| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009487 |
| Length | 2,906,700 |
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The map label for this gene is nhaK [H]
Identifier: 148267088
GI number: 148267088
Start: 716602
End: 718644
Strand: Direct
Name: nhaK [H]
Synonym: SaurJH9_0652
Alternate gene names: 148267088
Gene position: 716602-718644 (Clockwise)
Preceding gene: 148267087
Following gene: 148267093
Centisome position: 24.65
GC content: 31.86
Gene sequence:
>2043_bases TTGGAAATATTTGAAACAATTCTTATATTTATAGCTGTTGTGATACTAAGTTCGTTTGTCCATACTTTCATACCTAAAGT ACCCCTAGCATTTATACAAATTTTCTTGGGCATGTTACTATTTATTACCCCAATCCCTGTTCAATTTAATTTTGATTCTG AATTGTTTATGGTAACAATGATTGCGCCTTTGTTATTTGTAGAAGGTGTTAATGTTTCTAGAGTCCATTTAAGGAAATAT ATTAAGCCAGTGATGATGATGGCATTAGGATTAGTCATTACTACTGTGATAGGTGTAGGTTTATTTATTCATTGGATTTG GCCAGATTTACCTATTGGAGCAGCATTTGCAATTGCTGCCATTCTTTGTCCTACTGATGCAGTAGCAGTGCAAGCAATCA CTAAAGGAAAGGTCTTGCCAAAAGGAGCAATGACAATTCTTGAAGGTGAGTCATTATTGAATGATGCTGCTGGTATTATT TCATTTAAAATAGCTGTTGGAGTATTAGTTACAGGTGCTTTTTCACTTGTTGATGCTGTTCAGTTGTTTTTAATTGCATC AATTGGTGGCGCAGTGGTTGGTTTACTTATAGGTATGGCATTAGTAAGGTTCCGATTAACATTGATGCGTCGAGGATATG AAAACATTAATATGTTTACAATTATTCAATTGTTAACACCATTTGTTACGTATTTAATTGCTGAATTGTTTCACGCATCA GGAATCATTGCAGCAGTAGTTGCAGGACTTGTACATGGTTTCGAACGTGACAGAATTATGCAAGTACGTACACAACTGCA AATGAGTTACAATCATACATGGAATATACTAGGTTATGTTTTAAATGGCTTTGTTTTTTCAATATTAGGATTTTTAGTAC CTGAAGTTATTATTAAAATTATCAAAACAGAACCGCACAATTTAATCTTTTTAATAGGCATCACTATTGTTGTTGCTTTA GCTGTCTATCTATTTAGATTTGTTTGGGTTTATGTCTTATATCCTTATTTTTATTTAGCCATCAGTCCATTCCAAAAAAT GATGACTAAAAATGATGATGATAATCCAACGACTGAGAAACCACCAAAGCGAAGTTTATACGCTTTAATTATGACGTTAT GTGGTGTGCATGGAACAATTTCTTTAGCAATCGCATTAACGTTACCTTATTTTTTAGCAGGGCATCATGCTTTTACGTAT AGAAACGACTTATTATTTATTGCATCTGGTATGGTTATTATTAGTTTGGTAGTTGCGCAAGTATTATTGCCATTATTAAC GAAACCTGCACCTAAAACAGTAATTGGCAATATGTCGTTTAAAGTTGCTAGAATTTATATATTAGAACAAGTTATTGATT ATCTAAATCAAAAATCTACTTTCGAAACAAGTTTTAAATATGGTAACGTGATTAAAGAATATCATGATAAATTAGCATTT TTAAAAACTGTAGAGAAAGATGATGAAAACTCTAAAGAATTAGAACGTCTACAAAAAATTGCTTTTAATGTAGAAACAAA AACATTAGAGTCTTTAGTAGATGAAGGACAAATAACGAATAGTGTACTTGAAAACTATATGCGTTATGCTGAAAGAACAC AGGTATATAGACAAGCATCATTAATAAGAAGAATGATTGTATTATTACGAGGTGCTTTATTAAAACGAAGAGTACAAACG AGAGTGAACTCCGCATCTTCACTTAGTGTTACGGATAACTTAATGGAATTAAATAAAATTAATAAATTAGTCCATTATAA TGTGGTTAGTCGTTTGTCTAAGGAAACAACAAAAGATAATACACTTGAAATTGGAATGGTTTGTGACGGTTATTTAATGC GAATTGAAAACTTAACACCATCAAATTTCTTCAACTCAGCAAGTGAAGATACGATTACTAAAATTAAATTAAATGCATTG AGAGAACAACGTCGCATTTTACGTGAGTTGATTGATACAGATGAAGTATCAGAAGGTACAGCGTTAAAACTAAGAGAAGC CATCAATTATGATGAAATGGTTATTGTAGATAGTATGACGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTGTGGTCGCTAACTCAATTTATCCTCTAAAGTATAATTACAACGAGATGTGATACTTAATTTTCAATTAAACAATA CTTTTTAGAGAGGTGAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCCTAATTATGCTAAAAGGGATTGATGAAAAACGGTTCTCCACCAAATGTGGTGGGTATATAATTTAAAGAACTATTTT AAATTACAACTTTTAGAGTT
Product: sodium/hydrogen exchanger
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 680; Mature: 680
Protein sequence:
>680_residues MEIFETILIFIAVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTKDNTLEIGMVCDGYLMRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT
Sequences:
>Translated_680_residues MEIFETILIFIAVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTKDNTLEIGMVCDGYLMRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT >Mature_680_residues MEIFETILIFIAVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTMIAPLLFVEGVNVSRVHLRKY IKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAAILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGII SFKIAVGVLVTGAFSLVDAVQLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKIIKTEPHNLIFLIGITIVVAL AVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEKPPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTY RNDLLFIASGMVIISLVVAQVLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQASLIRRMIVLLRGALLKRRVQT RVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTKDNTLEIGMVCDGYLMRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNAL REQRRILRELIDTDEVSEGTALKLREAINYDEMVIVDSMT
Specific function: Transporter involved in the efflux of sodium, potassium, lithium and rubidium [H]
COG id: COG0025
COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family. Nhak (TC 2.A.36.3.2) subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790501, Length=440, Percent_Identity=35.4545454545455, Blast_Score=211, Evalue=1e-55, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320663, Length=378, Percent_Identity=25.1322751322751, Blast_Score=70, Evalue=1e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 - InterPro: IPR018422 - InterPro: IPR018417 - InterPro: IPR004705 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76439; Mature: 76439
Theoretical pI: Translated: 8.97; Mature: 8.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEIFETILIFIAVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHH IAPLLFVEGVNVSRVHLRKYIKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVGVLVTGAFSLVDAV HHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTEPHNLIFLIGITIVVALAVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEK HCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC PPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTYRNDLLFIASGMVIISLVVAQ CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF HHHHHHCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQAS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRRMIVLLRGALLKRRVQTRVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTKDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TLEIGMVCDGYLMRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNALREQRRILRELIDTDEVSEGT CEEEEEECCHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH ALKLREAINYDEMVIVDSMT HHHHHHHCCCCCEEEEECCC >Mature Secondary Structure MEIFETILIFIAVVILSSFVHTFIPKVPLAFIQIFLGMLLFITPIPVQFNFDSELFMVTM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHH IAPLLFVEGVNVSRVHLRKYIKPVMMMALGLVITTVIGVGLFIHWIWPDLPIGAAFAIAA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ILCPTDAVAVQAITKGKVLPKGAMTILEGESLLNDAAGIISFKIAVGVLVTGAFSLVDAV HHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLFLIASIGGAVVGLLIGMALVRFRLTLMRRGYENINMFTIIQLLTPFVTYLIAELFHAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GIIAAVVAGLVHGFERDRIMQVRTQLQMSYNHTWNILGYVLNGFVFSILGFLVPEVIIKI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTEPHNLIFLIGITIVVALAVYLFRFVWVYVLYPYFYLAISPFQKMMTKNDDDNPTTEK HCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC PPKRSLYALIMTLCGVHGTISLAIALTLPYFLAGHHAFTYRNDLLFIASGMVIISLVVAQ CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLLPLLTKPAPKTVIGNMSFKVARIYILEQVIDYLNQKSTFETSFKYGNVIKEYHDKLAF HHHHHHCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTVEKDDENSKELERLQKIAFNVETKTLESLVDEGQITNSVLENYMRYAERTQVYRQAS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIRRMIVLLRGALLKRRVQTRVNSASSLSVTDNLMELNKINKLVHYNVVSRLSKETTKDN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TLEIGMVCDGYLMRIENLTPSNFFNSASEDTITKIKLNALREQRRILRELIDTDEVSEGT CEEEEEECCHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH ALKLREAINYDEMVIVDSMT HHHHHHHCCCCCEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]