| Definition | Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010465 |
| Length | 4,689,441 |
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The map label for this gene is 170025289
Identifier: 170025289
GI number: 170025289
Start: 3375186
End: 3377393
Strand: Direct
Name: 170025289
Synonym: YPK_3070
Alternate gene names: NA
Gene position: 3375186-3377393 (Clockwise)
Preceding gene: 170025285
Following gene: 170025290
Centisome position: 71.97
GC content: 48.96
Gene sequence:
>2208_bases ATGGCTGAACCGAAACCCGCGTCTTGGATGCCTTCACATGCGGCAGCGCAACTCTGCCGCCAGTTGCAGTCACTCTTGCC AATGCATCTTCTTGCACCTGCGGCCTTTGAACAGATATTACGTTATTGCGGTGTCCGGCCCGGACGTCAGGCTTGGCGTT TGTTTCTCAGTAGAACGCTGCTACTGGCCGGATCCCTCGCGGCCATCTGTGGCGTCATCTTTTTCTTTGCGTGGAACTGG GCAGCAATGCCCGCAATGGCAAAGTTCGGTATCATCGAATTGCTGATCGTGGCCTTGGCCATTCTCATCTGGTGGCGCTG GTATGATGCCGTCAGTCGCACGGCATTATTGGCCGCAGGGTTCCTCTTTGGTGCGCTGTTTGCCGTCTTCGGGCAGATTT ACCAAACCGGGGCCGATAGCTGGGAGTTATTCCGCGCTTGGGCACTAATTCTTCTCCCTTTAGCGTTGCTCAGCAGGCAG GGGGGATTATGGTTTTTAACCTGGCTGGTGACCAATATTGGCCTGAATCTCTTTTTCTTCAGTTACTCATCGCCGTTTAC GGTCTCTTTCTCACTGTTCGACAGCATTTTTTATCTCAACACCTTGTTCACGTATGGTTATTTGCTTTTTCAGGGATTAT GTCTTTTGGCCTGGGAAGTGACACAAAGATTCAGCAAAACCCAATCCCCCGATAAAACGGTAAATCGCTGGTTTCCGAGG CTCATGGCAGCCTATTTTTTACTGTCACTGACAACCCCAATAATCAGTGAACTCACTTACTTTCACTTCCAACAGCCTGG CTACGTTTTACTACTTTGCTGGGTAGCGGTTATGGCCGGTGGCTACTGGTGGTATCGCTATCGCCAACCCGATTTATGCA TGCTGACACTGGGTGTTTGCAGCTTATTAGCGGTGGGAACTGCCGCTATCCTTACCTCGGCGGGTTGGGGTTGGTATAGA AATGTTGGCTCCCTGTTCCTGATTGGGATATTAATCGCCCTATTGCTTGGCGCAGGGGGCAAATTGTTACTCCACTGGCG CCGAAAGATGTATCCAAATCAAGCCGTGGAGTTATCCCGATCAGCCTACGACGAACTGTTAGTTAATCTCGAACAGCATT CGTTGCTCAACGCAGACCAAAAAGCGGTGTTGCTTGCTGAACAAGGCAAGTTAACTCTGCCTTGGTATATTCGTACCGCT TTTGCGTTCGGCGGGTGGATCGCGGCATTAATCCTGTTAGCTCTGTTGATATTGCTAGGATTTGTCAGTGGGATGTTTGA CAATCTCAATGCTGGAACAATTATTGTTGTTTCACTGATAGGCGGTGCCTTTGCCGCGTTCTTGCTCACCCGACCGGGTA TGGGGATACAGCAGATTGGTTTGGTATGGGCAATAGCATCCTCGATCGGGTTATATAGCGGAATAATATTAATCCAGGAT TCAAGCAGCAGATCGATGCTGATGCAAAGTCTGTGGTTCATTCCTGTTTTGGCGGTTCTGATTGTGGTATTCCACAATGA TATGTATCGCTTTCTGGCGACGGGCACGTTGGTATTCATGAGTATTGTTACGACAAGCTACGCTCTGATATGGCACTTGG CACCCGATAACCAACAGCTCTTTTTCTTCATTCCAATCCTGATAGTCACCGTCATTGTCATGTTGATTCTTTGGCTGATC TGCAATGAAACTAAATTGCTGGCGACCATCAATGCACCACTGATTCATCCGTTAATGTATGGCGGGATCGGGGGCATACT GGTGGTTTGCCTGCACAGTATTCAGATGGGGAATATCCATGAATTCTACTGGATGTCAGATCGGGGGCTTTATTTGGAAC AGAGTTTGAGCTACGGGATCCCTGCCGCTTTCTTGCTGTTTACGCTAATTCAATGGGTTTTGCATCGCAGTAAGCTCAAG CCACTCTGGTTGATAGCGGCGGTCGTAACCTCCCTTGCAGCCTATTTTGCACCGGGAATGGGTTTTGGTTTGGCACTGTT ATTGATTGCCCGTTATCAAGGGAATCAATGGTTACTGGGGGTTGCAGCCTGTTTTCTCGCGGTTTACACCAGTAGCTGGT ATTACTTCCTCGGATTCAGCTTGTTGTATAAATCCTTGTTATTAATCGGGTGTGGTGTCTTGCTGCTGGTTTTGGCCGCC GTATTGAATCGAGTACTCTCTGCTGGGGAGGTCAATCAACATGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAAACCAGAGATGACTCGCCATCTTGCCGCCGTCAGAGCCTATCGGCAACAAGACGGCATTTGATATCCCTTTCGCTTT CAGAAACAAGGATGTAAACC
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAAAATGGCTCAGCATCGCGGTCATTATCGTTGCCCTGATCGTGGTGAATATCTCTATTTATCAGAAGCAACATTTGT TGGCTAAAGGTGACATCATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 735; Mature: 734
Protein sequence:
>735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA VLNRVLSAGEVNQHA
Sequences:
>Translated_735_residues MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNW AAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQ GGLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYR NVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTA FAFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLI CNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLK PLWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA VLNRVLSAGEVNQHA >Mature_734_residues AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTLLLAGSLAAICGVIFFFAWNWA AMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAGFLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQG GLWFLTWLVTNIGLNLFFFSYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPRL MAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVCSLLAVGTAAILTSAGWGWYRN VGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSRSAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAF AFGGWIAALILLALLILLGFVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQDS SSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQLFFFIPILIVTVIVMLILWLIC NETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIHEFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKP LWLIAAVVTSLAAYFAPGMGFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAAV LNRVLSAGEVNQHA
Specific function: Unknown
COG id: COG4984
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82082; Mature: 81951
Theoretical pI: Translated: 9.15; Mature: 9.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAAICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AEPKPASWMPSHAAAQLCRQLQSLLPMHLLAPAAFEQILRYCGVRPGRQAWRLFLSRTL CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LLAGSLAAICGVIFFFAWNWAAMPAMAKFGIIELLIVALAILIWWRWYDAVSRTALLAAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLFGALFAVFGQIYQTGADSWELFRAWALILLPLALLSRQGGLWFLTWLVTNIGLNLFFF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEEE SYSSPFTVSFSLFDSIFYLNTLFTYGYLLFQGLCLLAWEVTQRFSKTQSPDKTVNRWFPR ECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH LMAAYFLLSLTTPIISELTYFHFQQPGYVLLLCWVAVMAGGYWWYRYRQPDLCMLTLGVC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHH SLLAVGTAAILTSAGWGWYRNVGSLFLIGILIALLLGAGGKLLLHWRRKMYPNQAVELSR HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SAYDELLVNLEQHSLLNADQKAVLLAEQGKLTLPWYIRTAFAFGGWIAALILLALLILLG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVSGMFDNLNAGTIIVVSLIGGAFAAFLLTRPGMGIQQIGLVWAIASSIGLYSGIILIQD HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEC SSSRSMLMQSLWFIPVLAVLIVVFHNDMYRFLATGTLVFMSIVTTSYALIWHLAPDNQQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCH FFFIPILIVTVIVMLILWLICNETKLLATINAPLIHPLMYGGIGGILVVCLHSIQMGNIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE EFYWMSDRGLYLEQSLSYGIPAAFLLFTLIQWVLHRSKLKPLWLIAAVVTSLAAYFAPGM EEEEECCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFGLALLLIARYQGNQWLLGVAACFLAVYTSSWYYFLGFSLLYKSLLLIGCGVLLLVLAA HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLNRVLSAGEVNQHA HHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA