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The map label for this gene is 108563602

Identifier: 108563602

GI number: 108563602

Start: 1241138

End: 1242385

Strand: Direct

Name: 108563602

Synonym: HPAG1_1177

Alternate gene names: NA

Gene position: 1241138-1242385 (Clockwise)

Preceding gene: 108563601

Following gene: 108563603

Centisome position: 77.75

GC content: 38.54

Gene sequence:

>1248_bases
ATGCAACTAAGCCCCTTACAAAGCGCTCTGTTATATTTCCGCTACTTTATTTATCCAGAGAAAAAAACAAGAAGCTTTGA
TTTAAGCGATTTAGTCTTTATTATCATGGTTTTTTTAGTCCTGGCTTTGGGGCTGTTGATGAGCGAAGAAATTTCTATCA
GCTATAATGAAGCGAAGGATTTTTTTTATAGCAGCGCATGGTTTGTTCAAATCGCTCAAAAAAGTACTGAAATTTTGGGT
CAAAACGATTTGGCTTTAAGATTGCCTTTTTTGATCGCTCATCTCATTAACATGTTTTTATTTTATTTGATAGGGCGAAA
GATTTTAAAAAAGCCTAAAGACGCTCTCTATGTGGTATTGACTTACGCTTTATTGCCTGGAGTGAATCTCTTTGCGATTT
TATTGGCTAAAAGCGTGCTGGTGTTAAGCCTTGGGCTTTTGGTTAGCTATTTGTATATCAAAACCCAAAAAATCCCTTAT
TTAACCCTTAGCGCTTGCGCATTTTTAGACGGCGCGTTCATCCCGCTTTTACTAGGGGTTTTTGCCTACACTTTAAGAAA
ACGCTATTTTAAGAGCGCGATCTTTATTTTGGTGGGTTTAATTGTGAATACCGCTCTTTTTAGCGGGAGTTTCAATAAGG
GCTTGCCTAGTGGGTATTTTATAGACACATGCTTAGAACTCATGCTTTTATACTCGCCCTTATTCTTCCTCTACTACCCT
TATACGCTCTATAAAGCCCTTTTGGATAAAAAGCCATCGTTACTGGCCTTTATGAGCGCGAGCGGTTGGCTTTTCCCTTT
GCTTTTGAGTATGCGCCAAGAGATAGATTTAAGAACTTTCGCTCCCTTAGCGTTAATCGGTTTGCCCTTGTTTGTTAAAA
GCGTTTTAAATAGCCTTAGGGTGCGTTTAAAGGAATTTAGGGGGCAGTATTATTTGCGCATTTTCAGCCTGTATCTTTTA
ATGCTCACTGAAACGCTTTTTTTGTGGGGGAGTAAAATTTCTGGCGCTAATGAAAAATTATTAAACCGGCATTTCTTAGC
CAAAGAAGTCGCTATAGCCTTGCAATTAAGGGGCATCCATCAAATCCGCACTAACGATAAACAACTCGCTTTAAGGCTCC
AATTCTATGGCATTAAAGAAGGGGGGAGGTTAAGACTGATTAACACTAAGATTTCTAAAAAACGCCCTGATATTACAGTC
ATCTACGCTGATAAAATTCTACAATCCTATAGTTTGGTGCGCCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTGGATCTTAAAAGCTCTTTAGGGGTGGCTTTGATTTTATGTTCAGGCTTACTCATTGCTTTACCCGCTCTTTTAAAA
GAATTAAAAAAATTTAAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCCATTCTTTAAAAAGCATTTTATCTAAAGAATGATAAAATACACTCCAAAAATAAATAAAATACGCGAGAAAAACCAT
GAGACTCAAACTAAACCATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Inner Membrane Protein OxaA

Number of amino acids: Translated: 415; Mature: 415

Protein sequence:

>415_residues
MQLSPLQSALLYFRYFIYPEKKTRSFDLSDLVFIIMVFLVLALGLLMSEEISISYNEAKDFFYSSAWFVQIAQKSTEILG
QNDLALRLPFLIAHLINMFLFYLIGRKILKKPKDALYVVLTYALLPGVNLFAILLAKSVLVLSLGLLVSYLYIKTQKIPY
LTLSACAFLDGAFIPLLLGVFAYTLRKRYFKSAIFILVGLIVNTALFSGSFNKGLPSGYFIDTCLELMLLYSPLFFLYYP
YTLYKALLDKKPSLLAFMSASGWLFPLLLSMRQEIDLRTFAPLALIGLPLFVKSVLNSLRVRLKEFRGQYYLRIFSLYLL
MLTETLFLWGSKISGANEKLLNRHFLAKEVAIALQLRGIHQIRTNDKQLALRLQFYGIKEGGRLRLINTKISKKRPDITV
IYADKILQSYSLVRH

Sequences:

>Translated_415_residues
MQLSPLQSALLYFRYFIYPEKKTRSFDLSDLVFIIMVFLVLALGLLMSEEISISYNEAKDFFYSSAWFVQIAQKSTEILG
QNDLALRLPFLIAHLINMFLFYLIGRKILKKPKDALYVVLTYALLPGVNLFAILLAKSVLVLSLGLLVSYLYIKTQKIPY
LTLSACAFLDGAFIPLLLGVFAYTLRKRYFKSAIFILVGLIVNTALFSGSFNKGLPSGYFIDTCLELMLLYSPLFFLYYP
YTLYKALLDKKPSLLAFMSASGWLFPLLLSMRQEIDLRTFAPLALIGLPLFVKSVLNSLRVRLKEFRGQYYLRIFSLYLL
MLTETLFLWGSKISGANEKLLNRHFLAKEVAIALQLRGIHQIRTNDKQLALRLQFYGIKEGGRLRLINTKISKKRPDITV
IYADKILQSYSLVRH
>Mature_415_residues
MQLSPLQSALLYFRYFIYPEKKTRSFDLSDLVFIIMVFLVLALGLLMSEEISISYNEAKDFFYSSAWFVQIAQKSTEILG
QNDLALRLPFLIAHLINMFLFYLIGRKILKKPKDALYVVLTYALLPGVNLFAILLAKSVLVLSLGLLVSYLYIKTQKIPY
LTLSACAFLDGAFIPLLLGVFAYTLRKRYFKSAIFILVGLIVNTALFSGSFNKGLPSGYFIDTCLELMLLYSPLFFLYYP
YTLYKALLDKKPSLLAFMSASGWLFPLLLSMRQEIDLRTFAPLALIGLPLFVKSVLNSLRVRLKEFRGQYYLRIFSLYLL
MLTETLFLWGSKISGANEKLLNRHFLAKEVAIALQLRGIHQIRTNDKQLALRLQFYGIKEGGRLRLINTKISKKRPDITV
IYADKILQSYSLVRH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47628; Mature: 47628

Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHCCCHHEEEEEEEEEECCCCEEEEEECHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHCCCHHEEEEEEEEEECCCCEEEEEECHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA