| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 118477806
Identifier: 118477806
GI number: 118477806
Start: 2301445
End: 2303676
Strand: Direct
Name: 118477806
Synonym: BALH_2146
Alternate gene names: NA
Gene position: 2301445-2303676 (Clockwise)
Preceding gene: 118477803
Following gene: 118477808
Centisome position: 43.78
GC content: 35.75
Gene sequence:
>2232_bases ATGAAAAAGCACCCGTTACATATGTTAGGGCGGCTTGTAGCAGGGAAGAATACGCAATGGATCACTTTATCGGTTTGGAT TCTTATTACATTATTACTTTCATTTACGTTACCACAAGTAAATAGTACGAAAGAACCGAATCCGAAAAATTTACCTGAAA CAGCTATGTCGCAGCAAGCGGAAGCGCTTATGAAAAAAGAGTTTCCGAATAATGCGGGGAATCCTTTGTTAGTAGTATGG TATAGAGATGGTGGATTACAGTCACAAGATTATAAACTCATACAAGACGTTTATAAAGAGTTAAAAGCTAGTCCTTTAAA AGAACAATCAACGTTACCACCATTTGATACTATCCCGGAACAAGTATTATCAAAAAGTGCATCAAAAGATGGTACATCAT TTGTTACACCGGTATTCTTTAACAAGTCAGCTGGAACAGATATATTAAAAGGAAATCTTGATGATTTAAGAAAGATAGTG AATAGTAAGGTGGATGTAGATCCATTTAAACAAAAAATAAGTGATTCTGGATTACATGTTCGATTATCTGGACCAGTAGG CATTCAAACAGATGCAGTTAGTTTGTTTAGTCAAGCAGATGTGAAATTATTAATTGCAACTGTATTACTCGTATTAGTCC TATTAATTTTACTGTACCGTTCGCCAATTTTAGCAATTTTACCTTTACTTGTTGTTGGCTTTGCATACGGTATTATTAGT CCGACGCTTGGGTTTTTAGCTGATCACGGATGGATTAAAGTAGATGCACAGGCGATATCAATTATGACTGTACTATTGTT TGGTGCTGGAACGGATTATTGTCTATTTTTAATTTCGAGATATCGGGAGTACTTGCTAGAAGAAGAAAGTAAATATAAGG CGCTGCAACTTGCAATTAAAGCTTCTGGCGGGGCAATAATAATGAGTGCGTTAACAGTTGTACTTGGATTAGGAACATTA TTACTTGCTCATTATGGTGCCTTCCATCGATTTGCAGTACCATTTAGTGTTGCTGTATTTATTATGGGAATCGCTGCTTT AACAATTTTACCAGCGTTATTATTAATTTTCGGTAGAGCTGCATTCTTCCCGTTTGTACCGAGAACAACTTCGATGAATG AGGAATTAGCAAGAAGGAAAAAGAAAGTAGTAAAAGTTAAAAAATCAAAAGGTGCCTTTAGTAAAAAACTTGGAGATGTT GTAGTACGTAGACCGTGGACAATCATTATGCTTACTGTATTTGTATTAGGTGGATTGGCATCATTTGTACCACGTATTCA ATACACATATGACCTATTAGAATCGTTTCCTAAAGATATGCCTTCACGCGAAGGGTTTACGTTAATTAGTGATCATTTTT CAGCTGGTGAACTAGCGCCAGTAAAAGTTGTTGTTGACACGAAAGGAAAAGAGCTTCCTATAAAAGAAGAACTAGAGAAA TTTTCTTTTGTAAATACAGTGAAAGACCCAAAAGAGGGTAAAGAAAATAAGCAAATACAAATGTATGAGGTTTCCTTAGC TGAAAATCCATACTCAATTGAAGCGTTAGATCAAATTCCTAAATTGAAAAACAGTGTAGAAAAAGTATTCAAAGATGCTG GGATTAGTAATGCAGAAGATCAACTATGGATTGGCGGAGAAACAGCTTCATTATATGATACTAAGCAAATTACAGAGCGT GATGAAGCAGTTATTATTCCAGTAATGATTAGTATTATAGCTTTATTATTACTGGTTTACTTACGATCAATTGTTGCGAT GATTTATTTAATTGTAACTGTTGTATTATCGTTCTTCTCGGCACTAGGAGCAGGGTGGCTATTACTTCATTATGGTATGG GAGTACCGGCCATACAAGGTGCGATACCGTTATACGCATTCGTATTTTTAGTTGCTTTAGGGGAAGATTATAATATCTTT ATGGTCTCAGAAATATGGAAAAACAGAAAAACACAAAATCATTTGGATGCAGTGAAAAATGGGGTTATACAAACAGGTAG TGTCATTACATCAGCAGGTTTAATTTTAGCAGGAACTTTTGCGGTATTAGGTACACTTCCAATTCAAGTGCTCGTTCAAT TTGGTATTGTAACAGCAATTGGCGTATTACTAGATACGTTTATTGTAAGACCATTACTTGTACCGGCAATCACAGTTGTG TTAGGCCGCTTTGCTTTTTGGCCAGGGAAACTTTCAAGAAAGAGTGAAGAAGTACAAAAGGTGGATGCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTCTTGAAATAATTATAACATAATTTTTAATCCTTCTTGATTAATTAACCGACCAGTATATATAATTAATAGTGGAGGA AAAAAGGAAGGTGGGTTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAGAAAGCCAAGGATATTTTCCTTGGCTTTCTTCTATGTAGTTTATTAATTTTTTGAAGTCAAATCTTCGGTTTCAGC GTGATCAGCATCTTCAATAG
Product: MmpL family membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 743; Mature: 743
Protein sequence:
>743_residues MKKHPLHMLGRLVAGKNTQWITLSVWILITLLLSFTLPQVNSTKEPNPKNLPETAMSQQAEALMKKEFPNNAGNPLLVVW YRDGGLQSQDYKLIQDVYKELKASPLKEQSTLPPFDTIPEQVLSKSASKDGTSFVTPVFFNKSAGTDILKGNLDDLRKIV NSKVDVDPFKQKISDSGLHVRLSGPVGIQTDAVSLFSQADVKLLIATVLLVLVLLILLYRSPILAILPLLVVGFAYGIIS PTLGFLADHGWIKVDAQAISIMTVLLFGAGTDYCLFLISRYREYLLEEESKYKALQLAIKASGGAIIMSALTVVLGLGTL LLAHYGAFHRFAVPFSVAVFIMGIAALTILPALLLIFGRAAFFPFVPRTTSMNEELARRKKKVVKVKKSKGAFSKKLGDV VVRRPWTIIMLTVFVLGGLASFVPRIQYTYDLLESFPKDMPSREGFTLISDHFSAGELAPVKVVVDTKGKELPIKEELEK FSFVNTVKDPKEGKENKQIQMYEVSLAENPYSIEALDQIPKLKNSVEKVFKDAGISNAEDQLWIGGETASLYDTKQITER DEAVIIPVMISIIALLLLVYLRSIVAMIYLIVTVVLSFFSALGAGWLLLHYGMGVPAIQGAIPLYAFVFLVALGEDYNIF MVSEIWKNRKTQNHLDAVKNGVIQTGSVITSAGLILAGTFAVLGTLPIQVLVQFGIVTAIGVLLDTFIVRPLLVPAITVV LGRFAFWPGKLSRKSEEVQKVDA
Sequences:
>Translated_743_residues MKKHPLHMLGRLVAGKNTQWITLSVWILITLLLSFTLPQVNSTKEPNPKNLPETAMSQQAEALMKKEFPNNAGNPLLVVW YRDGGLQSQDYKLIQDVYKELKASPLKEQSTLPPFDTIPEQVLSKSASKDGTSFVTPVFFNKSAGTDILKGNLDDLRKIV NSKVDVDPFKQKISDSGLHVRLSGPVGIQTDAVSLFSQADVKLLIATVLLVLVLLILLYRSPILAILPLLVVGFAYGIIS PTLGFLADHGWIKVDAQAISIMTVLLFGAGTDYCLFLISRYREYLLEEESKYKALQLAIKASGGAIIMSALTVVLGLGTL LLAHYGAFHRFAVPFSVAVFIMGIAALTILPALLLIFGRAAFFPFVPRTTSMNEELARRKKKVVKVKKSKGAFSKKLGDV VVRRPWTIIMLTVFVLGGLASFVPRIQYTYDLLESFPKDMPSREGFTLISDHFSAGELAPVKVVVDTKGKELPIKEELEK FSFVNTVKDPKEGKENKQIQMYEVSLAENPYSIEALDQIPKLKNSVEKVFKDAGISNAEDQLWIGGETASLYDTKQITER DEAVIIPVMISIIALLLLVYLRSIVAMIYLIVTVVLSFFSALGAGWLLLHYGMGVPAIQGAIPLYAFVFLVALGEDYNIF MVSEIWKNRKTQNHLDAVKNGVIQTGSVITSAGLILAGTFAVLGTLPIQVLVQFGIVTAIGVLLDTFIVRPLLVPAITVV LGRFAFWPGKLSRKSEEVQKVDA >Mature_743_residues MKKHPLHMLGRLVAGKNTQWITLSVWILITLLLSFTLPQVNSTKEPNPKNLPETAMSQQAEALMKKEFPNNAGNPLLVVW YRDGGLQSQDYKLIQDVYKELKASPLKEQSTLPPFDTIPEQVLSKSASKDGTSFVTPVFFNKSAGTDILKGNLDDLRKIV NSKVDVDPFKQKISDSGLHVRLSGPVGIQTDAVSLFSQADVKLLIATVLLVLVLLILLYRSPILAILPLLVVGFAYGIIS PTLGFLADHGWIKVDAQAISIMTVLLFGAGTDYCLFLISRYREYLLEEESKYKALQLAIKASGGAIIMSALTVVLGLGTL LLAHYGAFHRFAVPFSVAVFIMGIAALTILPALLLIFGRAAFFPFVPRTTSMNEELARRKKKVVKVKKSKGAFSKKLGDV VVRRPWTIIMLTVFVLGGLASFVPRIQYTYDLLESFPKDMPSREGFTLISDHFSAGELAPVKVVVDTKGKELPIKEELEK FSFVNTVKDPKEGKENKQIQMYEVSLAENPYSIEALDQIPKLKNSVEKVFKDAGISNAEDQLWIGGETASLYDTKQITER DEAVIIPVMISIIALLLLVYLRSIVAMIYLIVTVVLSFFSALGAGWLLLHYGMGVPAIQGAIPLYAFVFLVALGEDYNIF MVSEIWKNRKTQNHLDAVKNGVIQTGSVITSAGLILAGTFAVLGTLPIQVLVQFGIVTAIGVLLDTFIVRPLLVPAITVV LGRFAFWPGKLSRKSEEVQKVDA
Specific function: Unknown
COG id: COG2409
COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mmpL family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004869 - InterPro: IPR000731 [H]
Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81728; Mature: 81728
Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67
Prosite motif: PS50156 SSD
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKHPLHMLGRLVAGKNTQWITLSVWILITLLLSFTLPQVNSTKEPNPKNLPETAMSQQA CCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH EALMKKEFPNNAGNPLLVVWYRDGGLQSQDYKLIQDVYKELKASPLKEQSTLPPFDTIPE HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHH QVLSKSASKDGTSFVTPVFFNKSAGTDILKGNLDDLRKIVNSKVDVDPFKQKISDSGLHV HHHHHCCCCCCCCEECEEEECCCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEE RLSGPVGIQTDAVSLFSQADVKLLIATVLLVLVLLILLYRSPILAILPLLVVGFAYGIIS EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH PTLGFLADHGWIKVDAQAISIMTVLLFGAGTDYCLFLISRYREYLLEEESKYKALQLAIK HHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEEE ASGGAIIMSALTVVLGLGTLLLAHYGAFHRFAVPFSVAVFIMGIAALTILPALLLIFGRA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFPFVPRTTSMNEELARRKKKVVKVKKSKGAFSKKLGDVVVRRPWTIIMLTVFVLGGLA HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SFVPRIQYTYDLLESFPKDMPSREGFTLISDHFSAGELAPVKVVVDTKGKELPIKEELEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHH FSFVNTVKDPKEGKENKQIQMYEVSLAENPYSIEALDQIPKLKNSVEKVFKDAGISNAED HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QLWIGGETASLYDTKQITERDEAVIIPVMISIIALLLLVYLRSIVAMIYLIVTVVLSFFS CEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALGAGWLLLHYGMGVPAIQGAIPLYAFVFLVALGEDYNIFMVSEIWKNRKTQNHLDAVKN HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHHC GVIQTGSVITSAGLILAGTFAVLGTLPIQVLVQFGIVTAIGVLLDTFIVRPLLVPAITVV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGRFAFWPGKLSRKSEEVQKVDA HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKKHPLHMLGRLVAGKNTQWITLSVWILITLLLSFTLPQVNSTKEPNPKNLPETAMSQQA CCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH EALMKKEFPNNAGNPLLVVWYRDGGLQSQDYKLIQDVYKELKASPLKEQSTLPPFDTIPE HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHH QVLSKSASKDGTSFVTPVFFNKSAGTDILKGNLDDLRKIVNSKVDVDPFKQKISDSGLHV HHHHHCCCCCCCCEECEEEECCCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEE RLSGPVGIQTDAVSLFSQADVKLLIATVLLVLVLLILLYRSPILAILPLLVVGFAYGIIS EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH PTLGFLADHGWIKVDAQAISIMTVLLFGAGTDYCLFLISRYREYLLEEESKYKALQLAIK HHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEEE ASGGAIIMSALTVVLGLGTLLLAHYGAFHRFAVPFSVAVFIMGIAALTILPALLLIFGRA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFPFVPRTTSMNEELARRKKKVVKVKKSKGAFSKKLGDVVVRRPWTIIMLTVFVLGGLA HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SFVPRIQYTYDLLESFPKDMPSREGFTLISDHFSAGELAPVKVVVDTKGKELPIKEELEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHH FSFVNTVKDPKEGKENKQIQMYEVSLAENPYSIEALDQIPKLKNSVEKVFKDAGISNAED HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QLWIGGETASLYDTKQITERDEAVIIPVMISIIALLLLVYLRSIVAMIYLIVTVVLSFFS CEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALGAGWLLLHYGMGVPAIQGAIPLYAFVFLVALGEDYNIFMVSEIWKNRKTQNHLDAVKN HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHHC GVIQTGSVITSAGLILAGTFAVLGTLPIQVLVQFGIVTAIGVLLDTFIVRPLLVPAITVV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGRFAFWPGKLSRKSEEVQKVDA HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12000953 [H]