| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is feoB [H]
Identifier: 113476463
GI number: 113476463
Start: 4484081
End: 4485901
Strand: Reverse
Name: feoB [H]
Synonym: Tery_2878
Alternate gene names: 113476463
Gene position: 4485901-4484081 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113476464
Following gene: 113476461
Centisome position: 57.88
GC content: 33.5
Gene sequence:
>1821_bases ATGACTTGTCATAACAATAAAGTAACAATATCTCAACCTACTAATGCCACAAAAAAAGTGGCTTTAATAGGGATGCCAAA CACTGGAAAATCTACATTTTTTAATCGGATTACTGGAGTTTCGGCCCATGTAGGAAATTGGCCGGGAATAACAGTTGATC TTTTTCAAGCTGAGGTCAAAATAAATAAGGAAATTACACAATTTATAGACTTACCAGGAATTTATAATTTCAATGGTTTT TCTGAAGATGAAAAAGTTGTTCAAAATTTTCTGGAAAATAATCCTGTTGACTTAGTAATAGTCGTTATTAATTCCTCACA AATCGACCGTCAAATTATGCTACCATTACAGGTAAAATCTTTGGGTTTACCAGCAGTTTTGATGTTAAATATGTCAGATG AAGCTAAACAATATGGGATTAAAATAGACAAAGAAGAATTATCCAAACGTTTGTCAATGCCAGTGTTTTTAATAAGTGCT AAATATGGTAAAGGCTATATGAACGCCTACATGGCAATTTCTGAACAGTTAAAAGAGAGTAAAAATTCAGTTCAACTAGA TACGAATAAAATCAAGGAAAATATTTCTGTTAGGGAAATAGATAGTATTTTAAATGGAACTGTGATTATGCCTTCTCAAA TGGCACAAAATTTCACAGCTCAAGTTGATAAAATTCTGCTGCATCCTGTCTGGGGTTTACCTTTATTTTTCCTAGGAATG TTCCTGGTTTTTTTGGCAATTTGGAATATCGGACTTCCTTCAGTAGACCTTCTTGAAATTGGGGTTGAATGGGTACAGTC ATCAATTGTTGAACCTCTAGTTCAACCGTTTCCACAAGTACTTCAAGATTTTCTAATTAATGGGCTTTGGGCAGGGGTAA CTACTGTTGCTTCTTTTGTACCTTTAATTATAGTATTTTTTATAATTATGGCGGTGTTAGAAGATAGTGGTTATCTATCA CGTTCTGCTTATTTAATGGATGCCTTTATGGCAAGATTGGGTTTAGATGGACGTAGCTTTGTACTGCACATAATGGGGTT TGGTTGTAATGTTCCGGCATTAATGGGAACTAGGGTGATGCGATCGCGTGCTTTACGACTATTAACCATGTTAATTATTC CTTTTGGTTTATGTTCAGCACGATTACAAGTATTTGTATTTATTATTGCAGCAGTATTTCCTAATAGCAAGGGAGCGATA GTTTTATTCTCTTTATATATTCTAAGTTTTCTGGTTGCTATTATTACTGCAGCATTATTTCAAGGAGTATATAAAAATGA AGAACCTTTCGTTTTAGAGATGCCTCCTTATCGTTTTCCTACATGGAAACAAGTTTTACTAAGAAGTTGGGGAGAAGTTA GAGAATTTTTAGTTAGAGCATCTGGCTTCATTACTGTTGGTTGTATTGGAGTTTGGATACTGACAAGTTTACCTTCAGGG GCAACAGGATTAGATACAATTGGTGGTCAAATTGGTCAATTGATGAGTCCTATTATGGATCCTATTGGTATCAATTCTTA TTTAACATTATCCCTATTTTTTGGCTTTATTGCTAAAGAAATTGTGATCGGTTCTTTAGCAGTTATTTATAGCATGAGCG AACAGAATGTTAGTAGCAATATTGCTGAGACAGTTACTTTTATTCAAGGATATAGTTTCTGTATTTTTTGTTTACTTTAT ACCCCATGTTTATCTACTTTAGCAACTTTAATTAAAGAAGCAAAATCATGGAAATTTTCCTTACTTTCTTTAGTATTTCC ATTAGTTTTAGCTTGGTTATCTAGTTTCATTTTTTACCAAGGAGCTTTGGCTTTAAGTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GACAAATCAATATTTTTATGATACCAAATGTTAAGAATCTTTTCAAAAAATTACAAATATTACATAATTTTTATATTATC GGTTTTCTTGCTTAATAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAATCTAAATATTAGATATTTCTAGAAAAAAGGGAATAGAAATTAAGGATAAATAATTAATAGTTTATGTAGGATTATTA ATTTTATTTTGATGACTACA
Product: ferrous iron transport protein B
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 606; Mature: 605
Protein sequence:
>606_residues MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGF SEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISA KYGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLS RSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAI VLFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLY TPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS
Sequences:
>Translated_606_residues MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGF SEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISA KYGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLS RSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAI VLFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLY TPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS >Mature_605_residues TCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVKINKEITQFIDLPGIYNFNGFS EDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKSLGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAK YGKGYMNAYMAISEQLKESKNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGMF LVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFVPLIIVFFIIMAVLEDSGYLSR SAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVMRSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIV LFSLYILSFLVAIITAALFQGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSGA TGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSNIAETVTFIQGYSFCIFCLLYT PCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQGALALS
Specific function: GTP-driven Fe(2+) uptake system [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=612, Percent_Identity=30.0653594771242, Blast_Score=249, Evalue=5e-67,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67145; Mature: 67014
Theoretical pI: Translated: 7.33; Mature: 7.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVK CCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHH INKEITQFIDLPGIYNFNGFSEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKS HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCEEHHH LGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAKYGKGYMNAYMAISEQLKES CCCCEEEEECCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHC KNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM CCCEEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFV HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLIIVFFIIMAVLEDSGYLSRSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVM HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH RSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIVLFSLYILSFLVAIITAALF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG HHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IAETVTFIQGYSFCIFCLLYTPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GALALS CHHCCC >Mature Secondary Structure TCHNNKVTISQPTNATKKVALIGMPNTGKSTFFNRITGVSAHVGNWPGITVDLFQAEVK CCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHH INKEITQFIDLPGIYNFNGFSEDEKVVQNFLENNPVDLVIVVINSSQIDRQIMLPLQVKS HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCEEHHH LGLPAVLMLNMSDEAKQYGIKIDKEELSKRLSMPVFLISAKYGKGYMNAYMAISEQLKES CCCCEEEEECCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHC KNSVQLDTNKIKENISVREIDSILNGTVIMPSQMAQNFTAQVDKILLHPVWGLPLFFLGM CCCEEEEHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH FLVFLAIWNIGLPSVDLLEIGVEWVQSSIVEPLVQPFPQVLQDFLINGLWAGVTTVASFV HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLIIVFFIIMAVLEDSGYLSRSAYLMDAFMARLGLDGRSFVLHIMGFGCNVPALMGTRVM HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH RSRALRLLTMLIIPFGLCSARLQVFVFIIAAVFPNSKGAIVLFSLYILSFLVAIITAALF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGVYKNEEPFVLEMPPYRFPTWKQVLLRSWGEVREFLVRASGFITVGCIGVWILTSLPSG HHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC ATGLDTIGGQIGQLMSPIMDPIGINSYLTLSLFFGFIAKEIVIGSLAVIYSMSEQNVSSN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH IAETVTFIQGYSFCIFCLLYTPCLSTLATLIKEAKSWKFSLLSLVFPLVLAWLSSFIFYQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GALALS CHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8905231 [H]