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Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is rec2 [H]

Identifier: 119944660

GI number: 119944660

Start: 1127327

End: 1129723

Strand: Direct

Name: rec2 [H]

Synonym: Ping_0899

Alternate gene names: 119944660

Gene position: 1127327-1129723 (Clockwise)

Preceding gene: 119944658

Following gene: 119944661

Centisome position: 24.72

GC content: 36.42

Gene sequence:

>2397_bases
ATGACAATGCGTCTATTATTGTGGCTGTCAATTATTGTTTTTATATCAAGCCTATTTTGGCCACGATTATTAGACAATAA
CGAGATAATATTTTGTGGCGTTTTATTTATTTCTTTAATGTTGATTCCGCGCCTGCGTATTCTCGCGGTTATTCCATTTT
TTGCTGTCTATTTCTCACTTTATACTTCTTTAGCATTAACGGGAAGTTTTTTTGCTTTTCAACCCGTGACTAATCTCCCC
TTTTCAAACTCAGCCCCCCTGCAGGCTTCTGTCGATGGGCGAAACCATAGCATAGTTGTGCAAATTAAATCCTTAATCAG
TGATCAAAATAGAGGATATTTTCGCGCTAAGTTAGTTGAACTTGATGGGCATCACTTAAGTTACTCTCCTTTATTGGAAA
TGCGCTGGTACGCACCGACAGTAAAGGTACAGGAAAACGAAAGACATCTCTTTAAAGTGCGTTTTAAACCTATTTATGGA
CGCGCTAATCCGGCAGGATTTGATCAGCAAAAATACAAGTACTCTGAACATATTGGCTACCAGGCTATTATAAAGTCGCA
TATTAAAAAGCAAAAATCTGCTTTCTCCTTAAGAGCTTATTTATATGAAAGGGTGTTAAATCTTTCCGACTCTTTAAACA
ACCAAGGCGCTATTCTAGCCTTATCTTTTGCAGATAAATCACTAATAAAATCAGCGCAAAAAGCGTTAATTCAACAGTTG
GGCATTGCTCATCTGTTCGCTATTTCAGGTTTACATATTAGCCTGTTTTTTTCCTGTATTTATTTATGCGTGGCTTATTT
TACTCAGCGTTTTTTCCCCAAGAAATACCTTGGCTGGTTTTCTTGGCGATTTGTAAACTTAACGGCGTTACTCGGGGCAT
TTTTATATGCTTATTTAGCCGGTTTTTCCTTACCGACTCAGCGTGCATTTTTAATGTTGTTATTTGCAGTTTGTATTTTA
TCAATGAAACGAAAGTGCAGTTTGATCGATCTATTAGGCCTGACATTTTTTATGATTTTATTATGGGATCCTTTGGCGCT
ACTCAGTTTAAGCTTGTGGTTATCTTATGTGGCAGTATGTTTAATATTAATTGTTTTATGGCATTTTCCTCAATTTAAAA
ACAGGGAAGAAAAAAATGGTGAGATTTTTGGATTTACAAAAATAAAACATTATTTTAAATTTTTACTGCTTATTCAGTTC
TCTTTGAGTCTGTTAATGTTACCTATTCAGCTATTAAGTTTTTCATCTTTTTCAATGCTAGCGCCGTTTATTAATCTGCT
AGCGGTGCCACTTTTTTCACTGTTAATTATTCCTATTACTTTATTAGCGGTTGTTTTTTCGGTTGTGCATCAACCAATCG
CAGTGCTGTTATTTACCATTGCAGATCGTTTGATCAGTTATTTTTTTATTGTGTTTGAGCAAGCAAAATTTGCCTATCTG
TCCTTTTCCTATGATCAGGGGAGTTTACTTATCTTTTTTGTTGTTTTAATTGTAGTGCTTTATATTCTATTTAAACTACA
GCATGTTAATGCTCGCCTCAGTTATTTTTTTACTTTTATATTACTCTCATCGGTTTTATTATTATTATGGTCAGAAAAAC
AAAATAAATCTCACGATTGGCAGGTCGAGATCCTAGACATAGGGCAGGGGTTGTCAGTGTTAGTCAAAAGCCAAGGACAA
AGCCTACTCTATGATACCGGTCCTCGTTATCCGTCAGGATTTACCACTGCTGCTGTTGAGACGCTGCCCTATTTACACTC
TATTGGCATTGAACGATTAGATTATTTTGTGATAAGTCACAGTGATATTGACCATGCGGGTGGCGCGGATATCATTAACC
GCGCTTTTCTGCCTGAATATATACTGGTAGGCGAGCCGTTAGCGCCTCCAGCACTGCAAAATGAAAAAACGATATTGTGC
CGTGCAGGCATGAAATGGTCATTAGGTTCACTGTCAGTAAAAGTGCTATCACCCTTAAAGACGGGTACAAACAATAATAA
TAACTCTTGTGTTTTACGTATTGATGATGGTAATTATTCACTTTTATTGACGGGAGATATTGAAAAAAAACAAGAGATTA
AGTTAATTGTACAATATAGAGGGGATTTAAAAAGTACGATTTTGCTTGCCCCTCATCATGGAAGTCGACATTCATCAACC
AACGCCTTTATTAAAACCGTCGCGCCACAGTGGGTTGTTTTCAGTGCTGGATTTATGAATCGATGGGGATTTCCAGCAGC
AGAGGTAAAGTTACGTTATCAAGATCAAAATGTTAGAATGGTAAACAGCGGTTTGAATGGGTTTATTCGTTTTAAAATAA
CAACAGATAACATTATCATGCAAACATATCGAGAAGATCTTGCCCCTTATTGGTATCATCACTCTTTTTCTCTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGCCTAAGGTGAGGATGTGCTTTTAACGTTTCAGGTTTTGGAGTAAAACGTTTAAGAAATTTTTTTGGCATATAATTAA
GGTTTACTTAAATGGATTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAAGTACTTGGTGAATCATGGAACATAAAGAAGTAAATAGTTGGCTGGTTTTTAAGCGTTTACTGGGATACGTTAAAG
AGTTTAAATTGGGCTTAGTG

Product: DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 798; Mature: 797

Protein sequence:

>798_residues
MTMRLLLWLSIIVFISSLFWPRLLDNNEIIFCGVLFISLMLIPRLRILAVIPFFAVYFSLYTSLALTGSFFAFQPVTNLP
FSNSAPLQASVDGRNHSIVVQIKSLISDQNRGYFRAKLVELDGHHLSYSPLLEMRWYAPTVKVQENERHLFKVRFKPIYG
RANPAGFDQQKYKYSEHIGYQAIIKSHIKKQKSAFSLRAYLYERVLNLSDSLNNQGAILALSFADKSLIKSAQKALIQQL
GIAHLFAISGLHISLFFSCIYLCVAYFTQRFFPKKYLGWFSWRFVNLTALLGAFLYAYLAGFSLPTQRAFLMLLFAVCIL
SMKRKCSLIDLLGLTFFMILLWDPLALLSLSLWLSYVAVCLILIVLWHFPQFKNREEKNGEIFGFTKIKHYFKFLLLIQF
SLSLLMLPIQLLSFSSFSMLAPFINLLAVPLFSLLIIPITLLAVVFSVVHQPIAVLLFTIADRLISYFFIVFEQAKFAYL
SFSYDQGSLLIFFVVLIVVLYILFKLQHVNARLSYFFTFILLSSVLLLLWSEKQNKSHDWQVEILDIGQGLSVLVKSQGQ
SLLYDTGPRYPSGFTTAAVETLPYLHSIGIERLDYFVISHSDIDHAGGADIINRAFLPEYILVGEPLAPPALQNEKTILC
RAGMKWSLGSLSVKVLSPLKTGTNNNNNSCVLRIDDGNYSLLLTGDIEKKQEIKLIVQYRGDLKSTILLAPHHGSRHSST
NAFIKTVAPQWVVFSAGFMNRWGFPAAEVKLRYQDQNVRMVNSGLNGFIRFKITTDNIIMQTYREDLAPYWYHHSFSL

Sequences:

>Translated_798_residues
MTMRLLLWLSIIVFISSLFWPRLLDNNEIIFCGVLFISLMLIPRLRILAVIPFFAVYFSLYTSLALTGSFFAFQPVTNLP
FSNSAPLQASVDGRNHSIVVQIKSLISDQNRGYFRAKLVELDGHHLSYSPLLEMRWYAPTVKVQENERHLFKVRFKPIYG
RANPAGFDQQKYKYSEHIGYQAIIKSHIKKQKSAFSLRAYLYERVLNLSDSLNNQGAILALSFADKSLIKSAQKALIQQL
GIAHLFAISGLHISLFFSCIYLCVAYFTQRFFPKKYLGWFSWRFVNLTALLGAFLYAYLAGFSLPTQRAFLMLLFAVCIL
SMKRKCSLIDLLGLTFFMILLWDPLALLSLSLWLSYVAVCLILIVLWHFPQFKNREEKNGEIFGFTKIKHYFKFLLLIQF
SLSLLMLPIQLLSFSSFSMLAPFINLLAVPLFSLLIIPITLLAVVFSVVHQPIAVLLFTIADRLISYFFIVFEQAKFAYL
SFSYDQGSLLIFFVVLIVVLYILFKLQHVNARLSYFFTFILLSSVLLLLWSEKQNKSHDWQVEILDIGQGLSVLVKSQGQ
SLLYDTGPRYPSGFTTAAVETLPYLHSIGIERLDYFVISHSDIDHAGGADIINRAFLPEYILVGEPLAPPALQNEKTILC
RAGMKWSLGSLSVKVLSPLKTGTNNNNNSCVLRIDDGNYSLLLTGDIEKKQEIKLIVQYRGDLKSTILLAPHHGSRHSST
NAFIKTVAPQWVVFSAGFMNRWGFPAAEVKLRYQDQNVRMVNSGLNGFIRFKITTDNIIMQTYREDLAPYWYHHSFSL
>Mature_797_residues
TMRLLLWLSIIVFISSLFWPRLLDNNEIIFCGVLFISLMLIPRLRILAVIPFFAVYFSLYTSLALTGSFFAFQPVTNLPF
SNSAPLQASVDGRNHSIVVQIKSLISDQNRGYFRAKLVELDGHHLSYSPLLEMRWYAPTVKVQENERHLFKVRFKPIYGR
ANPAGFDQQKYKYSEHIGYQAIIKSHIKKQKSAFSLRAYLYERVLNLSDSLNNQGAILALSFADKSLIKSAQKALIQQLG
IAHLFAISGLHISLFFSCIYLCVAYFTQRFFPKKYLGWFSWRFVNLTALLGAFLYAYLAGFSLPTQRAFLMLLFAVCILS
MKRKCSLIDLLGLTFFMILLWDPLALLSLSLWLSYVAVCLILIVLWHFPQFKNREEKNGEIFGFTKIKHYFKFLLLIQFS
LSLLMLPIQLLSFSSFSMLAPFINLLAVPLFSLLIIPITLLAVVFSVVHQPIAVLLFTIADRLISYFFIVFEQAKFAYLS
FSYDQGSLLIFFVVLIVVLYILFKLQHVNARLSYFFTFILLSSVLLLLWSEKQNKSHDWQVEILDIGQGLSVLVKSQGQS
LLYDTGPRYPSGFTTAAVETLPYLHSIGIERLDYFVISHSDIDHAGGADIINRAFLPEYILVGEPLAPPALQNEKTILCR
AGMKWSLGSLSVKVLSPLKTGTNNNNNSCVLRIDDGNYSLLLTGDIEKKQEIKLIVQYRGDLKSTILLAPHHGSRHSSTN
AFIKTVAPQWVVFSAGFMNRWGFPAAEVKLRYQDQNVRMVNSGLNGFIRFKITTDNIIMQTYREDLAPYWYHHSFSL

Specific function: Might contribute to transformation as a member of a membrane-bound pore complex at the base of the transformasome. It could directly interact with transforming DNA during translocation indirectly by participating in the assembly of the pore [H]

COG id: COG2333

COG function: function code R; Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081801, Length=664, Percent_Identity=28.0120481927711, Blast_Score=248, Evalue=8e-67,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001279
- InterPro:   IPR004477
- InterPro:   IPR004797 [H]

Pfam domain/function: PF03772 Competence; PF00753 Lactamase_B [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91119; Mature: 90987

Theoretical pI: Translated: 9.82; Mature: 9.82

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTMRLLLWLSIIVFISSLFWPRLLDNNEIIFCGVLFISLMLIPRLRILAVIPFFAVYFSL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTSLALTGSFFAFQPVTNLPFSNSAPLQASVDGRNHSIVVQIKSLISDQNRGYFRAKLVE
HHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCEEEEEEEE
LDGHHLSYSPLLEMRWYAPTVKVQENERHLFKVRFKPIYGRANPAGFDQQKYKYSEHIGY
ECCCCCCCCCHHHEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCH
QAIIKSHIKKQKSAFSLRAYLYERVLNLSDSLNNQGAILALSFADKSLIKSAQKALIQQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
GIAHLFAISGLHISLFFSCIYLCVAYFTQRFFPKKYLGWFSWRFVNLTALLGAFLYAYLA
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFSLPTQRAFLMLLFAVCILSMKRKCSLIDLLGLTFFMILLWDPLALLSLSLWLSYVAVC
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LILIVLWHFPQFKNREEKNGEIFGFTKIKHYFKFLLLIQFSLSLLMLPIQLLSFSSFSML
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
APFINLLAVPLFSLLIIPITLLAVVFSVVHQPIAVLLFTIADRLISYFFIVFEQAKFAYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
SFSYDQGSLLIFFVVLIVVLYILFKLQHVNARLSYFFTFILLSSVLLLLWSEKQNKSHDW
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
QVEILDIGQGLSVLVKSQGQSLLYDTGPRYPSGFTTAAVETLPYLHSIGIERLDYFVISH
EEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEEEC
SDIDHAGGADIINRAFLPEYILVGEPLAPPALQNEKTILCRAGMKWSLGSLSVKVLSPLK
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHH
TGTNNNNNSCVLRIDDGNYSLLLTGDIEKKQEIKLIVQYRGDLKSTILLAPHHGSRHSST
CCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCC
NAFIKTVAPQWVVFSAGFMNRWGFPAAEVKLRYQDQNVRMVNSGLNGFIRFKITTDNIIM
HHHHHHCCCCCEEEECCHHHCCCCCHHHEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEECCHHHH
QTYREDLAPYWYHHSFSL
HHHHHHCCCHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TMRLLLWLSIIVFISSLFWPRLLDNNEIIFCGVLFISLMLIPRLRILAVIPFFAVYFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTSLALTGSFFAFQPVTNLPFSNSAPLQASVDGRNHSIVVQIKSLISDQNRGYFRAKLVE
HHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCEEEEEEEE
LDGHHLSYSPLLEMRWYAPTVKVQENERHLFKVRFKPIYGRANPAGFDQQKYKYSEHIGY
ECCCCCCCCCHHHEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCH
QAIIKSHIKKQKSAFSLRAYLYERVLNLSDSLNNQGAILALSFADKSLIKSAQKALIQQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
GIAHLFAISGLHISLFFSCIYLCVAYFTQRFFPKKYLGWFSWRFVNLTALLGAFLYAYLA
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFSLPTQRAFLMLLFAVCILSMKRKCSLIDLLGLTFFMILLWDPLALLSLSLWLSYVAVC
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LILIVLWHFPQFKNREEKNGEIFGFTKIKHYFKFLLLIQFSLSLLMLPIQLLSFSSFSML
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
APFINLLAVPLFSLLIIPITLLAVVFSVVHQPIAVLLFTIADRLISYFFIVFEQAKFAYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
SFSYDQGSLLIFFVVLIVVLYILFKLQHVNARLSYFFTFILLSSVLLLLWSEKQNKSHDW
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
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EEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEEEC
SDIDHAGGADIINRAFLPEYILVGEPLAPPALQNEKTILCRAGMKWSLGSLSVKVLSPLK
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEHHHHHHHH
TGTNNNNNSCVLRIDDGNYSLLLTGDIEKKQEIKLIVQYRGDLKSTILLAPHHGSRHSST
CCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCC
NAFIKTVAPQWVVFSAGFMNRWGFPAAEVKLRYQDQNVRMVNSGLNGFIRFKITTDNIIM
HHHHHHCCCCCEEEECCHHHCCCCCHHHEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEECCHHHH
QTYREDLAPYWYHHSFSL
HHHHHHCCCHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8063112; 7542800 [H]