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Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157962192

Identifier: 157962192

GI number: 157962192

Start: 2891025

End: 2892533

Strand: Direct

Name: 157962192

Synonym: Spea_2371

Alternate gene names: NA

Gene position: 2891025-2892533 (Clockwise)

Preceding gene: 157962191

Following gene: 157962193

Centisome position: 55.87

GC content: 43.67

Gene sequence:

>1509_bases
ATGCATTCTAAAAAACCCTTTTATATTTTAGTGGCGTTACTATTTATTAGCGGAATTGCCGCCAGTGTCTACCGTGGAAT
TGAGCACAGCGTACCTTTCCTTCCAGGTAAACAAGTACAGAGCTGGGCAGTCGATGCCAAAGTCAGCTTTCAAGGAACTG
GTGAGCCTGCTGAAGTCTCTTTCTCTTTGCCTGAAGATCCTGCCTATGAAATTCTGGTTGAAAATGCCACGTCACCGGGT
TATGGCTTAACCATCACCAATAATGCTATCGACCGCCGTGCAATTTGGTCAGTCCGTAGCGCATCGGGCAAGCAAGATCT
TTATTATAAAGTAACCCTAATCCCAACGGGTCAAAATAAGCTTCTAGCCGATGGAGTGCCAGCGGTTCCTACCACATATA
GTTGGCCTGCGACCGAAGAAGCAGCTGCGCAGCAGGTGATTGAAGAAGTTTGGTCACGCAGTGCCACTAGCCTTTCTTTC
GCCCAGCAGCTAAACAAAGTATTAAATGCCAACGAGCGTAGCCAGAATATCGAGCTACTACTTACAAGTAATACACCGAC
TAAATTATTTATCAGAATGCTTCACAGCAAAGGGCTCCCAGCTAAAGAAGTCAGTGGCCTTTATCTCGAAGATCAACGTC
GTAGACAGCAATTATCTAATTTTGTAGAAGTTTACCATGATGGCCAATGGTACTTATTCAATGCTGAAGATGGCAGTCAA
GGTCGCCCTGACAATCTACTGTTATGGGATCGCAGTGGCACATCTGTACTCGATGTTATAGGTGGAGTTAACTCACAAGT
TAACTTCTCTATGCTACAAGATACGCGCTCGGCACTGGCTACCGCAATTGATGTCATGAAAAATGACAACGCCTTAGACT
TCTCTCTTTATCAATTACCACTTGAAGAGCAGAGCCTATTTAAAGGGATCTTACTTATCCCTATCGGCGTATTAATGGTG
GTTTTTCTTCGGGTAATTATCGGTATCAAAACCTCTGGTACCTTTATGCCAGTATTGATTGCATTGGCATTCATTCAAAC
CACCCTTTTAACGGGTTTGATTGGTTTCTTGCTCATCGTCGCCTTTGGTTTAATGATCCGTTCCTACTTATCAGAACTAA
ACCTATTGCTCATATCGAGGATCTCTGCCGTCATCATTGTGGTGATAGGCATCATAGGTCTCTTTACACTGCTCTCTTAT
AAGTTTGGCTTAAGCGAAGGCTTAACCATTACCTTCTTCCCAATGATTATTTTGGCGTGGACCATTGAAAGAATGTCTAT
TCTATGGGAAGAGGAAGGTCCAAAAGAAGTTATCGTACAAGGTGGTGGCAGTCTATTTGTGGCAACACTTGCCTACCTAG
CAATGAGCGCAACTTGGGTCCAGCATTGGGTATTTAACTTCTTAGGCATTCATTTGGTGATCTTGGCGCTAGTGCTATTA
ATGGGCCAATACACTGGATATCGCTTGCTTGAGCTTAAACGCTTTAAGCCTCTAGCTGGAGAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGCAAGACATCGCTGTTGTCGATGTTGGACAAAATTATATCCATGGAAAAAAACAAGACGCTCAGCCGTCTAAGACA
AAAAAATAGGATAAATGCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTCTAGCGAGCCCTTCTGCCTTAAAACGCAACGGCGTGCTTTGTATGAACAAGCGTAATATCGACTATATAGGTCGT
TATAATCCGCGTAAATACTA

Product: gonadoliberin III-like protein

Products: NA

Alternate protein names: Membrane-Associated HD Superfamily Hydrolase; GoNADoliberin III-Like Protein; Transglutaminase-Like; Transglutaminase Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 502; Mature: 502

Protein sequence:

>502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITNNAIDRRAIWSVRSASGKQDLYYKVTLIPTGQNKLLADGVPAVPTTYSWPATEEAAAQQVIEEVWSRSATSLSF
AQQLNKVLNANERSQNIELLLTSNTPTKLFIRMLHSKGLPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYHDGQWYLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVIIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLLTGLIGFLLIVAFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVIVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFKPLAGEK

Sequences:

>Translated_502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITNNAIDRRAIWSVRSASGKQDLYYKVTLIPTGQNKLLADGVPAVPTTYSWPATEEAAAQQVIEEVWSRSATSLSF
AQQLNKVLNANERSQNIELLLTSNTPTKLFIRMLHSKGLPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYHDGQWYLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVIIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLLTGLIGFLLIVAFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVIVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFKPLAGEK
>Mature_502_residues
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVSFSLPEDPAYEILVENATSPG
YGLTITNNAIDRRAIWSVRSASGKQDLYYKVTLIPTGQNKLLADGVPAVPTTYSWPATEEAAAQQVIEEVWSRSATSLSF
AQQLNKVLNANERSQNIELLLTSNTPTKLFIRMLHSKGLPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYHDGQWYLFNAEDGSQ
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLPLEEQSLFKGILLIPIGVLMV
VFLRVIIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLLTGLIGFLLIVAFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSY
KFGLSEGLTITFFPMIILAWTIERMSILWEEEGPKEVIVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
MGQYTGYRLLELKRFKPLAGEK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55591; Mature: 55591

Theoretical pI: Translated: 6.27; Mature: 6.27

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCEEE
FSLPEDPAYEILVENATSPGYGLTITNNAIDRRAIWSVRSASGKQDLYYKVTLIPTGQNK
EECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCC
LLADGVPAVPTTYSWPATEEAAAQQVIEEVWSRSATSLSFAQQLNKVLNANERSQNIELL
EECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LTSNTPTKLFIRMLHSKGLPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYHDGQWYLFNAEDGSQ
EECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCC
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLP
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC
LEEQSLFKGILLIPIGVLMVVFLRVIIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLLTGLIGFLLIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSYKFGLSEGLTITFFPMIILAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TIERMSILWEEEGPKEVIVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGQYTGYRLLELKRFKPLAGEK
HCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHSKKPFYILVALLFISGIAASVYRGIEHSVPFLPGKQVQSWAVDAKVSFQGTGEPAEVS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCEEE
FSLPEDPAYEILVENATSPGYGLTITNNAIDRRAIWSVRSASGKQDLYYKVTLIPTGQNK
EECCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCC
LLADGVPAVPTTYSWPATEEAAAQQVIEEVWSRSATSLSFAQQLNKVLNANERSQNIELL
EECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LTSNTPTKLFIRMLHSKGLPAKEVSGLYLEDQRRRQQLSNFVEVYHDGQWYLFNAEDGSQ
EECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCC
GRPDNLLLWDRSGTSVLDVIGGVNSQVNFSMLQDTRSALATAIDVMKNDNALDFSLYQLP
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC
LEEQSLFKGILLIPIGVLMVVFLRVIIGIKTSGTFMPVLIALAFIQTTLLTGLIGFLLIV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFGLMIRSYLSELNLLLISRISAVIIVVIGIIGLFTLLSYKFGLSEGLTITFFPMIILAW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TIERMSILWEEEGPKEVIVQGGGSLFVATLAYLAMSATWVQHWVFNFLGIHLVILALVLL
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGQYTGYRLLELKRFKPLAGEK
HCCCCCEEEEEHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA