Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 117919831

Identifier: 117919831

GI number: 117919831

Start: 1598156

End: 1599400

Strand: Direct

Name: 117919831

Synonym: Shewana3_1383

Alternate gene names: NA

Gene position: 1598156-1599400 (Clockwise)

Preceding gene: 117919830

Following gene: 117919832

Centisome position: 32.14

GC content: 28.51

Gene sequence:

>1245_bases
GTGTTATATTTTTTAATTGTTTCAGTTATAATTCTTAGAATTACATTTTTAAAGTATTTTAATGGTTCTAGAAATATAGG
TTACATTTTGCCTTTATTTTTAGAATTAATTTTTATATATCCATTTTTTATTGTAGATATTCTTGGTTTGAAGTGGAGTA
TTTATGGTTTTATAGTGTTATATAGTAGTATACTCTCACTTCAAATAGGGTTACTCCCATTGAAATCTCTTCCTAATAAT
CGAGTCAACGCGGTTGTTATTAAGAAGAAAATATTATTGAATACGATTTATATTTCAATTCCATTTTACCTTGTCGGTGT
TTTAAGTAATTTTTCACTATCTCAGCTTGCTGATTTTAGTTTGTCAAATTATTTAAGTATTGCAAACTCTAGTGCGCTAG
AGCGATATTCTGGAACTCAAGTTCTAACTATCCAGTACAAAATAGGTTCTATTTTTTGCTACTATGCAATGTTTACTGTT
GGTTTTTTAGTTGGAACTAAGTCTGTTAAATGTAATAGTATAAAACATTATTATTTTTTAGCTGTATTACTTTTTTTGAT
TGCACTGCTTGACAGTTTTTTAATGGCTGCAAGAGCAGGAATGATGATGATGTCATTTTGCTTTTTTTCATCCTATTTCG
TTACATCTCAATACTTAAAGTCTGGAAAGTTAATTGCAATTTCGATTCCTATTATATTCAAGTTGCTTTCTGTGTTTTTT
TTAATATTTGGTTTTTTTCTTGTTATACAGATATTTCGTGGCGGAAAAGAAGATTATGATTTTTTAAATATTGTTAATCA
TCTTCTTACATGGTTTATCGGCCATATTTCTGCATTTTCAAATTGGATTGATGCTTATGATTTATACACAAAACCTAATT
TAGGTTTTAGCACATTGGCTGGTATATCCGATTTAATAGGTGTTAAGGAGCGAGATTCAGGAATATACGTTGCGACCGAT
ATTGGTGAAGGACGTTTAACAAATATATATACTAGCTTGAGGCCATTAATTGAAGATTATTCAATATTGGGTGTTTTTGT
TGTTTATACAATATTTGGCCTGATTTTCTCATTTTTTATTAAGACTAAGCATATGCAATTTAAGGGCGTTCTATTTATAT
GCTGTGTTGGAATAACCGTGTATTTGTGTTGGTCTTTTGTGACCAGTATTTTTGTGTACAATACAATATTATTTTCCTTT
TTTTGTTTTTCTCTAGCTTCATTGTTTTTTGTTAAGTTTAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGTTGCAAATGCATCTATAAGGTTGGCTTATTGTTATGTTATTTAGTGTAGATGTTGCAGGTTTATTTTAGCTTTATC
TCATACGATGAGAACCTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAAAAACTAACATTTAGAGTGCAACTCTGCACAAAAGGGGCATAAATTGCAAATACAAAAATCTTCCTCAAATTTTAAG
TGGTGTAAATTTAAATGAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 414; Mature: 414

Protein sequence:

>414_residues
MLYFLIVSVIILRITFLKYFNGSRNIGYILPLFLELIFIYPFFIVDILGLKWSIYGFIVLYSSILSLQIGLLPLKSLPNN
RVNAVVIKKKILLNTIYISIPFYLVGVLSNFSLSQLADFSLSNYLSIANSSALERYSGTQVLTIQYKIGSIFCYYAMFTV
GFLVGTKSVKCNSIKHYYFLAVLLFLIALLDSFLMAARAGMMMMSFCFFSSYFVTSQYLKSGKLIAISIPIIFKLLSVFF
LIFGFFLVIQIFRGGKEDYDFLNIVNHLLTWFIGHISAFSNWIDAYDLYTKPNLGFSTLAGISDLIGVKERDSGIYVATD
IGEGRLTNIYTSLRPLIEDYSILGVFVVYTIFGLIFSFFIKTKHMQFKGVLFICCVGITVYLCWSFVTSIFVYNTILFSF
FCFSLASLFFVKFK

Sequences:

>Translated_414_residues
MLYFLIVSVIILRITFLKYFNGSRNIGYILPLFLELIFIYPFFIVDILGLKWSIYGFIVLYSSILSLQIGLLPLKSLPNN
RVNAVVIKKKILLNTIYISIPFYLVGVLSNFSLSQLADFSLSNYLSIANSSALERYSGTQVLTIQYKIGSIFCYYAMFTV
GFLVGTKSVKCNSIKHYYFLAVLLFLIALLDSFLMAARAGMMMMSFCFFSSYFVTSQYLKSGKLIAISIPIIFKLLSVFF
LIFGFFLVIQIFRGGKEDYDFLNIVNHLLTWFIGHISAFSNWIDAYDLYTKPNLGFSTLAGISDLIGVKERDSGIYVATD
IGEGRLTNIYTSLRPLIEDYSILGVFVVYTIFGLIFSFFIKTKHMQFKGVLFICCVGITVYLCWSFVTSIFVYNTILFSF
FCFSLASLFFVKFK
>Mature_414_residues
MLYFLIVSVIILRITFLKYFNGSRNIGYILPLFLELIFIYPFFIVDILGLKWSIYGFIVLYSSILSLQIGLLPLKSLPNN
RVNAVVIKKKILLNTIYISIPFYLVGVLSNFSLSQLADFSLSNYLSIANSSALERYSGTQVLTIQYKIGSIFCYYAMFTV
GFLVGTKSVKCNSIKHYYFLAVLLFLIALLDSFLMAARAGMMMMSFCFFSSYFVTSQYLKSGKLIAISIPIIFKLLSVFF
LIFGFFLVIQIFRGGKEDYDFLNIVNHLLTWFIGHISAFSNWIDAYDLYTKPNLGFSTLAGISDLIGVKERDSGIYVATD
IGEGRLTNIYTSLRPLIEDYSILGVFVVYTIFGLIFSFFIKTKHMQFKGVLFICCVGITVYLCWSFVTSIFVYNTILFSF
FCFSLASLFFVKFK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47248; Mature: 47248

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLYFLIVSVIILRITFLKYFNGSRNIGYILPLFLELIFIYPFFIVDILGLKWSIYGFIVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSSILSLQIGLLPLKSLPNNRVNAVVIKKKILLNTIYISIPFYLVGVLSNFSLSQLADFS
HHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LSNYLSIANSSALERYSGTQVLTIQYKIGSIFCYYAMFTVGFLVGTKSVKCNSIKHYYFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
AVLLFLIALLDSFLMAARAGMMMMSFCFFSSYFVTSQYLKSGKLIAISIPIIFKLLSVFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
LIFGFFLVIQIFRGGKEDYDFLNIVNHLLTWFIGHISAFSNWIDAYDLYTKPNLGFSTLA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
GISDLIGVKERDSGIYVATDIGEGRLTNIYTSLRPLIEDYSILGVFVVYTIFGLIFSFFI
HHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTKHMQFKGVLFICCVGITVYLCWSFVTSIFVYNTILFSFFCFSLASLFFVKFK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLYFLIVSVIILRITFLKYFNGSRNIGYILPLFLELIFIYPFFIVDILGLKWSIYGFIVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSSILSLQIGLLPLKSLPNNRVNAVVIKKKILLNTIYISIPFYLVGVLSNFSLSQLADFS
HHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LSNYLSIANSSALERYSGTQVLTIQYKIGSIFCYYAMFTVGFLVGTKSVKCNSIKHYYFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
AVLLFLIALLDSFLMAARAGMMMMSFCFFSSYFVTSQYLKSGKLIAISIPIIFKLLSVFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH
LIFGFFLVIQIFRGGKEDYDFLNIVNHLLTWFIGHISAFSNWIDAYDLYTKPNLGFSTLA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
GISDLIGVKERDSGIYVATDIGEGRLTNIYTSLRPLIEDYSILGVFVVYTIFGLIFSFFI
HHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTKHMQFKGVLFICCVGITVYLCWSFVTSIFVYNTILFSFFCFSLASLFFVKFK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA