Definition | Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009615 |
Length | 4,811,379 |
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The map label for this gene is 150008219
Identifier: 150008219
GI number: 150008219
Start: 1858946
End: 1860493
Strand: Reverse
Name: 150008219
Synonym: BDI_1585
Alternate gene names: NA
Gene position: 1860493-1858946 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150008220
Following gene: 150008218
Centisome position: 38.67
GC content: 35.85
Gene sequence:
>1548_bases ATGGTAACAGACTCACGAACTTCGAAAAGTATAAAAAATAGTTTGGTAGCCTTGGCTTTTTATTTTATTAATCTGGTTCT TCAATTTTTCTCCCGTAAGGTATTCTTGGATTATCTTGGGGCAGAGATCTTGGGACTGAATACTACGGCTACCAATTTGC TTCAGTTCTTGAACCTTGCGGAATTAGGAATAGGATCAGCCATTGCTTGTACATTATATAAGCCTTTATTAGAGAAGGAT ACGGTTGCTATCAATGAGATTGTTTCCTTGCAAGGCTGGTTGTATCGGCGTATCGCATGGATCGTGATAGTGGGAAGTCT CGTGTTGATGGCGTTTTTCCCTTGGATCTTCGCTAAGATGCCGTTACCCTTATGGTATGCGTATGCTTCTTTCGGAGTGC TGCTAGTTAGTGCATTGCTGAGTTATTTTGTTAATTATAAGCAGATCGTTTTATCCGCTGACCAGAAAGAGTATAAGATC CAGTATAGCTATAAGGCCTCGATGTTGATTAAAACCCTTTGTCAGATATTGGCGATTCGATATTTGAGAGACGGTTATGT ATGGTGGTTGGTATTGGAGATTGTGTTTGCGATCGTAGCTTCGTTGGTGTTAAATAGAATGGTCCGGCAGACTTATCCAT TTCTAGAAACTAAATTAGGACGAGGTCGGGAATTATCGAGAAAGTATCCAGCTATTATTAAGAAAGTTAAGCAATTGTTT TTTCATAAGATCGGTAGCTTTGCTTTGACACAAACTAGCCCGATCATTATTTACGCCTACACTACACTAACTGTAGTGGC GTTATATGGCAATTACATGTTGGTTATCCTTGGGATTCAAACTTTGATGACTGCCATTTTTAATAGCATGAACGCAGGAA TTGGGAATTTAGTGGCAGAGGGAAATCGTAAACAGATTATGTCGGTGTTTGAGGAATTATTCTCTGTTCGTTTTCTATTC ACTTGTATAATGTGTTTTGGAGTGTTTATGTTGACTCCTTTATTTATAATACTTTGGGTGGGTAATGAATATGTGATGGA TACCATGACATTGCTATTGATGACTGTTACTTTGTTTATTCAATTAAACCGTACGACCGTGGATGCTTATATCAATGCTT ATGGTTTGTTTGGTGATATTTTTGCTCCAGTTACGGAGGCTTCTATCAATATCTGTTTGTCTGTGTTATTAGGATATTTT TGGGGGTTAAATGGTGTATTGTTGGGTGTGTTGATAAGTTTATTTCTTGTTGTTTTTTGTTGGAAACCTTATTATTTGTT TCGAAAAGCTTTGAAACAACGATTGAAATTGTATATAATTATGTACGTTAAGCATTTAAGTGTTGCAATTGTTAGTATAA TACTTATTTATTCTGTATTGAAATTTGTCCCAATGCACTCATTTGAAAGTGCTTTATCTTCTTTTGTATATGGAGTGTTT ATTACAATTTTGTATACACTCATTCTTTTATCTATGTTTTATTTTTTAGGACTTGGTTTGAATCGCTTTATTCGAAGAAT TCAAAGTATGATGAATGGGAGAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGAATAATAAGCGGATAGCGAAGAATACGCTGTTCCTCTACGTGCGTATGCTCTTTATCATGGAGAGCAATTTTTGTATT AAACACAATTCTTTGTAGCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAGTGATATATAGGTTGTATGATACATTAAAAAGTTAGCTAAGATAGGCTGTATGGTTTATAATATTCAAAGTAAAAA ATGTTTAATAAATATAACAA
Product: putative flippase
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 515; Mature: 515
Protein sequence:
>515_residues MVTDSRTSKSIKNSLVALAFYFINLVLQFFSRKVFLDYLGAEILGLNTTATNLLQFLNLAELGIGSAIACTLYKPLLEKD TVAINEIVSLQGWLYRRIAWIVIVGSLVLMAFFPWIFAKMPLPLWYAYASFGVLLVSALLSYFVNYKQIVLSADQKEYKI QYSYKASMLIKTLCQILAIRYLRDGYVWWLVLEIVFAIVASLVLNRMVRQTYPFLETKLGRGRELSRKYPAIIKKVKQLF FHKIGSFALTQTSPIIIYAYTTLTVVALYGNYMLVILGIQTLMTAIFNSMNAGIGNLVAEGNRKQIMSVFEELFSVRFLF TCIMCFGVFMLTPLFIILWVGNEYVMDTMTLLLMTVTLFIQLNRTTVDAYINAYGLFGDIFAPVTEASINICLSVLLGYF WGLNGVLLGVLISLFLVVFCWKPYYLFRKALKQRLKLYIIMYVKHLSVAIVSIILIYSVLKFVPMHSFESALSSFVYGVF ITILYTLILLSMFYFLGLGLNRFIRRIQSMMNGRK
Sequences:
>Translated_515_residues MVTDSRTSKSIKNSLVALAFYFINLVLQFFSRKVFLDYLGAEILGLNTTATNLLQFLNLAELGIGSAIACTLYKPLLEKD TVAINEIVSLQGWLYRRIAWIVIVGSLVLMAFFPWIFAKMPLPLWYAYASFGVLLVSALLSYFVNYKQIVLSADQKEYKI QYSYKASMLIKTLCQILAIRYLRDGYVWWLVLEIVFAIVASLVLNRMVRQTYPFLETKLGRGRELSRKYPAIIKKVKQLF FHKIGSFALTQTSPIIIYAYTTLTVVALYGNYMLVILGIQTLMTAIFNSMNAGIGNLVAEGNRKQIMSVFEELFSVRFLF TCIMCFGVFMLTPLFIILWVGNEYVMDTMTLLLMTVTLFIQLNRTTVDAYINAYGLFGDIFAPVTEASINICLSVLLGYF WGLNGVLLGVLISLFLVVFCWKPYYLFRKALKQRLKLYIIMYVKHLSVAIVSIILIYSVLKFVPMHSFESALSSFVYGVF ITILYTLILLSMFYFLGLGLNRFIRRIQSMMNGRK >Mature_515_residues MVTDSRTSKSIKNSLVALAFYFINLVLQFFSRKVFLDYLGAEILGLNTTATNLLQFLNLAELGIGSAIACTLYKPLLEKD TVAINEIVSLQGWLYRRIAWIVIVGSLVLMAFFPWIFAKMPLPLWYAYASFGVLLVSALLSYFVNYKQIVLSADQKEYKI QYSYKASMLIKTLCQILAIRYLRDGYVWWLVLEIVFAIVASLVLNRMVRQTYPFLETKLGRGRELSRKYPAIIKKVKQLF FHKIGSFALTQTSPIIIYAYTTLTVVALYGNYMLVILGIQTLMTAIFNSMNAGIGNLVAEGNRKQIMSVFEELFSVRFLF TCIMCFGVFMLTPLFIILWVGNEYVMDTMTLLLMTVTLFIQLNRTTVDAYINAYGLFGDIFAPVTEASINICLSVLLGYF WGLNGVLLGVLISLFLVVFCWKPYYLFRKALKQRLKLYIIMYVKHLSVAIVSIILIYSVLKFVPMHSFESALSSFVYGVF ITILYTLILLSMFYFLGLGLNRFIRRIQSMMNGRK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58918; Mature: 58918
Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVTDSRTSKSIKNSLVALAFYFINLVLQFFSRKVFLDYLGAEILGLNTTATNLLQFLNLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH ELGIGSAIACTLYKPLLEKDTVAINEIVSLQGWLYRRIAWIVIVGSLVLMAFFPWIFAKM HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PLPLWYAYASFGVLLVSALLSYFVNYKQIVLSADQKEYKIQYSYKASMLIKTLCQILAIR CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLRDGYVWWLVLEIVFAIVASLVLNRMVRQTYPFLETKLGRGRELSRKYPAIIKKVKQLF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FHKIGSFALTQTSPIIIYAYTTLTVVALYGNYMLVILGIQTLMTAIFNSMNAGIGNLVAE HHHHCCHHEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC GNRKQIMSVFEELFSVRFLFTCIMCFGVFMLTPLFIILWVGNEYVMDTMTLLLMTVTLFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLNRTTVDAYINAYGLFGDIFAPVTEASINICLSVLLGYFWGLNGVLLGVLISLFLVVFC HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WKPYYLFRKALKQRLKLYIIMYVKHLSVAIVSIILIYSVLKFVPMHSFESALSSFVYGVF HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITILYTLILLSMFYFLGLGLNRFIRRIQSMMNGRK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MVTDSRTSKSIKNSLVALAFYFINLVLQFFSRKVFLDYLGAEILGLNTTATNLLQFLNLA CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH ELGIGSAIACTLYKPLLEKDTVAINEIVSLQGWLYRRIAWIVIVGSLVLMAFFPWIFAKM HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PLPLWYAYASFGVLLVSALLSYFVNYKQIVLSADQKEYKIQYSYKASMLIKTLCQILAIR CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLRDGYVWWLVLEIVFAIVASLVLNRMVRQTYPFLETKLGRGRELSRKYPAIIKKVKQLF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FHKIGSFALTQTSPIIIYAYTTLTVVALYGNYMLVILGIQTLMTAIFNSMNAGIGNLVAE HHHHCCHHEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCC GNRKQIMSVFEELFSVRFLFTCIMCFGVFMLTPLFIILWVGNEYVMDTMTLLLMTVTLFI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLNRTTVDAYINAYGLFGDIFAPVTEASINICLSVLLGYFWGLNGVLLGVLISLFLVVFC HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WKPYYLFRKALKQRLKLYIIMYVKHLSVAIVSIILIYSVLKFVPMHSFESALSSFVYGVF HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ITILYTLILLSMFYFLGLGLNRFIRRIQSMMNGRK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA