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The map label for this gene is 116492494

Identifier: 116492494

GI number: 116492494

Start: 763934

End: 766549

Strand: Reverse

Name: 116492494

Synonym: PEPE_0726

Alternate gene names: NA

Gene position: 766549-763934 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116492502

Following gene: 116492485

Centisome position: 41.83

GC content: 34.94

Gene sequence:

>2616_bases
ATGGATTTTATTAAGAAACATCAGAATTTAATTTTAAGTGGATGTATCCCTGCTTGCATTATGCTAGCATACTTCGTTTA
TCGCGGATTTGCTCCATTTGGAACATCTAGTCTATTAACTGTCGATATGGGACAGCAATATGTCGCGTTCTATGAATATT
TCCGCAGTACACTTATCAGTCATCCTGGTCAGTTTTTCTATTCTTTTTCCAATGGTTTAGGTGGAGATATGTTTGGTACT
TGGGCTTATTATCTTTTCAGTCCAACCAATTTGCTGCTTTTGTTTTTTAAAAAAGAGAGTATCACTTCCGGAATCCTAGT
AATAACTGTACTAAAATACGCTTTAGCTGGACTAACATCTGCTATTTACTTGCAGCATCTTGCTCAAAAAAATAAAATCA
CCACTCCGCGAGCTAGTGTTGTTGGTTTTGCTACTGCCTATAGTTTGATGGCTTTTTCCATCGCCAATCAACTTAACCTT
TTTTGGCTAGATGCTCCCATCTTATTACCCTTAATTATTCTTGGTTTGGATGCTCTAATTGATCAAAATCAAATTAAAAT
TTTTGTAACGACGATGAGCTTAATGGTCATTATAAATTATTACTTTGCTTATATGATTGGTATTTTCACCTTAATTTACT
TTTTATGGCGAGCTTCGCCGTTATCATGGAAAAAGATTTTTCACTATGTTCAATCTTGGATTTACGTTCTAGTTTTTTCC
GCCATTGCTTGGATGCCGACATTATGGGCTCTCCTCCATGGTAAAGCACAGTATACAGAAAACTCAATTAAATGGTCTTT
TGCTTACACACCACTTAAAATGTTAACTAAATTAATGCCAGGGACATTCAGCTTTAAGCAAATGTCTGATGGTCTACCAA
ATATTTACGTGGGAATGTTTGTGTTAATGGCTTTTGTCGCCTACTTTTTCAATAAAAATATTGGTTTAAAAAGACGACTT
GGAGCTCTATTAATAACTGCTTTTTTCTTACTTTCTTTCTGTTTCACCCCATTAAACTTATTCTGGCATGCCATGCAATT
TCCATGGTGGTATGCATATCGTTTTAGTTTCATTTTTAGTTTCTGGGTTCTTATTTTAGCTTTTGAAGGACTATTACATC
CCATCCAAGAAGCACTTTTAAAACCCATCATCGCTGGTTTAGCACTCATTAGTCTTGTTGCTTATATATCAACTAAAAAT
TTACCAAAAATTAGCGACTTTATGACCGAGAATCAAATTCAATTTGGAGTTATTATCTTTATTGCAGCGCTTGTCTTTTG
GGTTGGCTTCCAAGCTAAAGACTTTAATCCGGGGCTCACGCCAATTTTAGTTTGTTTTATGGCCCTAGATTTATCTGTCA
ATGCTATCTGGTCGTTGAATCGTATAAGTTATGTTAGCCAAACCGAATTTGCTCAATATAGCTCAGCAGCTCGCAATGCA
ATCGACCAGATTAAAGACCAAGGTCATCATTTTTCGAGGATTGGTACAAATTACTCTAGGACTAAAAATGATCCAATTCA
ATTAGGTTTCAATAGTGGATCAAGTTTTAACTCTAACCTAGAAACTAATATGCTTGATATGATGAGTGCTCTGGGCCAAC
CTACAACTTCCGGAAATGTGACCTATATGAACGGAACCTTGATCTCTGATGCCCTTCTGAACTTCAAGTATTGGTCATTT
GTAAATAACGAAACTGACCATAATCCTTTTTCAACTAAAAGTGTTCGGCACGATGTTTTAAAAAGGTATCATCAGATTGG
TAACACTAAATATGCTGATAACTACTTAAATCAATATGCCCTTCCATTAGGTCTTACTACTACTCATCCGGTAAGTAATA
CCAAAAAAATTGGAAATCCTTTGCAATATCAATCTAATTTACTCAAAAAAATCAGTAATCATTCTCAAAATTTATTTACA
GACATTACTAACCAGGCCCAAATTTACTTTTCAAATGTTACTTCCACGCCTAATATTAAAAATGGTCTGTTAACTAAACA
GAAACTTAATAAGGCTGCCACGGTAACTTTTGAATATGAGCCAAAAAATAATAATCCAATTTATATTACCGCCGGATCAC
AACTTTCACATGATAATGCGGATATCTTCGTTAACAACCAACGAATTACTGAAGACCTTGATTATGACCAACCAATTGTT
TTATCGATTGCAGATCAGATGAAAGGCAAAAAAGTTCGTATTCAAATTGTTTTAAAGAAGCAAAGTTTACTTTTATCTGA
TTTTAGTGTCGCTGAGCTTCATTACGGCACATTTAAGCAAGATTACCAAGCTGCTAAGACAAATAGTCTAACGCAGGTGA
AAAACGCTGGGAACGTAGTCACAGGCAATTTAAACGTTAATTCTGATAAACCCTACTTATTCACTTCCATCCCTTACAGT
TCGGGATGGCACATTAAAATTGATGGTAAAACGATTCCTACTTCTAAAGTCGGTAATTACTTCTTAGGAAGCAACGTAAA
ATTAACTTCTGGCAAACATCAAATCAAGTTTACTTATATACCACCATTCTTTATGCTAGGTATGTCTATTACCATAATTG
GTTTTCTAATGCTCGTCTTGCTCCAACAAAAAAAGCTTTTCACTCATAAGAAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTCTACCAGAAAATATATCGGTGTACTAATAGTATTAACAAAGTCTTAAGCATGTTTTGTGCTATCCTATTATTATCA
ATTTAAAGGTTGGGATTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGCTTTTTTTAATATGATTAGTTTTTAAGCATTTTTAACGGTTAGGATTTTAACTTTCATATCTCCACCGGGAGTAGC
GATTGAAACTTCATCGCCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 871; Mature: 871

Protein sequence:

>871_residues
MDFIKKHQNLILSGCIPACIMLAYFVYRGFAPFGTSSLLTVDMGQQYVAFYEYFRSTLISHPGQFFYSFSNGLGGDMFGT
WAYYLFSPTNLLLLFFKKESITSGILVITVLKYALAGLTSAIYLQHLAQKNKITTPRASVVGFATAYSLMAFSIANQLNL
FWLDAPILLPLIILGLDALIDQNQIKIFVTTMSLMVIINYYFAYMIGIFTLIYFLWRASPLSWKKIFHYVQSWIYVLVFS
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DITNQAQIYFSNVTSTPNIKNGLLTKQKLNKAATVTFEYEPKNNNPIYITAGSQLSHDNADIFVNNQRITEDLDYDQPIV
LSIADQMKGKKVRIQIVLKKQSLLLSDFSVAELHYGTFKQDYQAAKTNSLTQVKNAGNVVTGNLNVNSDKPYLFTSIPYS
SGWHIKIDGKTIPTSKVGNYFLGSNVKLTSGKHQIKFTYIPPFFMLGMSITIIGFLMLVLLQQKKLFTHKK

Sequences:

>Translated_871_residues
MDFIKKHQNLILSGCIPACIMLAYFVYRGFAPFGTSSLLTVDMGQQYVAFYEYFRSTLISHPGQFFYSFSNGLGGDMFGT
WAYYLFSPTNLLLLFFKKESITSGILVITVLKYALAGLTSAIYLQHLAQKNKITTPRASVVGFATAYSLMAFSIANQLNL
FWLDAPILLPLIILGLDALIDQNQIKIFVTTMSLMVIINYYFAYMIGIFTLIYFLWRASPLSWKKIFHYVQSWIYVLVFS
AIAWMPTLWALLHGKAQYTENSIKWSFAYTPLKMLTKLMPGTFSFKQMSDGLPNIYVGMFVLMAFVAYFFNKNIGLKRRL
GALLITAFFLLSFCFTPLNLFWHAMQFPWWYAYRFSFIFSFWVLILAFEGLLHPIQEALLKPIIAGLALISLVAYISTKN
LPKISDFMTENQIQFGVIIFIAALVFWVGFQAKDFNPGLTPILVCFMALDLSVNAIWSLNRISYVSQTEFAQYSSAARNA
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VNNETDHNPFSTKSVRHDVLKRYHQIGNTKYADNYLNQYALPLGLTTTHPVSNTKKIGNPLQYQSNLLKKISNHSQNLFT
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SGWHIKIDGKTIPTSKVGNYFLGSNVKLTSGKHQIKFTYIPPFFMLGMSITIIGFLMLVLLQQKKLFTHKK
>Mature_871_residues
MDFIKKHQNLILSGCIPACIMLAYFVYRGFAPFGTSSLLTVDMGQQYVAFYEYFRSTLISHPGQFFYSFSNGLGGDMFGT
WAYYLFSPTNLLLLFFKKESITSGILVITVLKYALAGLTSAIYLQHLAQKNKITTPRASVVGFATAYSLMAFSIANQLNL
FWLDAPILLPLIILGLDALIDQNQIKIFVTTMSLMVIINYYFAYMIGIFTLIYFLWRASPLSWKKIFHYVQSWIYVLVFS
AIAWMPTLWALLHGKAQYTENSIKWSFAYTPLKMLTKLMPGTFSFKQMSDGLPNIYVGMFVLMAFVAYFFNKNIGLKRRL
GALLITAFFLLSFCFTPLNLFWHAMQFPWWYAYRFSFIFSFWVLILAFEGLLHPIQEALLKPIIAGLALISLVAYISTKN
LPKISDFMTENQIQFGVIIFIAALVFWVGFQAKDFNPGLTPILVCFMALDLSVNAIWSLNRISYVSQTEFAQYSSAARNA
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DITNQAQIYFSNVTSTPNIKNGLLTKQKLNKAATVTFEYEPKNNNPIYITAGSQLSHDNADIFVNNQRITEDLDYDQPIV
LSIADQMKGKKVRIQIVLKKQSLLLSDFSVAELHYGTFKQDYQAAKTNSLTQVKNAGNVVTGNLNVNSDKPYLFTSIPYS
SGWHIKIDGKTIPTSKVGNYFLGSNVKLTSGKHQIKFTYIPPFFMLGMSITIIGFLMLVLLQQKKLFTHKK

Specific function: Unknown

COG id: COG4485

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98818; Mature: 98818

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDFIKKHQNLILSGCIPACIMLAYFVYRGFAPFGTSSLLTVDMGQQYVAFYEYFRSTLIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHC
HPGQFFYSFSNGLGGDMFGTWAYYLFSPTNLLLLFFKKESITSGILVITVLKYALAGLTS
CCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIYLQHLAQKNKITTPRASVVGFATAYSLMAFSIANQLNLFWLDAPILLPLIILGLDALI
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHC
DQNQIKIFVTTMSLMVIINYYFAYMIGIFTLIYFLWRASPLSWKKIFHYVQSWIYVLVFS
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIAWMPTLWALLHGKAQYTENSIKWSFAYTPLKMLTKLMPGTFSFKQMSDGLPNIYVGMF
HHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHH
VLMAFVAYFFNKNIGLKRRLGALLITAFFLLSFCFTPLNLFWHAMQFPWWYAYRFSFIFS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FWVLILAFEGLLHPIQEALLKPIIAGLALISLVAYISTKNLPKISDFMTENQIQFGVIIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHH
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EEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHC
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CCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCC
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TGNLNVNSDKPYLFTSIPYSSGWHIKIDGKTIPTSKVGNYFLGSNVKLTSGKHQIKFTYI
EEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCEECCCHHCCCEECCCCEEEECCCEEEEEEEC
PPFFMLGMSITIIGFLMLVLLQQKKLFTHKK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MDFIKKHQNLILSGCIPACIMLAYFVYRGFAPFGTSSLLTVDMGQQYVAFYEYFRSTLIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHC
HPGQFFYSFSNGLGGDMFGTWAYYLFSPTNLLLLFFKKESITSGILVITVLKYALAGLTS
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VLMAFVAYFFNKNIGLKRRLGALLITAFFLLSFCFTPLNLFWHAMQFPWWYAYRFSFIFS
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TGNLNVNSDKPYLFTSIPYSSGWHIKIDGKTIPTSKVGNYFLGSNVKLTSGKHQIKFTYI
EEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCEECCCHHCCCEECCCCEEEECCCEEEEEEEC
PPFFMLGMSITIIGFLMLVLLQQKKLFTHKK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA