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The map label for this gene is yfhO [H]

Identifier: 161509408

GI number: 161509408

Start: 1256028

End: 1258634

Strand: Reverse

Name: yfhO [H]

Synonym: USA300HOU_1173

Alternate gene names: 161509408

Gene position: 1258634-1256028 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161509453

Following gene: 161509381

Centisome position: 43.81

GC content: 30.03

Gene sequence:

>2607_bases
GTGTTAAAAAAGTGGCTAAATTCAAACGTCAAACAATTCTTTGTTATAACTTTCATTAGTGTAATATTAACGCTTATTTT
ATTTTCTACTCATATCTATGATTATATTGTGAATGGTACTGTTTTTAGCGGGGCTGGAGATGGATTCCGTCAAATGATGC
CATTTCAAATGTATTTGTATGAACATCTACGTAGTTTTTCTAGTTTATATGATGCATCGTTTGGATTAGGTGGCGATTAT
ATGAAAGGACTATCATATTATTATTCGCTGTCACCTTTAATGTGGCTAAATTTTCTATTCATTAAAATAGGAGAAACGGT
TGGTATATTTAATCCGACGACAATACATTTTTGGCCGACAAACCAACTTATTATGGCTATGATACGAGCTATCATAACAT
TTGTCGTGACCTTCTACTTATTTAAAATATTACACTTTAAACGCTCAGCAAATATGATCGCTACGATTTTATACGGCATG
TCAACTGTCGTTATATACTTTAATTTTACTTGGTCATTTTATGGAAATTTATTATATTTATTGCCATTATCGATTCTTGG
TTTGGAAAGATATTTTCAACAACGCAAAATCGGTATTTTCATTGTTGCGATAGCCTTAACACTATTTAGCAATTTTTATT
TCAGTTATTATCAAGCTATTATTATAGGTTGCTACTATTTATATCGACTCATTTTCACTTACAAATATGACATTGTCTCT
AGAACACAAAAATTAATTTGCGTCATATCTGCTACAGTTTTGAGTGTGTTATCAAGTGTATTTGGTTTATTCACTGGCAT
TTCTGCGTTTTTGGAAAATGACAGAAAGCAAAATCCCAATGTTGATATACCGTTTTTGACACCACTTGATTATCATTATT
TTTTCTTTAGCGATGGATTTTATATTACGATTTCAATTCTTACTATCGTTGCATTATTGTCATTCAAACTGTATCGTTTT
TACTTTTATAGACTTTTCGCAATAGTAACATGGATATTATTTATAGGTTCATTATCACAGTATTTCGACAGTGCTTTTAA
TGGTTTTTCATTTCCAGAAAGGCGTTGGGTGTATATCTTAGCACTATCATCAAGTGCTCTTTGCGGATTGTTTATTCAAC
ATTTATCAACATTAAATATGAAATATTATTTAATCAGAACAATACCCGTATGCATCATCGCAATACTTTATGTATTACTA
TCACCGACACACCCACTTGCACTTATAGTAGGTATTATCCTGCTAATAGTGCTTGCCGTTATTTTAAAATTTAGTTTATG
GCGTTATAAAAAATTAACCGTTGCAATATTAGTATTAATCGTTATGATTCAACAAATCGTCATTTTAGATAACAACAAAA
ACATGGCAATCAAACCTTATCAACAATCATTATCAACGTTGAAACAACATGATTACCATAGTAACTATGTAAACCAGCTT
ATAAAAAAGATAAATCAAAATGCAACAGGCTCATTTAATCGCATTGATTATATGTCAGACTATGCATTAAATTCACCATT
TATATATCATTATAATGGCATTTCATTATATTCTAGTATTTTTAATGGAGACATTTTAAAATATTATGACAAGACACTCC
AAATTAATATGCCAATCGATAAAAACAGCACTTATAGATTACTTGGCAATCGTCAAAATTTACTATCACTTTGGAATGTT
AATGATCGAATTAGAGTGAATCATGATGACAACTTACCATATGGATTTAAAATTAAGTCTGAACACAAAGACAATAAAGT
TCGTTGGATTCATTCTAAAAATACCATCCATTATCCAAGTGCACATATTACAAATAAGGTCTTTTCCAATAAAGAATTAA
AATCTCCATTAGATAAAGAACAAGCAATGTTGCAAGGGATTGTTTCTAACAATATTAAAGATGTTAATACACATTTTAAA
GCCAATAAAAATTTACTATCAGATTCAACAATTAAATTAAATAGTGCAGCCTGGCAATCTCCTACAAAACATTTATTACA
AGTTAAACAAAATAATGGTGGTCTAACTGTACAGTTGCCAAAATCAGTTTCTAATCAATTTAAAGATTTGTATTTTGAAA
TGGATTTAGAATTACTTTCGCCGGATAAAGCTCATGATGTTAAAGTGAATGAATATACACAAGAAAGAAATAAACTCACT
TATAAATATCGACGCGTTGTAACACCCGTAACGATACGCATTAAAGCTCCAGATAGAATTAGATTATCATTGCCTAAAGG
TAAGTATCGAGTAAATTTAAAAGGGATATACGGCGAAGATTATACCACGCTTAAAGACGCTTCAAATTCATTAGAAGCTG
TCAAAGTTAGTAAGACAAAGCATGGTTATACTATTACTAAAAATAAAAATTCATCTGGGTATATTGTTTTGCCAACAGCA
TATAATCAAGGTATGAAAGCGACATCAGGTGATCAAAGTCTTAAAGTTGAACAAGTAAATGGTGTTATGACCGGCATTAA
AGCACCTAAAAATATAACAAAGATTCAATTGAGCTATACCCCACCATACTATTATTTACTTATAACAATTACTATATTTG
GCATTATATGTAGTATTATTTTCACGAGATGGGCAAGACAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCTGTTCCACAGTCATCTTCGTCTTTACCTATCAAGAACCTCATTAACTTTAGTTTCAGTTAAACTTAATTTTAAATT
TGAAAGTTGAGGATAATGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTGCTACGCATATATTTAATAAATCTACTAAGTCCTTTTCAATGGCACTTAGTAGATTTTTGTTTATATAACCATTTT
GAGCAAACACGTTATGAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 868; Mature: 868

Protein sequence:

>868_residues
MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLRSFSSLYDASFGLGGDY
MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSANMIATILYGM
STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS
RTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF
YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIAILYVLL
SPTHPLALIVGIILLIVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL
IKKINQNATGSFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV
NDRIRVNHDDNLPYGFKIKSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNIKDVNTHFK
ANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT
YKYRRVVTPVTIRIKAPDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKHGYTITKNKNSSGYIVLPTA
YNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK

Sequences:

>Translated_868_residues
MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLRSFSSLYDASFGLGGDY
MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSANMIATILYGM
STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS
RTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF
YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIAILYVLL
SPTHPLALIVGIILLIVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL
IKKINQNATGSFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV
NDRIRVNHDDNLPYGFKIKSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNIKDVNTHFK
ANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT
YKYRRVVTPVTIRIKAPDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKHGYTITKNKNSSGYIVLPTA
YNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK
>Mature_868_residues
MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLRSFSSLYDASFGLGGDY
MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSANMIATILYGM
STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS
RTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF
YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIAILYVLL
SPTHPLALIVGIILLIVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL
IKKINQNATGSFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV
NDRIRVNHDDNLPYGFKIKSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNIKDVNTHFK
ANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT
YKYRRVVTPVTIRIKAPDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKHGYTITKNKNSSGYIVLPTA
YNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018580 [H]

Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100432; Mature: 100432

Theoretical pI: Translated: 10.04; Mature: 10.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLY
CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
EHLRSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEEECC
NQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSANMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHCCHHHH
LPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCC
YITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYIL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEE
ALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIAILYVLLSPTHPLALIVGIILLIVLAV
EECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
IKKINQNATGSFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPID
HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEECCCC
KNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKIKSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPS
CCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCC
AHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNIKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQS
HHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHCCC
PTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT
HHHHHHEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
YKYRRVVTPVTIRIKAPDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTK
HHHHEEECCEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCC
HGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYT
CCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEC
PPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLY
CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
EHLRSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEEECC
NQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSANMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHCCHHHH
LPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCC
YITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYIL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEE
ALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIAILYVLLSPTHPLALIVGIILLIVLAV
EECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL
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HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEECCCC
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CCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCC
AHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNIKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQS
HHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHCCC
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HHHHHHEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHEEECCEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCC
HGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYT
CCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEC
PPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]