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The map label for this gene is natB [H]

Identifier: 126699219

GI number: 126699219

Start: 1868993

End: 1871053

Strand: Direct

Name: natB [H]

Synonym: CD1615

Alternate gene names: 126699219

Gene position: 1868993-1871053 (Clockwise)

Preceding gene: 126699218

Following gene: 126699220

Centisome position: 43.56

GC content: 26.69

Gene sequence:

>2061_bases
ATGAGAAGTAAGATTGTAAAATACATATTTAAAAAAGAAATGTTAGACATATTGAGAGATAAAAAGACTTTATTTATGAT
GATTGTTGTGCCACTTCTTTTATATCCATTACTTATGTTATTAATGATTCAAGTAATGAATATGTCTGCAAGTAGTATGA
ATAGTAAGGACATTAATATAGCTTTTAATAATAAACCTAATAAGGTTTTAGTATCCATGATTGAAGATGATAATTTAGAA
AAAGATACTAAAAATACTTCAAATGATAAAGGCAAAATAAGAGTGTTAGATGTAGATAACTATAAAAAGTCATTAGAAGA
AAATAAAATTGATGCTTATATAAAGATGGAAGAAAAAAAATCATCTATAAATTATCAAATATATATAAATTCTTCTCAAG
AAAATTCTTCTAATGCACTAAAAAGAATTGAAACTGTTTTGGATAAATATAAAAGATTTACCATAGAAAAAACTTTATCT
GAAAAAGGATTAGATGTACAAGCTACTTTAGAACCAATAACATATAGCACTGTAGATGTTGCAAAGACGGAAGAAGTGGC
AGGGTACTTTTTAGGTCAGATACTTCCATTTATATTAATAATAGGAGTTTTACTAGGTTCAATATATCCAGCAATAGATG
TTATGGCTGGAGAAAAGGAAAGAGGTACATTAGAAACATTATTTACACTGCCAATATCAAACTTAGAACTGGTTATGGGA
AAATATATGGCAGTTTCTCTTAGTGCAATAGTAACAGCAATTTTAAACATTTTATCTATGGGACTGACTATGGCATTTAT
TTTAGTTAGTGGAGGTATTAGTAGCCAATTTGGCTTTGGAAACTTTAATTATGGAGACTTAGTCTTACCAATTATAACTA
CTTTAATTTGCATATGTCTTTTTTCAATGGTAGTTTCAGCAATAAGTATGTGTGTATGTTCATTAGCAAAAAGTTTTAAA
GATGCTCAAAACTACATAACACCTCTTATGTTAATTATTATGATACCATCATATGTTTCTATGATACCAAATATAGTATT
AGATAGAGTGACAGCTGTAATACCTGTAGTAAATATATCTTTACTTATAAAAAGTGTATTATCTTTTAAAAGCGATTTAA
ATTTAATAGCCTTAGTTTTAGCATCAAATGTAGCCTTTGTTATATTGGCAATCATACTACTGTCTAAGATGTTCAATTCT
GAGGAAATACTTTTTGGTAATAGTAAGAGTTTTTCTTTCTTAGAGAAAAGAAGTAATATAAAAAAAGGGTCTATACCAAC
TGTAAGTGATGGTGTTATTTTATATGCAGTAGGATTAGTTCTATTGATTTATGTTGGTTCTTTAGTTCAAATTAAATTTG
GTATGGCAGGTATTATAATGACACAATTCATGATAATTTCTTTACCGTTATTATTTGCATACTATATTAAAGCTGATTTT
AAAGAGGTATTTAGCTTGAAAGTTCCCAAATTAAAGCACGTGTTTGGGAGCATTGTTCTTTGGATTGGTGGATACATACT
TATTATGATTATAACACAGCTAATTTTATTCTTATTTCCTCAAAATATGGAAGTTGCTGAAAGTTTAAATAAGGCTCTTT
TTATCAAAGATAGTGTTTTACTGAATTTACTAGCAATAGCTTTATTACCAGCTATATGTGAAGAAATGTTTTTTAGGGGA
TTTATATTTTCTTCATTTAGTAAATCAAAAGATAAAAATAAGTCTATCAAGCTAGCTATAATATGCAGTGGGGTACTATT
TGGTATTATGCATATGGATTTTATTAGAATAATTCCAACATCAATATTAGGTATTATATTTGCATATAGTGTGTATAAAT
CTGGTTCAATATTTGTATCAATGTTATTGCATTTTTTAAATAATAGTGTAGCAGTTGTGTTAAATCATTATACAACTGGA
AATATAACCAACTTATATAAATTTGTTGAAGTTGATTTTTCGAACTTAAATGTGCTTAAATTTGCCTTAATTCTTCTAAT
AAGTCTTATATTAATTATGTTAGGATTAAGAGTTTTAGATAGAAAGTCTTTAAGAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAATTGCATCAGGAACACCACAGAGTTTAAAAGAGGAATCTGGAGTAAATAATTTGAGAGATGTATTCATAGAACTTG
CCAGAAAGGAGGACATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATAAAGTTATTATATATATTAAAATATTAATAAGCACTAAAGTATATGGATATACCTTGTATATAAAAATACTTTAGT
GCTATTTTATATATTTTAAT

Product: sodium extrusion ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 686; Mature: 686

Protein sequence:

>686_residues
MRSKIVKYIFKKEMLDILRDKKTLFMMIVVPLLLYPLLMLLMIQVMNMSASSMNSKDINIAFNNKPNKVLVSMIEDDNLE
KDTKNTSNDKGKIRVLDVDNYKKSLEENKIDAYIKMEEKKSSINYQIYINSSQENSSNALKRIETVLDKYKRFTIEKTLS
EKGLDVQATLEPITYSTVDVAKTEEVAGYFLGQILPFILIIGVLLGSIYPAIDVMAGEKERGTLETLFTLPISNLELVMG
KYMAVSLSAIVTAILNILSMGLTMAFILVSGGISSQFGFGNFNYGDLVLPIITTLICICLFSMVVSAISMCVCSLAKSFK
DAQNYITPLMLIIMIPSYVSMIPNIVLDRVTAVIPVVNISLLIKSVLSFKSDLNLIALVLASNVAFVILAIILLSKMFNS
EEILFGNSKSFSFLEKRSNIKKGSIPTVSDGVILYAVGLVLLIYVGSLVQIKFGMAGIIMTQFMIISLPLLFAYYIKADF
KEVFSLKVPKLKHVFGSIVLWIGGYILIMIITQLILFLFPQNMEVAESLNKALFIKDSVLLNLLAIALLPAICEEMFFRG
FIFSSFSKSKDKNKSIKLAIICSGVLFGIMHMDFIRIIPTSILGIIFAYSVYKSGSIFVSMLLHFLNNSVAVVLNHYTTG
NITNLYKFVEVDFSNLNVLKFALILLISLILIMLGLRVLDRKSLRN

Sequences:

>Translated_686_residues
MRSKIVKYIFKKEMLDILRDKKTLFMMIVVPLLLYPLLMLLMIQVMNMSASSMNSKDINIAFNNKPNKVLVSMIEDDNLE
KDTKNTSNDKGKIRVLDVDNYKKSLEENKIDAYIKMEEKKSSINYQIYINSSQENSSNALKRIETVLDKYKRFTIEKTLS
EKGLDVQATLEPITYSTVDVAKTEEVAGYFLGQILPFILIIGVLLGSIYPAIDVMAGEKERGTLETLFTLPISNLELVMG
KYMAVSLSAIVTAILNILSMGLTMAFILVSGGISSQFGFGNFNYGDLVLPIITTLICICLFSMVVSAISMCVCSLAKSFK
DAQNYITPLMLIIMIPSYVSMIPNIVLDRVTAVIPVVNISLLIKSVLSFKSDLNLIALVLASNVAFVILAIILLSKMFNS
EEILFGNSKSFSFLEKRSNIKKGSIPTVSDGVILYAVGLVLLIYVGSLVQIKFGMAGIIMTQFMIISLPLLFAYYIKADF
KEVFSLKVPKLKHVFGSIVLWIGGYILIMIITQLILFLFPQNMEVAESLNKALFIKDSVLLNLLAIALLPAICEEMFFRG
FIFSSFSKSKDKNKSIKLAIICSGVLFGIMHMDFIRIIPTSILGIIFAYSVYKSGSIFVSMLLHFLNNSVAVVLNHYTTG
NITNLYKFVEVDFSNLNVLKFALILLISLILIMLGLRVLDRKSLRN
>Mature_686_residues
MRSKIVKYIFKKEMLDILRDKKTLFMMIVVPLLLYPLLMLLMIQVMNMSASSMNSKDINIAFNNKPNKVLVSMIEDDNLE
KDTKNTSNDKGKIRVLDVDNYKKSLEENKIDAYIKMEEKKSSINYQIYINSSQENSSNALKRIETVLDKYKRFTIEKTLS
EKGLDVQATLEPITYSTVDVAKTEEVAGYFLGQILPFILIIGVLLGSIYPAIDVMAGEKERGTLETLFTLPISNLELVMG
KYMAVSLSAIVTAILNILSMGLTMAFILVSGGISSQFGFGNFNYGDLVLPIITTLICICLFSMVVSAISMCVCSLAKSFK
DAQNYITPLMLIIMIPSYVSMIPNIVLDRVTAVIPVVNISLLIKSVLSFKSDLNLIALVLASNVAFVILAIILLSKMFNS
EEILFGNSKSFSFLEKRSNIKKGSIPTVSDGVILYAVGLVLLIYVGSLVQIKFGMAGIIMTQFMIISLPLLFAYYIKADF
KEVFSLKVPKLKHVFGSIVLWIGGYILIMIITQLILFLFPQNMEVAESLNKALFIKDSVLLNLLAIALLPAICEEMFFRG
FIFSSFSKSKDKNKSIKLAIICSGVLFGIMHMDFIRIIPTSILGIIFAYSVYKSGSIFVSMLLHFLNNSVAVVLNHYTTG
NITNLYKFVEVDFSNLNVLKFALILLISLILIMLGLRVLDRKSLRN

Specific function: Involved in ATP-dependent electrogenic sodium extrusion [H]

COG id: COG1668

COG function: function code CP; ABC-type Na+ efflux pump, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76618; Mature: 76618

Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRSKIVKYIFKKEMLDILRDKKTLFMMIVVPLLLYPLLMLLMIQVMNMSASSMNSKDINI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEE
AFNNKPNKVLVSMIEDDNLEKDTKNTSNDKGKIRVLDVDNYKKSLEENKIDAYIKMEEKK
EECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCCCHHEEEEECCC
SSINYQIYINSSQENSSNALKRIETVLDKYKRFTIEKTLSEKGLDVQATLEPITYSTVDV
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEECCCCH
AKTEEVAGYFLGQILPFILIIGVLLGSIYPAIDVMAGEKERGTLETLFTLPISNLELVMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHH
KYMAVSLSAIVTAILNILSMGLTMAFILVSGGISSQFGFGNFNYGDLVLPIITTLICICL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FSMVVSAISMCVCSLAKSFKDAQNYITPLMLIIMIPSYVSMIPNIVLDRVTAVIPVVNIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIKSVLSFKSDLNLIALVLASNVAFVILAIILLSKMFNSEEILFGNSKSFSFLEKRSNI
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHCCC
KKGSIPTVSDGVILYAVGLVLLIYVGSLVQIKFGMAGIIMTQFMIISLPLLFAYYIKADF
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEVFSLKVPKLKHVFGSIVLWIGGYILIMIITQLILFLFPQNMEVAESLNKALFIKDSVL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHEEEHHHHH
LNLLAIALLPAICEEMFFRGFIFSSFSKSKDKNKSIKLAIICSGVLFGIMHMDFIRIIPT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILGIIFAYSVYKSGSIFVSMLLHFLNNSVAVVLNHYTTGNITNLYKFVEVDFSNLNVLK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FALILLISLILIMLGLRVLDRKSLRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MRSKIVKYIFKKEMLDILRDKKTLFMMIVVPLLLYPLLMLLMIQVMNMSASSMNSKDINI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEE
AFNNKPNKVLVSMIEDDNLEKDTKNTSNDKGKIRVLDVDNYKKSLEENKIDAYIKMEEKK
EECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCCCHHEEEEECCC
SSINYQIYINSSQENSSNALKRIETVLDKYKRFTIEKTLSEKGLDVQATLEPITYSTVDV
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEECCCCH
AKTEEVAGYFLGQILPFILIIGVLLGSIYPAIDVMAGEKERGTLETLFTLPISNLELVMG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHH
KYMAVSLSAIVTAILNILSMGLTMAFILVSGGISSQFGFGNFNYGDLVLPIITTLICICL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FSMVVSAISMCVCSLAKSFKDAQNYITPLMLIIMIPSYVSMIPNIVLDRVTAVIPVVNIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLIKSVLSFKSDLNLIALVLASNVAFVILAIILLSKMFNSEEILFGNSKSFSFLEKRSNI
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHCCC
KKGSIPTVSDGVILYAVGLVLLIYVGSLVQIKFGMAGIIMTQFMIISLPLLFAYYIKADF
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEVFSLKVPKLKHVFGSIVLWIGGYILIMIITQLILFLFPQNMEVAESLNKALFIKDSVL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHEEEHHHHH
LNLLAIALLPAICEEMFFRGFIFSSFSKSKDKNKSIKLAIICSGVLFGIMHMDFIRIIPT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILGIIFAYSVYKSGSIFVSMLLHFLNNSVAVVLNHYTTGNITNLYKFVEVDFSNLNVLK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FALILLISLILIMLGLRVLDRKSLRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9106203; 9384377 [H]