACTTAATTAAATAATCGGAATAGTCACTGCTTAGCAGGCTATTGATGTTAAAGGGAGTAGTTCGAGCTACTTCCTT
TTTCTATACACAATTATAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAATGAGCTTAATAATCGCTACAATCGTTGTGGCAGTAGTAACTACGGCGTTTTTATTGTATAATAATAAGTATCAT
GATACACCAAATGATCAATT

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 700; Mature: 700

Protein sequence:

>700_residues
MMIEMMKGKHMQIKFCRKLIILASFLFVLGFAQTQVSADDSSSSSSTLVNQDMLNAIDDASKQADKAVDEVTSDAEKKSG
DTNTTDTSFKASDAQNINKLNDSLFSWQPYSEKIGVTDLANNTGMGLAKFFWYLNTLIYQINDELLSALSNDGNLSKAFT
QAQNAVSGKVKSIFDQGKLLFGGLAIIVLAITGFMHFASGRTSSAVRMVVNFVSILLVATLWYGNGNELFNQINEASDAG
QAQMLKVIGNSNDNVKPGDTLRVGYFERSIERPYFLMNYGQATADAVSKKGYSPYQLISTNAQRDDEKVQTQVTQLKKKF
PTMGKNNSFNKAGMSLVAIMVSVVNAIPYDAVALFNIFVMVIELALYLLSPFVLVMALFPQFSRNGYKIVGTTIMWGIAK
IGAGFLIVLVGALQTFTDSFIPATNFGSYAVNALLFFFLVFIVYKYRGKLFEFVGVSYSRIEGQMPQAMRLSNLREKGRS
IKQSSVGQKISQMGPMQRMSQRRDVRDEMKNKQADEKRQQNLSRVRDQLLGKEQAKTQKLSDKNKKPLTVDEFKKPMDSK
KSDDTKQSAVEKDGVHLPKSNFEAKQTNSRVNNPKSKDNGSDSQKEVAKKREAIKRQLYGAPATQSQPKTLNKVPDNHNN
FEQPKTPKRQEIANDQKKTVDCDKIARELLAERDKQKEQKQKLRDEKVSQLKNKFGKDNS

Sequences:

>Translated_700_residues
MMIEMMKGKHMQIKFCRKLIILASFLFVLGFAQTQVSADDSSSSSSTLVNQDMLNAIDDASKQADKAVDEVTSDAEKKSG
DTNTTDTSFKASDAQNINKLNDSLFSWQPYSEKIGVTDLANNTGMGLAKFFWYLNTLIYQINDELLSALSNDGNLSKAFT
QAQNAVSGKVKSIFDQGKLLFGGLAIIVLAITGFMHFASGRTSSAVRMVVNFVSILLVATLWYGNGNELFNQINEASDAG
QAQMLKVIGNSNDNVKPGDTLRVGYFERSIERPYFLMNYGQATADAVSKKGYSPYQLISTNAQRDDEKVQTQVTQLKKKF
PTMGKNNSFNKAGMSLVAIMVSVVNAIPYDAVALFNIFVMVIELALYLLSPFVLVMALFPQFSRNGYKIVGTTIMWGIAK
IGAGFLIVLVGALQTFTDSFIPATNFGSYAVNALLFFFLVFIVYKYRGKLFEFVGVSYSRIEGQMPQAMRLSNLREKGRS
IKQSSVGQKISQMGPMQRMSQRRDVRDEMKNKQADEKRQQNLSRVRDQLLGKEQAKTQKLSDKNKKPLTVDEFKKPMDSK
KSDDTKQSAVEKDGVHLPKSNFEAKQTNSRVNNPKSKDNGSDSQKEVAKKREAIKRQLYGAPATQSQPKTLNKVPDNHNN
FEQPKTPKRQEIANDQKKTVDCDKIARELLAERDKQKEQKQKLRDEKVSQLKNKFGKDNS
>Mature_700_residues
MMIEMMKGKHMQIKFCRKLIILASFLFVLGFAQTQVSADDSSSSSSTLVNQDMLNAIDDASKQADKAVDEVTSDAEKKSG
DTNTTDTSFKASDAQNINKLNDSLFSWQPYSEKIGVTDLANNTGMGLAKFFWYLNTLIYQINDELLSALSNDGNLSKAFT
QAQNAVSGKVKSIFDQGKLLFGGLAIIVLAITGFMHFASGRTSSAVRMVVNFVSILLVATLWYGNGNELFNQINEASDAG
QAQMLKVIGNSNDNVKPGDTLRVGYFERSIERPYFLMNYGQATADAVSKKGYSPYQLISTNAQRDDEKVQTQVTQLKKKF
PTMGKNNSFNKAGMSLVAIMVSVVNAIPYDAVALFNIFVMVIELALYLLSPFVLVMALFPQFSRNGYKIVGTTIMWGIAK
IGAGFLIVLVGALQTFTDSFIPATNFGSYAVNALLFFFLVFIVYKYRGKLFEFVGVSYSRIEGQMPQAMRLSNLREKGRS
IKQSSVGQKISQMGPMQRMSQRRDVRDEMKNKQADEKRQQNLSRVRDQLLGKEQAKTQKLSDKNKKPLTVDEFKKPMDSK
KSDDTKQSAVEKDGVHLPKSNFEAKQTNSRVNNPKSKDNGSDSQKEVAKKREAIKRQLYGAPATQSQPKTLNKVPDNHNN
FEQPKTPKRQEIANDQKKTVDCDKIARELLAERDKQKEQKQKLRDEKVSQLKNKFGKDNS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78233; Mature: 78233

Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]