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Definition Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1, complete genome.
Accession NC_009632
Length 2,906,507

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The map label for this gene is 150392838

Identifier: 150392838

GI number: 150392838

Start: 387532

End: 390501

Strand: Direct

Name: 150392838

Synonym: SaurJH1_0364

Alternate gene names: NA

Gene position: 387532-390501 (Clockwise)

Preceding gene: 150392837

Following gene: 150392839

Centisome position: 13.33

GC content: 38.92

Gene sequence:

>2970_bases
ATGGAAAAGAATTTTCTAGCTCGTATTACAGCTATAATCAGTGATTTTAAAAGGAATATGAGAACTGCTCAACGTATGGC
TAAAACTGATATACCGGACGAAATCAAGACAGAAGTTACAGCTAACATAAGAGATTACCAAAGAGAGTTAACGCGAGCTA
AATCGATGGCTCAGCGATGGCGAGAACATAAAGTTAATATCGATGCAGATGCTAGCAAAGTGAAACAAGTCATATCGTTT
GTTAAAGTAGAACTATCGAATATCAGACGTAAAAAAGTTGAAATTGATGGCGACGCAAGCGGATTAAAAAGAAATGTTGC
GACTTCTAAAGCAATGTTAGCTGGTTGGCGCAAACACACTGTTAAATTAGATTTTGATACAACTGGAATGACGAAAATGC
AAGTAGCGTTGACTGCTGGTAAAAGAGCGTTAGATCAGTATCAATCAACAATGGATGGCATCGCATCAAATATTAGAACT
TTCGGTACTATCTTCGCACAACAAGTCAAAGGTTTAATGATTGCTAGTATACAAGCGTTAATACCAGTAATTGCTGGATT
AGTTCCGGCTATTATGGCGGTACTTAATGCCGTTGGTGTATTAGGTGGTGGCGTCGTTGGTTTAGCTGGTGCATTCTCTG
TAGCAGGTGTTGGAGCGGTTGGTTTCGGCGCAATGGCTATTACTGCACTAAAAATGGTAAAAGATGGAACATTAGCAGTA
ACAAAAGAAGTTCAAAACTTTAGAGATGCAAGCGATCAGTTAAAAACTACATGGCAAGGCATTGTAAAAGAGAATCAAGC
AAGTATCTTTAATGCGATGTCAGCGGGTATCAGAGGCGTTACAAGTGCGATGTCGCAATTAAAACCTTTCTTATCCGAAG
TATCTATGCTGGTAGAAGCGAACGCGCGCGAGTTTGAGGATTGGGTTAAACATTCTGAAACGGCTAAGAAAGCGTTTGAA
GCATTGAATAGCATAGGTGGTGCAATCTTCGGAGATTTATTGAACGCTGCAGGACGATTTGGCGACGGATTAGTTAACAT
TCTCACTCAATTAATGCCATTGTTCAAATTCGTGTCTCAAGGATTACAGAACATGTCTATAGCTTTCCAAAATTGGGCTA
ATAGTGTAGCTGGTCAGAATGCTATTAAAGCGTTTATTGACTACACTACCACTAACTTACCTAAGATTGGCCAGATATTT
GGTAATGTATTCGCTGGTATTGGTAATTTAATGATTGCTTTTGCTCAAAACAGTTCTAATATTTTTGACTGGTTAGTTAA
ATTAACTTCTCAATTTAGAGCGTGGTCAGAACAAGTAGGACAATCACAAGGGTTCAAAGACTTTATAAGTTACGTTCAAG
AGAATGGTCCTACTATTATGCAATTAATCGGTAACATCATAAAAGCATTAGTAGCATTTGGCACTGCAATGGCTCCTATA
GCTAGTAAATTGTTAGACTTTATCACTAATCTAGCTGGTTTTATCGCTAAGCTATTCGAGACACACCCAGCTATAGCACA
AGTTGCTGGTGTTATGGGTATTTTAGGTGGTGTATTTTGGGCTTTAATGGCTCCGATTGTTGCTATAAGTAGTGTGCTTA
CAAATGTGTTTGGCTTGAGTTTATTCAGTGTCGTCGAAAAGATTTTAGAATTCGTTAGAACATCAAGTTTAGTTACTGGA
GCTTTGGAAGCATTAACAGGTGTTTTTGGAACGATTTCAGCACCTATTTTAGCGGTAATTGCAGTAATTGGCGCATTTAT
CGGTGTCCTAGTTTATTTATGGAAAACAAACGAGAATTTCAGAAACACTATTACTGAAGCGTGGAACGGTGTTAAAACGG
CGGTTTCTGGTGCGATTCAAGGTGTAGTTGGCTGGTTAACTGAATTGTGGGGCAAAATCCAATCTACCTTACAACCGATA
ATGCCTATATTGCAAGTTTTAGGGCAAATATTCATGCAAGTTTTAGGTGTTTTGGTAATAGGTATCATCACAAACGTTAT
GAATATCATACAGGGTTTGTGGACGTTAATTACAATTGCATTCCAAGCCATAGGAACAGTGATATCCGTGGCAGTCCAAA
TCATAGTAGGTTTATTCACTGCTTTAATTCAGTTGCTTACTGGCGACTTCTCAGGTGCTTGGGAGACTATTAAAACTACG
GTTACCAATGTACTTGATACGATTTGGCAATACATGCAATCAGTTTGGGAGTCAATCATCGGCTTTTTAACTGGCGTAAT
GAATCGAACACTTTCTATGTTTGGTACAAGTTGGTCGCAGATATGGAGTACAATCACTAATTTTGTTAGCAGTATTTGGA
ACAGTGTTACAAGTTGGTTTAGTCGTGTTGCTTCGAGTGTGGCCGAAAAAATGGGACAAGCACTAAACTTTATTATCACA
AAAGGTTCTGAATGGGTTTCTAATATTTGGAATACTGTTACAAGTTTCGCAAGTAAAGTAGCTGATGGATTTAAAAGAGT
TGTCTCAAATGTAGGCGACGGCATGAAAAACGCGCTTGATAAGATTAAAAGCTTTTTCAGCGATTTTTTAAATGCCGGAG
CAGAATTAATAGGCAAAGTAGCTGAGGGTGTAGCTAACGCTGCGCACAAAGTAGTCAGTGCGGTAGGCGATGCGATTTCA
TCAGCGTGGGACTCAGTAACTTCATTCGTAAGTGGACACGGTGGAGGTAGCGGTTTAGGTAAAGGTTTAGCGGTATCACA
AGCTAAAGTAATGGCTACTAGCTTCGGTAAAACGTTCACAAGTGAGTTAGGTTCAACGTTGACAGATGGATTCAACGACA
GTTTAACACCAAGCGTTGACGGCCATATGACAAACGATGTGCAACATAGCATGAAAGAAAATAACAGACCTATTGTTAAT
GTAACTGTTAGAAACGAGGGCGATCTAAACATGATTAAATCTCACATTGACGATATGGATGCAAAAGATGGTAGTTTCAA
CTTAATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCGTGAGCTAGCTAAAAACAAACGTAAAAGAGAAATACAAAAACAAGGGACTCGCAAGTTCCTTAACAGCTTAAAAACA
AGTCATAAAGGAGGTTAGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGAGGTTTGTTTATTGATAGCCCATGATGTAGAAATTATTAAAAATGGTGTGAAGTATCGTGTCAGTGACAATCCTCAC
ACTTACAAACACTTAAGAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Phage-Related Protein-Like Protein; Phage Tape Measure Protein; Tail Length Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TP; TMP Repeat-Containing Protein; Phage Related Protein; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Tape Measure Protein; Prophage Pi1 Protein; Transglycosylase Domain Protein; TMP Repeat Protein; Tail Tape Measure Protein; Phage Protein; Endoglucanase Y; Tail Protein

Number of amino acids: Translated: 989; Mature: 989

Protein sequence:

>989_residues
MEKNFLARITAIISDFKRNMRTAQRMAKTDIPDEIKTEVTANIRDYQRELTRAKSMAQRWREHKVNIDADASKVKQVISF
VKVELSNIRRKKVEIDGDASGLKRNVATSKAMLAGWRKHTVKLDFDTTGMTKMQVALTAGKRALDQYQSTMDGIASNIRT
FGTIFAQQVKGLMIASIQALIPVIAGLVPAIMAVLNAVGVLGGGVVGLAGAFSVAGVGAVGFGAMAITALKMVKDGTLAV
TKEVQNFRDASDQLKTTWQGIVKENQASIFNAMSAGIRGVTSAMSQLKPFLSEVSMLVEANAREFEDWVKHSETAKKAFE
ALNSIGGAIFGDLLNAAGRFGDGLVNILTQLMPLFKFVSQGLQNMSIAFQNWANSVAGQNAIKAFIDYTTTNLPKIGQIF
GNVFAGIGNLMIAFAQNSSNIFDWLVKLTSQFRAWSEQVGQSQGFKDFISYVQENGPTIMQLIGNIIKALVAFGTAMAPI
ASKLLDFITNLAGFIAKLFETHPAIAQVAGVMGILGGVFWALMAPIVAISSVLTNVFGLSLFSVVEKILEFVRTSSLVTG
ALEALTGVFGTISAPILAVIAVIGAFIGVLVYLWKTNENFRNTITEAWNGVKTAVSGAIQGVVGWLTELWGKIQSTLQPI
MPILQVLGQIFMQVLGVLVIGIITNVMNIIQGLWTLITIAFQAIGTVISVAVQIIVGLFTALIQLLTGDFSGAWETIKTT
VTNVLDTIWQYMQSVWESIIGFLTGVMNRTLSMFGTSWSQIWSTITNFVSSIWNSVTSWFSRVASSVAEKMGQALNFIIT
KGSEWVSNIWNTVTSFASKVADGFKRVVSNVGDGMKNALDKIKSFFSDFLNAGAELIGKVAEGVANAAHKVVSAVGDAIS
SAWDSVTSFVSGHGGGSGLGKGLAVSQAKVMATSFGKTFTSELGSTLTDGFNDSLTPSVDGHMTNDVQHSMKENNRPIVN
VTVRNEGDLNMIKSHIDDMDAKDGSFNLM

Sequences:

>Translated_989_residues
MEKNFLARITAIISDFKRNMRTAQRMAKTDIPDEIKTEVTANIRDYQRELTRAKSMAQRWREHKVNIDADASKVKQVISF
VKVELSNIRRKKVEIDGDASGLKRNVATSKAMLAGWRKHTVKLDFDTTGMTKMQVALTAGKRALDQYQSTMDGIASNIRT
FGTIFAQQVKGLMIASIQALIPVIAGLVPAIMAVLNAVGVLGGGVVGLAGAFSVAGVGAVGFGAMAITALKMVKDGTLAV
TKEVQNFRDASDQLKTTWQGIVKENQASIFNAMSAGIRGVTSAMSQLKPFLSEVSMLVEANAREFEDWVKHSETAKKAFE
ALNSIGGAIFGDLLNAAGRFGDGLVNILTQLMPLFKFVSQGLQNMSIAFQNWANSVAGQNAIKAFIDYTTTNLPKIGQIF
GNVFAGIGNLMIAFAQNSSNIFDWLVKLTSQFRAWSEQVGQSQGFKDFISYVQENGPTIMQLIGNIIKALVAFGTAMAPI
ASKLLDFITNLAGFIAKLFETHPAIAQVAGVMGILGGVFWALMAPIVAISSVLTNVFGLSLFSVVEKILEFVRTSSLVTG
ALEALTGVFGTISAPILAVIAVIGAFIGVLVYLWKTNENFRNTITEAWNGVKTAVSGAIQGVVGWLTELWGKIQSTLQPI
MPILQVLGQIFMQVLGVLVIGIITNVMNIIQGLWTLITIAFQAIGTVISVAVQIIVGLFTALIQLLTGDFSGAWETIKTT
VTNVLDTIWQYMQSVWESIIGFLTGVMNRTLSMFGTSWSQIWSTITNFVSSIWNSVTSWFSRVASSVAEKMGQALNFIIT
KGSEWVSNIWNTVTSFASKVADGFKRVVSNVGDGMKNALDKIKSFFSDFLNAGAELIGKVAEGVANAAHKVVSAVGDAIS
SAWDSVTSFVSGHGGGSGLGKGLAVSQAKVMATSFGKTFTSELGSTLTDGFNDSLTPSVDGHMTNDVQHSMKENNRPIVN
VTVRNEGDLNMIKSHIDDMDAKDGSFNLM
>Mature_989_residues
MEKNFLARITAIISDFKRNMRTAQRMAKTDIPDEIKTEVTANIRDYQRELTRAKSMAQRWREHKVNIDADASKVKQVISF
VKVELSNIRRKKVEIDGDASGLKRNVATSKAMLAGWRKHTVKLDFDTTGMTKMQVALTAGKRALDQYQSTMDGIASNIRT
FGTIFAQQVKGLMIASIQALIPVIAGLVPAIMAVLNAVGVLGGGVVGLAGAFSVAGVGAVGFGAMAITALKMVKDGTLAV
TKEVQNFRDASDQLKTTWQGIVKENQASIFNAMSAGIRGVTSAMSQLKPFLSEVSMLVEANAREFEDWVKHSETAKKAFE
ALNSIGGAIFGDLLNAAGRFGDGLVNILTQLMPLFKFVSQGLQNMSIAFQNWANSVAGQNAIKAFIDYTTTNLPKIGQIF
GNVFAGIGNLMIAFAQNSSNIFDWLVKLTSQFRAWSEQVGQSQGFKDFISYVQENGPTIMQLIGNIIKALVAFGTAMAPI
ASKLLDFITNLAGFIAKLFETHPAIAQVAGVMGILGGVFWALMAPIVAISSVLTNVFGLSLFSVVEKILEFVRTSSLVTG
ALEALTGVFGTISAPILAVIAVIGAFIGVLVYLWKTNENFRNTITEAWNGVKTAVSGAIQGVVGWLTELWGKIQSTLQPI
MPILQVLGQIFMQVLGVLVIGIITNVMNIIQGLWTLITIAFQAIGTVISVAVQIIVGLFTALIQLLTGDFSGAWETIKTT
VTNVLDTIWQYMQSVWESIIGFLTGVMNRTLSMFGTSWSQIWSTITNFVSSIWNSVTSWFSRVASSVAEKMGQALNFIIT
KGSEWVSNIWNTVTSFASKVADGFKRVVSNVGDGMKNALDKIKSFFSDFLNAGAELIGKVAEGVANAAHKVVSAVGDAIS
SAWDSVTSFVSGHGGGSGLGKGLAVSQAKVMATSFGKTFTSELGSTLTDGFNDSLTPSVDGHMTNDVQHSMKENNRPIVN
VTVRNEGDLNMIKSHIDDMDAKDGSFNLM

Specific function: Unknown

COG id: COG5412

COG function: function code S; Phage-related protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106387; Mature: 106387

Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93

Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKNFLARITAIISDFKRNMRTAQRMAKTDIPDEIKTEVTANIRDYQRELTRAKSMAQRW
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REHKVNIDADASKVKQVISFVKVELSNIRRKKVEIDGDASGLKRNVATSKAMLAGWRKHT
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
VKLDFDTTGMTKMQVALTAGKRALDQYQSTMDGIASNIRTFGTIFAQQVKGLMIASIQAL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPVIAGLVPAIMAVLNAVGVLGGGVVGLAGAFSVAGVGAVGFGAMAITALKMVKDGTLAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
TKEVQNFRDASDQLKTTWQGIVKENQASIFNAMSAGIRGVTSAMSQLKPFLSEVSMLVEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NAREFEDWVKHSETAKKAFEALNSIGGAIFGDLLNAAGRFGDGLVNILTQLMPLFKFVSQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLQNMSIAFQNWANSVAGQNAIKAFIDYTTTNLPKIGQIFGNVFAGIGNLMIAFAQNSSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IFDWLVKLTSQFRAWSEQVGQSQGFKDFISYVQENGPTIMQLIGNIIKALVAFGTAMAPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASKLLDFITNLAGFIAKLFETHPAIAQVAGVMGILGGVFWALMAPIVAISSVLTNVFGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFSVVEKILEFVRTSSLVTGALEALTGVFGTISAPILAVIAVIGAFIGVLVYLWKTNENF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
RNTITEAWNGVKTAVSGAIQGVVGWLTELWGKIQSTLQPIMPILQVLGQIFMQVLGVLVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIITNVMNIIQGLWTLITIAFQAIGTVISVAVQIIVGLFTALIQLLTGDFSGAWETIKTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
VTNVLDTIWQYMQSVWESIIGFLTGVMNRTLSMFGTSWSQIWSTITNFVSSIWNSVTSWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRVASSVAEKMGQALNFIITKGSEWVSNIWNTVTSFASKVADGFKRVVSNVGDGMKNALD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
KIKSFFSDFLNAGAELIGKVAEGVANAAHKVVSAVGDAISSAWDSVTSFVSGHGGGSGLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KGLAVSQAKVMATSFGKTFTSELGSTLTDGFNDSLTPSVDGHMTNDVQHSMKENNRPIVN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEE
VTVRNEGDLNMIKSHIDDMDAKDGSFNLM
EEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MEKNFLARITAIISDFKRNMRTAQRMAKTDIPDEIKTEVTANIRDYQRELTRAKSMAQRW
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REHKVNIDADASKVKQVISFVKVELSNIRRKKVEIDGDASGLKRNVATSKAMLAGWRKHT
HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
VKLDFDTTGMTKMQVALTAGKRALDQYQSTMDGIASNIRTFGTIFAQQVKGLMIASIQAL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPVIAGLVPAIMAVLNAVGVLGGGVVGLAGAFSVAGVGAVGFGAMAITALKMVKDGTLAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
TKEVQNFRDASDQLKTTWQGIVKENQASIFNAMSAGIRGVTSAMSQLKPFLSEVSMLVEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NAREFEDWVKHSETAKKAFEALNSIGGAIFGDLLNAAGRFGDGLVNILTQLMPLFKFVSQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLQNMSIAFQNWANSVAGQNAIKAFIDYTTTNLPKIGQIFGNVFAGIGNLMIAFAQNSSN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IFDWLVKLTSQFRAWSEQVGQSQGFKDFISYVQENGPTIMQLIGNIIKALVAFGTAMAPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASKLLDFITNLAGFIAKLFETHPAIAQVAGVMGILGGVFWALMAPIVAISSVLTNVFGLS
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LFSVVEKILEFVRTSSLVTGALEALTGVFGTISAPILAVIAVIGAFIGVLVYLWKTNENF
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RNTITEAWNGVKTAVSGAIQGVVGWLTELWGKIQSTLQPIMPILQVLGQIFMQVLGVLVI
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GIITNVMNIIQGLWTLITIAFQAIGTVISVAVQIIVGLFTALIQLLTGDFSGAWETIKTT
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SRVASSVAEKMGQALNFIITKGSEWVSNIWNTVTSFASKVADGFKRVVSNVGDGMKNALD
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KIKSFFSDFLNAGAELIGKVAEGVANAAHKVVSAVGDAISSAWDSVTSFVSGHGGGSGLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KGLAVSQAKVMATSFGKTFTSELGSTLTDGFNDSLTPSVDGHMTNDVQHSMKENNRPIVN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEE
VTVRNEGDLNMIKSHIDDMDAKDGSFNLM
EEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA