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The map label for this gene is hyfB [C]

Identifier: 150401775

GI number: 150401775

Start: 1415995

End: 1417440

Strand: Direct

Name: hyfB [C]

Synonym: Maeo_1353

Alternate gene names: 150401775

Gene position: 1415995-1417440 (Clockwise)

Preceding gene: 150401774

Following gene: 150401776

Centisome position: 90.22

GC content: 33.54

Gene sequence:

>1446_bases
ATGAATTTACTTCCTTTAATTGTGGTGTATCCCCTCATTCTTGCAATAATATTTAATTTTCTATATAAAAATAGATTTAT
AAAAATATTTGTATTATTAACGGCAATTTCCTTATTGACACTTCCGTTTTTAGGGGATTTTGGTACATATTTTTTCTCAA
ATCATGGAGTTATAAATGGGTTGGTATCAGGAATATCTTATATATATAATCCTGCAAAACAGGTTATGGTATTTACATTG
ATGTTAATTGCTTCCCTTGTTCTTATATCAATGGCAGGAGAGAAAAAACTAAACGGATTAATTGCTTCCCTTGTATTGAT
GGGTCTTGCCAGTGTTTCTGCAATACTTCTCGCCGATGACCTGTTTAATATATATGTATTTTATGAAATTGCAGCAATTG
CTCAAACAGGACTTGTTATAGCATCAGGAACAGAATCAGCATATAAATCAGCCTTTAAATATATGATTGTGGGCACTGTG
GCAGGTTCTTTGTTGTTGTTGGGTATTGCATTCTTACTTTCGGCAACTGGAACGCTGAATATAACAGATATGCATAATTA
TTTGGCAAATAATCCAGCAACTCCCCCAATATACGGTGGTTTGTTGATGCTAATAATCGGACTTGGGTATGGTAGTGGCC
TTCCACCCTTTCATACAGTTAAAGCTGATATGTATGCAAAGGCAAAGCCATTTATTTCTGCAATACTTCAAACATACTCT
AAATTTATACTTGTGGCAATGATGCTTGCCATATTTAAATTATTTGGAGGACTTTCTTACTTTGCACCAACACAAGGAAT
AATCATGGCCCTTTCAATATTTGCAATGGTATTTGGTGTAGTTATGGCATTATTACAAAGTGATTATAAAAAATTACTAT
CTTACCATGCCATAAGTCAAGGTGGATATGTTGCAGCAGGTCTTGCAATAGGAACTCCTCTTGGTATTGTAGCAGGAATT
TTCCATGCTATTAACCATGTTATCTATAAAAGTGCGTTATTTTTGGGGGCTCACCTTGTAGCACAAAAAAAGTCTAATAA
TTTATCAAAACTCGGGGGACTACTTCCAGTTATGCCAGTGGTAGCTTTTATGATATTATGTGCAAAATTGGCAATTAGTG
GAGTTCCACCATTTAATGGATTTCAAAGTAAAATATTATTGGCACAATCCGCCATGGCTGTAAATATGCCTGAACTTGCC
ATAATTATGATATTTGTAAGTATTGGGACATTTGTTTCAATGATGAAGGCATTTTATTTGATATTCTTAAAACCTTGTAG
CGAAGAACAGCTTAATGAATATAAAAATACCAAAGTCTCAAAATATTCCATATTTTCCCTTGCAATATTGACAATTTTAT
GTGTGATTTTGGGAATATATCCTGACATAGTAATTAATCAAATAACGCCTTATGCAACTGAAATCGGGAGAATTTGGAGT
TTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTAATCTATTAATCTATTATGTCTTAGTCAATTGGCAGATATAGCAAATTAGCATATTCATCATGAACTACTATTAT
TAAGTATATGCGGTGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTGATTAATATATATTAATTAATATTATTATGATTATTACTATTATTAATTTTATTTTTAATTATTGGTGTTATTTATG
AAATATGACGAATTTCAAAA

Product: hydrogenase subunit F

Products: H2; oxidized ferredoxin [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 481; Mature: 481

Protein sequence:

>481_residues
MNLLPLIVVYPLILAIIFNFLYKNRFIKIFVLLTAISLLTLPFLGDFGTYFFSNHGVINGLVSGISYIYNPAKQVMVFTL
MLIASLVLISMAGEKKLNGLIASLVLMGLASVSAILLADDLFNIYVFYEIAAIAQTGLVIASGTESAYKSAFKYMIVGTV
AGSLLLLGIAFLLSATGTLNITDMHNYLANNPATPPIYGGLLMLIIGLGYGSGLPPFHTVKADMYAKAKPFISAILQTYS
KFILVAMMLAIFKLFGGLSYFAPTQGIIMALSIFAMVFGVVMALLQSDYKKLLSYHAISQGGYVAAGLAIGTPLGIVAGI
FHAINHVIYKSALFLGAHLVAQKKSNNLSKLGGLLPVMPVVAFMILCAKLAISGVPPFNGFQSKILLAQSAMAVNMPELA
IIMIFVSIGTFVSMMKAFYLIFLKPCSEEQLNEYKNTKVSKYSIFSLAILTILCVILGIYPDIVINQITPYATEIGRIWS
L

Sequences:

>Translated_481_residues
MNLLPLIVVYPLILAIIFNFLYKNRFIKIFVLLTAISLLTLPFLGDFGTYFFSNHGVINGLVSGISYIYNPAKQVMVFTL
MLIASLVLISMAGEKKLNGLIASLVLMGLASVSAILLADDLFNIYVFYEIAAIAQTGLVIASGTESAYKSAFKYMIVGTV
AGSLLLLGIAFLLSATGTLNITDMHNYLANNPATPPIYGGLLMLIIGLGYGSGLPPFHTVKADMYAKAKPFISAILQTYS
KFILVAMMLAIFKLFGGLSYFAPTQGIIMALSIFAMVFGVVMALLQSDYKKLLSYHAISQGGYVAAGLAIGTPLGIVAGI
FHAINHVIYKSALFLGAHLVAQKKSNNLSKLGGLLPVMPVVAFMILCAKLAISGVPPFNGFQSKILLAQSAMAVNMPELA
IIMIFVSIGTFVSMMKAFYLIFLKPCSEEQLNEYKNTKVSKYSIFSLAILTILCVILGIYPDIVINQITPYATEIGRIWS
L
>Mature_481_residues
MNLLPLIVVYPLILAIIFNFLYKNRFIKIFVLLTAISLLTLPFLGDFGTYFFSNHGVINGLVSGISYIYNPAKQVMVFTL
MLIASLVLISMAGEKKLNGLIASLVLMGLASVSAILLADDLFNIYVFYEIAAIAQTGLVIASGTESAYKSAFKYMIVGTV
AGSLLLLGIAFLLSATGTLNITDMHNYLANNPATPPIYGGLLMLIIGLGYGSGLPPFHTVKADMYAKAKPFISAILQTYS
KFILVAMMLAIFKLFGGLSYFAPTQGIIMALSIFAMVFGVVMALLQSDYKKLLSYHAISQGGYVAAGLAIGTPLGIVAGI
FHAINHVIYKSALFLGAHLVAQKKSNNLSKLGGLLPVMPVVAFMILCAKLAISGVPPFNGFQSKILLAQSAMAVNMPELA
IIMIFVSIGTFVSMMKAFYLIFLKPCSEEQLNEYKNTKVSKYSIFSLAILTILCVILGIYPDIVINQITPYATEIGRIWS
L

Specific function: Unknown

COG id: COG0651

COG function: function code CP; Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=385, Percent_Identity=27.012987012987, Blast_Score=102, Evalue=5e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=296, Percent_Identity=28.7162162162162, Blast_Score=98, Evalue=2e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=443, Percent_Identity=25.7336343115124, Blast_Score=89, Evalue=4e-19,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=391, Percent_Identity=26.3427109974425, Blast_Score=81, Evalue=1e-16,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=381, Percent_Identity=27.0341207349081, Blast_Score=79, Evalue=5e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=401, Percent_Identity=27.6807980049875, Blast_Score=78, Evalue=1e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=450, Percent_Identity=23.3333333333333, Blast_Score=68, Evalue=2e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1 [H]

EC number: 1.-.-.- [C]

Molecular weight: Translated: 51947; Mature: 51947

Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLLPLIVVYPLILAIIFNFLYKNRFIKIFVLLTAISLLTLPFLGDFGTYFFSNHGVING
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LVSGISYIYNPAKQVMVFTLMLIASLVLISMAGEKKLNGLIASLVLMGLASVSAILLADD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFNIYVFYEIAAIAQTGLVIASGTESAYKSAFKYMIVGTVAGSLLLLGIAFLLSATGTLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
ITDMHNYLANNPATPPIYGGLLMLIIGLGYGSGLPPFHTVKADMYAKAKPFISAILQTYS
EHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFILVAMMLAIFKLFGGLSYFAPTQGIIMALSIFAMVFGVVMALLQSDYKKLLSYHAISQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GGYVAAGLAIGTPLGIVAGIFHAINHVIYKSALFLGAHLVAQKKSNNLSKLGGLLPVMPV
CCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
VAFMILCAKLAISGVPPFNGFQSKILLAQSAMAVNMPELAIIMIFVSIGTFVSMMKAFYL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLKPCSEEQLNEYKNTKVSKYSIFSLAILTILCVILGIYPDIVINQITPYATEIGRIWS
HHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
L
C
>Mature Secondary Structure
MNLLPLIVVYPLILAIIFNFLYKNRFIKIFVLLTAISLLTLPFLGDFGTYFFSNHGVING
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LVSGISYIYNPAKQVMVFTLMLIASLVLISMAGEKKLNGLIASLVLMGLASVSAILLADD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFNIYVFYEIAAIAQTGLVIASGTESAYKSAFKYMIVGTVAGSLLLLGIAFLLSATGTLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
ITDMHNYLANNPATPPIYGGLLMLIIGLGYGSGLPPFHTVKADMYAKAKPFISAILQTYS
EHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFILVAMMLAIFKLFGGLSYFAPTQGIIMALSIFAMVFGVVMALLQSDYKKLLSYHAISQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GGYVAAGLAIGTPLGIVAGIFHAINHVIYKSALFLGAHLVAQKKSNNLSKLGGLLPVMPV
CCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
VAFMILCAKLAISGVPPFNGFQSKILLAQSAMAVNMPELAIIMIFVSIGTFVSMMKAFYL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLKPCSEEQLNEYKNTKVSKYSIFSLAILTILCVILGIYPDIVINQITPYATEIGRIWS
HHHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
L
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton; reduced ferredoxin [C]

Specific reaction: Proton + reduced ferredoxin = H2 + oxidized ferredoxin [C]

General reaction: Oxidoreductases [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]