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The map label for this gene is 148359224

Identifier: 148359224

GI number: 148359224

Start: 1948123

End: 1949325

Strand: Reverse

Name: 148359224

Synonym: LPC_1118

Alternate gene names: NA

Gene position: 1949325-1948123 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148359225

Following gene: 148359222

Centisome position: 54.5

GC content: 34.33

Gene sequence:

>1203_bases
GTGTCCCATAATTATTTTCGTACCTGTCTGACGACAAAGGACAATAAGTTTTTTTGGCAAAAACCTTTGGCATCAGAACG
GTTTGACAAGCTGATTGCTGATAGAAAATTTCAAAAATCAATAGCTCACAGCAGGAAAAATCAATTAATGTATAGTTTTA
TAGAGTCTAAAATTGCCTCAGATTACGCACTATTGATTGATACTAAATTAAGAGAGCAATTGAAACAGTTTACTCTGGAT
GATTTTAATGATATTTCAGGATTTGAACGAAAAGAAAAATCGAATTCCAGGCAACAAAGCTATTTCAAATTAAGGCAAGA
GCTGGAATTTTTTCTTAAAAATGACATTCAACAGCATAAATCTTGCCCTGACGCTCAATTAAATGCGTTCAGACGCTGGA
TAAATATATCGGATTTACTCTTAAGACATCATTGTTATGAAGGCTTTCTTTTGGTATTTGTTAATTTGCAATTAATTGCA
GACAAACAGTTAATCGATGGCTTACCTGTAAGCGTAAGAAATAATTATAATCAACTATGTCAATTAAGTTCACCAATAGG
GAATCATGGCGCTTTGCGCCATTTTATGAATACGCATCAGGGTGAGAGTGATTTTACTCCTTTATTTTTTACCTATCATG
CCATTGGAGCTTTGGATGAATCGCTTGAATCCTTAAAGGACAAGGAAGTTCTTTTAAAAAAGCAATTAAAACATCTGAAT
AAAAAAATTAGTCATTTAAGAACAGAAGCCACTCCAGGAGTGATTGATGTCATTTCTGAATTATTGAAAAATAAGCAACA
AATACCAAAAAAAATGATGGAGCGTAGAGGACATCTGATACAGCTGATGGAAGAGGTTAGATTCACTGGAAAACAATTAA
AACAAATACAAGTTAACATGCAAAACCAACTTGAACAACGCGCTAATTTGGTAGGATTGATAGTCAAAGAACAAAAAGCA
ACGCCAAGAACGCTCCCTGAGTATTTCGAAAAAACCTATAGTATTATCAAGTACAGATTCAATAGGCAGTCTATTGCTAC
AGTCAAAAGCTCTCAGCTTCCAGAATCAACAGCAAGCAGCAATCCAAGTTCCTCAAATTTGTATAAAAGTAAATTGCTCC
CCCATTTTTGGAATAGACATGGAAAATCTTCCTCCAGTTACTGGGAAGAGGTATTCACGCCAAGTTGTTTGAACAATAAA
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAATAAAATCACTTCATTAACCAGGCATCTACCCAAAGGACTGGTCGACTACTTTGCTTAGTTTAACAAATCAATTG
TTGGTAAGGAGTTTACAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGAATTAGATGAACTCTGCTTCATACAAGCCCTGTTTATATGAATTTGGTTAAAAACAACGTTTGGCACAGCGAATGAC
TCGACCACTCCATCGGTCTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 400; Mature: 399

Protein sequence:

>400_residues
MSHNYFRTCLTTKDNKFFWQKPLASERFDKLIADRKFQKSIAHSRKNQLMYSFIESKIASDYALLIDTKLREQLKQFTLD
DFNDISGFERKEKSNSRQQSYFKLRQELEFFLKNDIQQHKSCPDAQLNAFRRWINISDLLLRHHCYEGFLLVFVNLQLIA
DKQLIDGLPVSVRNNYNQLCQLSSPIGNHGALRHFMNTHQGESDFTPLFFTYHAIGALDESLESLKDKEVLLKKQLKHLN
KKISHLRTEATPGVIDVISELLKNKQQIPKKMMERRGHLIQLMEEVRFTGKQLKQIQVNMQNQLEQRANLVGLIVKEQKA
TPRTLPEYFEKTYSIIKYRFNRQSIATVKSSQLPESTASSNPSSSNLYKSKLLPHFWNRHGKSSSSYWEEVFTPSCLNNK

Sequences:

>Translated_400_residues
MSHNYFRTCLTTKDNKFFWQKPLASERFDKLIADRKFQKSIAHSRKNQLMYSFIESKIASDYALLIDTKLREQLKQFTLD
DFNDISGFERKEKSNSRQQSYFKLRQELEFFLKNDIQQHKSCPDAQLNAFRRWINISDLLLRHHCYEGFLLVFVNLQLIA
DKQLIDGLPVSVRNNYNQLCQLSSPIGNHGALRHFMNTHQGESDFTPLFFTYHAIGALDESLESLKDKEVLLKKQLKHLN
KKISHLRTEATPGVIDVISELLKNKQQIPKKMMERRGHLIQLMEEVRFTGKQLKQIQVNMQNQLEQRANLVGLIVKEQKA
TPRTLPEYFEKTYSIIKYRFNRQSIATVKSSQLPESTASSNPSSSNLYKSKLLPHFWNRHGKSSSSYWEEVFTPSCLNNK
>Mature_399_residues
SHNYFRTCLTTKDNKFFWQKPLASERFDKLIADRKFQKSIAHSRKNQLMYSFIESKIASDYALLIDTKLREQLKQFTLDD
FNDISGFERKEKSNSRQQSYFKLRQELEFFLKNDIQQHKSCPDAQLNAFRRWINISDLLLRHHCYEGFLLVFVNLQLIAD
KQLIDGLPVSVRNNYNQLCQLSSPIGNHGALRHFMNTHQGESDFTPLFFTYHAIGALDESLESLKDKEVLLKKQLKHLNK
KISHLRTEATPGVIDVISELLKNKQQIPKKMMERRGHLIQLMEEVRFTGKQLKQIQVNMQNQLEQRANLVGLIVKEQKAT
PRTLPEYFEKTYSIIKYRFNRQSIATVKSSQLPESTASSNPSSSNLYKSKLLPHFWNRHGKSSSSYWEEVFTPSCLNNK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46886; Mature: 46755

Theoretical pI: Translated: 10.14; Mature: 10.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
SHNYFRTCLTTKDNKFFWQKPLASERFDKLIADRKFQKSIAHSRKNQLMYSFIESKIAS
CCCHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DYALLIDTKLREQLKQFTLDDFNDISGFERKEKSNSRQQSYFKLRQELEFFLKNDIQQHK
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SCPDAQLNAFRRWINISDLLLRHHCYEGFLLVFVNLQLIADKQLIDGLPVSVRNNYNQLC
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCHHHHH
QLSSPIGNHGALRHFMNTHQGESDFTPLFFTYHAIGALDESLESLKDKEVLLKKQLKHLN
HHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKISHLRTEATPGVIDVISELLKNKQQIPKKMMERRGHLIQLMEEVRFTGKQLKQIQVNM
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QNQLEQRANLVGLIVKEQKATPRTLPEYFEKTYSIIKYRFNRQSIATVKSSQLPESTASS
HHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHCCC
NPSSSNLYKSKLLPHFWNRHGKSSSSYWEEVFTPSCLNNK
CCCCCHHHHHHHCHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA