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Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is gdhB [H]

Identifier: 119944612

GI number: 119944612

Start: 1064059

End: 1068846

Strand: Direct

Name: gdhB [H]

Synonym: Ping_0851

Alternate gene names: 119944612

Gene position: 1064059-1068846 (Clockwise)

Preceding gene: 119944610

Following gene: 119944615

Centisome position: 23.34

GC content: 38.99

Gene sequence:

>4788_bases
ATGAAATCAATACTCAACCAAAAAAATGACATTTTAGATCAAATTTTTTCTCAATTAAAAAGTTATTTTTCTGAATCGGA
ACAACAAACTGTCGAGCAGTTTATTAAAACTATTTTCCGTGATGTGGCTATCGCCGATTTAACGCCAATACCATTAACAG
ATCTGGCCGGACTGACGGGTTCATTATGGCGAGAGACGGCTAAATGGAAAGGTAGCCGGGCAAAAGTACGTGTTTTTAAT
CCCGATGTTGAGCAAGATGAATGGAAATCTACTCATACGGTATTGACGGTATTATGCCGTAATACTCCCTTTGTGATTGA
TACGCTAAAACTTGTCCTCAATGAGCAAAATATTAAATTACATCGTGTTTATTATGGGGAAATGTCCAGCCAACGGGACA
AAAATGGGACATTAATCTCTTTCAATGAAGAAAAATTAAATGAATTGTTACTTTATTTTGAAATTGATAACACCAGTTCA
AAAAAAGAACGCGATCAGATATCAGCTAAAATACAAACAGCATTAGAAAATGTGGCTTTAGTGGGTGATGATTTTGCAGC
ATTAAAAAACACCCTGACAGAAGCCATCGAAATCAGTAAAACGGATAATTTAAAAGAACATATTGATAACTTAAGAGAAC
AGCAAACCTATTTATTATGGGTGTTAAAGGATCATTTTACTTTTCTCGGTTGTGATCAATTTAGTGTTGAAAATGGAAAA
ATCAATGTCATTGAGGGGAGTCAGTTAGGTTTATTGAAGCGTCCTGATTTTATGACTAAAGCCCATGATTTTGAATCGTT
TTCAATACTTAATGAGAAGACATTTATCCATTTCAGCAAAGCCTCTCAACGTGCGATGGTTCACCGCAGAGCTTTTCCTG
ATGTTATTTATATCAAACGTTTTAATGCCGCAGGGGAGCTGATTTCCGGTTTTCGTTTTGTCGGCTTATATACCTCTTCG
GTTTACAGTGGTACACCCACTGAGATGCCCGTAATACGTGACAAATTAGCGAATATGTTAAAACAATCGCCTTATAGTCA
AGGGGGGCATTATTATAAAGAGTTATCACAAATATTATATACCTACCCGATTGAAGATTTACTGTTATGTGATGAAACTG
GATTATTAAAAAATGCCACTGAAATATTACATGCTCAGGAGCGCAAAGAATTAAAATTATTTTTACGTATGGATGGTAAT
AATCAATTTGTCGTTGCCATCTTATATGTTCCACGAGATGTTTATAATACGAGGGTAAGACTTGATTTTGAAGAGTTAAT
TTGTCGTACTCTGGAAGTCACTGATCGTGATTTTCAAACCTACTTAAGTGAATCAAATTTAGCACGTTTACGTTTGGTAT
TACGCTTAAAAGCGCCCCTTGAATACCCATTAGAAGTGCAGGCCATACAAGATCGCATGAAACAGTTAACCAAGCTCTGG
AGCGAGGGTTTACAGGAATCTTTAGTTGAAAACTTTGGCGAAGAACGTGGTATAAAACTGGTTAAAAAATACCAGTCATC
ATTTTCAACAAGTTATAAAGACAGTTTTAGTGCCCGCGTTGCAGTGTCCGATATTGAACGCATCGAGTCCGTCTATGCAG
ATAAAGAACGGTCTATGGCATTGCGTTTTTATCGTTCTCTGGATCCTAATGGCAGTCAGTTAAAATTAAAACTTTTCCAT
CAGGATGGTGCTTTATTATTATCGGATCTTATCCCTATTCTGGAAAATCTCGGGCTTAAAGTGGCGGAAGAATACCCTTA
TAAAGTGACCCCGAATAGAGAACAGTCATTCTGGTTATATGATTTCACCTTAATTTATTCACGTGTTACTGATTTTAATC
CAGATGCTTACCACGATGTTTTTGTCGATACATTTTTATCTGTCTGGTATGGAAGAGCTGAAAATGACTCTTTTAATAAA
CTAATTTTGAGGACGGGATTAACGTGGCGTGATATTGCAATGTTGCGTGCTTATGCCAAATACTTAAAACAGATACGTTT
TGGTTTTAGTCAATCTGCAATAGCAAAAACAATGTTAGACCATAGCAAGTTAGTTATCGAGTTAGTGCAACTCTTTAAGT
TACGCTTTGACCCAAGTAACGAAATTAATTTAGAAAAGCAGCAAAAATTAGAAGAAAAAATTCTAACCTCATTAAATGAC
GTGACTAATCTTAATGAAGACCGTGTATTAAGGCAGTATGTTGAGCTTATCATGGCCACTATTCGGACCAATTATTTCCA
GAAAAGTGAGGGAGAAAATCAACCTTATATCAGTTTTAAGTTTGATCACGCTAAATTATCTGAGATTCCGTTACCGCGTT
TAAATGTTGAAATTTTTGTTTATTCACCGCGCGTAGAAGGAGTGCATTTACGCGGCGGCAAAGTTGCCCGTGGTGGTTTG
CGTTGGTCTGATCGTCGTGAAGATTACCGTACTGAGGTATTAGGATTAGTGAAAGCACAGCAGGTTAAAAATGCGGTGAT
TGTGCCCGTCGGTGCTAAAGGCGGTTTTGTTGCTAAAAAACTCAATGCTTCTATGGACAGAGATAGTTTTATGAAGGAGG
GGATTAGCAGCTACAAATTGTTTGTTAGCGCATTACTTGATCTTAGCGATAACCTCGATCAAGGCCGAGTAATTCCACCC
GTTGATGTGGTTCGTTATGACGAAGATGATACCTATCTTGTTGTTGCAGCAGATAAAGGAACAGCTACTTTTTCTGATTT
TGCCAATGAACTCGCGGTAGCAAGAAATTTCTGGCTAAATGATGCATTCGCCTCGGGTGGTAGCCATGGTTACGACCATA
AGGTCATGGGTATTACCGCGCGTGGTGCATGGATTAGTGTACAGCGTCACTTTCGTGAATTGGGTGTTAATGTACAAAAG
GATCCTATCAGTGTGATCGGTATAGGTGATATGGCGGGTGATGTATTTGGCAACGGTATGTTAAGTTCACAATCGATACG
CTTGGTTGCTGCCTTTAATCACCTGCATATATTTATTGATCCGAATCCGACTGATCAAGCGGCGTGTTTTACGGAGCGAA
AACGCTTATATGATACGCCGAAAACGGGTTGGAATGATTACGATAAAGCGTTAATTTCTGCAGGAGGCGGGGTTTTTGAA
CGTCGAGCTAAGTCAATAAACGTTTCTCCTGAAATGGCCAAACGTTTCGATATTCAAAAACAGAAAGTAACACCTAATGA
ATTGATCTCGCTATTATTAAAAGCGCAAGTTGATCTGATTTGGAATGGTGGCATCGGTACCTACATAAAAGCCAGCAGTC
AGAGTCATGCTGATGTAGGTGATAAAGCCAATGATGTGTTACGTGTCAATGCAAAACAACTGCGCTGTCGTGTGCTGGGT
GAAGGTGGAAATTTAGGTGTAACACAATCTGCCCGTATTGAATATGCATTAAACGGCGGTTTATGTTTCACCGATGCGAT
TGATAATGCAGGAGGAGTGAACTGTTCGGATTTAGAAGTTAATATTAAAATCCTACTTGATAAACTGGTCTCTGATGGGG
ATTTAACGGTTAAACAACGTAATATTTGGTTAGTTACTATGACCGATCAGGTTGGACAATTGGTGCTTAAAAATAATTAT
CGGCAAGCGCAGAGTATCAGCCTCTCTTACGTTGAATCATATAAACGTATTGAAGAGTATCGTCGTCTGATATGTAATTT
AGAAGAAAAAGGCAAGCTTAACCGTGCACTTGAATTTATTCCTACGGAGGATGTGCTTAATGAACGTAAAAATAGTCACC
TCGGTTTGACGCGACCTTGTATTGCGGTGATGTTAGCTTATGCCAAAAATGAATTGAAAGAAGCCCTGGTCGCTGAGCAT
GTTGCTTCTGATCCTTGTTTGATTAAAGAGGCAGAAAAAATATTCCCTCGATCGCTGGTGGATAAATATAAAAATGAAGT
TCATCGTCATCCGCTTATCAATGAAATTGTTGCCACGCAAATAAGTAATGATATTTTCAACTGCATGGGGACAACCTTTG
TACATCGTTTAATGGCCAGCGCAGGCTGCTCATTTTTAGATGTCTGTAAAGCGTGGGTGGCAGCAAGAGAAATTTTCGCT
ATGACTTCGCTTTTGGAAGATATTGAAGGGTTAGATAATCAAGTTCCTGTCAGTGTGCAAAATGATTTAATGCTGCAGTT
AAAACGTATGGTGCAGCGCGGTACGCGTTGGATCATTAGTACCCATCGTACAGATCTTGATATCAGCATGCTGATTAAAC
AATATCAGGAGCCTCTGAGTACGTTAGCGGAACAATTTGATAACATATTAACCGGATCATCTCTTCTTCATAGACAAAAA
TCCCTGACTGAATTAACCGCAAAGAATGTACCGGATAAATTGGCACATTCTCTGGCAAGTGTGGATAAAATTTATGCCAT
GTTGGGTGTTATTTCAGTTGCCGCAAAAGTGAAAATTGAACCTCAACTTGCAGTGCAGGTTTATTTCCACTGCGGTGATC
ATTTGAAATTATTTGATGTCGCTGAGCAACTTAGCCTTTTACCGGCAGATAATAATTGGCAATCGCTTGCCAGAGAAGCA
ATGCGTGATGATCTTGAATGGCAGCATATGCGGATCACTAAGAGTATATTAGAAATGGTCAAAGAAAGTACAGATGTTGG
GGATGCCTATGTTGATTGGCACACCTCAAATCATATGCTTTTTGATCGCTGGCAACGTATGGCTGATGCACTATTGGCCG
CTAGTCCTCCAGAGTTTAGTATGTGTCAGGTGGCGTTACGTGAGCTGCTGGATCTATCTCAGAGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCTCTATCACCTCTCATTTTATATTTTTTTTAAATAGCCTTTTAGTTTACACCAACCTATAGTGAGAGGATTTATAAGT
ACTTAATAAGGGTCGTGTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGCTCGAGGCTCGAAGGCTCAAAACTCGAAGCCGTCAGCCGTCAGCCGTCAGCCCGAAGCCGATAACTGACAGCTGAC
AGCTGACAGCTGTCAGCTGT

Product: NAD-glutamate dehydrogenase

Products: NA

Alternate protein names: NAD-GDH; NAD(+)-dependent glutamate dehydrogenase [H]

Number of amino acids: Translated: 1595; Mature: 1595

Protein sequence:

>1595_residues
MKSILNQKNDILDQIFSQLKSYFSESEQQTVEQFIKTIFRDVAIADLTPIPLTDLAGLTGSLWRETAKWKGSRAKVRVFN
PDVEQDEWKSTHTVLTVLCRNTPFVIDTLKLVLNEQNIKLHRVYYGEMSSQRDKNGTLISFNEEKLNELLLYFEIDNTSS
KKERDQISAKIQTALENVALVGDDFAALKNTLTEAIEISKTDNLKEHIDNLREQQTYLLWVLKDHFTFLGCDQFSVENGK
INVIEGSQLGLLKRPDFMTKAHDFESFSILNEKTFIHFSKASQRAMVHRRAFPDVIYIKRFNAAGELISGFRFVGLYTSS
VYSGTPTEMPVIRDKLANMLKQSPYSQGGHYYKELSQILYTYPIEDLLLCDETGLLKNATEILHAQERKELKLFLRMDGN
NQFVVAILYVPRDVYNTRVRLDFEELICRTLEVTDRDFQTYLSESNLARLRLVLRLKAPLEYPLEVQAIQDRMKQLTKLW
SEGLQESLVENFGEERGIKLVKKYQSSFSTSYKDSFSARVAVSDIERIESVYADKERSMALRFYRSLDPNGSQLKLKLFH
QDGALLLSDLIPILENLGLKVAEEYPYKVTPNREQSFWLYDFTLIYSRVTDFNPDAYHDVFVDTFLSVWYGRAENDSFNK
LILRTGLTWRDIAMLRAYAKYLKQIRFGFSQSAIAKTMLDHSKLVIELVQLFKLRFDPSNEINLEKQQKLEEKILTSLND
VTNLNEDRVLRQYVELIMATIRTNYFQKSEGENQPYISFKFDHAKLSEIPLPRLNVEIFVYSPRVEGVHLRGGKVARGGL
RWSDRREDYRTEVLGLVKAQQVKNAVIVPVGAKGGFVAKKLNASMDRDSFMKEGISSYKLFVSALLDLSDNLDQGRVIPP
VDVVRYDEDDTYLVVAADKGTATFSDFANELAVARNFWLNDAFASGGSHGYDHKVMGITARGAWISVQRHFRELGVNVQK
DPISVIGIGDMAGDVFGNGMLSSQSIRLVAAFNHLHIFIDPNPTDQAACFTERKRLYDTPKTGWNDYDKALISAGGGVFE
RRAKSINVSPEMAKRFDIQKQKVTPNELISLLLKAQVDLIWNGGIGTYIKASSQSHADVGDKANDVLRVNAKQLRCRVLG
EGGNLGVTQSARIEYALNGGLCFTDAIDNAGGVNCSDLEVNIKILLDKLVSDGDLTVKQRNIWLVTMTDQVGQLVLKNNY
RQAQSISLSYVESYKRIEEYRRLICNLEEKGKLNRALEFIPTEDVLNERKNSHLGLTRPCIAVMLAYAKNELKEALVAEH
VASDPCLIKEAEKIFPRSLVDKYKNEVHRHPLINEIVATQISNDIFNCMGTTFVHRLMASAGCSFLDVCKAWVAAREIFA
MTSLLEDIEGLDNQVPVSVQNDLMLQLKRMVQRGTRWIISTHRTDLDISMLIKQYQEPLSTLAEQFDNILTGSSLLHRQK
SLTELTAKNVPDKLAHSLASVDKIYAMLGVISVAAKVKIEPQLAVQVYFHCGDHLKLFDVAEQLSLLPADNNWQSLAREA
MRDDLEWQHMRITKSILEMVKESTDVGDAYVDWHTSNHMLFDRWQRMADALLAASPPEFSMCQVALRELLDLSQS

Sequences:

>Translated_1595_residues
MKSILNQKNDILDQIFSQLKSYFSESEQQTVEQFIKTIFRDVAIADLTPIPLTDLAGLTGSLWRETAKWKGSRAKVRVFN
PDVEQDEWKSTHTVLTVLCRNTPFVIDTLKLVLNEQNIKLHRVYYGEMSSQRDKNGTLISFNEEKLNELLLYFEIDNTSS
KKERDQISAKIQTALENVALVGDDFAALKNTLTEAIEISKTDNLKEHIDNLREQQTYLLWVLKDHFTFLGCDQFSVENGK
INVIEGSQLGLLKRPDFMTKAHDFESFSILNEKTFIHFSKASQRAMVHRRAFPDVIYIKRFNAAGELISGFRFVGLYTSS
VYSGTPTEMPVIRDKLANMLKQSPYSQGGHYYKELSQILYTYPIEDLLLCDETGLLKNATEILHAQERKELKLFLRMDGN
NQFVVAILYVPRDVYNTRVRLDFEELICRTLEVTDRDFQTYLSESNLARLRLVLRLKAPLEYPLEVQAIQDRMKQLTKLW
SEGLQESLVENFGEERGIKLVKKYQSSFSTSYKDSFSARVAVSDIERIESVYADKERSMALRFYRSLDPNGSQLKLKLFH
QDGALLLSDLIPILENLGLKVAEEYPYKVTPNREQSFWLYDFTLIYSRVTDFNPDAYHDVFVDTFLSVWYGRAENDSFNK
LILRTGLTWRDIAMLRAYAKYLKQIRFGFSQSAIAKTMLDHSKLVIELVQLFKLRFDPSNEINLEKQQKLEEKILTSLND
VTNLNEDRVLRQYVELIMATIRTNYFQKSEGENQPYISFKFDHAKLSEIPLPRLNVEIFVYSPRVEGVHLRGGKVARGGL
RWSDRREDYRTEVLGLVKAQQVKNAVIVPVGAKGGFVAKKLNASMDRDSFMKEGISSYKLFVSALLDLSDNLDQGRVIPP
VDVVRYDEDDTYLVVAADKGTATFSDFANELAVARNFWLNDAFASGGSHGYDHKVMGITARGAWISVQRHFRELGVNVQK
DPISVIGIGDMAGDVFGNGMLSSQSIRLVAAFNHLHIFIDPNPTDQAACFTERKRLYDTPKTGWNDYDKALISAGGGVFE
RRAKSINVSPEMAKRFDIQKQKVTPNELISLLLKAQVDLIWNGGIGTYIKASSQSHADVGDKANDVLRVNAKQLRCRVLG
EGGNLGVTQSARIEYALNGGLCFTDAIDNAGGVNCSDLEVNIKILLDKLVSDGDLTVKQRNIWLVTMTDQVGQLVLKNNY
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VASDPCLIKEAEKIFPRSLVDKYKNEVHRHPLINEIVATQISNDIFNCMGTTFVHRLMASAGCSFLDVCKAWVAAREIFA
MTSLLEDIEGLDNQVPVSVQNDLMLQLKRMVQRGTRWIISTHRTDLDISMLIKQYQEPLSTLAEQFDNILTGSSLLHRQK
SLTELTAKNVPDKLAHSLASVDKIYAMLGVISVAAKVKIEPQLAVQVYFHCGDHLKLFDVAEQLSLLPADNNWQSLAREA
MRDDLEWQHMRITKSILEMVKESTDVGDAYVDWHTSNHMLFDRWQRMADALLAASPPEFSMCQVALRELLDLSQS
>Mature_1595_residues
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LILRTGLTWRDIAMLRAYAKYLKQIRFGFSQSAIAKTMLDHSKLVIELVQLFKLRFDPSNEINLEKQQKLEEKILTSLND
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RWSDRREDYRTEVLGLVKAQQVKNAVIVPVGAKGGFVAKKLNASMDRDSFMKEGISSYKLFVSALLDLSDNLDQGRVIPP
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DPISVIGIGDMAGDVFGNGMLSSQSIRLVAAFNHLHIFIDPNPTDQAACFTERKRLYDTPKTGWNDYDKALISAGGGVFE
RRAKSINVSPEMAKRFDIQKQKVTPNELISLLLKAQVDLIWNGGIGTYIKASSQSHADVGDKANDVLRVNAKQLRCRVLG
EGGNLGVTQSARIEYALNGGLCFTDAIDNAGGVNCSDLEVNIKILLDKLVSDGDLTVKQRNIWLVTMTDQVGQLVLKNNY
RQAQSISLSYVESYKRIEEYRRLICNLEEKGKLNRALEFIPTEDVLNERKNSHLGLTRPCIAVMLAYAKNELKEALVAEH
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SLTELTAKNVPDKLAHSLASVDKIYAMLGVISVAAKVKIEPQLAVQVYFHCGDHLKLFDVAEQLSLLPADNNWQSLAREA
MRDDLEWQHMRITKSILEMVKESTDVGDAYVDWHTSNHMLFDRWQRMADALLAASPPEFSMCQVALRELLDLSQS

Specific function: Involved in arginine catabolism by converting L- glutamate, into 2-oxoglutarate, which is then channeled into the tricarboxylic acid cycle. Can also utilize other amino acids of the glutamate family [H]

COG id: COG2902

COG function: function code E; NAD-specific glutamate dehydrogenase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenases family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR007780 [H]

Pfam domain/function: PF05088 Bac_GDH [H]

EC number: =1.4.1.2 [H]

Molecular weight: Translated: 181580; Mature: 181580

Theoretical pI: Translated: 6.64; Mature: 6.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSILNQKNDILDQIFSQLKSYFSESEQQTVEQFIKTIFRDVAIADLTPIPLTDLAGLTG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHH
SLWRETAKWKGSRAKVRVFNPDVEQDEWKSTHTVLTVLCRNTPFVIDTLKLVLNEQNIKL
HHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE
HRVYYGEMSSQRDKNGTLISFNEEKLNELLLYFEIDNTSSKKERDQISAKIQTALENVAL
EEEEECCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VGDDFAALKNTLTEAIEISKTDNLKEHIDNLREQQTYLLWVLKDHFTFLGCDQFSVENGK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCHHEEEEEEECCCEEECCCCEEECCCE
INVIEGSQLGLLKRPDFMTKAHDFESFSILNEKTFIHFSKASQRAMVHRRAFPDVIYIKR
EEEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
FNAAGELISGFRFVGLYTSSVYSGTPTEMPVIRDKLANMLKQSPYSQGGHYYKELSQILY
CCHHHHHHHCCEEEEEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
TYPIEDLLLCDETGLLKNATEILHAQERKELKLFLRMDGNNQFVVAILYVPRDVYNTRVR
HCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCHHHCCEEE
LDFEELICRTLEVTDRDFQTYLSESNLARLRLVLRLKAPLEYPLEVQAIQDRMKQLTKLW
EEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SEGLQESLVENFGEERGIKLVKKYQSSFSTSYKDSFSARVAVSDIERIESVYADKERSMA
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
LRFYRSLDPNGSQLKLKLFHQDGALLLSDLIPILENLGLKVAEEYPYKVTPNREQSFWLY
HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEECCCCCCCCEEEE
DFTLIYSRVTDFNPDAYHDVFVDTFLSVWYGRAENDSFNKLILRTGLTWRDIAMLRAYAK
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
YLKQIRFGFSQSAIAKTMLDHSKLVIELVQLFKLRFDPSNEINLEKQQKLEEKILTSLND
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VTNLNEDRVLRQYVELIMATIRTNYFQKSEGENQPYISFKFDHAKLSEIPLPRLNVEIFV
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHCCCCCCCCCEEEEE
YSPRVEGVHLRGGKVARGGLRWSDRREDYRTEVLGLVKAQQVKNAVIVPVGAKGGFVAKK
ECCCCCEEEECCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHH
LNASMDRDSFMKEGISSYKLFVSALLDLSDNLDQGRVIPPVDVVRYDEDDTYLVVAADKG
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCC
TATFSDFANELAVARNFWLNDAFASGGSHGYDHKVMGITARGAWISVQRHFRELGVNVQK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DPISVIGIGDMAGDVFGNGMLSSQSIRLVAAFNHLHIFIDPNPTDQAACFTERKRLYDTP
CCEEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
KTGWNDYDKALISAGGGVFERRAKSINVSPEMAKRFDIQKQKVTPNELISLLLKAQVDLI
CCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEE
WNGGIGTYIKASSQSHADVGDKANDVLRVNAKQLRCRVLGEGGNLGVTQSARIEYALNGG
EECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
LCFTDAIDNAGGVNCSDLEVNIKILLDKLVSDGDLTVKQRNIWLVTMTDQVGQLVLKNNY
EEEECCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECEEEEEEECHHHHHHHHHCCC
RQAQSISLSYVESYKRIEEYRRLICNLEEKGKLNRALEFIPTEDVLNERKNSHLGLTRPC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCHHH
IAVMLAYAKNELKEALVAEHVASDPCLIKEAEKIFPRSLVDKYKNEVHRHPLINEIVATQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ISNDIFNCMGTTFVHRLMASAGCSFLDVCKAWVAAREIFAMTSLLEDIEGLDNQVPVSVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
NDLMLQLKRMVQRGTRWIISTHRTDLDISMLIKQYQEPLSTLAEQFDNILTGSSLLHRQK
HHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
SLTELTAKNVPDKLAHSLASVDKIYAMLGVISVAAKVKIEPQLAVQVYFHCGDHLKLFDV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEEEECCCCCHHHHH
AEQLSLLPADNNWQSLAREAMRDDLEWQHMRITKSILEMVKESTDVGDAYVDWHTSNHML
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHH
FDRWQRMADALLAASPPEFSMCQVALRELLDLSQS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSILNQKNDILDQIFSQLKSYFSESEQQTVEQFIKTIFRDVAIADLTPIPLTDLAGLTG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHH
SLWRETAKWKGSRAKVRVFNPDVEQDEWKSTHTVLTVLCRNTPFVIDTLKLVLNEQNIKL
HHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE
HRVYYGEMSSQRDKNGTLISFNEEKLNELLLYFEIDNTSSKKERDQISAKIQTALENVAL
EEEEECCCCCCCCCCCCEEEECHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VGDDFAALKNTLTEAIEISKTDNLKEHIDNLREQQTYLLWVLKDHFTFLGCDQFSVENGK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCHHEEEEEEECCCEEECCCCEEECCCE
INVIEGSQLGLLKRPDFMTKAHDFESFSILNEKTFIHFSKASQRAMVHRRAFPDVIYIKR
EEEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
FNAAGELISGFRFVGLYTSSVYSGTPTEMPVIRDKLANMLKQSPYSQGGHYYKELSQILY
CCHHHHHHHCCEEEEEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
TYPIEDLLLCDETGLLKNATEILHAQERKELKLFLRMDGNNQFVVAILYVPRDVYNTRVR
HCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCHHHCCEEE
LDFEELICRTLEVTDRDFQTYLSESNLARLRLVLRLKAPLEYPLEVQAIQDRMKQLTKLW
EEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SEGLQESLVENFGEERGIKLVKKYQSSFSTSYKDSFSARVAVSDIERIESVYADKERSMA
HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
LRFYRSLDPNGSQLKLKLFHQDGALLLSDLIPILENLGLKVAEEYPYKVTPNREQSFWLY
HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEECCCCCCCCEEEE
DFTLIYSRVTDFNPDAYHDVFVDTFLSVWYGRAENDSFNKLILRTGLTWRDIAMLRAYAK
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
YLKQIRFGFSQSAIAKTMLDHSKLVIELVQLFKLRFDPSNEINLEKQQKLEEKILTSLND
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VTNLNEDRVLRQYVELIMATIRTNYFQKSEGENQPYISFKFDHAKLSEIPLPRLNVEIFV
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHCCCCCCCCCEEEEE
YSPRVEGVHLRGGKVARGGLRWSDRREDYRTEVLGLVKAQQVKNAVIVPVGAKGGFVAKK
ECCCCCEEEECCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHH
LNASMDRDSFMKEGISSYKLFVSALLDLSDNLDQGRVIPPVDVVRYDEDDTYLVVAADKG
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCC
TATFSDFANELAVARNFWLNDAFASGGSHGYDHKVMGITARGAWISVQRHFRELGVNVQK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DPISVIGIGDMAGDVFGNGMLSSQSIRLVAAFNHLHIFIDPNPTDQAACFTERKRLYDTP
CCEEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
KTGWNDYDKALISAGGGVFERRAKSINVSPEMAKRFDIQKQKVTPNELISLLLKAQVDLI
CCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCEEEE
WNGGIGTYIKASSQSHADVGDKANDVLRVNAKQLRCRVLGEGGNLGVTQSARIEYALNGG
EECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
LCFTDAIDNAGGVNCSDLEVNIKILLDKLVSDGDLTVKQRNIWLVTMTDQVGQLVLKNNY
EEEECCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECEEEEEEECHHHHHHHHHCCC
RQAQSISLSYVESYKRIEEYRRLICNLEEKGKLNRALEFIPTEDVLNERKNSHLGLTRPC
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