Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007880 |
Length | 1,895,994 |
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The map label for this gene is 89256484
Identifier: 89256484
GI number: 89256484
Start: 1102042
End: 1106028
Strand: Reverse
Name: 89256484
Synonym: FTL_1162
Alternate gene names: NA
Gene position: 1106028-1102042 (Counterclockwise)
Preceding gene: 89256485
Following gene: 89256483
Centisome position: 58.33
GC content: 26.39
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TGAAATATCAATTGAAAATAATAAAAAAAATCAGATATACCTAAGTTATTTTAATTTATGAAAAATCCGAATCACTATCT GATAAATTAAGGAGGCACAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTAAGGATACAAATATATGAGTAAAAAAATATTTAAATTATTATCAATTTCAATAATATTTAGTATATATCAACAAACA TTTAGTAATACAATAACAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1328; Mature: 1328
Protein sequence:
>1328_residues MNDKYELNIYFEKIELPKTADFNMISKHDIKELRVDANLKKKIHLLQFDEDYLAYMRSLRAIHPSKIAMQKIKSIRNKKN SFIIAILSLDKIIHKTKFITFGHKTVIFDFKKLWGLVDFVIVHTSNKTWVNHKLTSFMPSITYCNQNIIHLAYHSDFLYI YHTPEFMDDINVDRENRRRLVAKIPDPYWVRADTKENKINITSENKNLEKDLKKITKLKNFEISANDIFFSKAIKAAPRL QHKNKSKLFNSLAIENNEKIKRDIIDYAISNAWYKNDGLLENLMTFLDALVVRHLYLIAVYSVYEIEIGIKSVKPEYSKL LKAGLLNKDIQNQLIYDQKKISNIIWLGETFHGLDIEEAQALCEFLDEENINPKINPINSKKLYKTYKENYKSDSEKILS FTKYKEKYNFLNNDKLREEHANKLSSILEDPKFRVLSYINAFLCSTKNYLVPYGYLGSNPLTYYNCMLETGKRRTSKEAY FADIRNKLFIVCYLPGFLSSVIADDDFIDWYSNKKENQELLKNSYLNNLYNSKQKYIKDFIDLDIIKLLKQTSSQIKPSY IPVAFRYGAFASTTALIRSNANVSNRMEFELYDSPERLHNQYLEKEEMIMPKSVNNPKDHSIDNGVSLFSLNLTNEKEDG LRKVMLKVAQLYNLDFKVGISGNLDQAMTQALILGMATTKKNGDIVIDEDQVLYMTYLYCIFMAHSVDHTVDEILMSSNT YMLNSKEEKYPIANIANFFARPVFKLSKDKEFKALVEKYENSIKPNSKVLKENYISRVTTLSEVYEDIYNLNCLYSSLSE GSLYNLLSTHSERNCTLLEQYSRKKKAETGLVQDGEKIKVVNNYNGYAAINQYQRFVSLGIMYDSGAKYSSSHKKQIEKD FNLYSPDKEQINYLKYNFKDNKFDAVYKNKKSKEKTQSHIVYAKKQNTRYCYGYFNNFFVKNRITTFYKIKDKSGNYLVN LHNEKYSFATPNSDSKIYRASPELLNNRDDFKRVSKDIIKSYKYISFDKQKEDIVKNFGKNLYHTNYEIWVGLSHQAISC FSVLDNIDTQEAANTFIDALYYIRLMQLYYGKTIPFLLISSEIVRYSSSETHYYIPTEENFENILKIALNSASKPVIERF LIILNIYNNTIDDNTLILIRCRLTIILFEHEEQKLKLKALQKYADAYKKNNYKNEINFRAWFESIFHVQNLSLSPNYIGN NILILSLVEELKPKCSEYKKNMINQQIIAKANELNFYQLIIRLIEISTYHRILTKSIITNTTSLLYDILNKPEFQTINKS INKLFIYKNKDLNTDKYKAFHTKLITIEKTYKKINSLYKSDFFKKISS
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 155910; Mature: 155910
Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNDKYELNIYFEKIELPKTADFNMISKHDIKELRVDANLKKKIHLLQFDEDYLAYMRSLR CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHH AIHPSKIAMQKIKSIRNKKNSFIIAILSLDKIIHKTKFITFGHKTVIFDFKKLWGLVDFV CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHEE IVHTSNKTWVNHKLTSFMPSITYCNQNIIHLAYHSDFLYIYHTPEFMDDINVDRENRRRL EEECCCCCEEHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEECCHHHHCCCCCCHHCCEE VAKIPDPYWVRADTKENKINITSENKNLEKDLKKITKLKNFEISANDIFFSKAIKAAPRL EEECCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHH QHKNKSKLFNSLAIENNEKIKRDIIDYAISNAWYKNDGLLENLMTFLDALVVRHLYLIAV CCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSVYEIEIGIKSVKPEYSKLLKAGLLNKDIQNQLIYDQKKISNIIWLGETFHGLDIEEAQ HHHEEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHH ALCEFLDEENINPKINPINSKKLYKTYKENYKSDSEKILSFTKYKEKYNFLNNDKLREEH HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH ANKLSSILEDPKFRVLSYINAFLCSTKNYLVPYGYLGSNPLTYYNCMLETGKRRTSKEAY HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHH FADIRNKLFIVCYLPGFLSSVIADDDFIDWYSNKKENQELLKNSYLNNLYNSKQKYIKDF HHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDLDIIKLLKQTSSQIKPSYIPVAFRYGAFASTTALIRSNANVSNRMEFELYDSPERLHN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHH QYLEKEEMIMPKSVNNPKDHSIDNGVSLFSLNLTNEKEDGLRKVMLKVAQLYNLDFKVGI HHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEC SGNLDQAMTQALILGMATTKKNGDIVIDEDQVLYMTYLYCIFMAHSVDHTVDEILMSSNT CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC YMLNSKEEKYPIANIANFFARPVFKLSKDKEFKALVEKYENSIKPNSKVLKENYISRVTT EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LSEVYEDIYNLNCLYSSLSEGSLYNLLSTHSERNCTLLEQYSRKKKAETGLVQDGEKIKV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE VNNYNGYAAINQYQRFVSLGIMYDSGAKYSSSHKKQIEKDFNLYSPDKEQINYLKYNFKD EECCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCEEEEECCC NKFDAVYKNKKSKEKTQSHIVYAKKQNTRYCYGYFNNFFVKNRITTFYKIKDKSGNYLVN 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PDB accession: NA
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References: NA