| Definition | Enterobacter sp. 638 plasmid pENTE01, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_009425 |
| Length | 157,749 |
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The map label for this gene is ndvB [H]
Identifier: 146284571
GI number: 146284571
Start: 63709
End: 72291
Strand: Direct
Name: ndvB [H]
Synonym: Ent638_4245
Alternate gene names: 146284571
Gene position: 63709-72291 (Clockwise)
Preceding gene: 146284570
Following gene: 146284573
Centisome position: 40.39
GC content: 53.34
Gene sequence:
>8583_bases ATGAATATAAATCCCAGGGCGTGGCTTCGCCGCCCCCGTCCCCTGACGCAAACTCCCGGCTGGGCTCCGTTTCCGGTTAA CGACCCGGCGGGTGAAATTCCTCTGCGGCCAGAGCTGTTTTCAACACCTCAGATGGAGCGTTATGGTCAAAAACTGGCGC GTACCCATAAAATTTCTCCAGATAAACTGCCTTACTACCTCCTTAAACGGCTCGGTGAAAATGAGGCCGTCATTACGCAA AACTGTTACGAACTCAATGCACGTAAAAAAACGACCATTATGCCCGCCGGGGAGTGGTTGCTGGACAATTACTACCTTAT TGAGGAGCAGATCCGTATCGTCCGCCAGCACTTGCCGAAAAGTTTTGGCAAAGGGCTGCCTTCACTGTCCTCCCCACACC GTTGTCCGCGAATTTATGATATTGCCGCAGAGGCCATTGCGCATGGCGATGGGCGATGGGATATCGCCAGCCTGACCAGC TATATCACGGCTTATCAGACAGTCACGCCGCTTACGTTAGGCGAAGTCTGGGCTTTGCCGGGCATGCTCCGCCTGTCCTT AATCGAAAACCTGCGCCGCGTCAGTGCCGAAGTCGTACAAGCCCAGCAAGAACGAAGCCTGGCCGATACGTGGATAACAC GAATTTTCGAATGCGCAGAGAATGATCCGGCTGATTTAATCATGGTGATCGCTGACATGGCGCGTTCACGCCCTCCGTTG AGCAGCGCATTTGTCGCTGAACTGGTACGCCGTCACCAGGGCCATGGCAACGCGCTCGCCCTACCTCTGACCTGGGTCGA ACAGCGCCTGGCCGAACAGGGCGTCACAACAGAGATCCTCATTCATCGCTTCAATCAACAGCTCGCTGCCAGTCAACTCT CTGTCAGCAACAGCATCGCCGGTTTACGCTTACTGAGTGAAACTAACTGGGCTGATTTTGCTGAAACCATTAGCGTGGTG 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Upstream 100 bases:
>100_bases AGCTGTTAAATCCCTGATGCCTTACGCCCATCCTGAGAGAACCCTTCTGAACTGATTTCGCAACTGCTCCTGCGCGTTAA CGTCGCATCAGAGCAACGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAGCTAAAAATGCGCATTAACGTCTTCCGTTAATGCGCTGATTATCTCTGAGAACGTCAATAGCCGTCTGCATCGCGA TTTTATCATCCCTTCGTTTT
Product: glycosyltransferase 36
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2860; Mature: 2860
Protein sequence:
>2860_residues MNINPRAWLRRPRPLTQTPGWAPFPVNDPAGEIPLRPELFSTPQMERYGQKLARTHKISPDKLPYYLLKRLGENEAVITQ NCYELNARKKTTIMPAGEWLLDNYYLIEEQIRIVRQHLPKSFGKGLPSLSSPHRCPRIYDIAAEAIAHGDGRWDIASLTS YITAYQTVTPLTLGEVWALPGMLRLSLIENLRRVSAEVVQAQQERSLADTWITRIFECAENDPADLIMVIADMARSRPPL SSAFVAELVRRHQGHGNALALPLTWVEQRLAEQGVTTEILIHRFNQQLAASQLSVSNSIAGLRLLSETNWADFAETISVV EQTLRLDPAGIYSRMHFDTRDHYRHVVELLARQSHFTEPEVANHVLALSRETTPGTQAHHIGHYLAGEGRQQLEIQLLAE TSRLIRLRHSFNKIPLLSWLGSLSLLTTATTAGILHETAHQGMGWLLLLLALPLIVAVSQLISDMLSEITTRFRIPLPLP RMDFSAGIPADCATMVAIPCLLTSHESICKLLTSLEVCWLGNQDENLCFALLTDFADSPSESTEENQALLNQAITETQNL NRRYPGSRPNFYLLHRKPEWNPLQGVWMGYERKRGKLALLNDWLRHPAAQFASVEGMPADQLPGHIKYVITLDSDTVLPR DTAHKLIATMAHPMNKPEYDPLKLRVVKGYGILQPGLAEEIPRNGQGRYAALSSSVPGNNPYSMMSSDIYQDLFWEGSFV GKGIYDVDIFVQATANTCPENLVLSHDLLEGCYARSGLLSEVLLYEQYPNNYLSDVARRTRWIRGDWQLLNWLRPHVRKA DGTSVKNPLSVLSCWKLFDNLRRSLVAPSLLVLLFCALIWVPNPFYWLGVVTLVWLLPAVLSITHDLLRKPPRRSLRQHL SLVVASALKRLSRIALNFAILPHEAGYTLYAIGVTLWRLAISRRNLSQWASHNPVSDQVKVSAVRFYRAMWLNVISGIAL TGLTFQFAPQLLAIALPVSILWCLAPLLMSWLSRQPVRKVFSPNKEQKELLRQTSREIWAFFETFATAKENWLPPDNYQE IPEPTIAHRTSPTNIGLSLLANLTAWDFGYLPGGEVLQRITQTLDSLDKMEHFRGHLYNWYDTRTLAPLSPRYVSSVDSG NMAGHLLTLRQGLSAMRKQPVLNGEQILAGLNDTLSILERHWGQNTPTSLRLLRKQCLSAMSLPPTHIFSALKKMRTQSN HLKMLYNQEDSFVVRWTEHLEHQLVQLCHEWTHLLGWLTPLYKDQTLPSLNWLATATYSGEGTPTASVITQARLRLDIIT ELEQRLDDHARMDFAFLYSEATSLLSVGYNCDTNTPDKSHYDLLPSEIRLTSFLAIATNQLPLKSWYTLGRLFTTIDNET ALMSWSGSMFEYLMPNLVMPVWPGSLLDEMSQSAVMRQISWGKERGVPWGVSESGYHAFDVQHNYQYQAFGVPGLGLRRG LADDMVVAPYATLLALPVSPQKACENLFRLKKTGAHGEYGFYEALDYTPSRLATGQLYAVVQSWMAHHQGMAFQALAHVL LDAPMTARFMSSTAFQSASLLLQERVPDAVDLYSPRRHFESHEGRVKPVRYEPRIFTAADSPVPEVQLLSNSHYHLMMTA GGGGYSRWNNLALTRWRSDTTRDNWGAFCYISDPQTGEIWSNTWLPTGDDSGDSDEVIFTDAGAEFRRNFGSLSVRTQIV VSPEDDIELRRVTLVHRGRLPRTLELTTYAEVVLAPYASDLSHPAFSNLFIQTELDPDRDAILCHRRPRSEHEKSPCLFH MMVVHGDKPKSVSFETDRAKFLGRGRSPADAMANSENGPLSNTSGSVLDPILAIRHAVTLQPGQPITIDIVYGISESRQQ SQTLLEKYRDHPIADRVFELAWSHSLVVLRQMNASEDDATLFNRLASAVLYPSQEWRADGQVISRNRRGQSGLWGWAISG DLPIVLLSIAREESIASVTTLIQAHRYWRLKGLEVDLVILNNSPGGYQQVLQAQMMDLIYAGSGASLLDKSGGIFVRNGE HLSADDKQLLMSVAYLYLDDRAGGINEQLSLRMNTSKTPARAFISYTMTGRNQHTDWTPDTSQLRHFNGYGGFSQDGREY QIVLKENAPTPAPWSNVLANRCIGSVISEAGQAYSWYENAHEYRLTPWENDPVSDRSGEAFYLRDEESGAFWSPTPLPVR GKGDYLARHGFGYSVFAHRESGIDTELTVLVAEKDPVKIAILTLSNNSGRTRKLSVTGYVEWTLGESRTRTAPHIVTHSA SIPGGCSVMANNFYGANGGGRTAFFAVSGIHCSLTGDRREFIGRNGSLQNPTAMKQHSLTGKTGAGLDPCGALQSMVTLI DGDQRTFIFVLGAEENQAQAQATLARYLNEDAAHQELNRVHDYWHSVLDKIVVTTPDSTVDLLVNGWMLYQTMACRLMAR SGYYQSGGAFGFRDQLQDSLALSHAAPERLREQIVLCASRQFIEGDVQHWWHPPHGNGVRTRCSDDYLWLPLAVCHYVET TGDTAVLEQSIPYLEGRLLQPGEESVYDSPVISNIEETLWLHCVKAIQHGLRFGQHGLPLMGAGDWNDGMNQVGIEGRGE SVWLGFFLYDILQRFATLAEQQQDASVALMCRSQALQLQKNLETSAWDGEWYRRGYFDDGTPLGSKGSQDCRIDAIAQSW SVLSGAASPDHSRRAMQALDKYLVDSDAGLIKLLSPPFDNHGPNPGYIQGYLPGVRENGGQYTHGAIWAVMAFARMGNKA RAWQLWSMINPINHTLNAGEVAKYKAEPYVMSADVYSVEPHTGRAGWSWYTGSAGWAYRLLTEELLGIKQYGTSFTLHAQ FPDEWSSFGLTYQHGYSQYHITVSRGGTEYKVLMDGVILPDDRIPLLDDGQNHTVDIIQK
Sequences:
>Translated_2860_residues MNINPRAWLRRPRPLTQTPGWAPFPVNDPAGEIPLRPELFSTPQMERYGQKLARTHKISPDKLPYYLLKRLGENEAVITQ NCYELNARKKTTIMPAGEWLLDNYYLIEEQIRIVRQHLPKSFGKGLPSLSSPHRCPRIYDIAAEAIAHGDGRWDIASLTS YITAYQTVTPLTLGEVWALPGMLRLSLIENLRRVSAEVVQAQQERSLADTWITRIFECAENDPADLIMVIADMARSRPPL SSAFVAELVRRHQGHGNALALPLTWVEQRLAEQGVTTEILIHRFNQQLAASQLSVSNSIAGLRLLSETNWADFAETISVV EQTLRLDPAGIYSRMHFDTRDHYRHVVELLARQSHFTEPEVANHVLALSRETTPGTQAHHIGHYLAGEGRQQLEIQLLAE TSRLIRLRHSFNKIPLLSWLGSLSLLTTATTAGILHETAHQGMGWLLLLLALPLIVAVSQLISDMLSEITTRFRIPLPLP RMDFSAGIPADCATMVAIPCLLTSHESICKLLTSLEVCWLGNQDENLCFALLTDFADSPSESTEENQALLNQAITETQNL NRRYPGSRPNFYLLHRKPEWNPLQGVWMGYERKRGKLALLNDWLRHPAAQFASVEGMPADQLPGHIKYVITLDSDTVLPR DTAHKLIATMAHPMNKPEYDPLKLRVVKGYGILQPGLAEEIPRNGQGRYAALSSSVPGNNPYSMMSSDIYQDLFWEGSFV GKGIYDVDIFVQATANTCPENLVLSHDLLEGCYARSGLLSEVLLYEQYPNNYLSDVARRTRWIRGDWQLLNWLRPHVRKA DGTSVKNPLSVLSCWKLFDNLRRSLVAPSLLVLLFCALIWVPNPFYWLGVVTLVWLLPAVLSITHDLLRKPPRRSLRQHL SLVVASALKRLSRIALNFAILPHEAGYTLYAIGVTLWRLAISRRNLSQWASHNPVSDQVKVSAVRFYRAMWLNVISGIAL 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Specific function: Involved in the production of beta-(1,2)-glucan. It is involved not only in invasion but also in bacteroid development [H]
COG id: COG3459
COG function: function code G; Cellobiose phosphorylase
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To A.tumefaciens ChvB [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008928 - InterPro: IPR009342 - InterPro: IPR019282 - InterPro: IPR021478 - InterPro: IPR011013 - InterPro: IPR010383 - InterPro: IPR010403 [H]
Pfam domain/function: PF06204 CBM_X; PF10091 DUF2329; PF11329 DUF3131; PF06165 Glyco_transf_36; PF06205 GT36_AF [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 320924; Mature: 320924
Theoretical pI: Translated: 6.78; Mature: 6.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNINPRAWLRRPRPLTQTPGWAPFPVNDPAGEIPLRPELFSTPQMERYGQKLARTHKISP CCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC DKLPYYLLKRLGENEAVITQNCYELNARKKTTIMPAGEWLLDNYYLIEEQIRIVRQHLPK CCHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHCCCCCCEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCH SFGKGLPSLSSPHRCPRIYDIAAEAIAHGDGRWDIASLTSYITAYQTVTPLTLGEVWALP HHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCC GMLRLSLIENLRRVSAEVVQAQQERSLADTWITRIFECAENDPADLIMVIADMARSRPPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC SSAFVAELVRRHQGHGNALALPLTWVEQRLAEQGVTTEILIHRFNQQLAASQLSVSNSIA HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH GLRLLSETNWADFAETISVVEQTLRLDPAGIYSRMHFDTRDHYRHVVELLARQSHFTEPE HEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH VANHVLALSRETTPGTQAHHIGHYLAGEGRQQLEIQLLAETSRLIRLRHSFNKIPLLSWL HHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH GSLSLLTTATTAGILHETAHQGMGWLLLLLALPLIVAVSQLISDMLSEITTRFRIPLPLP 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EECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGLTFQFAPQLLAIALPVSILWCLAPLLMSWLSRQPVRKVFSPNKEQKELLRQTSREIWA HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FFETFATAKENWLPPDNYQEIPEPTIAHRTSPTNIGLSLLANLTAWDFGYLPGGEVLQRI HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH TQTLDSLDKMEHFRGHLYNWYDTRTLAPLSPRYVSSVDSGNMAGHLLTLRQGLSAMRKQP HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC VLNGEQILAGLNDTLSILERHWGQNTPTSLRLLRKQCLSAMSLPPTHIFSALKKMRTQSN CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC HLKMLYNQEDSFVVRWTEHLEHQLVQLCHEWTHLLGWLTPLYKDQTLPSLNWLATATYSG CEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECC EGTPTASVITQARLRLDIITELEQRLDDHARMDFAFLYSEATSLLSVGYNCDTNTPDKSH CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC YDLLPSEIRLTSFLAIATNQLPLKSWYTLGRLFTTIDNETALMSWSGSMFEYLMPNLVMP CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCC VWPGSLLDEMSQSAVMRQISWGKERGVPWGVSESGYHAFDVQHNYQYQAFGVPGLGLRRG 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References: 2154461; 11481430 [H]