| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is mprF [H]
Identifier: 160875899
GI number: 160875899
Start: 3319719
End: 3322271
Strand: Reverse
Name: mprF [H]
Synonym: Sbal195_2788
Alternate gene names: 160875899
Gene position: 3322271-3319719 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160875901
Following gene: 160875898
Centisome position: 62.13
GC content: 41.83
Gene sequence:
>2553_bases ATGGGGAGACGAGTGCGGGTGTTTATTAGCCTTATAATATTCACTGTCTCATTACTCTTGCTTTATAATTTAGAGCAAGA ATATCAATTAAGTGACATTGTTAAAGAGGTTAAAGATTTTTCATTTGTTGAGTTGTTATGTGCAGCGCTGCTAACCGTGG GTAGTTACTCTTTATTAACCTTGTATGATTATATTGCCGTTCGAAATGTCGACAAGGAGATACCTTATCGTAAAATAGTT CCTATTTCTTTTTTAGGTTTTACGTTCTCTAATACCATAGGTTTCTCGCTGTTAACGGGGACGTCGATAAGATATAAGTT TTATTCCGAACTCGGCTTAAGTGGTAATAAAATCACTCAAATAGTCATTTCATGTTCAGTGACATTCTTCCTCGGACTCT TTTTTATTTGTGGTATTGCACTGGTATGCTTTCCCTCTGAACAATTATCAGCCTTACCTTTGCCAACATGGTTATTTTCA TTAACGACAGTAATCGGTATTGGCATGCTGCTCAGTGTATTAGGCTATTTACTGATGAGTGTGCTGCGGAAAAAGCCATT TAACTTTCGTGGCTTTGAAATTACGCCACCTCTGTTATCTGTATCTTTAAGACAGTTGTTGGTGTCTTCACTTGATTGGA TTGTCGTAGGAACCTTGTTTTATAGCTTACTGCCCGCGGTAGAAAATTTGGGCTATATACAGGTCTTAAGTATTTTCTTT GTTGCGAATGCGCTTGGGGTGCTTGCCCATGTGCCGGGTGGTATTGGGGTGTTCGAGTCCGTCGTGACTGTGGCCTTATC GCAATATTTACCGGTTGAGCAAATCCTCGGCGCCATTATTATCTATCGGATCATTTATTACATTATTCCATTTTTAATCT CTTTGGCATACTTTGTTATTATGATCGCGCGGTCAAATAAAGATAAAATTGTAAAATTAAATACTCGAATTGCATTTATC CGCCAACTGTTACCACCGCTACTGAGTATCAGTGTATTTAGCTCAGGTTTATTATTACTCTTGTCAGTGGTTAACCCTTC TATTATTCATAAGTATCACTGGTTGGGCGAGTTAGTACCGCTGCCGATCATCGAAATATCGAGCATCATTTTGAGTGTGA GCGGTGTCTTGCTATTGTTGTTATCCCATGGGTTATTTAAACGCTACCATAATGCCTTTGAATTAACGAAAAAGCTGCTG TTGGTGGGCATGTTATTTATTATGCTTAAGGGCGCGGAATGGGAAATATCACTCGCGATCGGATTAGTGTACACATTGAT GTTGCCATGTGAGAATTTGTTTTATCGAAAGGGTTCAGTCGTCGGGATTAAATACTCTTTGGGTTGGCTGTTATCACTTT CTGCCGCCTTATTCTTGATGATTTGGGTATTATTTTTCTCCTATCAAGATGTTGATTATGATCATTCACTCTGGTTTACC TTCTCCCCCGATAGCCATGTATCACGAGCATTGCGAGGAGGAGCGATTGCTATCTTTATCGTGCTTGCCTTTGCCGTGCG CTATTTCTCGTCACGAACTCAGCTTAAATCACCACAACTGGACACGCCTTCATTAAAGCAGGCGATGGAGATTGTCGCGC AGTCGCCGAGCAGTCATGGCTATTTAGCCTTAGTGCAAGATAAATCAATCCTATTTAACGAGGATAAAGACGCCTTTCTT ATGTATGCAAGGGCTGGACATTGCTGGGTGGTAATGGGTGATCCAATTGGTAATCAACATAAATTTGATGATTTATTGTG GCAGTTTAGGGAGTTATGCGATGCCTACGATGGTTGGCCGGTGTTTTATCAAGTGACGCAAAAATACCTGCCGAGCTTTT TAGAGCAAGGATTAGGTTTATATAAATTAGGCGAGGAGGCGATTGTTCAGCTCGACCAATTTGACTTACCGTCGAGTCGC TATCGGAGTTTGCGCCAGAGTCATGCCAAGGCGCAGCGTGAAGGCTTGAGTTTTGCTGTGATTGAGGCGAGTCAAGTGAG GGCCATACTGCCGCAATTAGAAGCCATATCATCGACTTGGTTAAAGGCGAAGCAAGGGCGCGAAAAGGGGTTTTCGGTCG GCTATTTCTCTGCCGCTTATCTGTGCTCGACACCTATGGCATTAGTGTATGCAAACGGTGAGCTCGTGGCGTTTTCAAAT ATTTGGGCTAGTGCTGCTCAGGTTGAATTTTCTGTCGATCTAATGCGTTACGAGCCTAAATTATCGAGCAGTAACATCAT GGATTTTCTGTTTACTGAACTATTGCTATGGGGAAAACAGCAAGGCTATCAGAGGTTTAATCTCGGGATGGCGCCGATGT CAGGCTTGACCGACAGAGCGTTAGTGCCATTTTGGACTAAGCTAGCGAAGGTTGTGTATAAGAAGGGTAATAAATTTTAT AACTTTCAGGGGCTTAGAAGATACAAGGATAAGTTTAATCCAACGTGGGAGGCCAAGTATTTGATTTGTTATGGCGGATT ATCTCTGCCAATTGTGGTGGGCAGTTTAGTGACATTAACGAGTCGTGGTGCAACCGGTGTATTTAAAAAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTGACTGGTATTAAACTAAGTTAATTAATTTTTAATGCTGTTTCAATGTTGACGTTAAATAACCTTAGCTGAATCAAT CTTAGGTGCTGGAGATTAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGAACGATGAATAAATCCTTTGTGAAAATACTAAGCCTTATGATGATGTTTTGCAGTAGCTTTAGTGTCTTAGCTGATG ACTTTGCTGACTCACTCGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase [H]
Number of amino acids: Translated: 850; Mature: 849
Protein sequence:
>850_residues MGRRVRVFISLIIFTVSLLLLYNLEQEYQLSDIVKEVKDFSFVELLCAALLTVGSYSLLTLYDYIAVRNVDKEIPYRKIV PISFLGFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNKITQIVISCSVTFFLGLFFICGIALVCFPSEQLSALPLPTWLFS LTTVIGIGMLLSVLGYLLMSVLRKKPFNFRGFEITPPLLSVSLRQLLVSSLDWIVVGTLFYSLLPAVENLGYIQVLSIFF VANALGVLAHVPGGIGVFESVVTVALSQYLPVEQILGAIIIYRIIYYIIPFLISLAYFVIMIARSNKDKIVKLNTRIAFI RQLLPPLLSISVFSSGLLLLLSVVNPSIIHKYHWLGELVPLPIIEISSIILSVSGVLLLLLSHGLFKRYHNAFELTKKLL LVGMLFIMLKGAEWEISLAIGLVYTLMLPCENLFYRKGSVVGIKYSLGWLLSLSAALFLMIWVLFFSYQDVDYDHSLWFT FSPDSHVSRALRGGAIAIFIVLAFAVRYFSSRTQLKSPQLDTPSLKQAMEIVAQSPSSHGYLALVQDKSILFNEDKDAFL MYARAGHCWVVMGDPIGNQHKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPSFLEQGLGLYKLGEEAIVQLDQFDLPSSR YRSLRQSHAKAQREGLSFAVIEASQVRAILPQLEAISSTWLKAKQGREKGFSVGYFSAAYLCSTPMALVYANGELVAFSN IWASAAQVEFSVDLMRYEPKLSSSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQRFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKVVYKKGNKFY NFQGLRRYKDKFNPTWEAKYLICYGGLSLPIVVGSLVTLTSRGATGVFKK
Sequences:
>Translated_850_residues MGRRVRVFISLIIFTVSLLLLYNLEQEYQLSDIVKEVKDFSFVELLCAALLTVGSYSLLTLYDYIAVRNVDKEIPYRKIV PISFLGFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNKITQIVISCSVTFFLGLFFICGIALVCFPSEQLSALPLPTWLFS LTTVIGIGMLLSVLGYLLMSVLRKKPFNFRGFEITPPLLSVSLRQLLVSSLDWIVVGTLFYSLLPAVENLGYIQVLSIFF VANALGVLAHVPGGIGVFESVVTVALSQYLPVEQILGAIIIYRIIYYIIPFLISLAYFVIMIARSNKDKIVKLNTRIAFI RQLLPPLLSISVFSSGLLLLLSVVNPSIIHKYHWLGELVPLPIIEISSIILSVSGVLLLLLSHGLFKRYHNAFELTKKLL LVGMLFIMLKGAEWEISLAIGLVYTLMLPCENLFYRKGSVVGIKYSLGWLLSLSAALFLMIWVLFFSYQDVDYDHSLWFT FSPDSHVSRALRGGAIAIFIVLAFAVRYFSSRTQLKSPQLDTPSLKQAMEIVAQSPSSHGYLALVQDKSILFNEDKDAFL MYARAGHCWVVMGDPIGNQHKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPSFLEQGLGLYKLGEEAIVQLDQFDLPSSR YRSLRQSHAKAQREGLSFAVIEASQVRAILPQLEAISSTWLKAKQGREKGFSVGYFSAAYLCSTPMALVYANGELVAFSN IWASAAQVEFSVDLMRYEPKLSSSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQRFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKVVYKKGNKFY NFQGLRRYKDKFNPTWEAKYLICYGGLSLPIVVGSLVTLTSRGATGVFKK >Mature_849_residues GRRVRVFISLIIFTVSLLLLYNLEQEYQLSDIVKEVKDFSFVELLCAALLTVGSYSLLTLYDYIAVRNVDKEIPYRKIVP ISFLGFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNKITQIVISCSVTFFLGLFFICGIALVCFPSEQLSALPLPTWLFSL TTVIGIGMLLSVLGYLLMSVLRKKPFNFRGFEITPPLLSVSLRQLLVSSLDWIVVGTLFYSLLPAVENLGYIQVLSIFFV ANALGVLAHVPGGIGVFESVVTVALSQYLPVEQILGAIIIYRIIYYIIPFLISLAYFVIMIARSNKDKIVKLNTRIAFIR QLLPPLLSISVFSSGLLLLLSVVNPSIIHKYHWLGELVPLPIIEISSIILSVSGVLLLLLSHGLFKRYHNAFELTKKLLL VGMLFIMLKGAEWEISLAIGLVYTLMLPCENLFYRKGSVVGIKYSLGWLLSLSAALFLMIWVLFFSYQDVDYDHSLWFTF SPDSHVSRALRGGAIAIFIVLAFAVRYFSSRTQLKSPQLDTPSLKQAMEIVAQSPSSHGYLALVQDKSILFNEDKDAFLM YARAGHCWVVMGDPIGNQHKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPSFLEQGLGLYKLGEEAIVQLDQFDLPSSRY RSLRQSHAKAQREGLSFAVIEASQVRAILPQLEAISSTWLKAKQGREKGFSVGYFSAAYLCSTPMALVYANGELVAFSNI WASAAQVEFSVDLMRYEPKLSSSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQRFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKVVYKKGNKFYN FQGLRRYKDKFNPTWEAKYLICYGGLSLPIVVGSLVTLTSRGATGVFKK
Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), one of the components of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contribu
COG id: COG2898
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787006, Length=292, Percent_Identity=29.7945205479452, Blast_Score=126, Evalue=7e-30,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR016181 - InterPro: IPR022791 [H]
Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]
EC number: =2.3.2.3 [H]
Molecular weight: Translated: 95606; Mature: 95475
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGRRVRVFISLIIFTVSLLLLYNLEQEYQLSDIVKEVKDFSFVELLCAALLTVGSYSLLT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LYDYIAVRNVDKEIPYRKIVPISFLGFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNKITQ HHHHHHHHCCCHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEHHHHCCCCCHHHH IVISCSVTFFLGLFFICGIALVCFPSEQLSALPLPTWLFSLTTVIGIGMLLSVLGYLLMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLRKKPFNFRGFEITPPLLSVSLRQLLVSSLDWIVVGTLFYSLLPAVENLGYIQVLSIFF HHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH VANALGVLAHVPGGIGVFESVVTVALSQYLPVEQILGAIIIYRIIYYIIPFLISLAYFVI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIARSNKDKIVKLNTRIAFIRQLLPPLLSISVFSSGLLLLLSVVNPSIIHKYHWLGELVP HHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCC LPIIEISSIILSVSGVLLLLLSHGLFKRYHNAFELTKKLLLVGMLFIMLKGAEWEISLAI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHH GLVYTLMLPCENLFYRKGSVVGIKYSLGWLLSLSAALFLMIWVLFFSYQDVDYDHSLWFT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE FSPDSHVSRALRGGAIAIFIVLAFAVRYFSSRTQLKSPQLDTPSLKQAMEIVAQSPSSHG ECCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC YLALVQDKSILFNEDKDAFLMYARAGHCWVVMGDPIGNQHKFDDLLWQFRELCDAYDGWP EEEEEECCCEEECCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH VFYQVTQKYLPSFLEQGLGLYKLGEEAIVQLDQFDLPSSRYRSLRQSHAKAQREGLSFAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE IEASQVRAILPQLEAISSTWLKAKQGREKGFSVGYFSAAYLCSTPMALVYANGELVAFSN EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEHH IWASAAQVEFSVDLMRYEPKLSSSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQRFNLGMAPMSGLTDRA HHHHHHHEEEEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC LVPFWTKLAKVVYKKGNKFYNFQGLRRYKDKFNPTWEAKYLICYGGLSLPIVVGSLVTLT HHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH SRGATGVFKK CCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure GRRVRVFISLIIFTVSLLLLYNLEQEYQLSDIVKEVKDFSFVELLCAALLTVGSYSLLT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LYDYIAVRNVDKEIPYRKIVPISFLGFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNKITQ HHHHHHHHCCCHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEEHHHHCCCCCHHHH IVISCSVTFFLGLFFICGIALVCFPSEQLSALPLPTWLFSLTTVIGIGMLLSVLGYLLMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLRKKPFNFRGFEITPPLLSVSLRQLLVSSLDWIVVGTLFYSLLPAVENLGYIQVLSIFF HHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH VANALGVLAHVPGGIGVFESVVTVALSQYLPVEQILGAIIIYRIIYYIIPFLISLAYFVI HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIARSNKDKIVKLNTRIAFIRQLLPPLLSISVFSSGLLLLLSVVNPSIIHKYHWLGELVP HHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCC LPIIEISSIILSVSGVLLLLLSHGLFKRYHNAFELTKKLLLVGMLFIMLKGAEWEISLAI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHH GLVYTLMLPCENLFYRKGSVVGIKYSLGWLLSLSAALFLMIWVLFFSYQDVDYDHSLWFT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE FSPDSHVSRALRGGAIAIFIVLAFAVRYFSSRTQLKSPQLDTPSLKQAMEIVAQSPSSHG ECCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC YLALVQDKSILFNEDKDAFLMYARAGHCWVVMGDPIGNQHKFDDLLWQFRELCDAYDGWP EEEEEECCCEEECCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH VFYQVTQKYLPSFLEQGLGLYKLGEEAIVQLDQFDLPSSRYRSLRQSHAKAQREGLSFAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE IEASQVRAILPQLEAISSTWLKAKQGREKGFSVGYFSAAYLCSTPMALVYANGELVAFSN EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEHH IWASAAQVEFSVDLMRYEPKLSSSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQRFNLGMAPMSGLTDRA HHHHHHHEEEEEEHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC LVPFWTKLAKVVYKKGNKFYNFQGLRRYKDKFNPTWEAKYLICYGGLSLPIVVGSLVTLT HHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH SRGATGVFKK CCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]