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Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113477223

Identifier: 113477223

GI number: 113477223

Start: 5775407

End: 5777149

Strand: Reverse

Name: 113477223

Synonym: Tery_3759

Alternate gene names: NA

Gene position: 5777149-5775407 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113477226

Following gene: 113477222

Centisome position: 74.54

GC content: 33.22

Gene sequence:

>1743_bases
ATGGTAATTTCAAATTTACATAAATTTTTGACTCATCCTATTAATAAAAAATCCTATCAAGGGGTGATATTTTGGTTTAG
TATTAGCATGACTTTTGCTGTTATTTATGGTTTTTTAGCAGTTAAAAAAGCTTTTATTAGTAGCCTTAGTGTTCAAGATG
ATGCTAGACAACATATTTTTTGGATGCAACGTTTTTTTGATCCTGATTTATTTCCTAATGATTTAATTGCTGACTATTTT
CAGTCGGTGGCTCCAGCCGGATATACTTGGCTTTATAAAAGTGCAGCATTTGTAGGAATTAATCCGTTGATTTTAGCAAA
AATTATTCCTTTTATCTTGGGTTTAATCTGTACTTACTATATTTTTAGAATTACTTTAGAAATATTGCCGGTCCCAATGG
CAGGGTTTATTGCTACTTTGGTAATGAATCAGGCTATTTGGATGAAAGATGATGTGGCTTCGGCTACGCCTAGAGCATTT
GTTTATCCATTTTTTATGGCTTTTTTATATTATTTAATCTGTGGTTCTTTAGTCAGAATGGGGATAGCGATCGCTCTGGT
GGGATTATTTTATCCACAGTATGTTTTTGTGGCTTCTGGAATGTTAATTTTGAGGTTGATTTGCTGGAGAAATGGCAGGT
TTCAATTCTCATCGAAAAAACAAGATTTTATATTTTGTGGAGTGGGTTTAAGTATGGCATTTTTTATTTTATTACCTTAT
GCTTTAACTTCTTCGGAATTCGGACCTGCTATTAGTCGAGAAGCAGCAATGAAATTAAGAGAATTTTATCCCAATGGGAG
GAGTACATTTTTTCATGTTCATCCAAAAGATTTTTGGTTAACTGGCAAACGTAGTGGAATGTTTCCTAAGTCTTTGTTTA
CTCCTGCTACTCAATGTGCGGGGTTAGTATTACCCTTTTTATTGTCTTTTGGTTCTGCTTTTCCTTTAATTAAAAATATT
ACTAGCCGTATTTGGTTATTACTGCATTTATTATTGTCATCTTTGGGAATGTTTTTTATTGCCCACGTCTTACTTTTTCG
ACTACATCTTCCTAGTAGATATACAGGATTAAGTTTCCGCATAATTATTGCTTTGGCAACGGCGATCGCTCTTACTTTGA
TTATTGATGCTTTATTTAATTGGGCAAAAAATATACACAAGTTTCCTGTTGCATTTCGGGGTATTATTTCTTTAAGTTTA
ATAGGTTTAATTCTGGCATCTCTGGTGTTATATCCTTCTTTTGTTAAAGGTTTTCCTCTGGTTAAATATAAGGTGGGAAG
GGCTACATATTTATATGATTTTTTTCAAGAACAACCTAAAGATATTCTGATTGCTTCTTTGGAAGAAGAGGCGAATTTAT
TACCTACATTTGCTCAACGTTCTATTTTGTTGGGTAGGGAATATGCTATTCCTTATCAAGTTGGTTATTATAGTCAATTT
CGCGAACGAACTATAGATTTAATTGTGGCTCAATATAGTTCGGATTTAACGGATGTTAAAGATTTTATTCAAAAGTATGG
AATTGATTTTTGGATGGTACATCGTGGTGCTTTTACGCCAGAATATGTTGAGGATAATAGTTGGTTAATGCAATATAAAT
TTGCACAAGAGGCGGTTACTTTTTTGCAGTTAGGAAATATTCCTGCTTTGGCAACAACTATATCTAATTGTGTTGTTTTT
CAGAGTGATAGTTTATTTGTTTTGGATGCTAATTGTATACTTAGGAAGGGTGTAGGGGAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGGTGAAACTGTTTAGATTCAAGATTAGCTTAATAAATTAGAAAAAAATATTTTAAATATCTATTAAAATTAGCTTAAT
TAATAAATTTTTCCTAGTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGTAGGGAAGTGTGAGAGGAGTTAGTCTAGTAGAGTAGTGGGCTATTGCATCTAAAACGATGCAATAGCAAATTTTTA
AATGACTTTCTCTTGCTAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 580; Mature: 580

Protein sequence:

>580_residues
MVISNLHKFLTHPINKKSYQGVIFWFSISMTFAVIYGFLAVKKAFISSLSVQDDARQHIFWMQRFFDPDLFPNDLIADYF
QSVAPAGYTWLYKSAAFVGINPLILAKIIPFILGLICTYYIFRITLEILPVPMAGFIATLVMNQAIWMKDDVASATPRAF
VYPFFMAFLYYLICGSLVRMGIAIALVGLFYPQYVFVASGMLILRLICWRNGRFQFSSKKQDFIFCGVGLSMAFFILLPY
ALTSSEFGPAISREAAMKLREFYPNGRSTFFHVHPKDFWLTGKRSGMFPKSLFTPATQCAGLVLPFLLSFGSAFPLIKNI
TSRIWLLLHLLLSSLGMFFIAHVLLFRLHLPSRYTGLSFRIIIALATAIALTLIIDALFNWAKNIHKFPVAFRGIISLSL
IGLILASLVLYPSFVKGFPLVKYKVGRATYLYDFFQEQPKDILIASLEEEANLLPTFAQRSILLGREYAIPYQVGYYSQF
RERTIDLIVAQYSSDLTDVKDFIQKYGIDFWMVHRGAFTPEYVEDNSWLMQYKFAQEAVTFLQLGNIPALATTISNCVVF
QSDSLFVLDANCILRKGVGE

Sequences:

>Translated_580_residues
MVISNLHKFLTHPINKKSYQGVIFWFSISMTFAVIYGFLAVKKAFISSLSVQDDARQHIFWMQRFFDPDLFPNDLIADYF
QSVAPAGYTWLYKSAAFVGINPLILAKIIPFILGLICTYYIFRITLEILPVPMAGFIATLVMNQAIWMKDDVASATPRAF
VYPFFMAFLYYLICGSLVRMGIAIALVGLFYPQYVFVASGMLILRLICWRNGRFQFSSKKQDFIFCGVGLSMAFFILLPY
ALTSSEFGPAISREAAMKLREFYPNGRSTFFHVHPKDFWLTGKRSGMFPKSLFTPATQCAGLVLPFLLSFGSAFPLIKNI
TSRIWLLLHLLLSSLGMFFIAHVLLFRLHLPSRYTGLSFRIIIALATAIALTLIIDALFNWAKNIHKFPVAFRGIISLSL
IGLILASLVLYPSFVKGFPLVKYKVGRATYLYDFFQEQPKDILIASLEEEANLLPTFAQRSILLGREYAIPYQVGYYSQF
RERTIDLIVAQYSSDLTDVKDFIQKYGIDFWMVHRGAFTPEYVEDNSWLMQYKFAQEAVTFLQLGNIPALATTISNCVVF
QSDSLFVLDANCILRKGVGE
>Mature_580_residues
MVISNLHKFLTHPINKKSYQGVIFWFSISMTFAVIYGFLAVKKAFISSLSVQDDARQHIFWMQRFFDPDLFPNDLIADYF
QSVAPAGYTWLYKSAAFVGINPLILAKIIPFILGLICTYYIFRITLEILPVPMAGFIATLVMNQAIWMKDDVASATPRAF
VYPFFMAFLYYLICGSLVRMGIAIALVGLFYPQYVFVASGMLILRLICWRNGRFQFSSKKQDFIFCGVGLSMAFFILLPY
ALTSSEFGPAISREAAMKLREFYPNGRSTFFHVHPKDFWLTGKRSGMFPKSLFTPATQCAGLVLPFLLSFGSAFPLIKNI
TSRIWLLLHLLLSSLGMFFIAHVLLFRLHLPSRYTGLSFRIIIALATAIALTLIIDALFNWAKNIHKFPVAFRGIISLSL
IGLILASLVLYPSFVKGFPLVKYKVGRATYLYDFFQEQPKDILIASLEEEANLLPTFAQRSILLGREYAIPYQVGYYSQF
RERTIDLIVAQYSSDLTDVKDFIQKYGIDFWMVHRGAFTPEYVEDNSWLMQYKFAQEAVTFLQLGNIPALATTISNCVVF
QSDSLFVLDANCILRKGVGE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65970; Mature: 65970

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVISNLHKFLTHPINKKSYQGVIFWFSISMTFAVIYGFLAVKKAFISSLSVQDDARQHIF
CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
WMQRFFDPDLFPNDLIADYFQSVAPAGYTWLYKSAAFVGINPLILAKIIPFILGLICTYY
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFRITLEILPVPMAGFIATLVMNQAIWMKDDVASATPRAFVYPFFMAFLYYLICGSLVRM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIAIALVGLFYPQYVFVASGMLILRLICWRNGRFQFSSKKQDFIFCGVGLSMAFFILLPY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH
ALTSSEFGPAISREAAMKLREFYPNGRSTFFHVHPKDFWLTGKRSGMFPKSLFTPATQCA
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHCCCHHHHH
GLVLPFLLSFGSAFPLIKNITSRIWLLLHLLLSSLGMFFIAHVLLFRLHLPSRYTGLSFR
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
IIIALATAIALTLIIDALFNWAKNIHKFPVAFRGIISLSLIGLILASLVLYPSFVKGFPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE
VKYKVGRATYLYDFFQEQPKDILIASLEEEANLLPTFAQRSILLGREYAIPYQVGYYSQF
EEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHH
RERTIDLIVAQYSSDLTDVKDFIQKYGIDFWMVHRGAFTPEYVEDNSWLMQYKFAQEAVT
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FLQLGNIPALATTISNCVVFQSDSLFVLDANCILRKGVGE
HHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCEEEEECHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVISNLHKFLTHPINKKSYQGVIFWFSISMTFAVIYGFLAVKKAFISSLSVQDDARQHIF
CCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
WMQRFFDPDLFPNDLIADYFQSVAPAGYTWLYKSAAFVGINPLILAKIIPFILGLICTYY
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFRITLEILPVPMAGFIATLVMNQAIWMKDDVASATPRAFVYPFFMAFLYYLICGSLVRM
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIAIALVGLFYPQYVFVASGMLILRLICWRNGRFQFSSKKQDFIFCGVGLSMAFFILLPY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH
ALTSSEFGPAISREAAMKLREFYPNGRSTFFHVHPKDFWLTGKRSGMFPKSLFTPATQCA
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHCCCHHHHH
GLVLPFLLSFGSAFPLIKNITSRIWLLLHLLLSSLGMFFIAHVLLFRLHLPSRYTGLSFR
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
IIIALATAIALTLIIDALFNWAKNIHKFPVAFRGIISLSLIGLILASLVLYPSFVKGFPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE
VKYKVGRATYLYDFFQEQPKDILIASLEEEANLLPTFAQRSILLGREYAIPYQVGYYSQF
EEEECCCHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHH
RERTIDLIVAQYSSDLTDVKDFIQKYGIDFWMVHRGAFTPEYVEDNSWLMQYKFAQEAVT
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FLQLGNIPALATTISNCVVFQSDSLFVLDANCILRKGVGE
HHHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCEEEEECHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA