Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
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Accession | NC_009881 |
Length | 1,231,060 |
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The map label for this gene is tlcB [H]
Identifier: 157825646
GI number: 157825646
Start: 513830
End: 515353
Strand: Reverse
Name: tlcB [H]
Synonym: A1C_02830
Alternate gene names: 157825646
Gene position: 515353-513830 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157825647
Following gene: 157825645
Centisome position: 41.86
GC content: 31.96
Gene sequence:
>1524_bases ATGGATGCCGTGGATTCTAACTTCACAATTTGGAATAAAGCCAGAAACAGTAAATTTAGGCATGTAGTGTGGCCAATTAG ATCGTATGAATTAACCAAGTTCATCCCGATGGCTTTACTAATGTTTTTTATTCTACTTAATCAAAACTTAGTTCGTAGTA TTAAAGATAGTTTTGTTGTTACCTTAATTAGCTCGGAAGTATTGAGTTTTATCAAACTTTGGGGCGAAATGCCGATGGGA ATTTTATTTGTTATTCTTTATTCTAAACTCTGTAATATTATGACAACAGAGCAAGTGTTTAGGATAATTACCGGTACTTT TTTATTTTTCTTCGCAATTTTTGGTTTTATTTTATTTCCGTACAAAGATTTTTTTCATCCTGATCCTGAATTAATTAAGC ACTATATCACTGTTCTTCCTCACTTAAAATGGTTTTTAATAATTTGGGGACAGTGGAGTTTAGTATTATTCTATATTATG GGAGAATTATGGCCAGTTATAGTCTTTACTCTTTTATATTGGCAGCTTGCAAATAAAATTACTAAAGTCGAAGAAGCACC AAGATTTTACTCATTTTTTACTTTATTCGGACAAACGAATTTACTCATATCAGGAACCGTAATTATTTATTTTGCTAAGA GTGAGCATTTCTTATTACCTTTATTTTCTTATCTAAACGATACAAACGAAATCCTTTTGAAATCATTTATTACGGTTATT TTAATATCCGGATTAATTTGCCTAGCTCTTCATAAACTTATTGATAAATCAGTAGTAGAAGCAGATAAAAATATTAAATT TAAAAACCAAAGAACGGATATATTAAAATTAAGCTTGATCGAAAGTGCAAAAGTAATATTCACTTCTAGATATCTCGGTT TTATTTGTCTTCTTGTAATGTCTTATTCTATGAGCATTAGCCTCATAGAAGGATTATGGATGTCAAAAGTAAAACAACTC TATCCTGCTACAAAGGATTTTATATCCTATCACGGTGAAGTGTTTTTTTGGACGGGAGTACTCACGTTAGTTAGTGCGTT TTTAGGAAGTAGTTTAATTAGAATATGCGGATGGTTTTGGGGAGCTATTATAACACCGATTATGATGTTTGGAGCAGGCG TTATGTTCTTTTCATTCACGGTGTTTGAAAATCACCTAGGAAATATCATAAATACTCTCGGCTATAGTTCACCGCTTGTC GTTATAGTTTTTATCGGCGGACTTTGGCATGTACTTTCTAAATCCGTAAAATATTCACTTTTCGATGCTACTAAAGAAAT GGTATATATTCCTCTCGATAGTGAAATCAAGACTAAAGGTAAAGCTGCTGTTGATGTTATGGGTACTAAAATCGGTAAAT CAATAGGTGCTATTATTCAATTCATATCCTTTAGTATGTTCCCGAACGCCGTACATAACGACATAGCAGGTTTATTGATG TTTAGTTTTATTATCGTATGTCTATTATGGCTATATGGAGTGAAAGTTTTATCGGCACACTATAATAAGATGATCAAACG TTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAACTCAAGAAGTGTCTTACTCTATGTCATGCGCGCAAGCAGGAATGACATATAATAAAAACTATCCGGTACTTAAAAAA AATAAGCTCATACTAAATCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATTTTGTGGATCATCCTGCAAGACATTGCAAGCGTGAATACTAAATTGTAATTGCAAGCGCGCTTGTTGCGTATATCA ATTGTACCTCTATCACTCCG
Product: ADP,ATP carrier protein
Products: NA
Alternate protein names: ADP/ATP translocase 2 [H]
Number of amino acids: Translated: 507; Mature: 507
Protein sequence:
>507_residues MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR
Sequences:
>Translated_507_residues MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR >Mature_507_residues MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVVTLISSEVLSFIKLWGEMPMG ILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFPYKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIM GELWPVIVFTLLYWQLANKITKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVMSYSMSISLIEGLWMSKVKQL YPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFWGAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLV VIVFIGGLWHVLSKSVKYSLFDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR
Specific function: Provides the rickettsial cell with host ATP in exchange for rickettsial ADP. This is an obligate exchange system. This energy acquiring activity is an important component of rickettsial parasitism [H]
COG id: COG3202
COG function: function code C; ATP/ADP translocase
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ADP/ATP translocase tlc family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004667 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58283; Mature: 58283
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVV CCCCCCCCEEEEHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH TLISSEVLSFIKLWGEMPMGILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFP HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIMGELWPVIVFTLLYWQLANKI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYSMSISLIEGLWMSKVKQLYPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLVVIVFIGGLWHVLSKSVKYSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM HHCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MDAVDSNFTIWNKARNSKFRHVVWPIRSYELTKFIPMALLMFFILLNQNLVRSIKDSFVV CCCCCCCCEEEEHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH TLISSEVLSFIKLWGEMPMGILFVILYSKLCNIMTTEQVFRIITGTFLFFFAIFGFILFP HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKDFFHPDPELIKHYITVLPHLKWFLIIWGQWSLVLFYIMGELWPVIVFTLLYWQLANKI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TKVEEAPRFYSFFTLFGQTNLLISGTVIIYFAKSEHFLLPLFSYLNDTNEILLKSFITVI HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH LISGLICLALHKLIDKSVVEADKNIKFKNQRTDILKLSLIESAKVIFTSRYLGFICLLVM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYSMSISLIEGLWMSKVKQLYPATKDFISYHGEVFFWTGVLTLVSAFLGSSLIRICGWFW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAIITPIMMFGAGVMFFSFTVFENHLGNIINTLGYSSPLVVIVFIGGLWHVLSKSVKYSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FDATKEMVYIPLDSEIKTKGKAAVDVMGTKIGKSIGAIIQFISFSMFPNAVHNDIAGLLM HHCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH FSFIIVCLLWLYGVKVLSAHYNKMIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA