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The map label for this gene is icmF

Identifier: 148360925

GI number: 148360925

Start: 549728

End: 552649

Strand: Reverse

Name: icmF

Synonym: LPC_2885

Alternate gene names: NA

Gene position: 552649-549728 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148360924

Following gene: 148360926

Centisome position: 15.45

GC content: 36.41

Gene sequence:

>2922_bases
ATGGACAATTCATTACGCGCATTATGTGATGCTATAAAAAAAATTCTCTCTCAATTAAAACCACAAGCTAATCAATTATC
TTTTATTGTCATCACCGGAAAAAACGCCCAAGGCAAATCGGCACTGTTAAAGCAAAGTAATATGGAAGAAATGCCCGTAT
TCAGCGAAGAACATGCCAAACTGTATTTTAATCAAAAGGGAATCATAGTAGAGCTTGGTGAAAATTGGCTTACCAATAGC
AAAACATTATTGCTCACAACACTTAAACAATTAAATAAATGCAATCGTCATCTCAAAATTACAGGTTTGATTTTATGCGT
TGATGTTAATGATTTACTGATCGCCGAACCAGCACAATTCACTGAACAAAAAAAATCTCATTTGCAACTTATTCAACGTT
TAGGTGTTAACCTGGGATATCAGGCTGAATTAGCTATAATATTCACCAAAATGGATACCTTGGCTGGCTTTTCTGAATTT
TATCAAATGGATCATGTCAATGATCTATCCAAACCTCTTGGCTTTTCCCTTGATTGTGTCAACCAATCAAGTAAAAAAAT
TGAAACGTTTTCCCTTCAATTCAATCAATTAATTGAAGCTTTGGGACAGCAAGTTATCAATAAAATGCATCCGGTACGTT
CCACTATTAAGCGCAGTTTGATACGCGAATTTCCTTTGCAATTAGCCAGCTTGAGAGCCCCAATTCAGTCGTTAATTCAG
GGGATTTCGCCAAAATTATTCCATGTTCACTCTATTTTTTTCACGAGTGCCGAGCAAGGTGGAGTCAGTGTAGATAGGCT
AAACAAAAAAATTCAGCATGAATATGCTTTGGTTGTTCAGGATACTTTCCCTCAAGCGACCAATTTCAGATCCTATTTTG
TAGAAGGTGCACTGAAAACAATCCAAGAACAATGTATCCAGGTACCACAGACTACAAAATTTTCTCAAAAACCATTCATT
GCTGTTGCAGTAAGTTTGGCCGGGCTCAGTTTATTAACGCTGATTTATAACCACTACAAAACCGCTCATATTCTTGATGA
GGCTAGTAAAGAATTGCTTGCCTATGAAGCACTGAATAATCAGGGCACTAGCGGTGCACAAGCGCTATATCACTTATCGC
AGGCTGCAAATAAAATGAATCACATTACATCAAACTCCATATCACTGCCTACTGTGCACCAATTAAAATTAAACCTTCAC
AACAATGCTCAAAATCGTTTACAAGGAGAATTTCTTCCCTCCTTAGCCAATGAGTTAGAACAAGTCATCACAAGTCCTGG
CAACACCCCTATCACCCGTTATAAGGCTTTAAAAATTTATTTAATGTTAGGAGACTCAAAATATTTTTCATCCCAACCCA
TTCTGGATTGGTTTCAACAACAATGGCAGGGACGTGCACCAGGCACTACACAAAAACAGTTGGCTCTTTTAAAACAAACT
CTTAGTAATCCTCCTCAAAATATACCCATCAAATCACAAATAATCAGTGATGCGAGGAATTATCTTAATGCACTTCCAAC
AAGCTATTTATATTACTCTATTGCTAAAGAATATTTCCCTCAGGAAAAACAAAAGATTGTGATCGAAGGTTTTTCTATAC
CCACGGATGAAGTACCAACCTATTTTACTAAAACCGGATTTACGAAAATTATTAACGAATTACCTAAAATTACCAGCACA
CTTCAATCAGAAAACTGGGTACTTGCGAGACAGGATTTGTCTCAATTACACAATATGCTGATTCAGGCTTATTGTTTTGA
TTACGTCACTTGGTGGCAGACGTTCATGAAAAAATCCCAACCATTACGTTATCAGGATTATCAGCAAGGTCGTCAATTAA
CAAAATTAATACAACAATCCAATTCGTTTTATAAATTCGCTAATCTTATTCAGCAGGAAACCAAACCGGATTTAACTGAA
GGCATATCCACCTTTAATCAATTCATTGCCAATCAATTTACTGATTTAAATTTAACAACTTTATCCAGCATCAAGGAATT
AGATTTTAGAATTTCTGAACTAGAACGATTTATTGCAACTTTATCTGTTGTAAATGATGGAGGTAAAACAGCGTTTACCA
TTACACGCTCGCGTTTTCTCAATGAAAATTCCTCTGACCCTGTGAGTTTGCTCTACAGCCAGGCACGACAATTACCTGAA
CCATTGAGTTCGTGGACAAAGCAAATAGCTGGTGACATTTGGGTTATACTGATTAGAGATAGTCGTCAATACATTAATAA
TCAATGGCAAAAAACCGTCTATAGAGAATTCCAAAACTCTATTGCCCAGCGCTATCCTTTTGACTCGTCACAAACTGCAG
AAATAGATATTGCAGATTTTAATCGCTTTTTCTCAACACATGGCTTATTGAACACCTACTCTGAACAATACATTAAGCCA
TTTCTTGACACTTCCTCTCCAGAATGGAAGCCCAAAGCTGTGAATGATTTCATCTTGCCTATTTCAAATGAAGTAATTGA
TGAGTTAATTCGTGCCAATATCATTACTAATATGTTCTTTCCTGATCACAGTGATGAAAGCAAAATTGATTTTAGCTTGC
AAAAAATCTCTCTGGATCCTGTAGTTTCTAATCTAGTCCTTGAAATTGGCGGCACTAAATTGATGGATAATCAAACAAGC
GACTCACTAATTCGCTTCACCTGGCCTCAAAATAACGCTAAATTGGCTCTTGATTCTATTGAAGGCAATCATTACGAGCT
CGCAGAATATGGAACCTGGGCAATATTTAAATTACTTGAAAAAGTTAATGTGCTTGTGGATGAACAAGATAGTTCCAGCC
TCCAAATACTTTTTGAAGTGAATAGCAACTCCGGCCGCTATTTATTAAAAACAAACAACCAAATTAATCCTTTTACTCCA
GGAATTCTGAATGGGTTTACTTTAAACGACCATATTGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTATTGTAATTCTAGCTTTTGTTACTAGCCATGTTTTATTAGAAAACAAAGCGAAAACTGTTTTATTTGGACATACCCAA
CTTGCTATGCTGGAAAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATGAATCAAAACACCAAACACAGCATTATTGCTGGATTATACGGAAATGCTTTGGAGTGGTATGATTTCTTGCTCTAT
GCCAGTTTTGCTCCTGTCTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ImcF Domain-Containing Protein; IcmF-Related Protein; IcmF Family Protein; IcmF-Like Protein; Lipoprotein; Inner Membrane Protein; ImcF-Like Protein; ImcF Family Protein; Secretion Protein IcmF; ImcF-Related; Replication Related Protein; Protein Conserved In Bacteria; Fis Family Transcriptional Regulator

Number of amino acids: Translated: 973; Mature: 973

Protein sequence:

>973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELAIIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQSSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTAHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Sequences:

>Translated_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELAIIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQSSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTAHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA
>Mature_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELAIIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQSSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTAHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Specific function: Unknown

COG id: COG3523

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110794; Mature: 110794

Theoretical pI: Translated: 7.50; Mature: 7.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELAIIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
NQSSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IQEQCIQVPQTTKFSQKPFIAVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTAHILDEASKELLAYEALNN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCC
YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQANQLSFIVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELAIIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECC
NQSSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPVRSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALKT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IQEQCIQVPQTTKFSQKPFIAVAVSLAGLSLLTLIYNHYKTAHILDEASKELLAYEALNN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGDSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
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LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
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YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
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PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA