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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 118477996

GI number: 118477996

Start: 2513742

End: 2515673

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BALH_2344

Alternate gene names: 118477996

Gene position: 2513742-2515673 (Clockwise)

Preceding gene: 118477995

Following gene: 118477997

Centisome position: 47.82

GC content: 30.64

Gene sequence:

>1932_bases
ATGACTTTTCGTCAGTTCGCATTTAATAATATTTTTCGAAATAAGCGTACATATGCTGCTCATTTTTTAAGTAGTGCATT
TTCGATTATGATTTTCTTTACGTATGCTCTTTTATTATTTCATCCTGATTTACAAGGTGAGTTGAAATCGACAAGTGCAA
CAATAAGTGCATTTGGTACATTGGGATTTTCAGTTTCGCAAGGATTGATTTTTGTATTTTCATTTTTCTTCATTTTATAT
TCAGTTAGTTCGTTTTTAAAAACACGTAAGAAAGAATTTGGCATTTTAATGATGGAAGGTATGTCAATGAGACAGCTTAA
GAAATTATTATTAATTGAAAATATGTTGATTGGACTTGGTTCAATTTGTATAGGGATTTTCATTGGACTCATATTTTCTA
AACTAGTCTTATTGATAAGTGCAAGTGTATTAATGATTAATAATGGTTTACCTTTTTATTTACCAGTGCAGGCTGTATTA
TTAACAGTTATCACATTTCTTTTCTTGTTTTTAATTGTTTCATTATTTACATTTAAAATGATAAAAGTAACGGAACTTGT
GGAACTTATTCGAGCAGAGGAAAAGCCAAAACCTGAACCAAAATCTTCAGTTTTATTATCGCTACTTTCTTTAATTTGTA
TAGGTTATGGATATATTTCAGTATTTCGTTTTATCCCAAGTACTAATTTTATTACGCTTGGAATAGGTGTGCTCCTAGTA
ATTATAGGAACGTACTTTTTATATACACAGTGTAGCGTGTATATACTGCACCTTGCTAAAAGGAGAGAATCTTTCTTTTT
AAAGAGAACAAATATATTGACATTTTCTGAATTAATTTACCGTATGAAAGATAATGCAACGATGTTTTTTATAGTATCTA
TTATTTCAGCAGTGGCATTTACAGCAATCGGTACAACAGCTGCCATTGGAAATAGGGATTTAGTATGGATGACAAATCCA
TATGCATTTCTGTATGAAAGCCCTGAAAATAACAAATTGGTAGATAAACACCTCTCAATGATAAAAAAACATCTCGCGGA
TGCAAATATTCCGTACCGGATGGCTTCATCTTCAAATAAATTTACAGAAAGTAACGTAAATGTATTGAAGTTAAGTGAAT
ATAACGAACTTGCGAGAGCACTCGGGTATAAACAAGAAACGATTGAAAAAGACGATGAAATCTTACTAATCCCTGGAAGA
GTGTCACAAAAACAAGAATTTAAAAACGGTAACTATAAAAAAAATATTGAAGTCATTCAAGGAGATTGGACAAACACATT
TCGTGTGAAGAAAACTGTAGAGAATTTAGTTTTACCACATGATTCTAGTAGTATTTATATTGCTGTTCAAGATCATGTGT
ATGATGAAATTCCTCTGACGAGTAATCCAGAGGATGAAGATATTCAACATCGTACTTACGGATTTGTCGTAGATGATTGG
ATAAGAACGAAAGAGATTTCAAATCAATTAAAGAGTATATTCGATAAAGATCTTAGGGACAGAGAGTTCCGCTTTGAAGC
TTTAACATTAAGCTTGTTGGAAGCAAAGCAAAAGAATGGTTTATTACTTATGGTAAGTGTTTTAGTCGGAATTGTTTTCT
TTACATTTGCTGCTAGTTTTATTTATTTCCGATTATATACTGATTTGAACCGTGATCAACAACAATATAAAATGATTTCG
AAAATGGGATTAAGTAAACGAGAGTTAAAAAAAATCGTAACGAGACAGTTAGTATTAATGTTCTTCTTACCAATTATCAT
TGCAGTAATCCATACTGTAGTTGCGTATACAGCACTGCAACAATTAGTCAGTTTTTCTATTTTAAACAGCTCGATTTTTA
TTTTAATTTCATTTATATGTATACAAATTTTATATTTCTTTATCACTCGTTGGCGTTACCTACAAAAGCTTTATAAGACT
ATGGAGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATGGTCAACTATATAATGAAATTTATTGTGGTGAAAGTAGGCAAGCATTTTATCAAAAGATTATGGATGTCCTTTC
TTTGTTAGGAGGGAAAAGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGATACCAACTAATAAGATTACAGAAAAACATGTGAATAATAATATGAATTATGAAAGGAATCGTAATGAAAAGAACAT
TAACTATTTGTATGTTAACT

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 643; Mature: 642

Protein sequence:

>643_residues
MTFRQFAFNNIFRNKRTYAAHFLSSAFSIMIFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATISAFGTLGFSVSQGLIFVFSFFFILY
SVSSFLKTRKKEFGILMMEGMSMRQLKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYLPVQAVL
LTVITFLFLFLIVSLFTFKMIKVTELVELIRAEEKPKPEPKSSVLLSLLSLICIGYGYISVFRFIPSTNFITLGIGVLLV
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRDLVWMTNP
YAFLYESPENNKLVDKHLSMIKKHLADANIPYRMASSSNKFTESNVNVLKLSEYNELARALGYKQETIEKDDEILLIPGR
VSQKQEFKNGNYKKNIEVIQGDWTNTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYDEIPLTSNPEDEDIQHRTYGFVVDDW
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDREFRFEALTLSLLEAKQKNGLLLMVSVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLNRDQQQYKMIS
KMGLSKRELKKIVTRQLVLMFFLPIIIAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIFILISFICIQILYFFITRWRYLQKLYKT
MEQ

Sequences:

>Translated_643_residues
MTFRQFAFNNIFRNKRTYAAHFLSSAFSIMIFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATISAFGTLGFSVSQGLIFVFSFFFILY
SVSSFLKTRKKEFGILMMEGMSMRQLKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYLPVQAVL
LTVITFLFLFLIVSLFTFKMIKVTELVELIRAEEKPKPEPKSSVLLSLLSLICIGYGYISVFRFIPSTNFITLGIGVLLV
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRDLVWMTNP
YAFLYESPENNKLVDKHLSMIKKHLADANIPYRMASSSNKFTESNVNVLKLSEYNELARALGYKQETIEKDDEILLIPGR
VSQKQEFKNGNYKKNIEVIQGDWTNTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYDEIPLTSNPEDEDIQHRTYGFVVDDW
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDREFRFEALTLSLLEAKQKNGLLLMVSVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLNRDQQQYKMIS
KMGLSKRELKKIVTRQLVLMFFLPIIIAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIFILISFICIQILYFFITRWRYLQKLYKT
MEQ
>Mature_642_residues
TFRQFAFNNIFRNKRTYAAHFLSSAFSIMIFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATISAFGTLGFSVSQGLIFVFSFFFILYS
VSSFLKTRKKEFGILMMEGMSMRQLKKLLLIENMLIGLGSICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYLPVQAVLL
TVITFLFLFLIVSLFTFKMIKVTELVELIRAEEKPKPEPKSSVLLSLLSLICIGYGYISVFRFIPSTNFITLGIGVLLVI
IGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAFTAIGTTAAIGNRDLVWMTNPY
AFLYESPENNKLVDKHLSMIKKHLADANIPYRMASSSNKFTESNVNVLKLSEYNELARALGYKQETIEKDDEILLIPGRV
SQKQEFKNGNYKKNIEVIQGDWTNTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYDEIPLTSNPEDEDIQHRTYGFVVDDWI
RTKEISNQLKSIFDKDLRDREFRFEALTLSLLEAKQKNGLLLMVSVLVGIVFFTFAASFIYFRLYTDLNRDQQQYKMISK
MGLSKRELKKIVTRQLVLMFFLPIIIAVIHTVVAYTALQQLVSFSILNSSIFILISFICIQILYFFITRWRYLQKLYKTM
EQ

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74074; Mature: 73942

Theoretical pI: Translated: 9.83; Mature: 9.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFRQFAFNNIFRNKRTYAAHFLSSAFSIMIFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATISAFGT
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LGFSVSQGLIFVFSFFFILYSVSSFLKTRKKEFGILMMEGMSMRQLKKLLLIENMLIGLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYLPVQAVLLTVITFLFLFLIVSLFTFKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKVTELVELIRAEEKPKPEPKSSVLLSLLSLICIGYGYISVFRFIPSTNFITLGIGVLLV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TAIGTTAAIGNRDLVWMTNPYAFLYESPENNKLVDKHLSMIKKHLADANIPYRMASSSNK
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCC
FTESNVNVLKLSEYNELARALGYKQETIEKDDEILLIPGRVSQKQEFKNGNYKKNIEVIQ
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEE
GDWTNTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYDEIPLTSNPEDEDIQHRTYGFVVDDW
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCEEHHHH
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDREFRFEALTLSLLEAKQKNGLLLMVSVLVGIVFFTFAASF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYFRLYTDLNRDQQQYKMISKMGLSKRELKKIVTRQLVLMFFLPIIIAVIHTVVAYTALQ
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLVSFSILNSSIFILISFICIQILYFFITRWRYLQKLYKTMEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TFRQFAFNNIFRNKRTYAAHFLSSAFSIMIFFTYALLLFHPDLQGELKSTSATISAFGT
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LGFSVSQGLIFVFSFFFILYSVSSFLKTRKKEFGILMMEGMSMRQLKKLLLIENMLIGLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SICIGIFIGLIFSKLVLLISASVLMINNGLPFYLPVQAVLLTVITFLFLFLIVSLFTFKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKVTELVELIRAEEKPKPEPKSSVLLSLLSLICIGYGYISVFRFIPSTNFITLGIGVLLV
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
IIGTYFLYTQCSVYILHLAKRRESFFLKRTNILTFSELIYRMKDNATMFFIVSIISAVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TAIGTTAAIGNRDLVWMTNPYAFLYESPENNKLVDKHLSMIKKHLADANIPYRMASSSNK
HHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCC
FTESNVNVLKLSEYNELARALGYKQETIEKDDEILLIPGRVSQKQEFKNGNYKKNIEVIQ
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEE
GDWTNTFRVKKTVENLVLPHDSSSIYIAVQDHVYDEIPLTSNPEDEDIQHRTYGFVVDDW
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCEEHHHH
IRTKEISNQLKSIFDKDLRDREFRFEALTLSLLEAKQKNGLLLMVSVLVGIVFFTFAASF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYFRLYTDLNRDQQQYKMISKMGLSKRELKKIVTRQLVLMFFLPIIIAVIHTVVAYTALQ
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLVSFSILNSSIFILISFICIQILYFFITRWRYLQKLYKTMEQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]