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The map label for this gene is 160901888

Identifier: 160901888

GI number: 160901888

Start: 434339

End: 437506

Strand: Direct

Name: 160901888

Synonym: Pmob_0404

Alternate gene names: NA

Gene position: 434339-437506 (Clockwise)

Preceding gene: 160901887

Following gene: 160901889

Centisome position: 20.02

GC content: 28.72

Gene sequence:

>3168_bases
ATGAAAATATTAGAACCGGTTTTTAAGCCTCTCTTAATAAAACCATATCATCAATATAGAGAGAAGTTACTAAATTCTTT
GATCAATAATAAAAGTAAAAACTACATTCTAATAAAAGCTCCTTCGGGATACGGTAAGAGCATTACTTTTAGTATGTATT
TTAATACATTGAATGAACAAAAAGTATGGATTAGCTGCCCACAGAATTACTTTGATTTTGACACCTTCCTCAATCATCTA
ATCTATATTTTGTTCAAAACAATAAATCTGAAAATATTTGAAGATAATTCACAAAATACTATTTCTTTTTTTACTGAAGA
AGAAAAGGTTGTTGAACTATTAAACGGTTTTTCAAGTTATACGAAAGAAATATTTATATTTGTTGATTCCTTCGAAAATG
TTGTTTTTGAAGGGAAAAATGAAAATCTTCTTAAATTGTTATTAAATTTCATACCCCAAAACGTTCATTTTCTTTTTACT
ACTAACCAAGAGTTTCCAATCCCTTTAACAAAATTTGCTATGGCAAATAATGTTTACACTATTCAAGAAGAGGAACTAAA
ATTTTCTTTTGATGAACTTAAAAATTATATCAGCACAAAAAAAATTAACTTGTCAGAAGACAACTTGTTAGAGTTATACC
AATTGACCGATGGGATACCCACTTTTATTAACATTTTATCCACATACATAGAGACAATAGACCTAAAAAAATATGATGCC
CTTATAGATTCAGCAAAAAAAATAGATGAATATATAAACTTACTAACTGAAGCCTTATCAGAAGATTTAAGAGAGTATTT
GAAAGTTTTCAGCTTAATGAATGAAATTGAGCCAAAGATTTGTAAAGCATATTTCAATCTCAAAAGCGATGAAAAAATTC
ACGAGTCTTTTGAAAAGTTATACGATTTAAACATGATAGAAAAAAAAGATCCGCATTACTACTATATGAATGAAATATTC
CGTCGAACAATCTCCAAAGGCATTGGAGAGAGAGAAAAAATCCAGATATACCAGACACTTTTTAACATATATCAAAAAGA
GCAAGATTACTATGGACAATTTCATTGCTTACTGAATATGAAAGATTTAGAAAAAGTCTATGACTTCTTTCTCAACCATT
CTGAGCTATTGATAAAAGATTTTTCAATCATCAAAAAATGGTTAGATTTAATACCCACCTCTTTTTTCAGCAACAACATT
GAATTGTACTATTACCGCGGCGTTATAGAAGAGAAATATTCCATGTTTGATGAAGCTCTTTCAGATTATAGGCTTGTAAA
AGATAATATCCATAAAATTTCCAATAAAAGTATTCTTGAGAATATAGATACACAAATAATAGGAATTTACTGGCATCAGG
AAAAATATGAAAAGGTCATCGAAATGGGAAATGAATTGCTAAAAAGTATACCAAATGAAAACTACCAGAGCTTAACTTCC
TTGTACAATTTATTGGGAACCAGTTATTCTTATCTTTCAAAATTAGATGAAGGGAAACTGTATTTAAACAAGGCTATGGA
ATTATGTGAAAGATTCAATTATACAGAAATGAAACCCTGGCTTCTCAACAACCTTGCTTACAATATTTTTCTAATCGAAG
GAAATTTAGAAAGTGCGGAAAAATACTTCGTTAAATCCTTAAAAAGCTTTGAGGATTCAAAAGATCTATATGGAAAAGCA
CTTTTAAATGCGAATCTTACCGATTTTTATATTGAAACGCAAAAATATGACAAAGCTAAAGAGCATCTCAAAGCTTTTGA
AAATATCTACTTAGAAACTAAAAACATCGCCTACCTACCCGTTCTAAAAATCTTGCAAGCTAAACTAGAAGTAGAAAAAA
ACGAATTAAACTCTGCTCAAAAAAGTTTAATGGAAGCTGAAAATTATTCTTCAAGATCAAAATTTCTACAAGCAAATTAT
TACTTCGTCCAATCACTGTATCTTTTAAAAAAAGATGAACTTAAAGAGTCTTTTTCAACAGTTGAAAAGGCAATCAAAAT
TGCTAAAACTATTTTCAATGAATATCAGATATTGAACTTTGAACTACAAAAAGTTCGATTATTGATCCATTTAAAACAAT
TCGAAAAAGCACTATCACACATTGGAAAAATTATTCAGATAGCCACAGAAGGGAAAGCAAAATTAATACTAACTGAAGCG
TTACTCTTAAAATTATTTTTAAGTAAATCATTTAATTTGTCTTCTTATAATGAAGATTTAAAAACATTTAACGAGTTATT
ATCAGACAACAATTACCAGTTTATTCTACAAAAATATCCCGAAATAACGAGCTCAATTGAAGATCTTATAAAAATTAATT
CAGGTGTGAAAATTCCTTCCTTAGATGCTTCATTTAAATTGAGATTCGAAGCCTCACCAGAAATCTCTTATCTTGAATCA
AAAAAAGCTTTATACCCAAAAATCTATCTCTTTGGTGAATTTAGATTGGTATGTGGCGATAAGGTTTTAACTATGAGAAA
GGTGAGAAATCAAAAAGCGTTAGAACTTTTTAAATTTTTAACTTTGAATTATGATCAATGGATTATTCAAGATCTCATAA
TTGAAAATTTCTGGCCAAATTTACCTTTTGAAAAAAGTCGTCAAAGTTTATACGTAGCACTTCACGACATACGAAAGAGA
TTTCAAGAGTTTGGTTTGGTTGAGGAATACATACTTCAAAAAAATAAAAATTACAAATTCAATGTAAACAAGGTTTATTA
CTTGGATTACGAAGATTTTATCCTCCATTTTGAAGAAGGAAATAAATCATTTAAAAACAAGCAATACTTAAAAGCTAAAG
AACATTATTTAAAGGCTAAGAAACTCTATTCCTATGGCCTTTTACCATCTAATATTTACGACGATTGGGCAATCCCAAAG
ATAGAAGATGCTGAAAAATCTTATCTGTCAATACTTGCTATTTTGTATTCTTTAGAAAAAGAGAAAGACATTGAAATGGC
AGAAAATTATTTAGACGAATACTTACGGATCGAACCTTTCGCCGACGAAATGAACATTGAGTACATCAATCTTCTACTGA
AAAAAGGTGAAAGAAAAAAGGCTTTGGATTATTACAAATATATCAACGAGTTGTACAAAAAAGAGTTAGGAACAGCTTTT
AATTCAAAAGAAATAAGTTACTTTGTCAAAGAGTTCCAAATTTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTTTGGAAATACTACCATCAATGGTATCAACAATATCGTATTAATAATGGATATATTATAATTTTTCCCGTGTTGTTT
ATTCAAAGGTGCTGATTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCTCTCCAAAAAAGTTGTTTTAGATTTTTTTTAGATCTCTTTACTAAAATCTAATAAACAACTTTTTATAAAAGGAGAG
GATTTTAAATGAGGAAATTA

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 1055; Mature: 1055

Protein sequence:

>1055_residues
MKILEPVFKPLLIKPYHQYREKLLNSLINNKSKNYILIKAPSGYGKSITFSMYFNTLNEQKVWISCPQNYFDFDTFLNHL
IYILFKTINLKIFEDNSQNTISFFTEEEKVVELLNGFSSYTKEIFIFVDSFENVVFEGKNENLLKLLLNFIPQNVHFLFT
TNQEFPIPLTKFAMANNVYTIQEEELKFSFDELKNYISTKKINLSEDNLLELYQLTDGIPTFINILSTYIETIDLKKYDA
LIDSAKKIDEYINLLTEALSEDLREYLKVFSLMNEIEPKICKAYFNLKSDEKIHESFEKLYDLNMIEKKDPHYYYMNEIF
RRTISKGIGEREKIQIYQTLFNIYQKEQDYYGQFHCLLNMKDLEKVYDFFLNHSELLIKDFSIIKKWLDLIPTSFFSNNI
ELYYYRGVIEEKYSMFDEALSDYRLVKDNIHKISNKSILENIDTQIIGIYWHQEKYEKVIEMGNELLKSIPNENYQSLTS
LYNLLGTSYSYLSKLDEGKLYLNKAMELCERFNYTEMKPWLLNNLAYNIFLIEGNLESAEKYFVKSLKSFEDSKDLYGKA
LLNANLTDFYIETQKYDKAKEHLKAFENIYLETKNIAYLPVLKILQAKLEVEKNELNSAQKSLMEAENYSSRSKFLQANY
YFVQSLYLLKKDELKESFSTVEKAIKIAKTIFNEYQILNFELQKVRLLIHLKQFEKALSHIGKIIQIATEGKAKLILTEA
LLLKLFLSKSFNLSSYNEDLKTFNELLSDNNYQFILQKYPEITSSIEDLIKINSGVKIPSLDASFKLRFEASPEISYLES
KKALYPKIYLFGEFRLVCGDKVLTMRKVRNQKALELFKFLTLNYDQWIIQDLIIENFWPNLPFEKSRQSLYVALHDIRKR
FQEFGLVEEYILQKNKNYKFNVNKVYYLDYEDFILHFEEGNKSFKNKQYLKAKEHYLKAKKLYSYGLLPSNIYDDWAIPK
IEDAEKSYLSILAILYSLEKEKDIEMAENYLDEYLRIEPFADEMNIEYINLLLKKGERKKALDYYKYINELYKKELGTAF
NSKEISYFVKEFQIY

Sequences:

>Translated_1055_residues
MKILEPVFKPLLIKPYHQYREKLLNSLINNKSKNYILIKAPSGYGKSITFSMYFNTLNEQKVWISCPQNYFDFDTFLNHL
IYILFKTINLKIFEDNSQNTISFFTEEEKVVELLNGFSSYTKEIFIFVDSFENVVFEGKNENLLKLLLNFIPQNVHFLFT
TNQEFPIPLTKFAMANNVYTIQEEELKFSFDELKNYISTKKINLSEDNLLELYQLTDGIPTFINILSTYIETIDLKKYDA
LIDSAKKIDEYINLLTEALSEDLREYLKVFSLMNEIEPKICKAYFNLKSDEKIHESFEKLYDLNMIEKKDPHYYYMNEIF
RRTISKGIGEREKIQIYQTLFNIYQKEQDYYGQFHCLLNMKDLEKVYDFFLNHSELLIKDFSIIKKWLDLIPTSFFSNNI
ELYYYRGVIEEKYSMFDEALSDYRLVKDNIHKISNKSILENIDTQIIGIYWHQEKYEKVIEMGNELLKSIPNENYQSLTS
LYNLLGTSYSYLSKLDEGKLYLNKAMELCERFNYTEMKPWLLNNLAYNIFLIEGNLESAEKYFVKSLKSFEDSKDLYGKA
LLNANLTDFYIETQKYDKAKEHLKAFENIYLETKNIAYLPVLKILQAKLEVEKNELNSAQKSLMEAENYSSRSKFLQANY
YFVQSLYLLKKDELKESFSTVEKAIKIAKTIFNEYQILNFELQKVRLLIHLKQFEKALSHIGKIIQIATEGKAKLILTEA
LLLKLFLSKSFNLSSYNEDLKTFNELLSDNNYQFILQKYPEITSSIEDLIKINSGVKIPSLDASFKLRFEASPEISYLES
KKALYPKIYLFGEFRLVCGDKVLTMRKVRNQKALELFKFLTLNYDQWIIQDLIIENFWPNLPFEKSRQSLYVALHDIRKR
FQEFGLVEEYILQKNKNYKFNVNKVYYLDYEDFILHFEEGNKSFKNKQYLKAKEHYLKAKKLYSYGLLPSNIYDDWAIPK
IEDAEKSYLSILAILYSLEKEKDIEMAENYLDEYLRIEPFADEMNIEYINLLLKKGERKKALDYYKYINELYKKELGTAF
NSKEISYFVKEFQIY
>Mature_1055_residues
MKILEPVFKPLLIKPYHQYREKLLNSLINNKSKNYILIKAPSGYGKSITFSMYFNTLNEQKVWISCPQNYFDFDTFLNHL
IYILFKTINLKIFEDNSQNTISFFTEEEKVVELLNGFSSYTKEIFIFVDSFENVVFEGKNENLLKLLLNFIPQNVHFLFT
TNQEFPIPLTKFAMANNVYTIQEEELKFSFDELKNYISTKKINLSEDNLLELYQLTDGIPTFINILSTYIETIDLKKYDA
LIDSAKKIDEYINLLTEALSEDLREYLKVFSLMNEIEPKICKAYFNLKSDEKIHESFEKLYDLNMIEKKDPHYYYMNEIF
RRTISKGIGEREKIQIYQTLFNIYQKEQDYYGQFHCLLNMKDLEKVYDFFLNHSELLIKDFSIIKKWLDLIPTSFFSNNI
ELYYYRGVIEEKYSMFDEALSDYRLVKDNIHKISNKSILENIDTQIIGIYWHQEKYEKVIEMGNELLKSIPNENYQSLTS
LYNLLGTSYSYLSKLDEGKLYLNKAMELCERFNYTEMKPWLLNNLAYNIFLIEGNLESAEKYFVKSLKSFEDSKDLYGKA
LLNANLTDFYIETQKYDKAKEHLKAFENIYLETKNIAYLPVLKILQAKLEVEKNELNSAQKSLMEAENYSSRSKFLQANY
YFVQSLYLLKKDELKESFSTVEKAIKIAKTIFNEYQILNFELQKVRLLIHLKQFEKALSHIGKIIQIATEGKAKLILTEA
LLLKLFLSKSFNLSSYNEDLKTFNELLSDNNYQFILQKYPEITSSIEDLIKINSGVKIPSLDASFKLRFEASPEISYLES
KKALYPKIYLFGEFRLVCGDKVLTMRKVRNQKALELFKFLTLNYDQWIIQDLIIENFWPNLPFEKSRQSLYVALHDIRKR
FQEFGLVEEYILQKNKNYKFNVNKVYYLDYEDFILHFEEGNKSFKNKQYLKAKEHYLKAKKLYSYGLLPSNIYDDWAIPK
IEDAEKSYLSILAILYSLEKEKDIEMAENYLDEYLRIEPFADEMNIEYINLLLKKGERKKALDYYKYINELYKKELGTAF
NSKEISYFVKEFQIY

Specific function: Unknown

COG id: COG2909

COG function: function code K; ATP-dependent transcriptional regulator

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 125582; Mature: 125582

Theoretical pI: Translated: 6.00; Mature: 6.00

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKILEPVFKPLLIKPYHQYREKLLNSLINNKSKNYILIKAPSGYGKSITFSMYFNTLNEQ
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
KVWISCPQNYFDFDTFLNHLIYILFKTINLKIFEDNSQNTISFFTEEEKVVELLNGFSSY
EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
TKEIFIFVDSFENVVFEGKNENLLKLLLNFIPQNVHFLFTTNQEFPIPLTKFAMANNVYT
HHEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCEEE
IQEEELKFSFDELKNYISTKKINLSEDNLLELYQLTDGIPTFINILSTYIETIDLKKYDA
EEHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDSAKKIDEYINLLTEALSEDLREYLKVFSLMNEIEPKICKAYFNLKSDEKIHESFEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
YDLNMIEKKDPHYYYMNEIFRRTISKGIGEREKIQIYQTLFNIYQKEQDYYGQFHCLLNM
HCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECH
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HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
SDYRLVKDNIHKISNKSILENIDTQIIGIYWHQEKYEKVIEMGNELLKSIPNENYQSLTS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
LYNLLGTSYSYLSKLDEGKLYLNKAMELCERFNYTEMKPWLLNNLAYNIFLIEGNLESAE
HHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCEEEEEEEECCHHHHH
KYFVKSLKSFEDSKDLYGKALLNANLTDFYIETQKYDKAKEHLKAFENIYLETKNIAYLP
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKAIKIAKTIFNEYQILNFELQKVRLLIHLKQFEKALSHIGKIIQIATEGKAKLILTEA
HHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHH
LLLKLFLSKSFNLSSYNEDLKTFNELLSDNNYQFILQKYPEITSSIEDLIKINSGVKIPS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LDASFKLRFEASPEISYLESKKALYPKIYLFGEFRLVCGDKVLTMRKVRNQKALELFKFL
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HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEE
NVNKVYYLDYEDFILHFEEGNKSFKNKQYLKAKEHYLKAKKLYSYGLLPSNIYDDWAIPK
ECCEEEEEEHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IEDAEKSYLSILAILYSLEKEKDIEMAENYLDEYLRIEPFADEMNIEYINLLLKKGERKK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHCCCHHH
ALDYYKYINELYKKELGTAFNSKEISYFVKEFQIY
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKILEPVFKPLLIKPYHQYREKLLNSLINNKSKNYILIKAPSGYGKSITFSMYFNTLNEQ
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
KVWISCPQNYFDFDTFLNHLIYILFKTINLKIFEDNSQNTISFFTEEEKVVELLNGFSSY
EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
TKEIFIFVDSFENVVFEGKNENLLKLLLNFIPQNVHFLFTTNQEFPIPLTKFAMANNVYT
HHEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCEEE
IQEEELKFSFDELKNYISTKKINLSEDNLLELYQLTDGIPTFINILSTYIETIDLKKYDA
EEHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDSAKKIDEYINLLTEALSEDLREYLKVFSLMNEIEPKICKAYFNLKSDEKIHESFEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
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KDLEKVYDFFLNHSELLIKDFSIIKKWLDLIPTSFFSNNIELYYYRGVIEEKYSMFDEAL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHH
VLKILQAKLEVEKNELNSAQKSLMEAENYSSRSKFLQANYYFVQSLYLLKKDELKESFST
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEKAIKIAKTIFNEYQILNFELQKVRLLIHLKQFEKALSHIGKIIQIATEGKAKLILTEA
HHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHH
LLLKLFLSKSFNLSSYNEDLKTFNELLSDNNYQFILQKYPEITSSIEDLIKINSGVKIPS
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LDASFKLRFEASPEISYLESKKALYPKIYLFGEFRLVCGDKVLTMRKVRNQKALELFKFL
CCCCEEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
TLNYDQWIIQDLIIENFWPNLPFEKSRQSLYVALHDIRKRFQEFGLVEEYILQKNKNYKF
HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEE
NVNKVYYLDYEDFILHFEEGNKSFKNKQYLKAKEHYLKAKKLYSYGLLPSNIYDDWAIPK
ECCEEEEEEHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IEDAEKSYLSILAILYSLEKEKDIEMAENYLDEYLRIEPFADEMNIEYINLLLKKGERKK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHCCCHHH
ALDYYKYINELYKKELGTAFNSKEISYFVKEFQIY
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA