| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146301349
Identifier: 146301349
GI number: 146301349
Start: 4304362
End: 4306056
Strand: Direct
Name: 146301349
Synonym: Fjoh_3607
Alternate gene names: NA
Gene position: 4304362-4306056 (Clockwise)
Preceding gene: 146301348
Following gene: 146301350
Centisome position: 70.6
GC content: 24.37
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAATACTACAGCTAAAACGCGCTACAAGCAATTTAGGCATTAGGTTTAAATTGAAATTAGTATTTTTTATTTGGAAG ATTTGCTTCGCCGGTTCTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 564; Mature: 563
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_564_residues MTKMTLRLNYSTYFNQNDTIEDLLAPLGKMDLLRAVSYLINRTKSEKNAVDTISNWFNDKNIQAQLIPKTKSNTSILNII SSLNLLTYITEKADTNTEEIISPNDFELRLFKSYLLLNSEQDKIEVAGQKNLPIDGSEEKLSASLITLLYHDYDLQNYIL QEVFLVQLIKSIDFFQFIEKDNKLKNHLSLFLSKYNCKTWTEWIMNLLNLILPILDHNDETYSEFRLDRDENFDTSTTFL SLFTIPLEYEELPDFIHLRSNPILKINDETFIIINKLFLVERIFKSLVFEFSLKINKEVKEEYQLKDFRATYCDNFSEQT LLYNALYNCFPNNPKWSKIKGEDFKKMKYSSEPDYYVRFKNKVLIFESKDVILKGNEKHSRDYSILSKCLKEKFLKIEKN NNISKKAILQIIENIRRVLDKYYDKIDTNYKTEFLNFYPILVVHDRQFDTPELNRLINIWFKKELEKAFNKSEQFKINEL VIINIDTLILYQEHFKKRGIYGLEIMINKYFEFKKPRICKNQKELEQKYLETSISFSDFIAKEFNKTNFKKVPSFVNEYI NKLI >Mature_563_residues TKMTLRLNYSTYFNQNDTIEDLLAPLGKMDLLRAVSYLINRTKSEKNAVDTISNWFNDKNIQAQLIPKTKSNTSILNIIS SLNLLTYITEKADTNTEEIISPNDFELRLFKSYLLLNSEQDKIEVAGQKNLPIDGSEEKLSASLITLLYHDYDLQNYILQ EVFLVQLIKSIDFFQFIEKDNKLKNHLSLFLSKYNCKTWTEWIMNLLNLILPILDHNDETYSEFRLDRDENFDTSTTFLS LFTIPLEYEELPDFIHLRSNPILKINDETFIIINKLFLVERIFKSLVFEFSLKINKEVKEEYQLKDFRATYCDNFSEQTL LYNALYNCFPNNPKWSKIKGEDFKKMKYSSEPDYYVRFKNKVLIFESKDVILKGNEKHSRDYSILSKCLKEKFLKIEKNN NISKKAILQIIENIRRVLDKYYDKIDTNYKTEFLNFYPILVVHDRQFDTPELNRLINIWFKKELEKAFNKSEQFKINELV IINIDTLILYQEHFKKRGIYGLEIMINKYFEFKKPRICKNQKELEQKYLETSISFSDFIAKEFNKTNFKKVPSFVNEYIN KLI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67310; Mature: 67179
Theoretical pI: Translated: 7.86; Mature: 7.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTKMTLRLNYSTYFNQNDTIEDLLAPLGKMDLLRAVSYLINRTKSEKNAVDTISNWFNDK CCEEEEEEEEHEECCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCC NIQAQLIPKTKSNTSILNIISSLNLLTYITEKADTNTEEIISPNDFELRLFKSYLLLNSE CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC QDKIEVAGQKNLPIDGSEEKLSASLITLLYHDYDLQNYILQEVFLVQLIKSIDFFQFIEK CCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DNKLKNHLSLFLSKYNCKTWTEWIMNLLNLILPILDHNDETYSEFRLDRDENFDTSTTFL HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHH SLFTIPLEYEELPDFIHLRSNPILKINDETFIIINKLFLVERIFKSLVFEFSLKINKEVK HHEECCCCHHHCCCCEEECCCCEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH EEYQLKDFRATYCDNFSEQTLLYNALYNCFPNNPKWSKIKGEDFKKMKYSSEPDYYVRFK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCEEEEEE NKVLIFESKDVILKGNEKHSRDYSILSKCLKEKFLKIEKNNNISKKAILQIIENIRRVLD CEEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KYYDKIDTNYKTEFLNFYPILVVHDRQFDTPELNRLINIWFKKELEKAFNKSEQFKINEL HHHHHHCCCCHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECEE VIINIDTLILYQEHFKKRGIYGLEIMINKYFEFKKPRICKNQKELEQKYLETSISFSDFI EEEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH AKEFNKTNFKKVPSFVNEYINKLI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TKMTLRLNYSTYFNQNDTIEDLLAPLGKMDLLRAVSYLINRTKSEKNAVDTISNWFNDK CEEEEEEEEHEECCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCC NIQAQLIPKTKSNTSILNIISSLNLLTYITEKADTNTEEIISPNDFELRLFKSYLLLNSE CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC QDKIEVAGQKNLPIDGSEEKLSASLITLLYHDYDLQNYILQEVFLVQLIKSIDFFQFIEK CCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DNKLKNHLSLFLSKYNCKTWTEWIMNLLNLILPILDHNDETYSEFRLDRDENFDTSTTFL HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHH SLFTIPLEYEELPDFIHLRSNPILKINDETFIIINKLFLVERIFKSLVFEFSLKINKEVK HHEECCCCHHHCCCCEEECCCCEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH EEYQLKDFRATYCDNFSEQTLLYNALYNCFPNNPKWSKIKGEDFKKMKYSSEPDYYVRFK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCEEEEEE NKVLIFESKDVILKGNEKHSRDYSILSKCLKEKFLKIEKNNNISKKAILQIIENIRRVLD CEEEEEECCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KYYDKIDTNYKTEFLNFYPILVVHDRQFDTPELNRLINIWFKKELEKAFNKSEQFKINEL HHHHHHCCCCHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECEE VIINIDTLILYQEHFKKRGIYGLEIMINKYFEFKKPRICKNQKELEQKYLETSISFSDFI EEEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH AKEFNKTNFKKVPSFVNEYINKLI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA