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Definition Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome.
Accession NC_010263
Length 1,268,188

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Identifier: 165933830

GI number:

Start: 1176543

End: 1181741

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: RrIowa_1493

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 165933831

Following gene: 165933829

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>5199_bases
GTGAATGTAGGAGCAGGTACAGCCACGTTAGGGGGAGCGGTTATTAAAGCTACTACGACTAAATTAACGAATGCTGCGTC
GGTATTAACCCTTACAAATGCAAATGCAGTATTAACAGGTGCGATTGATAACACCACAGGCGGTGATAATGTAGGTGTCT
TAAATTTAAATGGTGCATTAAGTCAAGTAACTGGGAATATAGGTAATACAAATTCATTAGCCACGATAAGTGTAGGAGCA
GGTACAGCCACGTTAGGGGGAGCGGTTATTAAAGCTACTACGACTAAGTTGACAGATGCTGCGTCAGCAGTGAAATTTAC
GAATCCTGTAGTGGTGACTGGAGCGATAGATAATACCGGTAATGCAAATAATGGTATAGTAACGTTTACCGGTAATAGTA
CAGTAACTGGGAATGTAGGTAATACAAATGCATTAGCAACAGTGAATGTAGGAGCAGGTTTGCTACAAGTACAAGGTGGA
GTGGTAAAAGCAAATACAATAAACTTAACGGATAATGCGTCAGCAGTGACATTTACGAATCCTGTAGTGGTGACCGGAGC
GATAGATAATACCGGTAATGCAAATAATGGTATAGTAACGTTTACCGGTAATAGTACAGTAACTGGGGATATAGGTAATA
CAAATGCATTAGCAACAGTGAATGTAGGAGCAGGTACAGCCACGCTAGGGGGAGCGGTTATTAAAGCTACTACGACTAAA
TTAACGAATGCTGCGTCGGTATTAACCCTTACAAATGCAAATGCAGTATTAACAGGTGCGATTGATAACACCACAGGCGG
TGATAATGTAGGTGTCTTAAATTTAAATGGTGCATTAAGTCAAGTAACTGGGAATATAGGTAATACAAATTCATTAGCCA
CGATAAGTGTAGGAGCAGGTACAGCCACGTTAGGGGGAGCGGTTATTAAAGCTACTACGACTAAGTTGACAGATGCTGCG
TCAGCAGTGAAATTTACGAATCCTGTAGTGGTGACTGGAGCGATAGATAATACCGGTAATGCAAATAATGGTATAGTAAC
GTTTACCGGTAATAGTACAGTAACTGGGGATATAGGTAATACAAATGCATTAGCAACAGTGAATGTAGGAGCAGGTACAG
CCACGTTAGGGGGAGCAGTTATTAAAGCTACTACGACTAAATTAACGAATGCTGCGTCGGTATTAACCCTTACAAATGCA
AATGCAGTATTAACAGGTGCGATTGATAACACCACAGGCGGTGATAATGTAGGTGTCTTAAATTTAAATGGTGCATTAAG
TCAAGTAACTGGGGATATAGGTAATACAAATTCATTAGCCACGATAAGTGTAGGAGCAGGTACAGCCACGTTAGGGGGAG
CGGTTATTAAAGCTACTACGACTAAATTAACGAATGCTGCGTCAGCAGTGACATTTACGAATCCTGTAGTGGTGACCGGA
GCGATAGATAATACCGGTAATGCAAATAATGGTATAGTAACGTTTACCGGTAATAGTACAGTAACTGGGAATGTAGGTAA
TACAAATGCATTAGCAACAGTGAATGTAGGAGCAGGTTTGCTACAAGTACAAGGTGGAGTGGTAAAAGCAAATACAATAA
ACTTAACGGATAATGCGTCAGCAGTGACATTTACGAATCCTGTAGTGGTGACCGGAGCGATAGATAATACCGGTAATGCA
AATAATGGTATAGTAACGTTTACCGGTAATAGTACAGTAACTGGGAATGTAGGTAATACAAATGCATTAGCAACAGTGAA
TGTAGGAGCAGGTTTGCTACAAGTACAAGGTGGAGTGGTAAAAGCAAATACAATAAACTTAACGGATAATGCGTCAGCAG
TGACATTTACGAATCCTGTAGTGGTGACCGGAGCGATAGATAATACCGGTAATGCAAATAATGGTATAGTAACGTTTACC
GGTAATAGTACAGTAACTGGGGATATAGGTAATACAAATGCATTAGCAACAGTGAATGTAGGAGCAGGAATAACATTACA
AGCTGGAGGAAGCCTAGCTGCGAATAATATAGATTTTGGAGCCAGGAGTACTTTAGAGTTTAACGGACCTCTTGATGGTG
GTGGTAAAGCAATCCCTTATTATTTTAAAGGAGCTATAGCAAACGGCAATAATGCTATATTAAATGTTAATACAAAGTTA
CTTACGGCATCTCATTTAACTATAGGAACAGTTGCAGAAATCAATATTGGAGCTGGTAATCTTTTTACAATTGATGCAAG
TGTTGGTGATGTTACTATATTAAATGCTCAAAATATTAATTTTAGAGCTCGAGATTCTGTTTTAGTACTTTCTAACTTAA
CCGGAGTCGGAGTAAATAATATATTATTAGCAGCTGATTTAGTAGCTCCCGGTGCTGATGAAGGTACGGTAGTCTTTAAT
GGTGGGGTTAATGGCCTGAATATTGGGAGTAATGTAGCAGGTACCGCTAGAAATATCGGTGATGGAGGCGGTAATAAATT
TAACACTTTACTTATTTATAATGCTGTTACAATAACTGACGATGTAAATTTAGAAGGTATACAGAACGTGCTTATTAACA
ATAATGCAGATTTTACTAGTAGTACAGCATTTAATGCTGGTGCTATACAAATAAACGATGCTACTTATACGATTGATGCA
AATAATGGTAATTTAAATATACCGGCAGGAAATATTCAATTTGCACATGCGGATGCTCAATTAGTATTACAAAATAGTTC
AGGAAACGACCGTACGATAACACTAGGTGCGAATATAGACCCTGATAATGACGATGAGGGTATAGTAATATTAAATTCTG
TAACTGCAGGAAAAAAATTAACGATAGCCGGAGGCAAGACGTTTGGTGGAGCTCATAAGTTACAAACTATATTGTTCAAA
GGAGCGGGAGATTGTAGCACGGCAGGTACCACTTTTAATACAACAAATATAGTACTTGATATTACAGGTCAATTAGAACT
TGGAGCTACTACGGCAAATGTAGTTTTATTTAATGATGCTGTTCAATTAACTCAAACCGGTAATATTGGCGGTTTCTTAG
ATTTTAATGCAAAAAACGGTATGGTAACATTAAATAACAATGTAAATGTTGCGGGAGCAGTCCAAAATACCGGCGGTACT
AATAACGGTACGTTAATAGTTTTAGGTGCAAGTAATCTTAATAGAGTAAACGGGATTGCTATGTTAAAAGTAGGTGCAGG
AAATGTAACTATTGCCAAAGGCGGTAAAGTTAAAATCGGCGAAATCCAAGGTACAGGCACAAATACTTTAACATTACCTG
CACACTTTAACTTAACAGGCAGCATAAATAAAACCGGTGGTCAGGCTCTGAAGCTAAACTTCATGAATGGCGGTAGTGTT
AGCGGTGTTGTAGGGACTGCGGCTAATTCGGTTGGTGATATCACAACGGCAGGTGCTACAAGTTTTGCAAGCAGTGTTAA
CGCAAAAGGTACGGCGACACTTGGCGGTACTACAAGTTTTGCCAATACATTCACTAATACAGGTGCGGTTACTTTAGCCA
AAGGTTCTATCACTAGTTTTGCTAAAAATGTAACGGCTACCAGCTTTGTAGCTAACAGTGCTACTATTAATTTCAGCAAT
AGCCTAGCCTTTAATAGTAATATAACAGGTGGCGGTACTACACTTACTTTAGGTGCAAATCAAGTAACATATACTGGCAC
CGGTAGCTTTACCGATACGCTAACCTTAAATACTACTTTTGACGGAGCAGCTAAGTCAGGTGGTAATATCTTAATTAAAT
CAGGTAGTACTCTTGATTTATCAGGGGTTTCAACTTTAGCACTTGTTGTTACTGCTACTAATTTCGACATGAATAATATA
AGCCCAGATACAAAATATACGGTAATATCTGCAGAAACAGCAGGTGGTTTAAAGCCTACTTCTAAAGAGAATGTTAAAAT
AACTATTAATAATGACAACCGTTTTGTTGACTTTACTTTTGATGCATCGACTTTAACGTTATTTGCAGAAGATATAGCTG
CAGATGTTATAGATGGAGATTTTGCACCGGGTGGACCGCTTGCAAATATCCCAAATGCTGCAAATATAAAGAAATCGCTT
GAGTTAATGGAGGATGCTCCCAATGGTTCAGATGCACGTCAAGCTTTCAATAACTTTGGTCTAATGACACCGCTACAGGA
AGCAGATGCTACAACTCATCTCATTCAAGATGTTGTAAAACCTAGCGACACTATAGCTGCCGTTAATAATCAAGTTGTAG
CGAGTAATATATCAAGTAATATAACTGCTCTAAATGCTAGAATGGATAAAGTACAATCAGGGAATAAAGGTCCTGTTTCT
TCTGGTGATGAAGATATGGATGCTAAGTTTGGTGCGTGGATAAGCCCGTTTGTCGGTAATGCAACGCAGAAGATGTGTAA
CAGTATAAGTGGTTATAAGTCTGATACAACTGGTGGCACTATAGGTTTTGACGGCTTCGTTAGCGATGATCTAGCACTCG
GACTTGCATATACAAGAGCCGATACTGACATTAAGCTAAAAAATAATAAAACGGGCGATAAGAATAAGGTAGAGAGCAAC
ATCTATTCTTTATACGGTTTATATAATGTACCTTATGAAAATCTCTTCGTTGAAGCTATAGCATCTTACTCAGATAATAA
GATAAGAAGCAAATCAAGACGTGTTATTGCAACGACACTAGAGACTGTCGGTTATCAAACTGCAAACGGTAAGTATAAAT
CCGAAAGCTATACAGGTCAGTTAATGGCTGGTTATACCTATATGATGCCTGAGAACATTAACTTAACACCGCTAGCTGGG
CTTAGATATTCGACTATCAAAGATAAGGGCTATAAGGAAACCGGTACTACTTACCAAAATCTTACCGTTAAAGGCAAGAA
CTATAATACTTTCGACGGTTTACTCGGTGCTAAAGTATCAAGTAATATCAATGTCAATGAAATAGTGCTAACACCTGAGC
TTTACGCAATGGTCGATTATGCATTCAAGAATAAAGTTTCGGCGATTGATGCAAGGTTACAAGGTATGACTGCTCCTCTT
CCAACCAACAGCTTTAAGCAAAGCAAAACAAGTTTTGATGTCGGTGTCGGTGTTACTGCTAAGCATAAAATGATGGAATA
CAGGATTAACTACGATACCAATATCGGAAGTAAGTATTTCGCTCAGCAAGGTAGTGTAAAAGTTCGTGTTAATTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATAACACTTGCAGGAAATATAGATGGAGGAGGTATAATAACTGTCAAGACAGATGCTGCCATTAACGGAACAATAGGTA
ATACAAATGCATTAGCAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACCGTTCTATAATCATAAAAAAAGCCTATATAGTTTGACTATATAGGCTTTTTTGCTTTATAATGTAGTTTTGAGAA
GCGTCATTGCGAGGAGCGAA

Product: outer membrane protein A

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1732_residues
MNVGAGTATLGGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISVGA
GTATLGGAVIKATTTKLTDAASAVKFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVTFTGNSTVTGNVGNTNALATVNVGAGLLQVQGG
VVKANTINLTDNASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVTFTGNSTVTGDIGNTNALATVNVGAGTATLGGAVIKATTTK
LTNAASVLTLTNANAVLTGAIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVTGNIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKATTTKLTDAA
SAVKFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVTFTGNSTVTGDIGNTNALATVNVGAGTATLGGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNA
NAVLTGAIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVTGDIGNTNSLATISVGAGTATLGGAVIKATTTKLTNAASAVTFTNPVVVTG
AIDNTGNANNGIVTFTGNSTVTGNVGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANTINLTDNASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNA
NNGIVTFTGNSTVTGNVGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANTINLTDNASAVTFTNPVVVTGAIDNTGNANNGIVTFT
GNSTVTGDIGNTNALATVNVGAGITLQAGGSLAANNIDFGARSTLEFNGPLDGGGKAIPYYFKGAIANGNNAILNVNTKL
LTASHLTIGTVAEINIGAGNLFTIDASVGDVTILNAQNINFRARDSVLVLSNLTGVGVNNILLAADLVAPGADEGTVVFN
GGVNGLNIGSNVAGTARNIGDGGGNKFNTLLIYNAVTITDDVNLEGIQNVLINNNADFTSSTAFNAGAIQINDATYTIDA
NNGNLNIPAGNIQFAHADAQLVLQNSSGNDRTITLGANIDPDNDDEGIVILNSVTAGKKLTIAGGKTFGGAHKLQTILFK
GAGDCSTAGTTFNTTNIVLDITGQLELGATTANVVLFNDAVQLTQTGNIGGFLDFNAKNGMVTLNNNVNVAGAVQNTGGT
NNGTLIVLGASNLNRVNGIAMLKVGAGNVTIAKGGKVKIGEIQGTGTNTLTLPAHFNLTGSINKTGGQALKLNFMNGGSV
SGVVGTAANSVGDITTAGATSFASSVNAKGTATLGGTTSFANTFTNTGAVTLAKGSITSFAKNVTATSFVANSATINFSN
SLAFNSNITGGGTTLTLGANQVTYTGTGSFTDTLTLNTTFDGAAKSGGNILIKSGSTLDLSGVSTLALVVTATNFDMNNI
SPDTKYTVISAETAGGLKPTSKENVKITINNDNRFVDFTFDASTLTLFAEDIAADVIDGDFAPGGPLANIPNAANIKKSL
ELMEDAPNGSDARQAFNNFGLMTPLQEADATTHLIQDVVKPSDTIAAVNNQVVASNISSNITALNARMDKVQSGNKGPVS
SGDEDMDAKFGAWISPFVGNATQKMCNSISGYKSDTTGGTIGFDGFVSDDLALGLAYTRADTDIKLKNNKTGDKNKVESN
IYSLYGLYNVPYENLFVEAIASYSDNKIRSKSRRVIATTLETVGYQTANGKYKSESYTGQLMAGYTYMMPENINLTPLAG
LRYSTIKDKGYKETGTTYQNLTVKGKNYNTFDGLLGAKVSSNINVNEIVLTPELYAMVDYAFKNKVSAIDARLQGMTAPL
PTNSFKQSKTSFDVGVGVTAKHKMMEYRINYDTNIGSKYFAQQGSVKVRVNF

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA