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The map label for this gene is 116516512

Identifier: 116516512

GI number: 116516512

Start: 1242332

End: 1243966

Strand: Reverse

Name: 116516512

Synonym: SPD_1213

Alternate gene names: NA

Gene position: 1243966-1242332 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116515435

Following gene: 116516182

Centisome position: 60.8

GC content: 38.78

Gene sequence:

>1635_bases
ATGCGTCTCAAGGTCATTAAAAAATTAGTTGATATCAATATCCTTTATTCATCTCAAGAAGCTAATCTGGCTAATCTACG
AAAGAAGCAGGCTAAGAATCCTGGGAAAAAAGTAAATGTTTCCGCTAGAGTCTTAAGTTCTTACATTTTTTCCAGTCTCT
TGATGATCATCTGTTTTAGTAATATAGCCATTCATTTTCCTTTTGAGGAAATACATATTTATTTTAGCTCGATGATTGCT
ATTTTACTAGTGATTGCCTTTTCAACTTCTTTAACGGCCTTTTACAATGTCTTTTATGAGAGTAAGGATTTGATATCGTA
TAGGCCCTATGCCTTTAAAGAATCAGAGATTATAATTGCTAAAGGACTGTCTGTCCTTTTGCCAGCTCTAACTGGAATTG
TACCAATCCTAGCTTATTTTCTGGTCCTCTACATTAGGCTAGCTCCTTCTCTATGGCTGGGTTTGCCTTTGATGCTACTG
TCCTTGACCTTATTATTTGTCTCTGTGGCTCTAGTGATGGTAGTGGCAGTGCATTTCTTGGCTCAAACTAGGGTCTTCAG
AAAGTATCAGTCTATTTTTTCGAATGTGATGATTGGGATAGGAGTTCTCATACCTTTAATATTTATCTTCTTTCTTCAGT
CGACTTTTGGAAGTATTGTTGACAAAGTTAGAGACATTCCATTTCTCCTTTATCCTCTTCATATCTTTTACAAAATAGCA
GTGGAGCCTTTTTCGACAGAAGCCTTAGTGGGTCTGCTCGCTTGGATAGGACTAACTCTCTTCCTGCTTTATCTGACCAA
AAAGAAGGTCCTTCCTCGTTTTTATGACGTGATCCTGCTTAATAGTGAGGATAAGGTCAAAAAAGAACGTCGCAGCAAGG
AGAGAATTTCAACCACTAAAAAGGGATTTTTCCGCATGGTTTTACGCTACCACCTCACCCTCTTGGGACAGGGTACTGGC
GTGGTTACAGTGCTTTTTACAAGTGCTTTCCTTCCTTATCTCATGATGATCGGTCTGATTTCCAAAATCCGAGATTCTCA
GATAGTTCCAGACATTCATCCTCCATACTGGTTACCCTTGTTTTTTATAGCTCTCTTTATAGCAGTTGTCAATAACAATA
TCACCAGCCTGCATTCAATTGCCTTGTCCTTGGAGAGGGAAAATGTTGATTTTCTTAAGAGTTTACCCTTTGACTTTGCT
CGTTATGTGAAAGTGAAATTTTGGATTATATATGCCGTCCAGTCCTTTTTACCAATTCTGACTTTACTTGGTCTTTCTCT
ATATCTAGGCTTGCCTATCATTTCGATGATTTACCTTATTGTGGCATGGATCCTTGCCAGTGTCATCCTTTCTTGCCACC
ATTACTTTAAGGACGTTAAAAATCTGTCAACCAATTGGAGTAGCATTACGGACCTGGTGAATCGTTCAAATGGCATAGTC
GCCATAGTTTTATTGTTTATTTATAGTGCAATCCTGATGGCCCTTGTAATTGGGAGCATATTCTTGGTTCAGTCTCTCTC
CACTATCCTTGCCATCAGCTTGGGAGTAGGAGCTCTTATCCTCCTGCTTGCTCTTGCTATTTTTGGCTATCATTATTACC
TGTCACGCATATTGGCAGAAATAGAAAAAAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTATTGTGGTAGTGTAGAGGACTTGAGAAAAGATTACCCAGACCAGTCTTTGGAAAGTATCTACCTTAGTCTTGCTGG
TAGAAAAGAGGAGGTTGCGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATGGTTGGTCGCTTGCTTGATAAATTCAATTCGACAAACGCTTTTATAGTTTGTTAGAATGTAGTTGTAAATGATTAAG
ATTGGTAATCAAAAATATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter Permease; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 544; Mature: 544

Protein sequence:

>544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMIICFSNIAIHFPFEEIHIYFSSMIA
ILLVIAFSTSLTAFYNVFYESKDLISYRPYAFKESEIIIAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLVLYIRLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVALVMVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEDKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VVTVLFTSAFLPYLMMIGLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFIALFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIYAVQSFLPILTLLGLSLYLGLPIISMIYLIVAWILASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSTILAISLGVGALILLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR

Sequences:

>Translated_544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMIICFSNIAIHFPFEEIHIYFSSMIA
ILLVIAFSTSLTAFYNVFYESKDLISYRPYAFKESEIIIAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLVLYIRLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVALVMVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEDKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VVTVLFTSAFLPYLMMIGLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFIALFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIYAVQSFLPILTLLGLSLYLGLPIISMIYLIVAWILASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSTILAISLGVGALILLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR
>Mature_544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMIICFSNIAIHFPFEEIHIYFSSMIA
ILLVIAFSTSLTAFYNVFYESKDLISYRPYAFKESEIIIAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLVLYIRLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVALVMVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEDKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VVTVLFTSAFLPYLMMIGLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFIALFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIYAVQSFLPILTLLGLSLYLGLPIISMIYLIVAWILASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSTILAISLGVGALILLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61649; Mature: 61649

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMIICFS
CCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIAIHFPFEEIHIYFSSMIAILLVIAFSTSLTAFYNVFYESKDLISYRPYAFKESEIIIA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCEEHH
KGLSVLLPALTGIVPILAYFLVLYIRLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVALVMVVAVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEDKVKKERRSKERISTTK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVVTVLFTSAFLPYLMMIGLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH
FFIALFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIYAVQSFLPIL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGLSLYLGLPIISMIYLIVAWILASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSTILAISLGVGALILLLALAIFGYHYYLSRILAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEKR
HHCC
>Mature Secondary Structure
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMIICFS
CCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIAIHFPFEEIHIYFSSMIAILLVIAFSTSLTAFYNVFYESKDLISYRPYAFKESEIIIA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCEEHH
KGLSVLLPALTGIVPILAYFLVLYIRLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVALVMVVAVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEDKVKKERRSKERISTTK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVVTVLFTSAFLPYLMMIGLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH
FFIALFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIYAVQSFLPIL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGLSLYLGLPIISMIYLIVAWILASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSTILAISLGVGALILLLALAIFGYHYYLSRILAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEKR
HHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA