Definition | Legionella pneumophila str. Corby chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009494 |
Length | 3,576,470 |
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The map label for this gene is 148359518
Identifier: 148359518
GI number: 148359518
Start: 2292484
End: 2293773
Strand: Reverse
Name: 148359518
Synonym: LPC_1428
Alternate gene names: NA
Gene position: 2293773-2292484 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148359519
Following gene: 148359517
Centisome position: 64.14
GC content: 41.24
Gene sequence:
>1290_bases ATGTCTTTCTACATTCAGCTAGCCAGTTTATCTATTATTATTCTTTATGTTTTACTGTTATTTCGTAACGTTGATCCATT AGTAGTGACAGCAGTTTGCGTTGGGCTAGGTTTTTTGTGGAATATAAGCACTCCCATTGACATAGGGAATGCTATGGCTG ACGCCTTGGGTTCATTTATGGCTTTGGTTGGTTTTATTATCATGTTAGGTCGAGGGTTGGGCGAGGTTTTAACGCATACC CAGGTAAGTCATACTTTAGTGCACCAAATTGTTTATGGAGTTGGGGTTAATACTCAGCGACGTGCTAAAATTGGTATAGT CCTCTCATCCTTTATTATTGTTGGTTTGCTTGGAACATTAGCGGGAGGTTTAGCCATTCTGGCTCCCAGTTTGCGTCCTA TTGCAGGGTCAGTAGGCTTGTCACGTCCCAGTTTGGCGGTACTCATGCAGGCCTCAGCTGAAGAGGCTTTAATTCTAGGG CCATTTGCCCCCCCGGTTGTGACCTTGCTTGGCGTCACTGGATTAAGTTATGGGACAGTATTTCTTTACGCTTCTCTTCC AATTGCTGTAGTGACTTTAATTACCACCTGGTTTATGGCTTCACGATTACAAAAACTATACATCAATGAGCCCTGCGAAG ACGAGAACAGCACTGAGCCTTTTACTCCCAATAGACAACAAAAAAGGGCTACATTAATTTTTCTGATTTCCTTTTTGTTT TGTGTTGTCTATGGTTTATTTACTCAAGCGAAAACCTCTTATGTGATCTTTGTCATGTTATTTCTGGCGCTGATTACCGG ATTATCCTGTCGACTCGGTTTGAAACAAATTTTTAACCTGTTATTTGAAGGAATGCAAAAAAGCTTGCATCTCTTCTTTT TGTTTATTTTATTTGATCCTTTTATGGCACTAATCCATCAAGCCGGAGGATTTAATGCATTAACTGAATTATTAACACCA TTAATTAACCTGGGAGGGAAACCAGTATTATCGATCTTAATAGGATTTACCGGCGCTTTTGGTATGCCAGGCGCTGCAGA AGCAACCATCAAAATGCTTCACCAGCTCTTTAGCCCCTCTGTCATCCAGATGCAATTGCCTCTAATCACTTTTGCTTTGT GCATGCTCTTTGCAACTCGCGTCACAAATTATGCTTACCCTGGAGCCAATATGTTCGCGGCAATGGGTTTTGCTGGAAGT GAGAATGTCAAAGCCATGATACAAAATGGCCTTGTAGTGACTGGCGTCCAGGTTGCGTTTTTAATTGTTTATAGTTTATT CATACCCTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGGCACAAAGTCTCAGCAATAAAATTATCCTGGCAGAGAAACCTGGATTAGGGATTGAAGGCATCACACAAGGACTAAAT CTAATTGGGGTGATCCGCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTGTGAGCGCTTTAATCCTTTAAATCAATGAGTTTGTACCACACAGGGCTATGCTTAGGGCTTATACAGATATAGAA GCTAAATTTGTATTTAATAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Permease; H+/Gluconate Symporter And Related Permeases; Sodium/Proton Antiporter; H Gluconate Symporter
Number of amino acids: Translated: 429; Mature: 428
Protein sequence:
>429_residues MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVVTAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHT QVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILG PFAPPVVTLLGVTGLSYGTVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTP LINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVIQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGS ENVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP
Sequences:
>Translated_429_residues MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVVTAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHT QVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILG PFAPPVVTLLGVTGLSYGTVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTP LINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVIQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGS ENVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP >Mature_428_residues SFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVVTAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFMALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQ VSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTLAGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGP FAPPVVTLLGVTGLSYGTVFLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLFC VVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDPFMALIHQAGGFNALTELLTPL INLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPSVIQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSE NVKAMIQNGLVVTGVQVAFLIVYSLFIP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46266; Mature: 46135
Theoretical pI: Translated: 8.68; Mature: 8.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVVTAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFM CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGPFAPPVVTLLGVTGLSYGTV HCHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH FLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMALIHQAGGFNALTELLTPLINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPS HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC VIQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSENVKAMIQNGLVVTGVQVAF CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEHHHHHHH LIVYSLFIP HHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SFYIQLASLSIIILYVLLLFRNVDPLVVTAVCVGLGFLWNISTPIDIGNAMADALGSFM CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ALVGFIIMLGRGLGEVLTHTQVSHTLVHQIVYGVGVNTQRRAKIGIVLSSFIIVGLLGTL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGLAILAPSLRPIAGSVGLSRPSLAVLMQASAEEALILGPFAPPVVTLLGVTGLSYGTV HCHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH FLYASLPIAVVTLITTWFMASRLQKLYINEPCEDENSTEPFTPNRQQKRATLIFLISFLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH CVVYGLFTQAKTSYVIFVMLFLALITGLSCRLGLKQIFNLLFEGMQKSLHLFFLFILFDP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMALIHQAGGFNALTELLTPLINLGGKPVLSILIGFTGAFGMPGAAEATIKMLHQLFSPS HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC VIQMQLPLITFALCMLFATRVTNYAYPGANMFAAMGFAGSENVKAMIQNGLVVTGVQVAF CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEHHHHHHH LIVYSLFIP HHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA