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The map label for this gene is dtpA [H]

Identifier: 89256312

GI number: 89256312

Start: 930229

End: 931686

Strand: Reverse

Name: dtpA [H]

Synonym: FTL_0963

Alternate gene names: 89256312

Gene position: 931686-930229 (Counterclockwise)

Preceding gene: 89256313

Following gene: 89256311

Centisome position: 49.14

GC content: 31.62

Gene sequence:

>1458_bases
ATGCCGATGAGTATTACTTTGTTTAAAAAAGCTTCCAGACTTTTGCTAATAACTCAACTATTTTCAACTCTTAGCTTTGC
TGTTTTATATTCAACCTTAGTATTATTTATGACTCAAGCTCTTGGTTTTACTGTTACTAAAGCTAGTGCTGTTATGGGAG
TATTTGTCGCCTTTAATTATGGCTTACATATATTAGGTGGCTATATTGGTGGGCGCTTAATAAGTTATCGAGTGCTATTT
TTATTAGGAATGGTATTACAAATATTTGCTTGTTTATTTTTAGCATTTCCATCAACAGAACATCTTTATATAGCTTTAGC
ACTATTTTTAACAGGGTGCAGTTTAAATGTTCCTTGTATAAATATGATGTTAACTCAGCAATTTGAGAATAATGATGGTG
ATAGAGAAAGTGCATTTTTCTGGAATTATGCTGGTATGAATATCGGCTTTTTTATCGGTTTTACAATTGCTGGAATATAT
CAAGGCAAACAAAGTTATAATACCTTATTTCTTATAACAACTATTACCAACATTATTGCTTTTTTACTCTTAGCAACAAG
TTGGAAGACAGTCGCGGATAGAACTACCCCACTAGTCAAAAAAATTCAACAAAAAGGTAACAATATATTACTCAAAAATA
ATTTTTTTGCTTTATTGATAATTTTTATTACAGTACTACTATTATTTATTGCATTGCAGTATCCACTTAATACCAACTAT
ATTGCCCTTGTGGTCGGAATATTACTATTATTAATGTTTATCCCTATAGCTAGAGCTCAAAATATTAAAGAGCAAAAGAA
TAAAGTTTATGCTTATGTGATATTAGCAACTTTTGGCTTAGTCTTTTGGTCAGCATATCAACTTGCTCCAATGGCACTAA
CGGTATTTGCTGAAGCAAATATAGATAAACACTTACTAGGTTTTACAATTCAAACACAATGGTTTCAGAATGTAAATACA
GTAGTGATAGCTGTCGGGGGTATGTTGCTTCCAAGTATATTATTAATTATACGTAAGCGTTTTATCTTTTCATTTCCAAT
GCAATTCTGTTTTAGCCTTATTTTTATTGCAATTGGTTTTGCAATGCTAATTATTGGAATATTATGTGCTAATAGTTATG
GCTACACAGCTGCGATTTGGCTAATATTAAGTTATGTATTTCAGTCTATAGGAGAATTACTAATAGGCCCTACTGGCTAT
GCTATGATTGGTAAACTTGCTAAACCAAAACTTCAAGGTTTAATGATGGGATCTTGGATGGTTGTCACTGGAAGTACATC
TGGAGTTATTGCTAGCTTACTATCAATACTAGTAGCGTCACCAGATATTAATGCAGCACCTATTGAAACAAACTCTAGTT
ATTTGACACTATTTACTGGTCTAACAATAGTTGCTGCTGTTGCTGCGTTTATTATGTATCTAATAATTTCTAAAATTAGA
AAGCTTGCATATATCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATAACTAAGCTGATTTTATATTTTTTTTACGCGTAATATATATATATTTCCTTGTGTTATGACGATAAAATCTTGTTT
ACTATTTTATCAACTTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAATAATAACTATATTTTCCTAAACATATATCTTATAATCTTTGCATTCTAAACGATTATCTTAATATCATTTATCAA
TGACTATTAGAGAAAAATAC

Product: proton-dependent oligopeptide transport (POT) family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 485; Mature: 484

Protein sequence:

>485_residues
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLF
LLGMVLQIFACLFLAFPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIY
QGKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNT
VVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGELLIGPTGY
AMIGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTSGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIISKIR
KLAYI

Sequences:

>Translated_485_residues
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLF
LLGMVLQIFACLFLAFPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIY
QGKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNT
VVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGELLIGPTGY
AMIGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTSGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIISKIR
KLAYI
>Mature_484_residues
PMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLFL
LGMVLQIFACLFLAFPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQ
GKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNYI
ALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNTV
VIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGELLIGPTGYA
MIGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTSGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIISKIRK
LAYI

Specific function: Proton-dependent permease that transports di- and tripeptides [H]

COG id: COG3104

COG function: function code E; Dipeptide/tripeptide permease

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the PTR2/POT transporter (TC 2.A.17) family. DtpA subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789911, Length=489, Percent_Identity=25.3578732106339, Blast_Score=127, Evalue=1e-30,
Organism=Escherichia coli, GI1787922, Length=489, Percent_Identity=23.3128834355828, Blast_Score=126, Evalue=3e-30,
Organism=Escherichia coli, GI1786927, Length=453, Percent_Identity=23.3995584988962, Blast_Score=110, Evalue=2e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1790572, Length=443, Percent_Identity=22.1218961625282, Blast_Score=99, Evalue=6e-22,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR000109
- InterPro:   IPR005279
- InterPro:   IPR018456 [H]

Pfam domain/function: PF00854 PTR2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53646; Mature: 53515

Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNY
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLHILGGYIGGRLISYRVLFLLGMVLQIFACLFLAFPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
NMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQGKQSYNTLFLITTITNIIA
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
FLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
HHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
IDKHLLGFTIQTQWFQNVNTVVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGF
CCHHHHHHEEHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGELLIGPTGYAMIGKLAKPKLQGLMMGSWM
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHEEECCEE
VVTGSTSGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIISKIR
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAYI
HHHCC
>Mature Secondary Structure 
PMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLHILGGYIGGRLISYRVLFLLGMVLQIFACLFLAFPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
NMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQGKQSYNTLFLITTITNIIA
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
FLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
HHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
IDKHLLGFTIQTQWFQNVNTVVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGF
CCHHHHHHEEHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGELLIGPTGYAMIGKLAKPKLQGLMMGSWM
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHEEECCEE
VVTGSTSGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIISKIR
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAYI
HHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 14500782 [H]