Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009972 |
Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159899495
Identifier: 159899495
GI number: 159899495
Start: 3754215
End: 3757499
Strand: Direct
Name: 159899495
Synonym: Haur_2976
Alternate gene names: NA
Gene position: 3754215-3757499 (Clockwise)
Preceding gene: 159899492
Following gene: 159899496
Centisome position: 59.15
GC content: 51.78
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CCTTGATTCCTAGCCCCTCTTTCATCCTTCATAATTCATCCCTCATGCTTAACTTTGCTTTATACTTAGGCTAGCAACCA AACAGCGATGGAGGGATGGC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAGACCTATACAATCACTCAGCGGGCTACTTGTTTGGTGTGGAGGATGTTATGAATTCATTGGCGGCAATCCCGCACCT TCACGATCTACCACAAGTGG
Product: abortive infection protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1094; Mature: 1094
Protein sequence:
>1094_residues MHKPDTKRLIPPIFVLLAIFGIFLAIVFAAESTPMAEIRFNLDREAALQRSVEALQAAGGDPSQFTQTITFGSNNDAQSY LIRERSRALLNQRVDEDLNLASWNVRFWRELDPEQWSISLSPATGRILAINHMRPDEAAGATLSQTEALLLAQAQLPIPL DQLTLLDQFTNQQPNRTDHTFIWQRRDISDAEAQYRYSVTIAGDQLGQRGEYYWLPQSWYLDKDWQLRRGGILNHTGWTL TYALTALIGVAWFIQARRGRLRWRWALRLFAAVAAVGVLVMLNSIPLDLAHYDINQSLPVYWGNVLGGYVGQLVTIATTI ILAGMAGEALVWEETEGTVSLSETLTHRGLVSRPVVQALWVGGLVGIFQLGFVSAFYALGSRYFGVWSPVTPLYDDTIAT PFPALYGMALGLLPAIGEELIFRLGGITVLTRYFGRPKLAIIVTAVVWAALHATYPQHPFYIRVVELSIIGILFGFLSVR YGVLASIAAHYTYNASLYVPLFWKTNNFYLLSGIAAAALVLWLLVPAIIRQLRGIPLESDNTIRAALPPQVPEPVVPQLS WQWRSDWKLFAGLSGLAVIMLLVIGLNRAPALTRNGVRQDMVTRTEALAQERKIDLTGLNPSVTVVADWVDLDLAYIYDQ LDPEQTAAAIEKGTVRAWSVRWSNWDRPEYSWLVYLDPAGRLLSYRLSLPENAKAISTTLEQAQTIATTHASQFIALDQY ELSNTSTSQKPNRNDYSFVWQTKMPWIGEAYRRFEVTVAGDQVIVSSPSMYTPPEYRRERDQTTLSESILSNLRSALRGI PATILPILGLIGIFRRRTELWPWVWLGIIAGIGYLIQGAGRWTFAQVSELPRFILAISQTLANAVLNGGELALLGAGAAT AWNLTKNEQQLPLEAFIRAIPHRIQDFVADRAQVLRRESIVLGILIVPWILLIRSSIGFTTAKAGFWASVQPLNAQSAML DILLQATFDAITTSLLLIGSLSMLTWVVRGKQQIALAITCLGMALVLLPLREPAQWLVLGLAVLLSFWLGRMLRWNGLAL TVALWLANIVPAALTLLATTPLALQLNGAALIVLLCGFCGWYLGGWWQTQNAEN
Sequences:
>Translated_1094_residues MHKPDTKRLIPPIFVLLAIFGIFLAIVFAAESTPMAEIRFNLDREAALQRSVEALQAAGGDPSQFTQTITFGSNNDAQSY LIRERSRALLNQRVDEDLNLASWNVRFWRELDPEQWSISLSPATGRILAINHMRPDEAAGATLSQTEALLLAQAQLPIPL DQLTLLDQFTNQQPNRTDHTFIWQRRDISDAEAQYRYSVTIAGDQLGQRGEYYWLPQSWYLDKDWQLRRGGILNHTGWTL TYALTALIGVAWFIQARRGRLRWRWALRLFAAVAAVGVLVMLNSIPLDLAHYDINQSLPVYWGNVLGGYVGQLVTIATTI ILAGMAGEALVWEETEGTVSLSETLTHRGLVSRPVVQALWVGGLVGIFQLGFVSAFYALGSRYFGVWSPVTPLYDDTIAT PFPALYGMALGLLPAIGEELIFRLGGITVLTRYFGRPKLAIIVTAVVWAALHATYPQHPFYIRVVELSIIGILFGFLSVR YGVLASIAAHYTYNASLYVPLFWKTNNFYLLSGIAAAALVLWLLVPAIIRQLRGIPLESDNTIRAALPPQVPEPVVPQLS WQWRSDWKLFAGLSGLAVIMLLVIGLNRAPALTRNGVRQDMVTRTEALAQERKIDLTGLNPSVTVVADWVDLDLAYIYDQ LDPEQTAAAIEKGTVRAWSVRWSNWDRPEYSWLVYLDPAGRLLSYRLSLPENAKAISTTLEQAQTIATTHASQFIALDQY ELSNTSTSQKPNRNDYSFVWQTKMPWIGEAYRRFEVTVAGDQVIVSSPSMYTPPEYRRERDQTTLSESILSNLRSALRGI PATILPILGLIGIFRRRTELWPWVWLGIIAGIGYLIQGAGRWTFAQVSELPRFILAISQTLANAVLNGGELALLGAGAAT AWNLTKNEQQLPLEAFIRAIPHRIQDFVADRAQVLRRESIVLGILIVPWILLIRSSIGFTTAKAGFWASVQPLNAQSAML DILLQATFDAITTSLLLIGSLSMLTWVVRGKQQIALAITCLGMALVLLPLREPAQWLVLGLAVLLSFWLGRMLRWNGLAL TVALWLANIVPAALTLLATTPLALQLNGAALIVLLCGFCGWYLGGWWQTQNAEN >Mature_1094_residues MHKPDTKRLIPPIFVLLAIFGIFLAIVFAAESTPMAEIRFNLDREAALQRSVEALQAAGGDPSQFTQTITFGSNNDAQSY LIRERSRALLNQRVDEDLNLASWNVRFWRELDPEQWSISLSPATGRILAINHMRPDEAAGATLSQTEALLLAQAQLPIPL DQLTLLDQFTNQQPNRTDHTFIWQRRDISDAEAQYRYSVTIAGDQLGQRGEYYWLPQSWYLDKDWQLRRGGILNHTGWTL TYALTALIGVAWFIQARRGRLRWRWALRLFAAVAAVGVLVMLNSIPLDLAHYDINQSLPVYWGNVLGGYVGQLVTIATTI ILAGMAGEALVWEETEGTVSLSETLTHRGLVSRPVVQALWVGGLVGIFQLGFVSAFYALGSRYFGVWSPVTPLYDDTIAT PFPALYGMALGLLPAIGEELIFRLGGITVLTRYFGRPKLAIIVTAVVWAALHATYPQHPFYIRVVELSIIGILFGFLSVR YGVLASIAAHYTYNASLYVPLFWKTNNFYLLSGIAAAALVLWLLVPAIIRQLRGIPLESDNTIRAALPPQVPEPVVPQLS WQWRSDWKLFAGLSGLAVIMLLVIGLNRAPALTRNGVRQDMVTRTEALAQERKIDLTGLNPSVTVVADWVDLDLAYIYDQ LDPEQTAAAIEKGTVRAWSVRWSNWDRPEYSWLVYLDPAGRLLSYRLSLPENAKAISTTLEQAQTIATTHASQFIALDQY ELSNTSTSQKPNRNDYSFVWQTKMPWIGEAYRRFEVTVAGDQVIVSSPSMYTPPEYRRERDQTTLSESILSNLRSALRGI PATILPILGLIGIFRRRTELWPWVWLGIIAGIGYLIQGAGRWTFAQVSELPRFILAISQTLANAVLNGGELALLGAGAAT AWNLTKNEQQLPLEAFIRAIPHRIQDFVADRAQVLRRESIVLGILIVPWILLIRSSIGFTTAKAGFWASVQPLNAQSAML DILLQATFDAITTSLLLIGSLSMLTWVVRGKQQIALAITCLGMALVLLPLREPAQWLVLGLAVLLSFWLGRMLRWNGLAL TVALWLANIVPAALTLLATTPLALQLNGAALIVLLCGFCGWYLGGWWQTQNAEN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 121714; Mature: 121714
Theoretical pI: Translated: 8.33; Mature: 8.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHKPDTKRLIPPIFVLLAIFGIFLAIVFAAESTPMAEIRFNLDREAALQRSVEALQAAGG CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCC DPSQFTQTITFGSNNDAQSYLIRERSRALLNQRVDEDLNLASWNVRFWRELDPEQWSISL CHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECEEEHCCCCCCCEEEEE SPATGRILAINHMRPDEAAGATLSQTEALLLAQAQLPIPLDQLTLLDQFTNQQPNRTDHT CCCCCEEEEEECCCCCHHCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE FIWQRRDISDAEAQYRYSVTIAGDQLGQRGEYYWLPQSWYLDKDWQLRRGGILNHTGWTL EEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHH TYALTALIGVAWFIQARRGRLRWRWALRLFAAVAAVGVLVMLNSIPLDLAHYDINQSLPV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCH YWGNVLGGYVGQLVTIATTIILAGMAGEALVWEETEGTVSLSETLTHRGLVSRPVVQALW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VGGLVGIFQLGFVSAFYALGSRYFGVWSPVTPLYDDTIATPFPALYGMALGLLPAIGEEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLGGITVLTRYFGRPKLAIIVTAVVWAALHATYPQHPFYIRVVELSIIGILFGFLSVR HHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH YGVLASIAAHYTYNASLYVPLFWKTNNFYLLSGIAAAALVLWLLVPAIIRQLRGIPLESD HHHHHHHHHHEEECCEEEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC NTIRAALPPQVPEPVVPQLSWQWRSDWKLFAGLSGLAVIMLLVIGLNRAPALTRNGVRQD CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHH MVTRTEALAQERKIDLTGLNPSVTVVADWVDLDLAYIYDQLDPEQTAAAIEKGTVRAWSV HHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEEE RWSNWDRPEYSWLVYLDPAGRLLSYRLSLPENAKAISTTLEQAQTIATTHASQFIALDQY ECCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECE ELSNTSTSQKPNRNDYSFVWQTKMPWIGEAYRRFEVTVAGDQVIVSSPSMYTPPEYRRER ECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEEEEEEECCEEEEECCCCCCCHHHHHHH DQTTLSESILSNLRSALRGIPATILPILGLIGIFRRRTELWPWVWLGIIAGIGYLIQGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RWTFAQVSELPRFILAISQTLANAVLNGGELALLGAGAATAWNLTKNEQQLPLEAFIRAI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH PHRIQDFVADRAQVLRRESIVLGILIVPWILLIRSSIGFTTAKAGFWASVQPLNAQSAML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHH DILLQATFDAITTSLLLIGSLSMLTWVVRGKQQIALAITCLGMALVLLPLREPAQWLVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LAVLLSFWLGRMLRWNGLALTVALWLANIVPAALTLLATTPLALQLNGAALIVLLCGFCG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHH WYLGGWWQTQNAEN HHHCCEEECCCCCC >Mature Secondary Structure MHKPDTKRLIPPIFVLLAIFGIFLAIVFAAESTPMAEIRFNLDREAALQRSVEALQAAGG CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCC DPSQFTQTITFGSNNDAQSYLIRERSRALLNQRVDEDLNLASWNVRFWRELDPEQWSISL CHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECEEEHCCCCCCCEEEEE SPATGRILAINHMRPDEAAGATLSQTEALLLAQAQLPIPLDQLTLLDQFTNQQPNRTDHT CCCCCEEEEEECCCCCHHCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE FIWQRRDISDAEAQYRYSVTIAGDQLGQRGEYYWLPQSWYLDKDWQLRRGGILNHTGWTL EEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHH TYALTALIGVAWFIQARRGRLRWRWALRLFAAVAAVGVLVMLNSIPLDLAHYDINQSLPV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCH YWGNVLGGYVGQLVTIATTIILAGMAGEALVWEETEGTVSLSETLTHRGLVSRPVVQALW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VGGLVGIFQLGFVSAFYALGSRYFGVWSPVTPLYDDTIATPFPALYGMALGLLPAIGEEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLGGITVLTRYFGRPKLAIIVTAVVWAALHATYPQHPFYIRVVELSIIGILFGFLSVR HHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH YGVLASIAAHYTYNASLYVPLFWKTNNFYLLSGIAAAALVLWLLVPAIIRQLRGIPLESD HHHHHHHHHHEEECCEEEEEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC NTIRAALPPQVPEPVVPQLSWQWRSDWKLFAGLSGLAVIMLLVIGLNRAPALTRNGVRQD CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHH MVTRTEALAQERKIDLTGLNPSVTVVADWVDLDLAYIYDQLDPEQTAAAIEKGTVRAWSV HHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEEE RWSNWDRPEYSWLVYLDPAGRLLSYRLSLPENAKAISTTLEQAQTIATTHASQFIALDQY ECCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECE ELSNTSTSQKPNRNDYSFVWQTKMPWIGEAYRRFEVTVAGDQVIVSSPSMYTPPEYRRER ECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEEEEEEECCEEEEECCCCCCCHHHHHHH DQTTLSESILSNLRSALRGIPATILPILGLIGIFRRRTELWPWVWLGIIAGIGYLIQGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RWTFAQVSELPRFILAISQTLANAVLNGGELALLGAGAATAWNLTKNEQQLPLEAFIRAI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHH PHRIQDFVADRAQVLRRESIVLGILIVPWILLIRSSIGFTTAKAGFWASVQPLNAQSAML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEECCCCCHHHHHH DILLQATFDAITTSLLLIGSLSMLTWVVRGKQQIALAITCLGMALVLLPLREPAQWLVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LAVLLSFWLGRMLRWNGLALTVALWLANIVPAALTLLATTPLALQLNGAALIVLLCGFCG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHH WYLGGWWQTQNAEN HHHCCEEECCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA