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The map label for this gene is 108562889

Identifier: 108562889

GI number: 108562889

Start: 478414

End: 481407

Strand: Direct

Name: 108562889

Synonym: HPAG1_0464

Alternate gene names: NA

Gene position: 478414-481407 (Clockwise)

Preceding gene: 108562888

Following gene: 108562890

Centisome position: 29.97

GC content: 37.14

Gene sequence:

>2994_bases
GTGTGCTTTTTAAACCAATTAAACGAGTTTAAAGATGATGTTTTTACCACGCCCAAGGCTAAAGAATACATTGACATAGC
GAGCGGTTTTCATAAGCTTTTTAAAAACGACGCTAAGATCGCAGAAAGCCTAAAGCCCGCTATTACCAAGAACTTAAGCC
AAGGTTTAGCGACCACTTTAAGCGGAGCGTTAAAGTATCAGTGGACTAAATTCACATTAGGAACGCTTTATAGAAACGCG
CCCGATCGCATTTTAGGGATTAAATTACCTAAAGCCCTAAACGAAGCCACCGCAGGCGCGGCCTTAAAGTATCACATTAA
AAGAGCGCTTGAGAGAAGCCACTCAATAAGTGATTTTAGTAAGAATTTAGAAATTAGCGCTAAAAATTCTAAATTCACTA
ACAACACGCTTAAAATCATTGAAGAGCTTAACAACGGCGTTAAAAGCGCGAGTGAAGAAATCAAAGAAAAGGCTACTAAA
TACGAAAAAGCCTTACAAGAATTGCAAAAGATTGATGGAAGCACGCTAACTAAAGAACAGCAACAAGTTTTAAAAGTGTT
TAAAGGAGAGCTAGACAAAAGCGAGATTAAAGGAATAGATTTAAACGACCTCTACATTTTAGAACAAGGATCGAGGAATG
CAGGAGCTAGAAAAATACTAAGAAAGCAGAACGGAGAAGAGAATACAGGCGGAGTAACTAACGATGAACTACTTAACATG
AGCGAAGTGATTAAAAACGGAAGCGTGTTATTAGATAGTTTTGAAAGGCTTAAAAACGGATTTAGATACGCTTACGAATA
CGAGCATGACGGCGTTCAGCTTAGGTTAGTAATAGATGATTTAAACGATGGAAATAAGATTTTTGATTTTTATAGGAATT
TTAAAGATTTCAGGGATACCAGTCTACACTCTGGAAACCACCCCTATGAACCTAATCCTACACCAAAACCGCTAAATAGT
CAAGAGGATTTATTAAAAACAAGCGAAAATTTAAACGAAACCACCAAAGAAGCTACAAAATTAAGCCCACTAGAGCAAGC
CAACGCCGAAAAGTTAGCGAAGTTACAAAGAGAGCAAGAACAAAGCGAACAGGAATTTTTAAAAGCTAAAGAGCAAGAAA
AACAACGCAAGGAAGCGTTAAAAAAGAAATTAGAACACGAGCGAGGGAATGCGGGCAACATTGAAAGCCAGACTAAAATA
GAAGTAGGAGAGGATATACCTACAAAAACGCAAGAGCAATTACCCAAAAGCCGAGTAAGATTGAACGAACGAGAGATTTA
CGATCTAGACTATGCGATCGTGAAAGCCAAAGACTTAAAGCCGAGTTTTACTACAGGCGGGACGCAAAAACGCACCGACA
TGAACGAAGAGCAGATCAAAAGCATCGCGCAAAATTTTGATCCTAAAAAGATATTTGGGAGCGGAGGGTTTGAAGATTTA
CCGATTATCTTACATGACGGCCAAGTGATCGCAGGAAACCACCGCATCCAAGGCATGCTGAATTTCACGCCTAAAAGCCG
TTACATTTACGAGAAAGCGATCAAGGAATACTATCACATAGACTTAAAACCGGACGAGCTATTAGTGCGAGTGCCGCACA
ATAGATTAAACAACACCGAGATCAACAATTTAGCGGCTAGTTCTAATCAAGGAAGATTTAACAGCGAGAGCGATCATGCA
ATAGCGGTTTTAAGCCACTATGAAGCGAAATTGAAAGAATTAGACCAAAAATTAGACGCTGATAGCATTTACTCACTTAA
AAACATCGTTGCTAAAAATTTGAATTTTGATAAGGCTACTCATCCTAATGTAGGCGATAGTAATTTAGCGTTGCTTATGT
TTAACATGCCACGAACGAAGACGCAAGGGATAGAATTACTCAATCGTTGGCAGAAAGAATTTTCAAATGATATTAAAAGC
TATGAAAAAGTGAAAAAAATGTTTGTAGATAACGCCGGGAGTTTTCACAATTTAATCCATGATATTAATTTTCCTAAGGT
GAGTTTAAACGCTTATTTAAGCGATATTATGGATCGCAGTTTTGCCAATTTAAAGAATTATCAAAGCACGAGCGAGAGCC
TTAAAAGTTTGAGCGAAAAATTCTATAAAACGAGTTCTTTAGAGATGTTTGAAAAGAGCGAACAAGGATCGAGCGACATT
AGCGAGATTTTAGGAGGTGCGATCGCAAGGTTTGCACGATTTGATGATCCGTCTAAAGCGTTATTTGAAGCCTTAAGAAG
CGATAACATTAAAAAAGGCTTGAAAGATTTTAAGATCGCAGATGTTACTAAAGACATGTTCGATCCTAAAAGTAAGGAAC
TTAAGGACATTGATATTTACGACTTCACGCATTACCTTTTAATGGCAAGTAGAGAACCAAACGAAAATAACCCTACCTTA
AAGCGCTTGATAGAAGCTATAAAGGATATGCAAAAAGAGAGCGAGAAAGGGAGTAAAAAACAAAAACTTGACACTCCTAG
CGAATGGGGACACAATTATAGCGAGTTTAAAAATGATGGCTTAGGAGCGATTAACAAGCTATTAGAAACTAAAAAAGGTT
TTGTAGCGGGAGCGTTTTATAAGGAAGGTTTAGGGGATATTGATTTAGTTTGGGGTAATAAAGATTACGAGCTAGAACAC
ATCTTAAAGCGTAGGGAAAGCGATGCGATAGACAAAGACATGGGTGAAGAAGAAGCTAAAAAATACGCATTAAAAATAAT
TAACAATATCCCTAACATAATAAGCAATGGAAAACTATCAAAAGATAATTTAGGGCGTTTAAAAATTGAATTCAAAAATC
AAAGAGTGGGGTTAAATGATAGTTGGAAAGGTGAAACCTTAAATAATAGATGGGTTATTACAAGCTATGAATTAAATCAA
TCAAGGAATGGGCTAATTGAGTCGCCTTTAGCACCAAATTACAAGGGGAAAGATACTAATCCCCTAAACCTTGATAATCC
TAATCCTACCACAAAAAAATTAAATAAGGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTAAAAGGCTCTGCTCCAATCAAATATCAATACTCAAAAAGCCTTATTTAATTTTATTATTCAATATTTAATACACT
AGAACAAAACACCACACCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGATAAACTACCCTAATTTGCCTAATAGCACACTAGAGATCACCGAACAGCCACAGGTAAAAGAAATCACTAACGAAC
TCTTAAAGCAATTACAAAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 997; Mature: 997

Protein sequence:

>997_residues
MCFLNQLNEFKDDVFTTPKAKEYIDIASGFHKLFKNDAKIAESLKPAITKNLSQGLATTLSGALKYQWTKFTLGTLYRNA
PDRILGIKLPKALNEATAGAALKYHIKRALERSHSISDFSKNLEISAKNSKFTNNTLKIIEELNNGVKSASEEIKEKATK
YEKALQELQKIDGSTLTKEQQQVLKVFKGELDKSEIKGIDLNDLYILEQGSRNAGARKILRKQNGEENTGGVTNDELLNM
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EVGEDIPTKTQEQLPKSRVRLNEREIYDLDYAIVKAKDLKPSFTTGGTQKRTDMNEEQIKSIAQNFDPKKIFGSGGFEDL
PIILHDGQVIAGNHRIQGMLNFTPKSRYIYEKAIKEYYHIDLKPDELLVRVPHNRLNNTEINNLAASSNQGRFNSESDHA
IAVLSHYEAKLKELDQKLDADSIYSLKNIVAKNLNFDKATHPNVGDSNLALLMFNMPRTKTQGIELLNRWQKEFSNDIKS
YEKVKKMFVDNAGSFHNLIHDINFPKVSLNAYLSDIMDRSFANLKNYQSTSESLKSLSEKFYKTSSLEMFEKSEQGSSDI
SEILGGAIARFARFDDPSKALFEALRSDNIKKGLKDFKIADVTKDMFDPKSKELKDIDIYDFTHYLLMASREPNENNPTL
KRLIEAIKDMQKESEKGSKKQKLDTPSEWGHNYSEFKNDGLGAINKLLETKKGFVAGAFYKEGLGDIDLVWGNKDYELEH
ILKRRESDAIDKDMGEEEAKKYALKIINNIPNIISNGKLSKDNLGRLKIEFKNQRVGLNDSWKGETLNNRWVITSYELNQ
SRNGLIESPLAPNYKGKDTNPLNLDNPNPTTKKLNKE

Sequences:

>Translated_997_residues
MCFLNQLNEFKDDVFTTPKAKEYIDIASGFHKLFKNDAKIAESLKPAITKNLSQGLATTLSGALKYQWTKFTLGTLYRNA
PDRILGIKLPKALNEATAGAALKYHIKRALERSHSISDFSKNLEISAKNSKFTNNTLKIIEELNNGVKSASEEIKEKATK
YEKALQELQKIDGSTLTKEQQQVLKVFKGELDKSEIKGIDLNDLYILEQGSRNAGARKILRKQNGEENTGGVTNDELLNM
SEVIKNGSVLLDSFERLKNGFRYAYEYEHDGVQLRLVIDDLNDGNKIFDFYRNFKDFRDTSLHSGNHPYEPNPTPKPLNS
QEDLLKTSENLNETTKEATKLSPLEQANAEKLAKLQREQEQSEQEFLKAKEQEKQRKEALKKKLEHERGNAGNIESQTKI
EVGEDIPTKTQEQLPKSRVRLNEREIYDLDYAIVKAKDLKPSFTTGGTQKRTDMNEEQIKSIAQNFDPKKIFGSGGFEDL
PIILHDGQVIAGNHRIQGMLNFTPKSRYIYEKAIKEYYHIDLKPDELLVRVPHNRLNNTEINNLAASSNQGRFNSESDHA
IAVLSHYEAKLKELDQKLDADSIYSLKNIVAKNLNFDKATHPNVGDSNLALLMFNMPRTKTQGIELLNRWQKEFSNDIKS
YEKVKKMFVDNAGSFHNLIHDINFPKVSLNAYLSDIMDRSFANLKNYQSTSESLKSLSEKFYKTSSLEMFEKSEQGSSDI
SEILGGAIARFARFDDPSKALFEALRSDNIKKGLKDFKIADVTKDMFDPKSKELKDIDIYDFTHYLLMASREPNENNPTL
KRLIEAIKDMQKESEKGSKKQKLDTPSEWGHNYSEFKNDGLGAINKLLETKKGFVAGAFYKEGLGDIDLVWGNKDYELEH
ILKRRESDAIDKDMGEEEAKKYALKIINNIPNIISNGKLSKDNLGRLKIEFKNQRVGLNDSWKGETLNNRWVITSYELNQ
SRNGLIESPLAPNYKGKDTNPLNLDNPNPTTKKLNKE
>Mature_997_residues
MCFLNQLNEFKDDVFTTPKAKEYIDIASGFHKLFKNDAKIAESLKPAITKNLSQGLATTLSGALKYQWTKFTLGTLYRNA
PDRILGIKLPKALNEATAGAALKYHIKRALERSHSISDFSKNLEISAKNSKFTNNTLKIIEELNNGVKSASEEIKEKATK
YEKALQELQKIDGSTLTKEQQQVLKVFKGELDKSEIKGIDLNDLYILEQGSRNAGARKILRKQNGEENTGGVTNDELLNM
SEVIKNGSVLLDSFERLKNGFRYAYEYEHDGVQLRLVIDDLNDGNKIFDFYRNFKDFRDTSLHSGNHPYEPNPTPKPLNS
QEDLLKTSENLNETTKEATKLSPLEQANAEKLAKLQREQEQSEQEFLKAKEQEKQRKEALKKKLEHERGNAGNIESQTKI
EVGEDIPTKTQEQLPKSRVRLNEREIYDLDYAIVKAKDLKPSFTTGGTQKRTDMNEEQIKSIAQNFDPKKIFGSGGFEDL
PIILHDGQVIAGNHRIQGMLNFTPKSRYIYEKAIKEYYHIDLKPDELLVRVPHNRLNNTEINNLAASSNQGRFNSESDHA
IAVLSHYEAKLKELDQKLDADSIYSLKNIVAKNLNFDKATHPNVGDSNLALLMFNMPRTKTQGIELLNRWQKEFSNDIKS
YEKVKKMFVDNAGSFHNLIHDINFPKVSLNAYLSDIMDRSFANLKNYQSTSESLKSLSEKFYKTSSLEMFEKSEQGSSDI
SEILGGAIARFARFDDPSKALFEALRSDNIKKGLKDFKIADVTKDMFDPKSKELKDIDIYDFTHYLLMASREPNENNPTL
KRLIEAIKDMQKESEKGSKKQKLDTPSEWGHNYSEFKNDGLGAINKLLETKKGFVAGAFYKEGLGDIDLVWGNKDYELEH
ILKRRESDAIDKDMGEEEAKKYALKIINNIPNIISNGKLSKDNLGRLKIEFKNQRVGLNDSWKGETLNNRWVITSYELNQ
SRNGLIESPLAPNYKGKDTNPLNLDNPNPTTKKLNKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113570; Mature: 113570

Theoretical pI: Translated: 8.67; Mature: 8.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCFLNQLNEFKDDVFTTPKAKEYIDIASGFHKLFKNDAKIAESLKPAITKNLSQGLATTL
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGALKYQWTKFTLGTLYRNAPDRILGIKLPKALNEATAGAALKYHIKRALERSHSISDFS
HHHHHEEEHEEHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
KNLEISAKNSKFTNNTLKIIEELNNGVKSASEEIKEKATKYEKALQELQKIDGSTLTKEQ
CCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
QQVLKVFKGELDKSEIKGIDLNDLYILEQGSRNAGARKILRKQNGEENTGGVTNDELLNM
HHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCH
SEVIKNGSVLLDSFERLKNGFRYAYEYEHDGVQLRLVIDDLNDGNKIFDFYRNFKDFRDT
HHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
SLHSGNHPYEPNPTPKPLNSQEDLLKTSENLNETTKEATKLSPLEQANAEKLAKLQREQE
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHCCHHHHC
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CCCHHEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHEECCCCCCCC
PIILHDGQVIAGNHRIQGMLNFTPKSRYIYEKAIKEYYHIDLKPDELLVRVPHNRLNNTE
CEEEECCEEEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCC
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HHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
HPNVGDSNLALLMFNMPRTKTQGIELLNRWQKEFSNDIKSYEKVKKMFVDNAGSFHNLIH
CCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
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>Mature Secondary Structure
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HHHHHEEEHEEHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
KNLEISAKNSKFTNNTLKIIEELNNGVKSASEEIKEKATKYEKALQELQKIDGSTLTKEQ
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CCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCC
SRNGLIESPLAPNYKGKDTNPLNLDNPNPTTKKLNKE
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA