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The map label for this gene is csp2H

Identifier: 116515655

GI number: 116515655

Start: 321951

End: 323114

Strand: Direct

Name: csp2H

Synonym: SPD_0323

Alternate gene names: NA

Gene position: 321951-323114 (Clockwise)

Preceding gene: 116516693

Following gene: 116516743

Centisome position: 15.73

GC content: 26.98

Gene sequence:

>1164_bases
ATGCTCTCTCTATATACAGGAAATGGTGTTACTCCTGTTATTGTTATTTTATTTTTTTTGTCGGCATTGTATTCTTTATA
TCGAAAAAGCAAATTAAGTATAAATTTAAATTTTTTGTTTATATATATTTTTTTAGCCTACTATTTGTTATTAACAGTTA
TATTCACACAAGATTTATTGGTGATGACTTCTAAATTTATATTATTTCCAATATTTGTTTATTATATAATACCTAAAAAT
ATAAATGGCGTTATAAGAATACTATCTATTTTTAAATCTTTCATTGGTTTTACTGCTATTTTTGGATTATATGAATATAT
GCAACATTTCAATCTTATGGTGAATTTTGTAAAAATAGATGCAGTTAAATGGATACAAACGATGAATTTGAATAGTGTGT
ATTATCCCAGTTCAATATTTCTCCACTACACCTATTTTGCATATGTTTTGTTACTAGCTTTTATTTTGGTAATTGTTATC
CCATATAAGAACCGAGTGTTAAATTTAGTTTATAAAACACTTATTGCAATTTCAATTTTTTTGCCCCAATCTCGTATAGT
TTGGATAGCTTTTGGGGTAATTTTAATTCTTTCGTTTATACTAAATAGACAGGGGATATTAACCTATAGAAAGTTGAGTG
TTATAGTACTTATTTTAATTATAGTAGTCTCTCTCTGCCTATATTTTGATGTGTTTGCGTTTATTTCTAATTATATAAGT
TTAAGATTTTCTTCACTTTATCGTTATGGACTGGCTGATGGTTCTCTAGGTCAACGTATTGGAACTCTTAGAAATTGGGA
AAATTATTTAGACTCTGATACTATAAAGGCTATTATTGGGTCAGGATTTGGTGGTGTCAATAGTTACTTGAGTACTTATT
CATTTTTTAATGGCTATACTACAGCTGATTCAACAGTGACAAGTTTCCTTATTGATACTGGGGTTATTGGCTTATTTATC
TTTTTATTATCTATGTTTCAGATATTAGTAATAGTGGTAAAAGGAAAAGGAATTTTTAGAGAATTAGCGTTATATACTAT
TGTAGCTTCTTCTATAGTTAGTTTAACAATTGATTTTTGGGCAAATTATGTTATTCTTCATATATTTTACGTGGTTATTA
TCTGTGCATTTATAGGAATGAGATTGACTAAGCAAGAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTCTTGTTTAGAATTTGAGAAGATTATATCAGGGGTATATATTGAAAACGGTAAATAGTATAACAAATTATATTTTAT
TATTAGTATGGATAGTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATGGATGGGGAAATTCAAGGTTGTATGATAATGTGCAGAAGGCATATGGAATAGTTGTTTTTTAGATTTTTAATTTAT
TTTTTAATACATAATTTTCT

Product: polysaccharide polymerase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 387; Mature: 387

Protein sequence:

>387_residues
MLSLYTGNGVTPVIVILFFLSALYSLYRKSKLSINLNFLFIYIFLAYYLLLTVIFTQDLLVMTSKFILFPIFVYYIIPKN
INGVIRILSIFKSFIGFTAIFGLYEYMQHFNLMVNFVKIDAVKWIQTMNLNSVYYPSSIFLHYTYFAYVLLLAFILVIVI
PYKNRVLNLVYKTLIAISIFLPQSRIVWIAFGVILILSFILNRQGILTYRKLSVIVLILIIVVSLCLYFDVFAFISNYIS
LRFSSLYRYGLADGSLGQRIGTLRNWENYLDSDTIKAIIGSGFGGVNSYLSTYSFFNGYTTADSTVTSFLIDTGVIGLFI
FLLSMFQILVIVVKGKGIFRELALYTIVASSIVSLTIDFWANYVILHIFYVVIICAFIGMRLTKQEK

Sequences:

>Translated_387_residues
MLSLYTGNGVTPVIVILFFLSALYSLYRKSKLSINLNFLFIYIFLAYYLLLTVIFTQDLLVMTSKFILFPIFVYYIIPKN
INGVIRILSIFKSFIGFTAIFGLYEYMQHFNLMVNFVKIDAVKWIQTMNLNSVYYPSSIFLHYTYFAYVLLLAFILVIVI
PYKNRVLNLVYKTLIAISIFLPQSRIVWIAFGVILILSFILNRQGILTYRKLSVIVLILIIVVSLCLYFDVFAFISNYIS
LRFSSLYRYGLADGSLGQRIGTLRNWENYLDSDTIKAIIGSGFGGVNSYLSTYSFFNGYTTADSTVTSFLIDTGVIGLFI
FLLSMFQILVIVVKGKGIFRELALYTIVASSIVSLTIDFWANYVILHIFYVVIICAFIGMRLTKQEK
>Mature_387_residues
MLSLYTGNGVTPVIVILFFLSALYSLYRKSKLSINLNFLFIYIFLAYYLLLTVIFTQDLLVMTSKFILFPIFVYYIIPKN
INGVIRILSIFKSFIGFTAIFGLYEYMQHFNLMVNFVKIDAVKWIQTMNLNSVYYPSSIFLHYTYFAYVLLLAFILVIVI
PYKNRVLNLVYKTLIAISIFLPQSRIVWIAFGVILILSFILNRQGILTYRKLSVIVLILIIVVSLCLYFDVFAFISNYIS
LRFSSLYRYGLADGSLGQRIGTLRNWENYLDSDTIKAIIGSGFGGVNSYLSTYSFFNGYTTADSTVTSFLIDTGVIGLFI
FLLSMFQILVIVVKGKGIFRELALYTIVASSIVSLTIDFWANYVILHIFYVVIICAFIGMRLTKQEK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44404; Mature: 44404

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSLYTGNGVTPVIVILFFLSALYSLYRKSKLSINLNFLFIYIFLAYYLLLTVIFTQDLL
CCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMTSKFILFPIFVYYIIPKNINGVIRILSIFKSFIGFTAIFGLYEYMQHFNLMVNFVKID
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVKWIQTMNLNSVYYPSSIFLHYTYFAYVLLLAFILVIVIPYKNRVLNLVYKTLIAISIF
HHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPQSRIVWIAFGVILILSFILNRQGILTYRKLSVIVLILIIVVSLCLYFDVFAFISNYIS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSSLYRYGLADGSLGQRIGTLRNWENYLDSDTIKAIIGSGFGGVNSYLSTYSFFNGYT
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
TADSTVTSFLIDTGVIGLFIFLLSMFQILVIVVKGKGIFRELALYTIVASSIVSLTIDFW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANYVILHIFYVVIICAFIGMRLTKQEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLSLYTGNGVTPVIVILFFLSALYSLYRKSKLSINLNFLFIYIFLAYYLLLTVIFTQDLL
CCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMTSKFILFPIFVYYIIPKNINGVIRILSIFKSFIGFTAIFGLYEYMQHFNLMVNFVKID
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVKWIQTMNLNSVYYPSSIFLHYTYFAYVLLLAFILVIVIPYKNRVLNLVYKTLIAISIF
HHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPQSRIVWIAFGVILILSFILNRQGILTYRKLSVIVLILIIVVSLCLYFDVFAFISNYIS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSSLYRYGLADGSLGQRIGTLRNWENYLDSDTIKAIIGSGFGGVNSYLSTYSFFNGYT
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
TADSTVTSFLIDTGVIGLFIFLLSMFQILVIVVKGKGIFRELALYTIVASSIVSLTIDFW
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANYVILHIFYVVIICAFIGMRLTKQEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA